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The“depict”strategy for discovering new compounds in complex matrices:Lycibarbarspermidines as a case

Journal of Pharmaceutical Analysis 2024年第3期14卷 416-426页

作者： Chen Han Zhixin Zhang zhiyang feng Chuanjia Zhai Xuejiao Li Yulian Shi Xiang Li Miao Li Ying Wang Gan Luo Xiaoyan Gao Department of Chinese Medicine Analysis School of Chinese Materia MedicaBeijing University of Chinese MedicineBeijing102488China

The comprehensive detection and identification of active ingredients in complex matrices is a crucial *** chromatography coupled with high-resolution mass spectrometry(LC-HRMS)is the most prominent analytical platform for the exploration of novel active compounds from complex ***,the LC-HRMS-based analysis workflow suffers from several bottleneck issues,such as trace content of target compounds,limited acquisition for fragment information,and uncertainty in interpreting relevant MS2 *** are vital antioxidant active ingredients in Lycii Fructus,while the reported structures are merely focused on dicaffeoylspermidines due to their low *** comprehensively detect the new structures of lycibarbarspermidine derivatives,a“depict”strategy was developed in this ***,potential new lycibarbarspermidine derivatives were designed according to the biosynthetic pathway,and a comprehensive database was established,which enlarged the coverage of lycibarbarspermidine ***,the polarity-oriented sample preparation of potential new compounds increased the concentration of the target ***,the construction of the molecular network based on the fragmentation pathway of lycibarbarspermidine derivatives broadened the comprehensiveness of ***,the weak response signals were captured by data-dependent scanning(DDA)followed by parallel reaction monitoring(PRM),and the efficiency of acquiring MS2 fragment ions of target compounds was significantly *** on the integrated strategy above,210 lycibarbarspermidine derivatives were detected and identified from Lycii Fructus,and in particular,170 potential new compounds were structurally *** integrated strategy improved the sensitivity of detection and the coverage of low-response components,and it is expected to be a promising pipeline for discovering new compounds.

关键词： Mass spectrometric detection Weak response signals Complex matrices Novel lycibarbarspermidines

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近代中国蚕业国族话语的兴起和传播

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学术月刊 2024年第5期56卷 203-216页

作者：冯志阳上海社会科学院历史研究所上海200235

蚕业在中国有数千年的历史,但“蚕丝祖国”的观念至20世纪初才出现。它的起源与国族话语在近代中国的兴起和传播有关。蚕业国族话语在蚕丝国际贸易的语境中产生,并与近代中国的国族转型密切关联。20世纪初,中国蚕丝出口被日本赶超,蚕学... 详细信息

蚕业在中国有数千年的历史,但“蚕丝祖国”的观念至20世纪初才出现。它的起源与国族话语在近代中国的兴起和传播有关。蚕业国族话语在蚕丝国际贸易的语境中产生,并与近代中国的国族转型密切关联。20世纪初,中国蚕丝出口被日本赶超,蚕学界人士在焦虑和不甘中,试图用“蚕丝祖国”观念激励国人奋起直追。他们将传统文献中零散的蚕业“记录”整合为具有整体意义的“中国蚕业史”,并结合蚕业考古,系统论证“蚕丝祖国”观念,使之得到学理支撑,成为国人耳熟能详的常识。“中国蚕业史”是近代中国蚕丝国际贸易、蚕业学术共同塑造的,成为当下蚕业学科体系进一步推进的基础和前提。

关键词：中国丝蚕丝贸易蚕业国族话语中国蚕业史

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宏基因组来源高活性酯酶的鉴定及其酶学性质表征

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食品与发酵工业 2024年第5期50卷 22-28页

作者：张颖董耀吕云斌王绍琛冯治洋南京农业大学食品科技学院江苏南京210000

土壤中大量的非培养微生物是新酶发现的重要资源。该研究利用功能宏基因组学策略筛选获得高活性酯酶,并对其进行鉴定分析。采用三丁酸甘油酯平板法对土壤微生物宏基因组文库中具有酯酶活性的克隆进行筛选,获得高活性的阳性克隆,通过生... 详细信息

土壤中大量的非培养微生物是新酶发现的重要资源。该研究利用功能宏基因组学策略筛选获得高活性酯酶,并对其进行鉴定分析。采用三丁酸甘油酯平板法对土壤微生物宏基因组文库中具有酯酶活性的克隆进行筛选,获得高活性的阳性克隆,通过生物信息学分析和生化实验对酯酶的酶学性质进行研究表征。获得一个比活力高达(3 957±3) U/mg的酯酶AesZF899,该酯酶为不含信号肽的酯酶第四家族胞内酯酶,蛋白大小34 kDa,与来自Afipia sp.P52-10中未表征的α/β水解酶(GenBank登录号为WP_034470467.1)一致性达76.43%。AesZF899的最佳底物为对硝基苯乙酸酯,酶反应的最适pH值和最适温度分别是9.0和40℃。AesZF899在30℃温育8 h后仍可保持初始活性,在35、40℃分别温育7和4 h后仍可保持50%的活性,在反应温度大于80℃后酶活性丧失。终浓度10 mmol/L的Fe3+可以增强酶活性,而终浓度10 mmol/L的Na+、Li+和Mg2+有较强的抑制作用。体积分数为1%二甲基亚砜可以增强酶活性,异戊醇也对酶活性有一定的促进作用。

关键词：酯酶 HSL家族宏基因组异源表达高活性

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Efficient measurement and optical proximity correction modeling to catch lithography pattern shift issues of arbitrarily distributed hole layer

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FRONTIERS OF MECHANICAL ENGINEERING 2024年第4期19卷 24-24页

作者： feng, Yaobin Liu, Jiamin Song, zhiyang Jiang, Hao Liu, Shiyuan Huazhong Univ Sci & Technol State Key Lab Intelligent Mfg Equipment & Technol Wuhan 430074 Peoples R China Opt Valley Lab Wuhan 430074 Peoples R China

With the continued shrinking of the critical dimensions (CDs) of wafer patterning, the requirements for modeling precision in optical proximity correction (OPC) increase accordingly. This requirement extends beyond CD controlling accuracy to include pattern alignment accuracy because misalignment can lead to considerable overlay and metal-via coverage issues at advanced nodes, affecting process window and yield. This paper proposes an efficient OPC modeling approach that prioritizes pattern-shift-related elements to tackle the issue accurately. Our method integrates careful measurement selection, the implementation of pattern-shift-aware structures in design, and the manipulation of the cost function during model tuning to establish a robust model. Confirmatory experiments are performed on a via layer fabricated using a negative tone development. Results demonstrate that pattern shifts can be constrained within a range of +/- 1 nm, remarkably better than the original range of +/- 3 nm. Furthermore, simulations reveal notable differences between post OPC and original masks when considering pattern shifts at locations sensitive to this phenomenon. Experimental validation confirms the accuracy of the proposed modeling approach, and a firm consistency is observed between the simulation results and experimental data obtained from actual design structures.

关键词： computational lithography optical proximity correction modeling pattern shift metrology AERIAL IMAGE OPC

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Dynamic cooperations between lattice oxygen and oxygen vacancies for photocatalytic ethane dehydrogenation by a self-restoring LaVO_(4)catalyst

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Chinese Chemical Letters 2024年第3期35卷 171-176页

作者： Fen Wei Weichao Xue zhiyang Yu Xue feng Lu Sibo Wang Wei Lin Xinchen Wang State Key Laboratory of Photocatalysis on Energy and Environment College of ChemistryFuzhou UniversityFuzhou 350108China

Thermocatalytic nonoxidative ethane dehydrogenation(EDH)is a promising strategy for ethene production but suffers from intense energy consumption and poor catalyst durability;exploring technology that permits efficient EDH by solar energy remains a giant ***,we present that an oxygen vacancy(O_v)-rich LaVO_(4)(LaVO_(4)-O_v)catalyst is highly active and stable for photocatalytic EDH,through a dynamic lattice oxygen(O_(latt.))and O_(v)co-mediated *** by simulated sunlight at mild conditions,LaVO_(4)-O_(v)effectively dehydrogenates undiluted ethane to produce C_(2)H_(4)and CO with a conversion of 2.3%.By loading a small amount of Pt cocatalyst,the evolution and selectivity of C_(2)H_(4)are enhanced to 275μmol h^(-1)g^(-1)and 96.8%.Of note,LaVO_(4)-O_(v)appears nearly no carbon deposition after the *** isotope tracked reactions reveal that the consumed O_(latt.)recuperates by exposing the used catalyst with O_(2),thus establishing a dynamic cycle of O_(latt.)and achieving a facile catalyst regeneration to preserve its intrinsic *** refreshed LaVO_(4)-O_(v)exhibits superior reusability and delivers a turnover number of about *** O_(v)promotes photo absorption,boosts ethane adsorption/activation,and accelerates charge separation/transfer,thus improving the photocatalytic *** possible photocatalytic EDH mechanism is proposed,considering the key intermediates predicted by density functional theory(DFT)and monitored by in-situ diffuse reflectance infrared Fourier transform spectroscopy(DRIFTS).

关键词： Photocatalysis Ethane dehydrogenation Ethene LaVO_(4) Oxygen vacancy

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基于序列宏基因组学技术的土壤Ⅱ型聚酮合酶KS_α基因的挖掘

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南京农业大学学报 2020年第2期43卷 356-363页

作者：计青青冯治洋南京农业大学食品科学技术学院

[目的]本文旨在挖掘土壤微生物宏基因组(environmental DNA,eDNA)中的Ⅱ型聚酮化合物酮基合成酶基因(ketosynthase alpha,KSα),并依据获得的KSα基因与化合物结构的关系初步预测其所在基因簇可能合成的Ⅱ型聚酮化合物种类。[方法]利用... 详细信息

[目的]本文旨在挖掘土壤微生物宏基因组(environmental DNA,eDNA)中的Ⅱ型聚酮化合物酮基合成酶基因(ketosynthase alpha,KSα),并依据获得的KSα基因与化合物结构的关系初步预测其所在基因簇可能合成的Ⅱ型聚酮化合物种类。[方法]利用Ⅱ型聚酮合酶基因KSα保守区域设计简并引物筛选珠穆朗玛峰及峨眉山土壤宏基因组文库,对筛选得到的KSα基因片段进行测序,并与已知Ⅱ型聚酮化合物KSα基因、孢子色素基因的氨基酸序列用邻接法构建系统发生树,以大肠杆菌的fabB基因作为系统发生树的外群。[结果]总共筛选得到28个珠峰文库来源的KSα基因,11个峨眉山文库来源的KSα基因。将这些KSα基因的氨基酸序列与34种编码已知Ⅱ型聚酮化合物KSα基因和5种聚酮化合物孢子色素KSα基因的氨基酸序列构建系统发生树,结果显示许多eDNA来源的KSα基因与已知聚酮化合物的KSα基因的氨基酸序列相似性较低,并且除在不同Ⅱ型聚酮结构类型对应的KSα基因分支中均有分布外,有些eDNA来源KSα基因在系统发生树中形成了独立的一个分支。[结论]利用宏基因组学方法可以获得新的KSα基因,通过新基因与已知KSα基因的同源比对,可以预测新基因所合成化合物的新颖性,为新化合物的发现奠定基础。

关键词：宏基因组学序列筛选 Ⅱ型聚酮合酶系统发生树

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云南土壤宏基因组文库中替加环素耐药基因的筛选与分析

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微生物学通报 2021年第6期48卷 2089-2100页

作者：雷蕾冯治洋南京农业大学食品科技学院江苏南京210095

【背景】随着抗生素的广泛应用以及滥用,出现了多重耐药的"超级细菌",并且在临床上已出现对治疗"超级细菌"感染的最后一线抗生素——替加环素耐药的细菌。【目的】对土壤环境中存在的替加环素耐药基因进行筛选调查,探讨替加环素耐药机制... 详细信息

【背景】随着抗生素的广泛应用以及滥用,出现了多重耐药的"超级细菌",并且在临床上已出现对治疗"超级细菌"感染的最后一线抗生素——替加环素耐药的细菌。【目的】对土壤环境中存在的替加环素耐药基因进行筛选调查,探讨替加环素耐药机制,为临床抗生素治疗提供借鉴。【方法】利用功能宏基因组学技术对土壤宏基因组文库进行替加环素耐药阳性克隆的筛选和耐药亚克隆的构建,对构建成功的亚克隆进行测序和生物信息学分析探知其功能,同时进行最低抑菌浓度(Minimum Inhibitory Concentration,MIC)的测定。【结果】筛选得到一个四环素抗性Major Facilitator Superfamily(MFS)外排泵基因,携带该基因的菌株对四环素类抗生素均耐药,对替加环素和四环素的MIC值分别为16μg/mL和32μg/mL。当MFS外排泵抑制剂羰基氰化物间氯苯腙(CarbonylCyanide3-Chlorophenylhydrazone,CCCP)浓度为4μg/mL时可以抑制其对四环素类抗生素的外排作用。生物信息学结果表明该基因编码483个氨基酸,编码的蛋白质属于疏水稳定蛋白;其含有的14个跨膜区构成MFS外排泵蛋白典型的14次跨膜螺旋保守结构域;系统进化树分析表明其与其他替加环素耐药基因编码的蛋白质位于不同的分支上,相似性较低。【结论】利用功能宏基因组学技术筛选得到一个有替加环素抗性的MFS外排泵基因,编码的蛋白质属于14次跨膜螺旋MFS外排泵家族,为今后研究替加环素耐药机制提供参考。

关键词：土壤功能宏基因组学替加环素耐药基因 Major Facilitator Superfamily外排泵

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土壤宏基因组文库中纤维素酶的筛选与鉴定

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应用与环境生物学报 2020年第2期26卷 299-305页

作者：赵陈阁柴树茂冯治洋南京农业大学食品科技学院南京210095

纤维素酶是最重要的工业用酶之一,已广泛应用于食品、纺织、造纸、洗涤和生物燃料生产等多个领域中.为挖掘微生物来源的纤维素酶,基于功能宏基因组学的方法,筛选云南土壤宏基因组文库获得具有纤维素酶活性的阳性克隆;通过构建亚克隆和... 详细信息

纤维素酶是最重要的工业用酶之一,已广泛应用于食品、纺织、造纸、洗涤和生物燃料生产等多个领域中.为挖掘微生物来源的纤维素酶,基于功能宏基因组学的方法,筛选云南土壤宏基因组文库获得具有纤维素酶活性的阳性克隆;通过构建亚克隆和测序分析确定纤维素酶的编码基因,将其克隆到表达载体上并转化到大肠杆菌中构建重组表达系统,诱导蛋白表达后对纤维素酶酶学性质进行分析.通过筛选约65万个文库克隆,获得一个有纤维素酶水解活性的克隆,预测该纤维素酶基因全长为1 419 bp,编码蛋白分子量(Mr)为50.99×103,蛋白的氨基酸序列与Rhizobacter sp.S-16中的内切葡聚糖酶有88.66%的相似性,蛋白同源比对结果表明该酶属于糖苷水解酶第五家族(GH5),将其命名为YNEG5;对YNEG5的生化特性进行分析,确定其最佳反应温度为66℃,最适pH为4.8,该酶热稳定性良好且对工业试剂尿素具有较强的耐受性.本研究基于功能宏基因组学技术获得一个具有工业应用潜能的纤维素酶,可为不可培养微生物中纤维素酶的挖掘提供参考.(图10表1参36)

关键词：功能宏基因组学土壤宏基因组文库纤维素酶酶学性质

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热处理工艺对中碳低合金钢力学性能的影响

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材料研究学报 2015年第6期29卷 422-428页

作者：潘伟李祖来山泉蒋业华冯志扬周荣昆明理工大学材料科学与工程学院昆明650093

用水冷+盐浴等温淬火、空冷+盐浴等温淬火和直接盐浴等温淬火等方式对中碳低合金钢进行热处理,借助彩色金相技术和XRD分析方法研究了热处理方式对合金钢组织、力学性能的影响,并探索了性能与组织的关联性。结果表明,对中碳低合金钢进行... 详细信息

用水冷+盐浴等温淬火、空冷+盐浴等温淬火和直接盐浴等温淬火等方式对中碳低合金钢进行热处理,借助彩色金相技术和XRD分析方法研究了热处理方式对合金钢组织、力学性能的影响,并探索了性能与组织的关联性。结果表明,对中碳低合金钢进行空冷+盐浴等温淬火和水冷+盐浴等温淬火热处理,可得到不同下贝氏体含量的贝氏体/马氏体复相组织,材料的性能比铸态有大幅度地提高,冲击韧性提高92%-183%、硬度提高31%-55%。对材料进行空冷+盐浴等温淬火热处理,随着空冷时间的增加复相组织中下贝氏体含量逐渐降低、马氏体含量逐渐升高,而硬度和冲击韧性分别呈增加和降低趋势。中碳低合金钢的性能与各组织的含量密切相关,当下贝氏体含量为30%-40%、马氏体含量50%-60%时,贝氏体/马氏体复相组织强韧性匹配较好,材料具有较高的综合性能。

关键词：金属材料贝氏体/马氏体复相组织等温淬火彩色金相韧性断裂

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微网系统并网/孤岛运行模式无缝切换控制策略

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中国电机工程学报 2014年第19期34卷 3089-3097页

作者：陈杰陈新冯志阳龚春英严仰光江苏省新能源发电与电能变换重点实验室(南京航空航天大学) 江苏省南京市210016 江苏中天科技股份有限公司江苏省南通市226009

对于采用主从控制策略的微网系统,如何实现并网/孤岛工作模式之间的无缝切换是一项亟待克服的技术难点。首先介绍微网系统的基本结构和工作模式,结合微网系统并网/孤岛工作模式切换时的工作特征,提出一种改进的电压环调节器结构。即根... 详细信息

对于采用主从控制策略的微网系统,如何实现并网/孤岛工作模式之间的无缝切换是一项亟待克服的技术难点。首先介绍微网系统的基本结构和工作模式,结合微网系统并网/孤岛工作模式切换时的工作特征,提出一种改进的电压环调节器结构。即根据能量守恒原则,在工作模式切换前预先估算并设置调节器的输出需求,可较好地解决切换过程中微网母线电压的震荡和电流冲击等问题。其次,提出一种适合微网的软件锁相方法,保证各种切换条件下微网母线电压相位的连续性和平顺性,为不同工作模式间的无缝切换奠定基础,并对储能变流器的控制参数进行了优化设计。最后,建立微网系统的仿真模型和完善的实验验证平台,仿真和实验结果共同验证了所提控制策略和锁相方法的有效性和优越性。

关键词：微网主从控制并网运行孤岛运行无缝切换

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