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Structure modeling and spatial epitope analysis for HA protein of the novel H1N1 influenza virus

Chinese Science Bulletin 2009年第13期54卷 2171-2173页

作者： WU Di XU TianLei SUN Jing DAI JianXin DING GuoHui HE YunGang ZHOU ZhengFeng XIONG Hui DONG Hui JIN WeiRong BIAN Chao JIN Li WANG HongYan WANG XiaoNing YANG Zhong ZHONG Yang WANG Hao CHE XiaoYan HUANG Zhong LAN Ke SUN Bing WU Fan YUAN ZhenAn ZHANG Xi ZHOU XiaoNong ZHOU JiaHai MA ZhiYong TONG GuangZhi GUO YaJun ZHAO GuoPing LI YiXue cao zhiwei School of Life Sciences and Technology Tongji University Shanghai 200092 China Shanghai Center for Bioinformation Technology Shanghai 200235 China School of Life Sciences Fudan University Shanghai 200433 China Cancer Institute of the Second Military Medical University Shanghai 200433 China School of Life Sciences and Technology South China University of Technology Guangzhou 510641 China National Engineering Research Center for Antibody Drugs Shanghai 201203 China Zhujiang Hospital Southern Medical University Guangzhou 510282 China Shanghai Municipal Center for Disease Control & Prevention Shanghai 200336 China Shanghai Institutes of Biological Sciences Chinese Academy of Sciences (Lab of Computational Genomics CAS-MPG Partner Institute of Computational Biology Center of Bioinformatics Key Lab of System Biology Lab of Synthetic Biology Institute of Plant Physiology & Ecology Institute Pasteur) Shanghai 200031 China National Engineering Research Center for Biochip Technology Shanghai Biochip Co. Ltd Shanghai 201203 China National Institute for Parasitic Diseases Chinese Center for Disease Control and Prevention Shanghai 200025 China Shanghai Institute of Organic Chemistry Chinese Academy of Sciences Shanghai 200032 China Shanghai Veterinary Research Institute Chinese Academy of Agricultural Sciences Shanghai 200241 China

In recent months,a novel influenza virus H1N1 broke out around the *** bioinformatics technology,the 3D structure of HA protein was obtained,and the epitope residues were predicted with the method developed in our group for this novel flu virus.58 amino acids were identified as potential epitope residues,the majority of which clustered at the surface of the globular head of HA *** it is located at the similar position,the epitope of HA protein for the novel H1N1 flu virus has obvious differences in the electrostatic potential compared to that of HA proteins from previous flu viruses.

关键词：禽流感病毒抗原表位 A蛋白结构建模和空间生物信息学技术三维结构残留物

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Th17细胞与Treg细胞比例失衡在慢性炎症性疾病中研究进展

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临床与病理杂志 2014年第5期34卷 601-605页

作者：张溪夏曹志伟中国医科大学附属盛京医院耳鼻咽喉科沈阳110000

慢性炎症性疾病涉及许多疾病的发展过程,如变应性鼻炎、支气管哮喘、类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis,R A)、炎症性肠病(inflammator y bowel disease,IBD)等。研究发现,Th17和Treg细胞通过其自身及产生的相应细胞因子,在慢性炎症... 详细信息

慢性炎症性疾病涉及许多疾病的发展过程,如变应性鼻炎、支气管哮喘、类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis,R A)、炎症性肠病(inflammator y bowel disease,IBD)等。研究发现,Th17和Treg细胞通过其自身及产生的相应细胞因子,在慢性炎症性疾病发生发展过程中起着重要作用,而Th17和调节性T细胞(T Regulator Cell,Treg细胞)的分化共用了TGF-β这个细胞因子,提示他们在分化过程中有某种关联。本文旨在阐述Th17细胞与Treg细胞比例失衡在相关慢性炎症性疾病的发生发展中所起的关键作用。

关键词：辅助性T细胞调节性T细胞慢性炎症性疾病

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影像导航技术在鼻腔鼻窦骨源性肿瘤手术中的应用

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中国医科大学学报 2021年第1期50卷 73-75页

作者：赵鹤顾兆伟时栋曹志伟中国医科大学附属盛京医院耳鼻咽喉科沈阳110004

选择2017年7月至2019年6月于中国医科大学附属盛京医院耳鼻咽喉科住院行单纯鼻内镜手术或鼻内镜联合额部鼻外进路骨源性肿瘤切除术并术中同时使用影像导航技术的病例7例。所有患者术后均复查鼻窦三维CT并随访。结果显示,所有患者术后均... 详细信息

选择2017年7月至2019年6月于中国医科大学附属盛京医院耳鼻咽喉科住院行单纯鼻内镜手术或鼻内镜联合额部鼻外进路骨源性肿瘤切除术并术中同时使用影像导航技术的病例7例。所有患者术后均复查鼻窦三维CT并随访。结果显示,所有患者术后均恢复良好,肿瘤切除彻底,鼻窦引流良好,无并发症。表明鼻窦骨源性肿瘤切除同时使用导航技术有利于彻底切除肿瘤,判断肿瘤边界,减少并发症。

关键词：鼻腔鼻窦骨源性肿瘤影像导航技术鼻内镜手术

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儿童扁桃体腺样体肥大与过敏相关指标对比观察

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中国耳鼻咽喉头颈外科 2022年第7期29卷 451-455页

作者：米晓琳曹志伟中国医科大学附属盛京医院耳鼻咽喉头颈外科辽宁沈阳110000

目的多因素探索儿童扁桃体腺样体肥大与过敏相关指标的关系,为疾病之间的联系提供临床证据,对病因诊断和综合治疗提供依据。方法收集2020年8月~2021年7月中国医科大学附属盛京医院鼻科病房收治的扁桃体腺样体肥大患儿(病例组)120例,同... 详细信息

目的多因素探索儿童扁桃体腺样体肥大与过敏相关指标的关系,为疾病之间的联系提供临床证据,对病因诊断和综合治疗提供依据。方法收集2020年8月~2021年7月中国医科大学附属盛京医院鼻科病房收治的扁桃体腺样体肥大患儿(病例组)120例,同时期收集门诊的健康体检儿童(对照组)50例。对比观察两组儿童的血常规检查、食物过敏原、呼吸过敏原、总IgE等指标结果的差异,并通过分层和分组分析比较年龄与季节在疾病中的作用。结果120例扁腺组患儿的过敏原阳性数量、嗜酸性粒细胞绝对值及百分比、血清总IgE与健康组相比显著升高(Z=-2.404、-3.412、-3.862、-2.58,P均0.05),不同季节组过敏原总阳性率有显著差异(63.3%、80%、83.3%、43.3%,P<0.05)。结论扁桃体腺样体肥大儿童的过敏原阳性数量、嗜酸性粒细胞绝对值及百分比、血清总IgE均显著高于健康儿童,其中粉尘螨在疾病发展中作用最显著。过敏在扁桃体腺样体肥大儿童的疾病中发挥作用或与年龄无关,但与季节显著相关。

关键词：儿童扁桃体切除术腺样体切除术扁桃体腺样体肥大过敏

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基于分布式计算的证书应用审计系统

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信息网络安全 2018年第9期 30-34页

作者：曹志威尹心明杨金云黄海晔公安部第三研究所信息安全技术部上海201204 同济大学电子与信息工程学院上海200125

公安证书应用审计任务具有分布面广、工作量大的特点,需要通过分布式计算的方式进行任务调度和管理。文章结合公安证书应用审计任务的需求,提出基于分布式计算的任务调度策略。为解决大规模审计任务中网络资源消耗较大的问题,文章提出... 详细信息

公安证书应用审计任务具有分布面广、工作量大的特点,需要通过分布式计算的方式进行任务调度和管理。文章结合公安证书应用审计任务的需求,提出基于分布式计算的任务调度策略。为解决大规模审计任务中网络资源消耗较大的问题,文章提出一种面向节点子集与节点层级的分级节能调度策略。文章最后给出了一个完整的基于分布式计算的证书应用审计系统设计方案。通过试点运行,证明该方案具备承载大量证书应用审计任务的能力,同时兼具安全性。

关键词：分布式计算证书分级节能调度

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从新冠Spike蛋白抗原抗体复合物探究表位与抗体的空间识别关系

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中国现代应用药学 2022年第21期39卷 2850-2855页

作者：王彩翠毛甜甜裘天颐汪源郑根徽曹志伟同济大学生命科学与技术学院上海200092 复旦大学附属中山医院上海200032 复旦大学生命科学学院上海200433

目的基于新冠Spike蛋白抗原抗体复合物结构数据,探究表位与抗体的空间识别关系。方法基于718对新冠Spike蛋白抗原抗体复合物结构数据,首先分析抗原表位分布的热点区域及抗体基因片段使用偏好性;其次对抗原抗体结合界面提取抗原空间表... 详细信息

目的基于新冠Spike蛋白抗原抗体复合物结构数据,探究表位与抗体的空间识别关系。方法基于718对新冠Spike蛋白抗原抗体复合物结构数据,首先分析抗原表位分布的热点区域及抗体基因片段使用偏好性;其次对抗原抗体结合界面提取抗原空间表位和CDR结构,分别构建抗原空间表位的相似性聚类树以及对应抗体重链CDR结构的相似性聚类树,通过比较对应聚类树之间的相似性评估抗原空间表位与抗体CDR结构的整体识别关系。结果表位位点中94.02%分布于RBD,4.44%分布于NTD,且前10位热点位置均分布于RBM;抗体VJ基因的偏好性片段为IGHV3-30/IGHJ4和IGHV1-58/IGHJ3。空间表位聚类树与对应抗体CDR结构聚类树之间的相似性显著高于随机聚类树,提示表位与CDR结构存有内在关联。进一步分析数据发现,免疫原性相似的抗原表位,会被结构相似的CDR结构识别,且CDR3结构的贡献最大。结论从目前数据来看,表位位点分布以RBD区域为主,抗体IGHV3-30/IGHJ4和IGHV1-58/IGHJ3片段突出,相似的抗原空间表位会被相似的CDR结构识别,这些发现为后续的新冠病毒抗体设计及优化提供一定的理论支撑。

关键词：抗原表位抗体 CDR 层次聚类 SARS-CoV-2

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温等静压机卸压系统的建模与仿真

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机床与液压 2014年第21期42卷 151-156页

作者：梁晓辉范玉德曹志伟张程滔中国工程物理研究院化工材料研究所四川绵阳621900

研究温等静压机卸压系统的组成与特性,采用理论辨识法得到控制系统数学模型,研究模糊控制算法在不同孔径组合阀的温等静压机卸压系统的应用。采用模糊推理机设计工具FIS构建模糊控制器,将其嵌入到SIMULINK仿真工具,组建卸压系统仿真平台... 详细信息

研究温等静压机卸压系统的组成与特性,采用理论辨识法得到控制系统数学模型,研究模糊控制算法在不同孔径组合阀的温等静压机卸压系统的应用。采用模糊推理机设计工具FIS构建模糊控制器,将其嵌入到SIMULINK仿真工具,组建卸压系统仿真平台,并进行5种常用工艺曲线的跟随控制仿真实验。仿真结果表明:模糊控制算法可以满足温等静压机卸压系统的宽压力域、高精度的卸压曲线控制要求。

关键词：曲线控制模糊控制器非线性因素高精度

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正常钩突黏膜与下鼻甲黏膜上皮超微结构比较观察

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临床耳鼻咽喉头颈外科杂志 2016年第5期30卷 370-372页

作者：陈鹏曹志伟中国医科大学附属盛京医院鼻科沈阳110004

目的:使用电镜观察正常钩突黏膜与下鼻甲黏膜的形态学差异,探讨钩突的生理学作用。方法:选取接受鼻内镜手术的12例患者(正常钩突黏膜8例,正常下鼻甲黏膜4例)为研究对象。术中取所需黏膜后,将观察面朝上,置于滤纸片上,行常规扫描电镜和... 详细信息

目的:使用电镜观察正常钩突黏膜与下鼻甲黏膜的形态学差异,探讨钩突的生理学作用。方法:选取接受鼻内镜手术的12例患者(正常钩突黏膜8例,正常下鼻甲黏膜4例)为研究对象。术中取所需黏膜后,将观察面朝上,置于滤纸片上,行常规扫描电镜和透射电镜标本制样方法处理;观察纤毛形态、结构及分布和摆动方向。结果:1钩突内外侧面黏膜与下鼻甲黏膜均为假复层纤毛柱状上皮,其纤毛形态一致,均具有典型"9+2"结构,黏膜表面均有密集的纤毛分布;2正常下鼻甲黏膜纤毛总体方向朝向后上方,钩突内侧面(鼻腔面)黏膜纤毛摆动总体朝向内下及后方,钩突外侧面(窦腔面)黏膜纤毛摆动总体朝向外下及后方。结论:钩突内、外侧面黏膜与下鼻甲黏膜纤毛结构与形态一致,但在纤毛摆动方向上有各自的特点,推断钩突内、外侧面纤毛清除系统在鼻腔鼻窦黏液清除系统中可能具有不同的作用。

关键词：钩突纤毛扫描电镜透射电镜

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干细胞在颅骨缺损修补中的应用及研究进展

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实用医学杂志 2022年第3期38卷 380-384页

作者：曹志威邵国赵志军张春阳内蒙古科技大学包头医学院内蒙古包头014000 内蒙古科技大学包头医学院第一附属医院神经外科内蒙古包头014000 包头医学院神经外科疾病研究所(转化医学) 内蒙古包头014000 内蒙古自治区骨组织再生与损伤修复工程技术中心内蒙古包头014000 深圳市龙岗区第三人民医院转化医学中心广东深圳518172

颅骨缺损是神经外科中常见且重要的临床问题,利用干细胞的成骨特性来修补临界大小的骨缺损已成为人们关注的焦点。目前,各种干细胞在骨组织工程中的应用方面取得了显著进展,但如何提高干细胞的植入率和存活率是该修补方式的关键。干细... 详细信息

颅骨缺损是神经外科中常见且重要的临床问题,利用干细胞的成骨特性来修补临界大小的骨缺损已成为人们关注的焦点。目前,各种干细胞在骨组织工程中的应用方面取得了显著进展,但如何提高干细胞的植入率和存活率是该修补方式的关键。干细胞治疗颅骨缺损已经在动物研究中被证明是可行的,这可能为进一步的临床研究开辟新的途径。干细胞移植仍是颅骨缺损修补方式中最有希望的一种。

关键词：干细胞移植颅骨缺损颅骨修补

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基于ERP的军械仓库装备保障研究

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计量与测试技术 2016年第11期43卷 75-76,78页

作者：曹志伟陈晓辉 91019部队海南海口571137

探讨军械仓库装备保障存在的问题,运用ERP的管理思想对仓库装备保障资源进行科学管理,使物力、人力经常保持最佳比例,并在实施计划的过程中加以控制、协调,使其资源得到最优化的配置,发挥最大效能。

关键词： ERP 装备保障资源管理

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