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Disruption of PABPN1 phase separation by SNRPD2 drives colorectal cancer cell proliferation and migration through promoting alternative polyadenylation of CTNNBIP1

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Science China(Life Sciences) 2024年第6期67卷 1212-1225页

作者： zhijie hu Mengxia Li Yufeng Chen Liutao Chen Yuting Han Chengyong Chen Xin Lu Nan You Yawen Lou Yingye huang Zhanfeng huo Chao Liu Cheng Liang Susu Liu Ke Deng Liangfu Chen Shangwu Chen Guohui Wan Xiaojian Wu Yonggui Fu Anlong Xu State Key Laboratory of Biocontrol Guangdong Province Key Laboratory of Pharmaceutical Functional GenesDepartment of BiochemistrySchool of Life SciencesSun Yat-sen UniversityGuangzhou 510275China Department of General Surgery(Colorectal Surgery)&Guangdong Provincial Key Laboratory of Colorectal and Pelvic Floor Diseases&Biomedical Innovation Center The Sixth Affiliated HospitalSun Yat-sen UniversityGuangzhou 510655China National-Local Joint Engineering Laboratory of Druggability and New Drug Evaluation National Engineering Research Center for New Drug and Druggability(cultivation)Guangdong Province Key Laboratory of New Drug Design and EvaluationSchool of Pharmaceutical SciencesSun Yat-sen UniversityGuangzhou 510006China School of Life Sciences Beijing University of Chinese MedicineBeijing 100029China

Generally shortened 3′UTR due to alternative polyadenylation(APA)is widely observed in cancer,but its regulation mechanisms for cancer are not well ***,with profiling of APA in colorectal cancer tissues and poly(A)signal editing,we firstly identified that the shortened 3′UTR of CTNNIBP1 in colorectal cancer promotes cell proliferation and *** found that liquid-liquid phase separation(LLPS)of PABPN1 is reduced albeit with higher expression in cancer,and the reduction of LLPS leads to the shortened 3′UTR of CTNNBIP1and promotes cell proliferation and ***,the splicing factor SNRPD2 upregulated in colorectal cancer,can interact with glutamic-proline(EP)domain of PABPN1,and then disrupt LLPS of PABPN1,which attenuates the repression effect of PABPN1 on the proximal poly(A)*** results firstly reveal a new regulation mechanism of APA by disruption of LLPS of PABPN1,suggesting that regulation of APA by interfering LLPS of 3′end processing factor may have the potential as a new way for the treatment of cancer.

关键词： alternative polyadenylation colorectal cancer CTNNBIP1 PABPN1 liquid-liquid phase separation SNRPD2

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面向技术创新过程表征和描述的技术要素关联概念模型

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图书情报工作 2024年第10期68卷 53-65页

作者：邬金鸣胡智杰姚茹林巧张学福中国农业科学院农业信息研究所北京100081 北京市农林科学院数据科学与农业经济研究所北京100097

[目的/意义]构建一种技术要素关联概念模型,以解决技术创新过程有效表征和描述的问题,为通过文本挖掘探测技术创新过程与规律、研判预测未来发展趋势奠定基础。[方法/过程]首先梳理技术创新与技术创新要素概念,其次基于技术范式与技术... 详细信息

[目的/意义]构建一种技术要素关联概念模型,以解决技术创新过程有效表征和描述的问题,为通过文本挖掘探测技术创新过程与规律、研判预测未来发展趋势奠定基础。[方法/过程]首先梳理技术创新与技术创新要素概念,其次基于技术范式与技术轨道模式下技术创新机理的分析,归纳技术创新要素及其关联,在此基础上进一步聚焦与技术本身直接相关的要素,设计技术要素关联概念模型,并进行应用案例分析。[结果/结论]技术要素关联概念模型,包括4种技术要素、2种要素属性和6种要素关联关系,支持通过分析技术要素及其关联随时间的动态变化、要素跨领域相互作用等,在微观层面揭示技术创新过程与规律,特别是可以支持揭示前沿交叉领域技术创新过程与规律,为技术融合机会发现奠定基础。

关键词：技术创新创新要素创新要素关联技术创新机理融合创新

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电子束辐照超高分子量聚乙烯在加速老化过程中的自由基演变

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辐射研究与辐射工艺学报 2024年第2期42卷 18-26页

作者：王静鲁曼丽沈蓉芳王谋华胡志杰张文礼中国科学院上海应用物理研究所上海201800 中国科学院大学北京100049 北京安通忆泰医疗科技有限公司北京101300

经过辐照处理的医用超高分子量聚乙烯(UHMWPE)必须通过加速老化试验的验证才能达到植入人体使用的要求,但在加速老化过程中,UHMWPE材料的自由基演化机制尚不明确。本研究从自由基角度出发,对现有加速老化方法的效果进行了系统分析。利... 详细信息

经过辐照处理的医用超高分子量聚乙烯(UHMWPE)必须通过加速老化试验的验证才能达到植入人体使用的要求,但在加速老化过程中,UHMWPE材料的自由基演化机制尚不明确。本研究从自由基角度出发,对现有加速老化方法的效果进行了系统分析。利用电子顺磁共振波谱研究了电子束辐照交联UHMWPE在加速老化过程中的自由基浓度和组成的变化,分析了自由基在该过程中的演变机理,对比分析了自由基在室温空气和70℃氮气中的演变机理。结果表明:加速老化评估方法有很大的局限性,辐照交联UHMWPE表层和内部的自由基在室温空气环境中的演变与在加速老化环境中的演变有显著区别,氧诱导自由基(OIR)的生成率在室温空气环境中约为2%,在加速老化环境中约为0.3%。OIR自由基在室温空气中会稳定存在,而在加速老化环境中会被快速氧化。

关键词：超高分子量聚乙烯电子束辐照自由基氧化反应

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基于D-D中子源开展^(238)U样品屏蔽积分实验研究

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原子能科学技术 2024年第5期58卷 970-981页

作者：丁琰琰聂阳波胡志杰赵齐张环宇徐阔之张时宇潘欣怡兰长林任杰阮锡超中国原子能科学研究院北京102413 兰州大学甘肃兰州730000 中国工程物理研究院四川绵阳621900

利用中国原子能科学研究院的中子学屏蔽积分实验装置,通过飞行时间法分别测量了D-D中子源与不同尺寸^(238)U样品作用后在60°和120°的泄漏中子谱,样品表面积为30 cm×30 cm的板状样品,厚度分别为3、6和9 cm。利用蒙特卡罗程序对泄漏中... 详细信息

利用中国原子能科学研究院的中子学屏蔽积分实验装置,通过飞行时间法分别测量了D-D中子源与不同尺寸^(238)U样品作用后在60°和120°的泄漏中子谱,样品表面积为30 cm×30 cm的板状样品,厚度分别为3、6和9 cm。利用蒙特卡罗程序对泄漏中子谱进行了模拟计算,其中^(238)U数据分别采用CENDL-3.2库、ENDF/B-Ⅷ.0库、JENDL-5.0库和JEFF-3.3库中的数据。通过对模拟结果与实验结果的比较,重点分析了CENDL-3.2库中^(238)U数据存在的不足和需要改进之处,结果表明:在裂变反应能区内,CENDL-3.2库计算结果与实验结果符合较好,但在弹性散射能区60°和120°均有较大的高估,尤其是120°,而在裂变反应和分立能级非弹性散射的混合能区1.5~2.5 MeV又有明显低估。

关键词：泄漏中子谱铀 D-D中子源飞行时间法评价核数据

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Modification of Flow Structure and Sound Source by Hybrid Porous-serrated Trailing Edge

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Journal of Bionic Engineering 2020年第3期17卷 539-552页

作者： Hanru Liu Nanshu Chen Yangang Wang zhijie hu School of Power and Energy Northwestern Polytechnical UniversityXi'an 710072China Research&Development Institute of Northwestern Polytechnical University in Shenzhen Shenzhen 518057China Key Laboratory of Aerodynamic Noise Control Mianyang 621000China

The effects of hybrid porous-serrated trailing edge on flow structure and sound source of NACA65(12)-10 at moderate Reynolds number(Rec=5×1O^5)have been investigated by Delayed Detached Eddy Simulation(DDES).Compared with conventional serrated trailing edge,the pressure fluctuation in the vicinity of hybrid porous-serrated trailing edge is further decreased *** typical necklace vortex structures stretching across adjacent serrations are suppressed by the porous *** is found that porous media changes the shear stress distribution along the serration edge and inside the serration gap,which consequently eliminates the generation of necklace ***,the deformation of vortex tube caused by velocity vector is *** underlying mechanisms associated to the sound source modification are analyzed based on vortex sound *** magnitude of Lamb vector and the angle between vorticity and velocity vectors are synchronously reduced by the porous additive,which implies that the present hybrid porous-serrated trailing edge has important influence on the further attenuation of far-field aerodynamic noise.

关键词： bionic flow control wake modification hybrid porous-serration vortex sound theory noise reduction

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泛素样蛋白质2在结直肠癌中的表达及其对癌细胞增殖作用

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安徽医药 2024年第09期28卷 1810-1813页

作者：孙光源王晓元任艳丽尹洁胡智洁武雪亮薛军河北北方学院附属第一医院普通外科

目的探讨泛素样蛋白质2(UBQLN2)在结直肠癌中的表达及其对结直肠癌细胞增殖的影响。方法选取2020年1月至2021年1月河北北方学院附属第一医院治疗的90例病人为研究对象，根据术中手术获取组织情况，分为正常组、癌旁组和肿瘤组。免疫... 详细信息

目的探讨泛素样蛋白质2(UBQLN2)在结直肠癌中的表达及其对结直肠癌细胞增殖的影响。方法选取2020年1月至2021年1月河北北方学院附属第一医院治疗的90例病人为研究对象，根据术中手术获取组织情况，分为正常组、癌旁组和肿瘤组。免疫组织化学法和免疫荧光评估UBQLN2在肿瘤组织、远端组织和正常组织中表达；分析UBQLN2与病人临床病理特征以及预后的相关性；蛋白质印迹法和实时荧光定量逆转录聚合酶链反应（qRT-PCR）检测UBQLN2在结直肠癌细胞系HT29、SW620、SW480、LOVO、HCT116以及人正常肠上皮细胞HIEC细胞中的表达；分别过表达和干扰UBQLN2在结肠癌细胞中的表达，随后CCK-8检测干扰前后细胞增殖能力变化。结果 UBQLN2在结直肠癌癌旁组织中阳性面积（32.57±12.44）%显著高于肿瘤组织（12.68±9.79）%;UBQLN2 mRNA表达在转移阴性病人肿瘤组织中0.98±0.15显著高于转移阳性病人肿瘤组织0.33±0.08;UBQLN2的表达与结直肠癌病人预后呈正相关；UBQLN2在人正常肠上皮细胞中表达显著高于结直肠癌细胞，且在HCT116中表达最低；HCT116过表达UBQLN2培养36 h后，与pcDNA3.1-NC组细胞增殖能力0.78±0.23比较，pcDNA3.1-UBQLN-2组细胞0.52±0.18增殖能力显著降低；SW480细胞敲减UBQLN2培养36 h后，与si-NC细胞0.65±0.37增殖能力比较，si-UBQLN-2组细胞0.89±0.36增殖能力显著增加。结论 UBQLN2在结直肠癌肿瘤组织和细胞中明显低表达并与转移呈负相关，UBQLN2可抑制结直肠癌增殖并与病人预后呈正相关。

关键词：泛素类结直肠癌细胞增殖生存期预后

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结肠癌中UBQLN2的表达情况及其免疫调控作用

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中国癌症防治杂志 2024年第1期16卷 76-83页

作者：孙光源王晓元向骁任艳丽尹洁胡智洁武雪亮薛军河北北方学院附属第一医院普通外科张家口075000 中山大学附属第一医院肝胆外科广州510000

目的探讨UBQLN2基因在结肠癌中的表达及其免疫调控功能。方法收集2021年1月至2023年6月在河北北方学院附属第一医院手术切除的32例结肠癌及匹配的癌旁组织。采用转录组测序检测UBQLN2表达,qRT-PCR检测UBQLN2 mRNA表达水平,免疫组织化学... 详细信息

目的探讨UBQLN2基因在结肠癌中的表达及其免疫调控功能。方法收集2021年1月至2023年6月在河北北方学院附属第一医院手术切除的32例结肠癌及匹配的癌旁组织。采用转录组测序检测UBQLN2表达,qRT-PCR检测UBQLN2 mRNA表达水平,免疫组织化学检测UBQLN2蛋白表达水平。分析UBQLN2表达与结肠癌患者临床病理及预后的关系。采用多色免疫荧光检测UBQLN2与TGF-β的共表达情况,利用单细胞转录组测序和TCGA数据库验证UBQLN2在结肠癌中的表达情况及其与免疫抑制因子、TGF-β和结肠癌预后的关系。结果转录组分析显示,结肠癌组织中UBQLN2基因高表达,其mRNA表达水平高于癌旁组织(P<0.01)。通过TCGA数据库纳入275例结肠癌组织及41例癌旁组织,结肠癌组织中的UBQLN2 mRNA相对表达量也高于癌旁组织(P<0.001)。免疫组织化学检测结果显示,UBQLN2蛋白主要在细胞质中表达,且结肠癌组织中UBQLN2蛋白阳性表达强度明显高于癌旁组织。qRT-PCR检测结果显示,结肠癌组织中UBQLN2 mRNA表达显著高于癌旁组织(P<0.001)。通路富集分析显示,UBQLN2高表达组肿瘤增殖通路显著上调,免疫激活通路显著下调;而且与UBQLN2低表达组相比,UBQLN2高表达组免疫逃逸评分更高(P<0.05),CD8^(+)T细胞特异性标志物、免疫趋化因子及免疫杀伤因子表达更低(均P<0.05),而免疫耗竭分子表达更高(均P<0.05)。在UBQLN2高表达组中TGF-β、IL10和ARG1等免疫抑制细胞因子的表达高于UBQLN2低表达组(均P<0.05),且UBQLN2与TGF-β表达呈正相关(r=0.280,P<0.0001),UBQLN2与TGF-β在肿瘤中共表达。TGF-β和UBQLN2均高表达组较两者均低表达组患者的的预后更差(P=0.004)。单细胞转录组测序显示UBQLN2阳性结肠癌高表达TGF-β且微环境呈免疫抑制状态。结论UBQLN2在结肠癌中高表达且与预后较差相关,UBQLN2高表达的结肠癌可能通过释放TGF-β细胞因子抑制CD8^(+)T细胞的杀伤活性,实现免疫逃逸。UBQLN2可能是结肠癌的潜在治疗靶点。

关键词：结肠癌免疫抑制 UBQLN2 TGF-β

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植物NLR免疫受体的结构、生化功能及分子调控

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植物生理学报 2023年第11期59卷 1975-1986页

作者：胡智杰吴忠长浙江大学生命科学学院杭州310058

NLR受体是植物免疫中重要的抗病蛋白,植物体在应对病原微生物入侵时需要激活NLR受体以触发免疫反应。随着功能基因组学、结构生物学技术的快速发展, NLR受体蛋白的结构功能以及激活机制取得了极大的进展,尤其是抗病小体结构的精密解析... 详细信息

NLR受体是植物免疫中重要的抗病蛋白,植物体在应对病原微生物入侵时需要激活NLR受体以触发免疫反应。随着功能基因组学、结构生物学技术的快速发展, NLR受体蛋白的结构功能以及激活机制取得了极大的进展,尤其是抗病小体结构的精密解析。本文综述了NLR受体蛋白的结构类型,并阐述了NLR受体对病原微生物效应蛋白的识别方式、NLR受体的激活机制以及分子调控模式,以期为今后的植物抗病免疫研究提供参考依据。

关键词： NLR受体植物免疫抗病小体分子调控

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Low temperature,non-halogen solvent processed single-component organic solar cells with 10%efficiency

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Chinese Chemical Letters 2023年第12期34卷 241-245页

作者： Zhou Zhang Jjing Wang zhijie hu Chengyi Xiao Qiaomei Chen Zheng Tang Weiwei Li Bejing Advanced Innovation Center for Soft Matter Science and Engineering&State Key Laboratory of Organic-Inorganic Composites Bejing University of Chemical TechnologyBeijing 100029China Center for Advanced Low-dimension Materials College of Materials Science and EngineeringDonghua UniversityShanghai 201620China

A double-cable conjugated polymer DCPIC-BO is designed via introducing a long-branched alkyl chains 2-buthyloctyl into the acceptor side *** with the double-cable polymer(DCPIC-EH)with the 2-ethylhexyl alkyl chains,the solubility of the DCPIC-BO in non-halogen solvents is substantially ***,a power conversion efficiency(PCE)of 9.77%can be obtained by the devices processed from o-xylene at 40℃,while the DCPIC-EH cannot be processed due to its poor solubility under this ***,PCEs of 10.10%for small-area(0.04 cm^(2))devices and nearly 9%for devices with an area of 1 cm^(2) are achieved using a non-halogenated solid additive in o-xylene,realizing the"absolutely halogen-free"OSC fabrication.

关键词： Organic solar cells Non-halogenated solvents Double-cable conjugated polymers Long-branched alkyl chains Solubility

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U1 snRNP proteins promote proximal alternative polyadenylation sites by directly interacting with 3'end processing core factors

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Journal of Molecular Cell Biology 2022年第8期14卷 29-42页

作者： zhijie hu Mengxia Li Zhanfeng huo Liutao Chen Susu Liu Ke Deng Xin Lu Shangwu Chen Yonggui Fu Anlong Xu State Key Laboratory of Biocontrol Guangdong Province Key Laboratory of Pharmaceutical Functional GenesDepartment of BiochemistrySchool of Life SciencesSun Yat-sen UniversityHigher Education Mega CenterGuangzhou 510006China School of Life Sciences Beĳing University of Chinese MedicineBeĳing 100029China

In eukaryotic cells,both alternative splicing and alternative polyadenylation(APA)play essential roles in the gene regulation network.U1 small ribonucleoprotein particle(U1 snRNP)is a major component of spliceosome,and U1 snRNP complex can suppress proximal APA sites through crosstalking with 3end processing ***,here we show that both knockdown and overexpression of SNRPA,SNRPC,SNRNP70,and SNRPD2,the U1 snRNP proteins,promote the usage of proximal APA sites at the transcriptome ***70 can drive the phase transition of PABPN1 from droplet to aggregate,which may reduce the repressive effects of PABPN1 on the proximal APA ***,SNRNP70 can also promote the proximal APA sites by recruiting CPSF6,suggesting that the function of CPSF6 on APA is related with other RNA-binding proteins and cell ***,these results reveal that,on the contrary to U1 snRNP complex,the free proteins of U1 snRNP complex can promote proximal APA sites through the interaction with 3end processing machinery.

关键词： U1 snRNP 3'end processing factors alternative polyadenylation phase separation

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