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Graph based recurrent network for context specific synthetic lethality prediction

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Science China Life Sciences 2024年

作者： Yuyang Jiang Jing Wang Yixin Zhang zhiwei cao Qinglong Zhang Jinsong Su Song He Xiaochen Bo Academy of Medical Engineering and Translational Medicine Tianjin University Department of Bioinformatics Institute of Health Service and Transfusion MedicineBeijing School of Medicine Tsinghua University School of Informatics Xiamen University

The concept of synthetic lethality (SL) has been successfully used for targeted therapies. To further explore SL for cancer therapy, identifying more SL interactions with therapeutic potential are essential. Recently, graph neural network-based deep learning methods have been proposed for SL prediction, which reduce the SL search space of wet-lab based methods. However, these methods ignore that most SL interactions depend strongly on genetic context, which limits the application of the predicted results. In this study, we proposed a graph recurrent network-based model for specific context-dependent SL prediction (SLGRN). In particular, we introduced a Graph Recurrent Network-based encoder to acquire a context-specific, low-dimensional feature representation for each node, facilitating the prediction of novel SL. SLGRN leveraged gate recurrent unit (GRU) and it incorporated a context-dependent-level state to effectively integrate information from all nodes. As a result, SLGRN outperforms the state-of-the-arts models for SL prediction. We subsequently validate novel SL interactions under different contexts based on combination therapy or patient survival analysis. Through in vitro experiments and retrospective clinical analysis, we emphasize the potential clinical significance of this context-specific SL prediction model.

关键词：

网课之困:深度媒介化背景下大学生群体的学习异化与问题反思——基于高校网课的田野调查

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中国青年研究 2024年第2期 111-119页

作者：曹志伟南京财经大学新闻学院

网课是当代大学生必须掌握的新型学习途径,它在技术上彻底解决了特殊情境下授课时空连接的难题,但在大规模普及的过程中逐渐暴露出一些隐藏的缺陷。调查发现,当代大学生普遍存在在线学习方式异化的问题,并形成一种“网课之困”,其中包... 详细信息

网课是当代大学生必须掌握的新型学习途径,它在技术上彻底解决了特殊情境下授课时空连接的难题,但在大规模普及的过程中逐渐暴露出一些隐藏的缺陷。调查发现,当代大学生普遍存在在线学习方式异化的问题,并形成一种“网课之困”,其中包括过度强调学习设备的更新、在线虚拟痕迹的考核、知识传播仪式的忽视等。这些问题的产生与深度媒介化的教育现实密切相关,随之而来的是师生关系疏离、躺平习惯流行、糊弄交差横行、师生权力倒置等诸多“怪象”的发生,高等教育质量存在下降的风险。为此,要积极寻找破解“网课之困”的路径和方法,引导大学生重塑健康的学习习惯。

关键词：网课异化大学生学习媒介技术

大沽河流域海水入侵数值模拟及其全局敏感性分析

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水资源保护 2024年第1期40卷 100-107页

作者：张迪王煜郑小康曹智伟黄河勘测规划设计研究院有限公司河南郑州450003 南京大学地球科学与工程学院江苏南京210023

基于SEAWAT建立三维海水入侵数值模型对胶州湾附近大沽河流域滨海含水层的非稳定海水入侵过程进行了模拟,并利用2010年1月1日至2018年6月1日的地下水位和Cl-质量浓度观测数据对海水入侵数值模型中的水文地质参数进行校准和验证,同时利... 详细信息

基于SEAWAT建立三维海水入侵数值模型对胶州湾附近大沽河流域滨海含水层的非稳定海水入侵过程进行了模拟,并利用2010年1月1日至2018年6月1日的地下水位和Cl-质量浓度观测数据对海水入侵数值模型中的水文地质参数进行校准和验证,同时利用全局敏感性分析评估含水层渗透系数和给水度等水文地质参数以及由降水入渗补给和地下水开采组成的源汇项对海水入侵数值模型的影响。结果表明:海水入侵的发展对降水入渗补给和地下水开采最为敏感,而渗透系数的影响则相对次要;增加降水补给量和减少地下水开采量可以有效地降低未来海水入侵的范围。

关键词：海水入侵数值模型滨海含水层全局敏感性分析 SEAWAT 大沽河流域

地舒单抗用药人群拔牙围手术期管理的研究进展

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中华口腔医学杂志 2024年第8期59卷 840-845页

作者：姜志深曹钰彬曹志炜叶立刘济远潘剑四川大学华西口腔医院口腔颌面外科、口腔疾病防治全国重点实验室、国家口腔医学中心、国家口腔疾病临床医学研究中心成都610041

地舒单抗是一种全人源单克隆抗体,用于预防恶性肿瘤骨相关事件和治疗骨折高风险的骨质疏松。2019年,地舒单抗于我国获批上市后,地舒单抗引发的药物相关性颌骨坏死(DRONJ)也日益受到关注。DRONJ与双膦酸盐引发的药物相关性颌骨坏死类似,... 详细信息

地舒单抗是一种全人源单克隆抗体,用于预防恶性肿瘤骨相关事件和治疗骨折高风险的骨质疏松。2019年,地舒单抗于我国获批上市后,地舒单抗引发的药物相关性颌骨坏死(DRONJ)也日益受到关注。DRONJ与双膦酸盐引发的药物相关性颌骨坏死类似,多发生于拔牙术后,表现为颌骨裸露坏死、流脓、颌面部肿胀及疼痛等,严重影响患者生活质量。但DRONJ的拔牙围手术期管理策略与双膦酸盐相关性颌骨坏死不同。本文从口腔卫生保健、抗生素药物应用、围手术期停药和手术策略选择等方面,总结DRONJ高危患者的拔牙围手术期管理策略,旨在为口腔外科医师应对使用地舒单抗患者的拔牙手术提供参考。

关键词：拔牙地舒单抗双膦酸盐颌骨坏死抗生素

RUNX1在骨发育及骨相关疾病中的作用研究进展

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四川大学学报（医学版） 2024年第2期55卷 256-262页

作者：潘子建周雪儿曹志炜潘剑口腔疾病防治全国重点实验室、国家口腔医学中心、国家口腔疾病临床医学研究中心、四川大学华西口腔医院口腔颌面外科成都610041

RUNX1是一种与造血系统发生密切相关的转录因子,其基因突变在血液系统肿瘤,特别是在急性髓系白血病的发生发展中起到重要的致病作用。近年来研究表明,RUNX1也参与调控骨发育以及骨相关疾病的病理进程。RUNX1能促进间充质干细胞向软骨细... 详细信息

RUNX1是一种与造血系统发生密切相关的转录因子,其基因突变在血液系统肿瘤,特别是在急性髓系白血病的发生发展中起到重要的致病作用。近年来研究表明,RUNX1也参与调控骨发育以及骨相关疾病的病理进程。RUNX1能促进间充质干细胞向软骨细胞及成骨细胞分化,并调控软骨细胞成熟及细胞外基质的形成。RUNX1在间充质干细胞、软骨细胞及成骨细胞中的表达对于维持正常的骨发育和骨质与骨量有着重要意义。RUNX1还能抑制破骨细胞的分化及功能,且该过程可能存在性别二态性。此外,通过基因敲除鼠模型还阐明了RUNX1缺乏在骨关节炎、骨折愈合延迟、骨质疏松等病理状况中的促病机制。然而,RUNX1在调控软骨细胞肥大分化、调控破骨细胞功能中的性别二态性,以及在糖尿病、衰老、感染及慢性炎症等相关骨丢失中的作用等方面还尚不完全清楚。本综述系统总结了关于RUNX1在骨生物学领域中的研究进展,为RUNX1作为治疗骨相关疾病,特别是骨关节炎、骨折延迟愈合及骨质疏松的潜在靶点提供思路。

关键词： RUNX1 骨生物学骨发育骨关节炎综述

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矮塔斜拉桥斜拉索安装施工关键技术

建筑机械化 2024年第4期45卷 48-51页

作者：曹志伟中铁十六局集团第五工程有限公司河北唐山063000

以巴河特大桥斜拉索安装施工为例,从施工平台搭设、锚具安装、HDPE套管吊装、斜拉索挂索、斜拉索张拉、斜拉索调索、附属装置安装、斜拉索防护等方面,对矮塔斜拉桥斜拉索安装施工关键技术进行探讨,可供类似项目借鉴参考。

关键词：矮塔斜拉桥斜拉索安装施工技术

Parametric Vibration Stability Analysis of a Pyramid Lattice Sandwich Plate Subjected to Pulsatile External Airflow

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Acta Mechanica Solida Sinica 2023年第1期36卷 95-104页

作者： zhiwei cao Guo Yao School of Mechanical Engineering and Automation Northeastern UniversityShenyang 110819China

Lattice sandwich structures are broadly used in aerospace,navigation,and high-speed rail *** engineering practice,the airflow outside the vehicle or aircraft always exhibits the pulsatile property,which makes the elastic structural components and the external airflow a parametric excitation *** this paper,the parametric vibration stability analysis and dynamic characteristics of a lattice sandwich plate interacting with the pulsatile external airflow are *** equation of motion is derived using Hamilton’s principle and discretized using the assumed mode *** linear potential flow theory is applied to derive the perturbation aerodynamic *** stability of the system is analyzed using the Floquet theory and validated by numerical *** effects of design parameters of the lattice sandwich plate on the stability of the system are *** the simulations and discussions,some practical principles for the optimal design of lattice sandwich structures in the aerodynamic environment are proposed.

关键词： Lattice sandwich structures Pulsatile airflow Parametric excitation Floquet theory

COMPUTER NUMERICAL SIMULATION OF MECHANICAL PROPERTIES OF TUNGSTEN HEAVY ALLOYS

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中国有色金属学会会刊：英文版 1999年第1期9卷 54-58页

作者： Huang, Jihua cao, zhiwei Zhou, Guo'an Univ of Science and Technology Beijing Beijing China

１ＩＮＴＲＯＤＵＣＴＩＯＮＴｕｎｇｓｔｅｎｈｅａｖｙａｌｏｙｓａｒｅｄｕａｌｐｈａｓｅｃｏｍｐｏｓｉｔｅｓｐｒｏｄｕｃｅｄｂｙｌｉｑｕｉｄｐｈａｓｅｓｉｎｔｅｒｉｎｇｏｆａｍｉｘｔｕｒｅｏｆ８０％～９７％ｔｕｎｇｓ... 详细信息

１ＩＮＴＲＯＤＵＣＴＩＯＮＴｕｎｇｓｔｅｎｈｅａｖｙａｌｏｙｓａｒｅｄｕａｌｐｈａｓｅｃｏｍｐｏｓｉｔｅｓｐｒｏｄｕｃｅｄｂｙｌｉｑｕｉｄｐｈａｓｅｓｉｎｔｅｒｉｎｇｏｆａｍｉｘｔｕｒｅｏｆ８０％～９７％ｔｕｎｇｓｔｅｎａｎｄａｓｍａｌａｍｏｕｎｔ...

关键词： tungsten heavy alloy mechanical property computer numerical simulation

快速动态响应同步调相机转子引线断裂故障分析

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电网技术 2024年第9期48卷 3957-3964页

作者：王庆郭贤珊黄金军刘超李明韩晋思李斯特曹志伟国家电网有限公司北京市西城区100031 国家电网有限公司直流技术中心北京市西城区100052 国网内蒙古东部电力有限公司内蒙古自治区呼和浩特市010010 国网山东省电力公司电力科学研究院山东省济南市250003

大型调相机的安全稳定运行关乎着电网电压的稳定、动态无功支撑水平和新能源消纳能力。该文研究了一起实际的调相机转子引线断裂故障,综合现场检查、返厂解体检查、试验分析、故障复现实验及其他换流站同型号调相机的检查结果,发现转子... 详细信息

大型调相机的安全稳定运行关乎着电网电压的稳定、动态无功支撑水平和新能源消纳能力。该文研究了一起实际的调相机转子引线断裂故障,综合现场检查、返厂解体检查、试验分析、故障复现实验及其他换流站同型号调相机的检查结果,发现转子引线的设计及工艺方面存在缺陷,径向存在约4mm的悬空区域,加之长期运行磨损,最终导致调相机引线断裂烧熔触发跳机。从引线设计方案优化和实际运行工况着手,充分研判该型号调相机转子引线各段结构的可靠性及适用性,深入研究各种工况下的离心力及振动,保证引线及配套绝缘紧固连接,论证得出治理方案,为在运工程及后续新建机组安全可靠性奠定基础。

关键词：同步调相机转子引线断裂一点接地

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