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Wheat genomic study for genetic improvement of traits in China

Science China(Life Sciences) 2022年第9期65卷 1718-1775页

作者： Jun Xiao Bao Liu Yingyin Yao Zifeng Guo Haiyan Jia Lingrang Kong Aimin Zhang Wujun Ma Zhongfu Ni Shengbao Xu Fei Lu Yuannian Jiao Wuyun Yang Xuelei Lin Silong Sun Zefu Lu Lifeng Gao Guangyao Zhao Shuanghe Cao Qian Chen Kunpu Zhang Mengcheng Wang Meng Wang Zhaorong Hu Weilong Guo Guoqiang Li Xin Ma Junming Li Fangpu Han Xiangdong Fu Zhengqiang Ma Daowen Wang Xueyong Zhang Hong-Qing Ling Guangmin Xia Yiping Tong Zhiyong Liu zhonghu he Jizeng Jia Kang Chong Key Laboratory of Plant Molecular Physiology Institute of BotanyChinese Academy of SciencesBeijing 100093China Institute of Crop Sciences Chinese Academy of Agricultural SciencesBeijing 100081China The State Key Laboratory of Plant Cell and Chromosome Engineering Institute of Genetics and Developmental BiologyChinese Academy of SciencesBeijing 100101China State Key Laboratory for Agrobiotechnology and Key Laboratory of Crop heterosis and Utilization(MOE)and Beijing Key Laboratory of Crop Genetic Improvement China Agricultural UniversityBeijing 100193China The Key Laboratory of Plant Development and Environment Adaptation Biology Ministry of EducationSchool of Life ScienceShandong UniversityQingdao 266237China State Key Laboratory of Crop Biology College of AgronomyShandong Agricultural UniversityTai’an 271018China Crop Genomics and Bioinformatics Center and National Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement Nanjing Agricultural UniversityNanjing210095China Key Laboratory of Molecular Epigenetics Northeast Normal UniversityChangchun 130024China College of Agronomy State Key Laboratory of Wheat and Maize Crop Scienceand Center for Crop Genome EngineeringHenan Agricultural UniversityZhengzhou 450002China State Key Laboratory of Crop Stress Biology for Arid Areas College of AgronomyNorthwest A&F UniversityYangling 712100China College of Agronomy Qingdao Agricultural UniversityQingdao 266109China Ministry of Education Key Laboratory of Molecular and Cellular Biology Hebei Collaboration Innovation Center for Cell SignalingHebei Key Laboratory of Molecular and Cellular BiologyCollege of Life SciencesHebei Normal UniversityShijiazhuang 050024China Institute of Crop Research Sichuan Academy of Agricultural SciencesChengdu 610066China State Key Laboratory of Systematic and Evolutionary Botany Institute of BotanyChinese Academy of SciencesBeijing 100093China State Key Laboratory of Soil and Sustainable Agriculture Institute of Soil ScienceChinese Academy of Sciences

Bread wheat(Triticum aestivum L.)is a major crop that feeds 40%of the world’s *** the past several decades,advances in genomics have led to tremendous achievements in understanding the origin and domestication of wheat,and the genetic basis of agronomically important traits,which promote the breeding of elite *** this review,we focus on progress that has been made in genomic research and genetic improvement of traits such as grain yield,end-use traits,flowering regulation,nutrient use efficiency,and biotic and abiotic stress responses,and various breeding strategies that contributed mainly by Chinese *** genomic research in wheat is entering a new era with the availability of multiple reference wheat genome assemblies and the development of cutting-edge technologies such as precise genome editing tools,highthroughput phenotyping platforms,sequencing-based cloning strategies,high-efficiency genetic transformation systems,and speed-breeding *** insights will further extend our understanding of the molecular mechanisms and regulatory networks underlying agronomic traits and facilitate the breeding process,ultimately contributing to more sustainable agriculture in China and throughout the world.

关键词： wheat genomics genetic improvement China

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三种限水灌溉水平下中麦175干物质积累与水分利用特性解析

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中国农业科学 2018年第2期51卷 374-385页

作者：李法计徐学欣何中虎肖永贵陈新民王志敏中国农业科学院作物科学研究所/国家小麦改良中心中国农业大学农学院 CIMMYT中国办事处

【目的】中麦175是中国北部冬麦区水浇地和黄淮旱肥地大面积种植的水旱兼用型小麦品种。研究旨在明确其干物质积累和水分利用特征,揭示节水高产机理,为培育水旱兼用的广适型小麦新品种提供理论支撑和评价指标。【方法】在河北吴桥和北... 详细信息

【目的】中麦175是中国北部冬麦区水浇地和黄淮旱肥地大面积种植的水旱兼用型小麦品种。研究旨在明确其干物质积累和水分利用特征,揭示节水高产机理,为培育水旱兼用的广适型小麦新品种提供理论支撑和评价指标。【方法】在河北吴桥和北京顺义两个试验点,以中麦175和京冬17为试验材料,在3种限水灌溉(W0,全生育期不灌溉;W1,灌拔节水75 mm;W2,灌拔节水和开花水共150 mm)水平下,比较两个品种群体性能、干物质积累与分配、产量及水分利用效率(water use efficiency,WUE)等性状及其对供水的响应特征。【结果】两个品种的产量均在W2水平最高,随着灌水量减少产量降低;W0主要降低单位面积粒数(每平米穗数减少47—67穗,穗粒数减少1.6—5.1粒),W1主要降低千粒重(降低0.6—1.5 g)。水分亏缺显著降低蒸散量(ET)和群体生物量,但显著促进了花前积累的干物质向籽粒的转运,适度水分亏缺(W1)提高WUE。在3种灌溉水平下,中麦175的产量及其稳定性均优于京冬17,表现为穗数、花前干物质积累量及其向籽粒的转运量和转运率、收获指数(HI)均较高,灌浆期反映群体性能的归一化植被指数(NDVI)和气冠温差(CTD)指标值及反映品种抗旱性能的茎秆可溶性糖含量(WSC)含量均较高,全生育期ET和WUE较高,大部分产量性状的水分敏感性较弱。穗粒数和生物量对水分的敏感系数(WS)与产量对水分的WS呈密切相关性,而灌浆前期群体NDVI和CTD对水分的WS也与产量对水分的WS高度相关。【结论】前期干物质积累快、群体库容量大及花后群体性能稳定性强可能是中麦175节水高产的主要原因。不同供水条件下灌浆期群体NDVI和CTD的差异性可作为小麦品种对水分敏感性的快速综合评价指标。

关键词：冬小麦水分利用效率水分敏感系数可溶性糖含量产量

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甘肃小麦品种(系)面筋强度和糯蛋白基因分布规律研究

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麦类作物学报 2015年第7期35卷 933-939页

作者：杨芳萍杨莉郭莹何中虎李志虎夏先春甘肃省农业科学院小麦研究所甘肃兰州730070 中国农业科学院作物科学研究所北京100081 陇南高等师范专科学校甘肃成县742500

高分子量麦谷蛋白、1B/1R易位系和糯蛋白基因是影响小麦面包、面条和馒头加工品质的重要因素。为明确甘肃省小麦品种(系)品质状况,用Dx5、By8、By9、Bx7OE、1B/1R、Wx等基因的特异性分子标记鉴定其对应基因在甘肃4个麦区298份小麦材料... 详细信息

高分子量麦谷蛋白、1B/1R易位系和糯蛋白基因是影响小麦面包、面条和馒头加工品质的重要因素。为明确甘肃省小麦品种(系)品质状况,用Dx5、By8、By9、Bx7OE、1B/1R、Wx等基因的特异性分子标记鉴定其对应基因在甘肃4个麦区298份小麦材料中的存在状况。结果表明,甘肃省小麦品种(系)中被检测基因分布频率在不同生态区域存在一定差异,从西部到东南部,Dx5、By8、Bx7OE、Wx-B1b基因的检出频率逐渐降低,而By9基因和1B/1R易位系检出频率逐渐升高;春小麦中Dx5(46.4%)、By8(26.1%)、Bx7OE(1.4%)、Wx-B1b(14.4%)基因的检出频率明显高于冬小麦中Dx5(26.3%)、By8(25.0%)、Bx7OE(0)、Wx-B1b(7.5%)基因的检出频率;但春小麦By9(34.8%)基因、1B/1R易位系(27.5%)检出频率低于冬小麦By9(41.3%)、1B/1R(38.8%)的被检出频率。面筋强度和糯蛋白基因的分布频率表明甘肃省小麦品种(系)用于加工面包、面条和馒头的品质状况较差,且从西部到东南部品质逐渐变劣,春小麦品质优于冬小麦。甘肃省大部分小麦品种(系)仅适宜于加工普通馒头和面条。

关键词：小麦品种(系) 面筋强度糯蛋白分子检测品种改良

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小麦品质与馒头品质关系的研究

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中国粮油学报 2000年第2期15卷 10-14页

作者：刘爱华何中虎王光瑞王德森张艳周桂英中国农科院作物育种栽培研究所北京100081

选用我国主产麦区 71个小麦品种 (品系 )和 38个澳大利亚小麦品种 (品系 ) ,初步研究了小麦品质特性与北方馒头品质的关系。结果表明 :面粉蛋白质、沉降值、和面时间、形成时间、稳定时间与馒头体积和比容呈极显著正相关 ,与馒头外观呈... 详细信息

选用我国主产麦区 71个小麦品种 (品系 )和 38个澳大利亚小麦品种 (品系 ) ,初步研究了小麦品质特性与北方馒头品质的关系。结果表明 :面粉蛋白质、沉降值、和面时间、形成时间、稳定时间与馒头体积和比容呈极显著正相关 ,与馒头外观呈极显著负相关 ,适宜制作馒头的小麦面粉蛋白质含量中等偏高 ,面筋强度中等 ;澳大利亚小麦的面粉蛋白质含量、沉降值、和面时间、形成时间、稳定时间均大于中国小麦 ;两国小麦馒头品质相比 ,差别不大 ,仅在体积 ,外观和弹韧性上略有差别 ;黄淮冬麦区和北部冬麦区的小麦适宜制作优质馒头 ;筛选出小偃 6号等馒头品质优良的一批品种 ,有可能培育出面包

关键词：小麦品质馒头品质蛋白质面筋

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子宫肌瘤与卵巢肿瘤的CT诊断价值

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实用医技杂志 2017年第3期24卷 254-256页

作者：何中虎吴军平邓启伟广东省广州市增城区中新镇中心卫生院放射科 511365 广东省广州市增城区妇幼保健院放射科

目的探讨双螺旋CT在子宫肌瘤和卵巢肿瘤鉴别诊断中的临床应用价值。方法将经手术病理证实的79例子宫肌瘤患者和79例卵巢肿瘤患者进行回顾性分析,将2组患者通过双螺旋CT扫描检查仪,进行CT平扫及CT增强扫描,并比较2组的应用价值。结果卵... 详细信息

目的探讨双螺旋CT在子宫肌瘤和卵巢肿瘤鉴别诊断中的临床应用价值。方法将经手术病理证实的79例子宫肌瘤患者和79例卵巢肿瘤患者进行回顾性分析,将2组患者通过双螺旋CT扫描检查仪,进行CT平扫及CT增强扫描,并比较2组的应用价值。结果卵巢肿瘤组的卵巢静脉及卵巢动脉显示率分别是62%、85%,显著高于子宫肌瘤组的34%、62%,2组比较差异有统计学意义(P0.05)。结论双螺旋CT扫描检查能够清晰表现出肿瘤供血的现象,能够辅助子宫肌瘤和卵巢肿瘤的鉴别诊断,值得基层医院大力推广。

关键词：子宫肌瘤卵巢肿瘤 CT扫描鉴别诊断

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基于高光谱遥感和集成学习方法的冬小麦产量估测研究

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中国农业科学 2021年第16期54卷 3417-3427页

作者：费帅鹏禹小龙兰铭李雷夏先春何中虎肖永贵河南理工大学测绘与国土信息工程学院中国农业科学院作物科学研究所 3CIMMYT中国办事处

【目的】利用2种灌溉处理下不同发育阶段的冬小麦冠层高光谱信息,通过机器学习方法对小麦籽粒产量进行估测精度研究,明确产量最佳估测模型,对于育种工作有着重要应用价值。【方法】以黄淮麦区207个主栽小麦品种为材料,于2018—2019和201... 详细信息

【目的】利用2种灌溉处理下不同发育阶段的冬小麦冠层高光谱信息,通过机器学习方法对小麦籽粒产量进行估测精度研究,明确产量最佳估测模型,对于育种工作有着重要应用价值。【方法】以黄淮麦区207个主栽小麦品种为材料,于2018—2019和2019—2020年度连续2个生长季在河南省新乡基地的正常灌溉和节水处理下种植,并调查开花期、灌浆前期和灌浆中期的冠层高光谱数据,分别以6种机器学习方法和集成方法建立光谱指数产量估测模型。【结果】2种灌溉处理下,3个生育期各光谱指数均与产量呈极显著相关(P<0.0001),且表现出较高的遗传力(0.61-0.85),主要受遗传因素控制。在正常灌溉处理下,与传统机器学习方法表现最佳的模型相比,集成学习方法在3个生育期的平均决定系数(R~2)分别由0.610、0.611和0.640提高至0.649、0.612和0.675,平均均方根误差(RMSE)分别降低至0.607、0.612和0.593 t·hm;节水处理下,3个生育期的平均R2分别由0.461、0.408和0.452提高至0.467、0.433和0.498,平均RMSE分别降低至0.519、0.559和0.504 t·hm。【结论】利用集成方法将不同模型估测结果进行结合,能够有效地提高产量估测精度,2种灌溉处理下均在灌浆中期估测精度最佳,可为冬小麦育种工作中产量估测提供参考。

关键词：冬小麦产量高光谱集成方法机器学习

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沼液施用条件下添加浮萍对稻田氮素流失和Cu、Pb变化的影响

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中国生态农业学报（中英文） 2020年第4期28卷 608-618页

作者：宋蝶何忠虎董永华戴巍杨晓磊曹林奎沙之敏上海交通大学农业与生物学院上海200240 上海新农饲料股份有限公司上海201600 上海市农产品质量安全中心上海201799 上海市农业技术推广服务中心上海201103

养分流失和重金属积累是沼液还田资源化利用过程中的主要问题。为探讨利用浮萍吸收氮磷、富集重金属的能力调控沼液施用中环境污染问题的可行性,在上海市金山区开展了水稻田间试验,研究沼液施用条件下添加浮萍对稻田氮素流失和Cu、Pb的... 详细信息

养分流失和重金属积累是沼液还田资源化利用过程中的主要问题。为探讨利用浮萍吸收氮磷、富集重金属的能力调控沼液施用中环境污染问题的可行性,在上海市金山区开展了水稻田间试验,研究沼液施用条件下添加浮萍对稻田氮素流失和Cu、Pb的影响。试验设置4个处理:常规化肥、常规化肥+浮萍、沼液全量替代化肥和沼液全量替代化肥+浮萍,测定并比较了不同处理下稻田田面水氮素浓度变化、径流水氮素流失负荷,土壤、水稻籽粒及秸秆中Cu和Pb含量差异。结果表明:不同处理田面水总氮、铵态氮(NH4^+-N)浓度变化趋势基本一致,均在每次施肥后第1 d达到峰值,此后逐日递减,在施肥后第5 d降至峰值的30%以下;硝态氮(NO3^–-N)浓度峰值滞后3~7 d。稻田中添加浮萍能够显著降低田面水TN含量,沼液全量替代化肥+浮萍处理的TN总径流流失负荷为3.67 kg·hm^-2,比常规化肥处理显著降低37.2%。沼液全量替代化肥+浮萍处理土壤Cu和Pb含量为22.65 mg·kg^-1和49.05 mg·kg^-1,与其他处理间无显著差异;但土壤有效态Cu和Pb含量较常规化肥处理显著提高18.6%和17.5%。不同处理水稻秸秆Cu和Pb、籽粒Pb含量无显著差异,但沼液全量替代化肥+浮萍处理水稻籽粒Cu含量较沼液全量替代化肥处理显著减少41.1%。综上,沼液施用条件下添加浮萍可以降低稻田氮素流失,在控制土壤、籽粒和秸秆中重金属Cu和Pb含量增加方面具有一定效果,在短期内可以作为沼液还田模式下水体和土壤污染有效的调控手段。

关键词：稻田沼液浮萍氮素流失流失负荷重金属

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京411及其衍生系苗期氮和磷利用效率相关性状的遗传分析

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麦类作物学报 2015年第6期35卷 737-746页

作者：李法计肖永贵金松灿夏先春陈新民汪洪何中虎中国农业科学院作物科学研究所/国家小麦改良中心北京100081 河南省洛阳市种子管理站河南洛阳471000 中国农业科学院农业资源与农业区划研究所北京100081 CIMMYT中国办事处北京100081

为了研究小麦苗期氮、磷吸收及利用效率的遗传差异,以骨干亲本京411及其14份衍生后代为材料,在3个氮处理(Ca(NO3)2含量分别为0、0.05和2.0mmol·L-1)和3个磷处理(KH2PO4含量分别为0、0.005和0.25mmol·L-1)条件下分析不同基因型苗期营... 详细信息

为了研究小麦苗期氮、磷吸收及利用效率的遗传差异,以骨干亲本京411及其14份衍生后代为材料,在3个氮处理(Ca(NO3)2含量分别为0、0.05和2.0mmol·L-1)和3个磷处理(KH2PO4含量分别为0、0.005和0.25mmol·L-1)条件下分析不同基因型苗期营养利用效率及相关性状,并结合90kSNP芯片分析氮、磷吸收及利用效率相关遗传区段,以及京411携带的重要区段的传递和分布。结果表明,供试品种(系)的氮、磷吸收及利用效率存在较大遗传变异,京411和CA0958的氮吸收量和农学效率较高,北京0045、中麦175和CA0816R的氮利用效率较高,09抗1027、CA9722、中麦415和CA1133具有较强的耐低氮能力;09抗1027、北京0045和CA1133的磷吸收量较高,中麦175和CA9722的磷利用效率较高,CA0958和北京0045具有较高的磷农学效率,中麦175和CA1055具有较强的耐低磷能力。A和B染色体组在小麦苗期氮和磷吸收及利用中的作用可能大于D染色体组。3B和4B染色体上各存在一个在低磷和高磷条件下对苗期磷利用效率均有影响的位点,1B和2A染色体上各存在一个在不施磷和低磷条件下均表现较强耐低磷能力的位点。氮、磷吸收及利用效率可能具有相同或相似的遗传背景。中麦175与骨干亲本的氮、磷吸收及利用效率相同位点较多,且含有较多的正向效应位点,同时在苗期表现出了较强的氮、磷吸收及利用效率,其在实际生产中表现为高产且水肥利用效率高,是京411的优良衍生后代。

关键词：普通小麦骨干亲本衍生系氮和磷利用效率 SNP标记

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螺旋CT三维重建技术在诊断腰椎滑脱症中的应用价值

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国际医药卫生导报 2016年第15期22卷 2243-2247页

作者：何中虎吴军平虞勇欧志强广州市增城区中新镇中心卫生院放射科 511365 广州市白云区人民医院放射科 510500 广州市红十字会医院放射科 510220

目的探讨螺旋CT三维重建技术在腰椎滑脱症诊断中的临床应用效果。方法选择本院放射科及广州市白云区人民医院放射科的56例腰椎滑脱症病人的x线片、CT及螺旋CT三维重建图像，结合术中椎弓根钉定位及对于是否为峡部裂的不同处理，分析螺... 详细信息

目的探讨螺旋CT三维重建技术在腰椎滑脱症诊断中的临床应用效果。方法选择本院放射科及广州市白云区人民医院放射科的56例腰椎滑脱症病人的x线片、CT及螺旋CT三维重建图像，结合术中椎弓根钉定位及对于是否为峡部裂的不同处理，分析螺旋CT三维重建在腰椎滑脱症中的诊断价值。结果56例中2例为侧方滑脱，其他均为腰椎前滑脱，三种检查方法对椎弓峡部的成像存在不同，螺旋CT三维重建可清楚显示椎弓峡部的全貌和裂隙，指导手术定位。结论螺旋CT三维重建能较好地评价椎弓峡部裂所致的病理解剖改变，科学合理地完善手术诊疗方案，通过CT图像三维重建技术充分显示病变，判断腰椎滑脱的性质与精确测量滑脱的程度，利于临床制定合理的诊疗方案，具有很大的优越性及应用前景。

关键词：腰椎滑脱症螺旋CT 三维重建

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甘肃小麦品种(系)面制品色泽相关基因的分布规律

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麦类作物学报 2015年第8期35卷 1091-1097页

作者：杨芳萍刘亚男郭莹冯楠何中虎李志虎夏先春甘肃省农业科学院小麦研究所甘肃兰州730070 中国农业科学院作物科学研究所北京100081 陇南高等师范专科学校甘肃成县742500

黄色素含量、多酚氧化酶、脂肪氧化酶和1B/1R易位系对小麦面粉和面团的外观品质影响很大。为明确甘肃省小麦品种（系）面粉色泽相关基因的分布状况,用Psy-A1、Ppo-A1、Ppo-D1、Ta Lox-B1和1B/1R易位系等特异性分子标记鉴定对应的基因。... 详细信息

黄色素含量、多酚氧化酶、脂肪氧化酶和1B/1R易位系对小麦面粉和面团的外观品质影响很大。为明确甘肃省小麦品种（系）面粉色泽相关基因的分布状况,用Psy-A1、Ppo-A1、Ppo-D1、Ta Lox-B1和1B/1R易位系等特异性分子标记鉴定对应的基因。结果表明,甘肃省冬、春小麦品种（系）面制品色泽相关基因等位变异分布频率存在一定差异;Psy-A1 a（68.1%）在被检测小麦品种（系）中为优势的黄色素含量基因等位变异,且在春小麦中的分布频率低于冬小麦;2AL染色体上高PPO活性等位变异Ppo-A1 a,除天水麦区分布频率（58%）较低外,其余麦区的分布频率均较高（72.4%-82.3%）;2DL染色体高PPO活性等位变异Ppo-D1 b在春小麦中分布频率较冬小麦低;2AL、2DL染色体PPO活性等位基因组合Ppo-A1 a/Ppo-D1 b（高活性）、PpoA1 a/Ppo-D1 a（中高活性）明显比Ppo-A1 b/Ppo-D1 b（中高活性）和Ppo-A1 b/Ppo-D1 a（低活性）分布频率高;甘肃省小麦品种（系）PPO活性从西部到东南逐渐增强。高活性LOX基因Ta Lox-B1 a分布频率在各麦区均较低;从甘肃省西部到东南部1B/1R易位系分布频率逐渐升高。色泽相关基因分布频率说明,甘肃省小麦品种（系）的优异色泽等位变异分布频率低,色泽品质状况较差,春小麦优于冬小麦。大部分材料仅适宜于加工普通馒头和面条。

关键词：甘肃小麦品种(系) 色泽相关基因分子检测品种改良

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