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Xa1 Allelic R Genes Activate Rice Blight Resistance Suppressed by Interfering TAL Effectors

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Plant Communications 2020年第4期1卷 54-62页

作者： Chonghui ji zhiyuan ji Bo Liu He Cheng Hua Liu Sanzhen Liu Bing Yang Gongyou Chen Division of Plant Sciences C.Bond Life Science CenterUniversity of MissouriColumbiaMO 65211USA School of Agriculture and Biology/State Key Laboratory of Microbial Metabolism Shanghai Jiao Tong UniversityShanghai 200240P.R.China National Key Facility for Crop Gene Resources and Genetic Improvement(NFCRI) Institute of Crop SciencesChinese Academy of Agricultural SciencesBeijing 100081P.R.China Department of Plant Pathology Kansas State UniversityManhattanKS 66506USA Donald Danforth Plant Science Center St.LouisMO 63132USA

Xanthomonas oryzae pathovar oryzae(Xoo)uses transcription activator-like effectors(TALEs)to cause bacterial blight(BB)in *** turn,rice has evolved several mechanisms to resist BB by targeting *** mechanism involves the nucleotide-binding leucine-rich repeat(NLR)resistance gene Xa1 and ***,Xoo has evolved TALE variants,C-terminally truncated versions(interfering TALEs or iTALEs),to overcome Xa1 ***,it remains unknown to what extent the two co-adaptive mechanisms mediate Xoo–rice *** this study,we cloned and characterized five additional Xa1 allelic R genes,Xa2,Xa31(t),Xa14,CGS-Xo111,and Xa45(t)from a collection of rice *** analysis revealed that Xa2 and Xa31(t)from different rice cultivars are *** genes and their predicted proteins were found to be highly conserved,forming a group of Xa1 *** XA1 alleles could be distinguished by the number of C-terminal tandemrepeats consisting of 93 amino acid residues and ranged from four in XA14 to seven in XA45(t).Xa1 allelic genes were identified in the 3000 rice genomes *** the other hand,iTALEs could suppress the resistance mediated by Xa1 allelic R genes,and iTALE genes were prevalent(95%)in Asian,but not in African Xoo *** findings demonstrate the prominence of a defense mechanism in which rice depends on Xa1 alleles and a counteracting mechanismin which Xoo relies on iTALEs for BB.

关键词： Xa2 Xa14 Xa45(t) TAL effector iTAL effector bacterial blight

Engineering Broad-Spectrum Resistance to Bacterial Blight by CRISPR/Cas9-Mediated Precise Homology Directed Repair in Rice

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Molecular Plant 2021年第8期14卷 1215-1218页

作者： Zheng Wei Mohamed Abdelrahman Ying Gao zhiyuan ji Rukmini Mishra Hongda Sun Yi Sui Chuanyin Wu Chunlian Wang Kaijun Zhao National Key Facility for-Crop Gene Resources and Genetic Improvement Institute of Crop SciencesChinese Academy of Agricultural SciencesBeijingChina Rice Research and Training Center Field Crops Research InstituteAgricultural Research CenterKafrelsheikhEgypt

Dear Editor,Rice(Oryza sativa)is one of the most important food crops as well as a model plant for basic *** bacterial blight(BB)caused by Xanthomonas oryzae ***(Xoo)is a devastating bacterial disease worldwide(Mew et al.,1993),affecting millions of hectares of rice annually,with an estimated crop loss of as high as 75%.Upon invasion of rice cells,Xoo secretes transcription activator-like effectors(TALEs)to activate the host Sugars Will Eventually be Exported Transporters(SWEET)genes to obtain nutrition for bacterial growth,because the induced SWEET transports more sugars to where the bacteria reside(Boch and Bonas,2010).

关键词： sativa CRISPR/Cas9 blight

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国家科技计划执行研究:困境及对策初探

中国科技论坛 2014年第8期 5-10页

作者：嵇智源智强科学技术部高技术研究发展中心北京100044 中央财经大学北京100081

国家科技计划作为我国支持科技创新的重要政策工具,是实施创新驱动战略的重要组成部分。本文基于国家科技计划的执行实践,以国家863计划为例,对目标导向型国家研发计划的过程管理中存在的现实困境进行归纳和提炼,分析创新驱动战略下科... 详细信息

国家科技计划作为我国支持科技创新的重要政策工具,是实施创新驱动战略的重要组成部分。本文基于国家科技计划的执行实践,以国家863计划为例,对目标导向型国家研发计划的过程管理中存在的现实困境进行归纳和提炼,分析创新驱动战略下科技计划管理面临的制度困境、选择困境和风险困境,并针对这些困境提出政策建议,以期对完善科技计划管理制度提供参考。

关键词：创新驱动科技计划执行困境对策

A Potential Disease Susceptibility Gene CsLOB of Citrus Is Targeted by a Major Virulence Effector PthA of Xanthomonas citri subsp, citri

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Molecular Plant 2014年第5期7卷 912-915页

作者： Zheng Li Lifang Zou Gang Ye Li Xiong zhiyuan ji Muhammad Zakria Ni Hong Guoping Wang Gongyou Chen School of Agriculture and Biology Shanghai Jiao Tong University Shanghai 200240 China State Key Laboratory of Microbial Metabolism School of Life Science &Biotechnology Shanghai Jiao Tong University Shanghai 200240 China National Key Laboratory of Agromicrobiology Huazhong Agricultural University Wuhan Hubei 430070 China

Dear Editor, Citrus bacterial canker （CBC）, one of the most destructive diseases of citrus, has a severe economic impact on citrus industries in tropical and subtropical countries （Das, 2003）. It has been widely known that Xanthomonas citri subsp, citri （Xcc） causes the CBC by transferring the type-Ill effectors （T3SEs） to the interior of the plant cell through type-Ill secretion system （T3S） to modulate transcription of host plants to trigger CBC disease （Schaad et al., 2006）. Pathotype A,

关键词：柑橘属黄单胞菌属基因疾病易感性内皮缩血管肽类胰岛素植物转录遗传

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3种方法测定水中粪便污染指示菌比较研究

工业水处理 2013年第10期33卷 79-82页

作者：嵇志远翁天楚杭州市水务控股集团有限公司水质监测中心浙江杭州310014

分别采用多管发酵法、滤膜法和酶底物法测定水中总大肠菌群、粪大肠菌群和大肠埃希氏菌,对3种方法的精密度、检测结果的一致性等进行了比较,总结得出水质检测实验室对此3个主要细菌学项目最佳的测定方法选择。结果表明,对清洁水样的检... 详细信息

分别采用多管发酵法、滤膜法和酶底物法测定水中总大肠菌群、粪大肠菌群和大肠埃希氏菌,对3种方法的精密度、检测结果的一致性等进行了比较,总结得出水质检测实验室对此3个主要细菌学项目最佳的测定方法选择。结果表明,对清洁水样的检测可以选择滤膜法作为第一法,对重度污染水样的检测可以选择酶底物法作为第一法。

关键词：多管发酵法滤膜法酶底物法总大肠菌群粪大肠菌群大肠埃希氏菌

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基于道路环境上下文的行人跟踪方法

计算机应用 2015年第8期35卷 2311-2315,2326页

作者：方义嵇智源盛浩中航发动机控股有限公司科技与信息化部北京101304 中华人民共和国科学技术部高技术研究发展中心北京100044 北京航空航天大学计算机学院北京100191

针对目前城市交通中人车混行场景中行人跟踪效果不佳的问题,提出了一种基于道路环境上下文的行人跟踪方法。首先通过对道路环境上下文进行分析,建立道路模型;其次在道路模型的约束下建立行人与环境的交互运动模型;最后利用该模型进行行... 详细信息

针对目前城市交通中人车混行场景中行人跟踪效果不佳的问题,提出了一种基于道路环境上下文的行人跟踪方法。首先通过对道路环境上下文进行分析,建立道路模型;其次在道路模型的约束下建立行人与环境的交互运动模型;最后利用该模型进行行人的跟踪。在真实场景中的实验表明使用了道路上下文信息的跟踪方法与连续离散连续能量最小化的多行人跟踪方法相比,多目标跟踪准确度从47.6%提升至63.2%,多目标跟踪精度从68.8%提升至74.3%。数值结果表明道路上下文信息对于提高人车混行场景中行人跟踪效果的有效性。

关键词：多行人跟踪人车混行环境上下文道路模型环境交互

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含氯消毒剂处理城镇污水投加量的快速测定

环境卫生工程 2015年第3期23卷 48-49,52页

作者：嵇志远杭州市水务控股集团有限公司水质监测中心浙江杭州310014

通过采集一定量污水处理厂未经消毒处理的水样,在实验室中对样品进行氯水杀菌消毒小试实验,研究含氯消毒剂投加量和接触时间对污水消毒效果的影响,结果表明:在每吨水中投加3.88 g效价(有效氯)的含氯消毒剂并接触20 min后,采用可快速测... 详细信息

通过采集一定量污水处理厂未经消毒处理的水样,在实验室中对样品进行氯水杀菌消毒小试实验,研究含氯消毒剂投加量和接触时间对污水消毒效果的影响,结果表明:在每吨水中投加3.88 g效价(有效氯)的含氯消毒剂并接触20 min后,采用可快速测定的酶底物法检测消毒后水样的粪大肠菌群指标能够达到国家标准的排放限值要求。

关键词：含氯消毒剂剂量接触时间酶底物法粪大肠菌群排放限值

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分布式进化算法的性能测试与分析

计算机应用 2014年第11期34卷 3086-3090页

作者：陈炳亮张宇辉嵇智源华南农业大学理学院广州510642 中山大学计算机科学系广州510006 科技部高技术研究发展中心北京100044

针对分布式进化算法设计过程中由于缺乏对性能影响因素的分析而导致算法无法达到预期加速比的问题,提出一种全面的性能分析方法。根据分布式进化算法的组成结构,将影响分布式进化算法性能的因素分为进化操作开销、适应值计算开销和通信... 详细信息

针对分布式进化算法设计过程中由于缺乏对性能影响因素的分析而导致算法无法达到预期加速比的问题,提出一种全面的性能分析方法。根据分布式进化算法的组成结构,将影响分布式进化算法性能的因素分为进化操作开销、适应值计算开销和通信开销三个部分。首先研究进化算法在不同个体编码维数下进化操作开销的特性;其次,在进化操作开销相对固定的情况下,通过使用操作系统的延时函数控制适应值计算开销,通过改变个体编码维数控制通信开销;最后,应用控制变量方法,逐一测试各因素对算法加速比的影响。实验结果展现了三种因素的相互制约关系,给出了分布式进化算法获得更好加速比的条件。

关键词：分布式进化算法分布式模型遗传算法粒子群优化算法性能分析

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非线性弹性有限条分析

上海力学 1992年第1期13卷 30-37页

作者：曹志远张耀勤同济大学浙江计算技术所

本文探讨适用于板壳结构物理非线性分析的半解析有限元法,可用以求解各种材料,任意形状与边界以及变厚度的平板与柱壳问题,将在很大程度上节省计算工作量。文中还讨论了非线性特性的结构效应。

关键词：非线性弹性有限条法板壳