检索结果-南通市图书馆

Dual-extraction modeling:A multi-modal deeplearning architecture for phenotypic prediction and functional gene mining of complex traits

引用

Plant Communications 2024年第9期5卷 54-71页

作者： Yanlin Ren Chenhua Wu He Zhou Xiaona Hu zhenyan miao State Key Laboratory for Crop Stress Resistance and High-Efficiency Production Center of BioinformaticsCollege of Life SciencesNorthwest A&F UniversityYanglingShaanxi 712100China College of Chemistry&Pharmacy Northwest A&F UniversityYanglingShaanxi 712100China Key Laboratory of Biology and Genetics Improvement of Maize in Arid Area of Northwest Region Ministry of AgricultureNorthwest A&F UniversityYanglingShaanxi 712100China

Despite considerable advances in extracting crucial insights from bio-omics data to unravel the intricate mechanisms underlying complex traits,the absence of a universal multi-modal computational tool with robust interpretability for accurate phenotype prediction and identification of trait-associated genes remains a *** study introduces the dual-extraction modeling(DEM)approach,a multi-modal deep-learning architecture designed to extract representative features from heterogeneous omics datasets,enabling the prediction of complex trait *** comprehensive benchmarking experiments,we demonstrate the efficacy of DEM in classification and regression prediction of complex *** consistently exhibits superior accuracy,robustness,generalizability,and ***,we establish its effectiveness in predicting pleiotropic genes that influence both flowering time and rosette leaf number,underscoring its commendable *** addition,we have developed user-friendly software to facilitate seamless utilization of DEM’s *** summary,this study presents a state-of-the-art approach with the ability to effectively predict qualitative and quantitative traits and identify functional genes,confirming its potential as a valuable tool for exploring the genetic basis of complex traits.

关键词： deep learning complex traits multi-omics phenotypic prediction gene mining

来源：

维普期刊数据库评论

在线全文

维普期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

标准全消化道可消化钙、磷含量对断奶仔猪肠-肝-肾轴钙、磷吸收的影响及机制

引用

动物营养学报 2024年第7期36卷 4243-4257页

作者：孙焱杰韦洋洋苗振彦熊云霞吴绮雯杨雪芬王丽蒋宗勇易宏波黄艳娜广西大学动物科学技术学院南宁530004 广东省农业科学院动物科学研究所猪禽种业全国重点实验室农业农村部华南动物营养与饲料重点实验室广东省畜禽育种与营养研究重点实验室广州510640

本试验旨在研究标准全消化道可消化钙(STTD Ca)和标准全消化道可消化磷(STTD P)含量对7~25 kg断奶仔猪钙、磷吸收的影响。选取21日龄、体重接近的杜长大杂交断奶仔猪144头,随机分为6组,每组6个重复,每个重复4头猪(阉公猪和母猪各2头)。... 详细信息

本试验旨在研究标准全消化道可消化钙(STTD Ca)和标准全消化道可消化磷(STTD P)含量对7~25 kg断奶仔猪钙、磷吸收的影响。选取21日龄、体重接近的杜长大杂交断奶仔猪144头,随机分为6组,每组6个重复,每个重复4头猪(阉公猪和母猪各2头)。第1~6组饲粮中STTD Ca和STTD P的比例均为1.2,STTD P含量分别为0.18%、0.26%、0.34%、0.42%、0.50%、0.58%,STTD Ca含量分别为0.216%、0.312%、0.408%、0.504%、0.600%、0.696%。试验期42 d。结果表明:1)随着饲粮中STTD Ca和STTD P的含量逐渐升高,血清碱性磷酸酶活性逐渐降低,但组间没有显著差异(P>0.05),血清降钙素(CT)、甲状腺素(T 4)、1,25二羟维生素D 3[1,25(OH)D 3]、甲状旁腺素(PTH)含量逐渐升高,且6组显著高于1组(P0.05)。3)所有组肠道结构完整,1和2组十二指肠绒毛高度/隐窝深度显著高于5和6组(P<0.05),2组空肠绒毛高度/隐窝深度显著低于5组(P<0.05)。4)在十二指肠中,2和3组维生素D受体(VDR)的基因相对表达量显著高于1和5组(P<0.05),1和2组钙磷结合蛋白1(CALB1)的基因相对表达量显著高于4、5和6组(P<0.05),1组细胞色素P450家族成员24A1(CYP24A1)的基因相对表达量显著高于其他组(P<0.05);在空肠中,4和6组的钙离子通道6(TRPV6)的基因相对表达量显著高于2和5组(P<0.05),6组S100钙结合蛋白G(S100G)的基因相对表达量显著高于2组(P<0.05),4组ATP酶质膜钙离子转运蛋白1(ATP2B1)的基因相对表达量显著高于2组(P<0.05),5和6组溶质载体家族蛋白34成员A3(SLC34A3)的基因相对表达量显著高于1和2组(P<0.05),1组CYP24A1的基因相对表达量显著高于其他组(P<0.05);在回肠中,CYP24A1和SLC34A3的基因相对表达量逐渐降低,1和2组CYP24A1的基因相对表达量显著高于其他组(P<0.05),2组SLC34A3的基因相对表达量显著高于其他组(P<0.05);在结肠中,1组TRPV6、ATP2B1和CALB1的基因相对表达量显著高于其他组(P<0.05)。在肾脏中,甲状旁腺素1受体(PTH1R)和钙离子通道5(TRPV5)的基因相对表达量先升高后降低,当升高到NRC(2012)推荐STTD P添加量(STTD P含量为0.34%~0.42%)时到达最大;3和4组PTH1R的基因相对表达量显著高于其他组(P<0.05),4组TRPV5的基因相对表达量显著高于其他组(P<0.05)。在肝脏中,2组SLC34A3的基因相对表达量显著高于4组(P<0.05),1组CALB1的基因相对表达量显著高于其他组(P<0.05)。综上所述,饲粮中STTD Ca和STTD P的比例为1.2时,随着饲粮中STTD Ca和STTD P的含量逐渐升高,十二指肠和结肠对钙、磷的吸收能力逐渐减弱,空肠对钙、磷的吸收能力逐渐增强,肝脏对钙、磷吸收能力逐渐降低。当饲粮中STTD Ca和STTD P的含量增加到NRC(2012)推荐的STTD P添加量(饲粮STTD P含量为0.34%~0.42%)时,肾脏对钙、磷重吸收的能力最强。结合血清钙、磷含量数据,当饲粮中STTD Ca和STTD P的含量分别在0.216%~0.312%和0.18%~0.26%时,断奶仔猪能有效利用饲粮钙、磷。

关键词：断奶仔猪 STTD Ca STTD P 肠道肾脏肝脏钙、磷吸收

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

关于提升财政库款管理效能的思考

引用

财政科学 2019年第1期 150-154页

作者：缪臻彦浙江省舟山市财政局

本文首先介绍了浙江省财政库款管理的总体情况,结合国务院相关工作部署要求,对省厅强化市县库款管理约束的主要举措,以及舟山市提升库款管理效能的主要措施进行梳理,针所取得的经验和不足,并提出提升库款管理效能的核心思想应为"明确目... 详细信息

本文首先介绍了浙江省财政库款管理的总体情况,结合国务院相关工作部署要求,对省厅强化市县库款管理约束的主要举措,以及舟山市提升库款管理效能的主要措施进行梳理,针所取得的经验和不足,并提出提升库款管理效能的核心思想应为"明确目标、突出重点、多管齐下、强化监测",以及具体措施与建议。

关键词：财政库款管理效能措施与建议

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

玉米CesA家族的系统鉴定及功能研究

引用

西北农林科技大学学报（自然科学版） 2019年第2期47卷 45-53页

作者：张晓榕谭俊峰温曼晴苗震龑西北农林科技大学生命科学学院生物信息学中心陕西杨凌712100

【目的】系统鉴定玉米纤维素合成酶(CesA)家族成员,明确其进化关系及基因功能。【方法】采用系统生物学方法,在全基因组水平上对玉米CesA家族成员进行鉴定,进一步结合基因结构变化对CesA家族成员的进化关系进行系统阐述;通过RNA测序和... 详细信息

【目的】系统鉴定玉米纤维素合成酶(CesA)家族成员,明确其进化关系及基因功能。【方法】采用系统生物学方法,在全基因组水平上对玉米CesA家族成员进行鉴定,进一步结合基因结构变化对CesA家族成员的进化关系进行系统阐述;通过RNA测序和核糖体图谱,系统分析玉米CesA家族成员响应干旱胁迫的表达模式,并从基因复制角度分析该家族基因的扩增方式,同时基于构建的转录调控网络,对玉米CesA基因的功能进行初步探索。【结果】鉴定出16个玉米CesA家族成员,分为7个子家族,其中有3个是新发现的成员;CesA家族成员在玉米发育过程中对干旱胁迫的响应有明显的组织特异性和发育时期特异性,干旱胁迫对玉米种子发育过程的影响较对植株生长过程的影响大;CesA家族成员在合成纤维素过程中相互协同作用,成员间存在功能冗余。【结论】系统鉴定出了16个玉米CesA家族成员,进一步明确了其彼此之间的功能协作及其在种子发育和植株生长过程中对干旱胁迫的响应程度。

关键词：纤维素合成酶玉米系统生物学干旱胁迫基因功能

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

Uranium mineralization formed through multi-stage superposition: Case of the Qianjiadian deposit in Songliao Basin, China

引用

能源地球科学(英文) 2021年第1期2卷 32-40页

作者： zhenyan Chen Qingchun Li Mingyi Liu Bairong Song Minqiang Cao miao Wang Liaohe Petroleum Exploration Bureau PanjinLiaoning124010China Department of Geology Northwest UniversityXi’an710069China Xi'an Center of Geological Survey CGSXi'an710054China

The Qianjiadian uranium deposit is located in the Kailu Depression of Songliao *** is a large-scale in-situ leachable uranium deposit of sandstone type and provides a typical case of the uranium deposits in the Songliao *** we analyze the impact of oil and gas on reduction alteration,and factors including low grade *** Qianjiadian uranium deposit is characterized as a typical rolltype deposit with interlayers in oxidized *** occurrence of reductive low-permeability sandstone in uranium reservoirs controls the morphology of the uranium-rich *** propose a metallogenic model involving multi-stage superposition characterized by“primary sediment enrichment-interlayer oxidation-superimposed transformation”.Our model would be helpful for formulating guidelines in the exploration for sandstone-type uranium deposits in the Songliao Basin.

关键词： Qianjiadian uranium deposit Sandstone-type uranium deposit Interlayer oxidation Hydrothermal transformation Metallogenic model

来源：

维普期刊数据库评论

在线全文

维普期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

茯苓多糖在秀丽隐杆线虫中的抗氧化和抗衰老作用及其作用机制

引用

中草药 2024年第4期55卷 1133-1144页

作者：宋祯彦黄亚琦王也彤邓嘉甄达贵谭年花成绍武湖南中医药大学中西医结合学院中西医结合心脑疾病防治湖南省重点实验室湖南长沙410208 靖州苗族侗族自治县质量计量检验检测中心湖南怀化418400

目的分析茯苓多糖成分对秀丽隐杆线虫体内抗氧化和抗衰老作用的影响,并阐明其潜在机制。方法将L4期线虫随机分为低、中、高剂量(10、20、40μg/mL)的茯苓多糖组和空白组进行培养;采用百草枯抗氧化实验、寿命实验、脂褐素测定实验、应激... 详细信息

目的分析茯苓多糖成分对秀丽隐杆线虫体内抗氧化和抗衰老作用的影响,并阐明其潜在机制。方法将L4期线虫随机分为低、中、高剂量(10、20、40μg/mL)的茯苓多糖组和空白组进行培养;采用百草枯抗氧化实验、寿命实验、脂褐素测定实验、应激实验(紫外/高温)、生理功能实验(吞咽频率/摆动次数/产卵量)探究茯苓多糖对野生型秀丽隐杆线虫抗氧化和抗衰老作用;将突变体线虫分为茯苓多糖组(40μg/mL)和空白组,采用应激实验、寿命实验、线虫BZIP结构域蛋白1(protein skinhead-1,skn-1)绿色荧光蛋白的细胞定位检测、qRT-PCR实验、活性氧(reactive oxygen species,ROS)检测探究茯苓多糖的抗衰老的作用机制。结果茯苓多糖显著延长线虫的寿命,减少脂褐素的产生,增强对紫外线和热胁迫的抵抗力,提高咽部泵血频率和运动能力,显示出显著的抗衰老生物活性。茯苓多糖的抗衰老作用是通过skn-1信号通路介导的,而不依赖于胰岛素样受体β亚基(insulin-like receptor subunit beta,daf-2)和神经元乙酰胆碱受体亚基eat-2(neuronal acetylcholine receptor subunit eat-2,eat-2)信号通路。茯苓多糖增加了线虫中skn-1转录因子的核定位,上调了下游抗氧化基因谷胱甘肽S-转移酶4(glutathione S-transferase 4,gst-4)和gst-7的转录水平,并显著降低了细胞内ROS水平。然而,在skn-1突变体蠕虫中未观察到这些效应。结论茯苓多糖在秀丽隐杆线虫中表现出抗氧化和抗衰老的作用,其机制涉及调控skn-1转录因子及其下游抗氧化基因,最终降低ROS水平,增强机体的抗氧化应激能力。

关键词：茯苓多糖秀丽隐杆线虫抗衰老抗氧化 BZIP结构域蛋白1

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

基于六经病“欲解时”解读仲景时间医学的应用

引用

陕西中医药大学学报 2024年第3期47卷 43-47页

作者：周千易亚乔陈延杰刘林宋祯彦邓奕辉杨新湖南中医药大学湖南长沙410208 湖南中医药大学第一附属医院湖南长沙410007 湘西土家族苗族自治州民族中医院湖南吉首433100

中医有关的时间医学理论是以中医理论为指导,研究人体生理病理与自然界时间节律对应关系的学科。该理论起源于《黄帝内经》,继承和发展于张仲景,重点体现在《伤寒论》六经病的“欲解时”等内容,阐述其中蕴含的时间医学理论。通过对相关... 详细信息

中医有关的时间医学理论是以中医理论为指导,研究人体生理病理与自然界时间节律对应关系的学科。该理论起源于《黄帝内经》,继承和发展于张仲景,重点体现在《伤寒论》六经病的“欲解时”等内容,阐述其中蕴含的时间医学理论。通过对相关医史文献的探索研究,着眼于仲景及后世医家对人体时间节律的认识、疾病的发生发展节律以及择时治病等相关问题,综合近现代时间医学理论的发展,以丰富中医有关的时间医学理论,指导临床实践。

关键词：伤寒论时间医学六经病“欲解时” 张仲景文献研究

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

基于糖烯的碳苷合成方法研究进展

引用

有机化学 2020年第10期40卷 3094-3111页

作者：郭真言柏金和刘苗熊德彩叶新山北京大学天然药物及仿生药物国家重点实验室北京100191

碳苷是一类具有多种生物活性的糖类天然产物,其独特的C—C糖苷键构筑是糖化学研究中的热点和难点.通过双键官能团构建新的C—C键是有机化学中的常用策略.随着烯化学的飞速发展,含1,2-位双键的糖烯供体在碳苷合成中也取得了显著进步.从Fe... 详细信息

碳苷是一类具有多种生物活性的糖类天然产物,其独特的C—C糖苷键构筑是糖化学研究中的热点和难点.通过双键官能团构建新的C—C键是有机化学中的常用策略.随着烯化学的飞速发展,含1,2-位双键的糖烯供体在碳苷合成中也取得了显著进步.从Ferrier I型碳苷化反应、Heck偶联型碳苷化反应、1-取代糖烯的过渡金属催化偶联碳苷化反应、2-取代糖烯的Michael加成型和自由基加成型碳苷化反应等方面,总结近年来基于糖烯的碳苷合成方法.

关键词：糖烯碳苷碳苷化反应碳水化合物

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

峡江水利枢纽工程T形预应力梁施工技术

引用

施工技术 2013年第12期42卷 59-60,64页

作者：朱刘东刘淼廖振炎武警水电第二总队第五支队江苏常州213135

峡江水利枢纽工程泄水闸轨道梁为预应力T形梁结构,采用后张法预应力施工。在预制生产过程中,通过控制配合比设计,模板制作,钢筋绑扎和混凝土浇筑优化和养护等,保证了混凝土的施工质量,为预应力施工创造了条件。预应力施工过程中,严格控... 详细信息

峡江水利枢纽工程泄水闸轨道梁为预应力T形梁结构,采用后张法预应力施工。在预制生产过程中,通过控制配合比设计,模板制作,钢筋绑扎和混凝土浇筑优化和养护等,保证了混凝土的施工质量,为预应力施工创造了条件。预应力施工过程中,严格控制张拉程序,保证了预应力T形梁的施工质量。

关键词：水利枢纽工程梁后张法预应力优化

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

化痰消瘀方治疗胃癌前病变的分子机制研究

引用

中药药理与临床 2021年第1期37卷 172-179页

作者：崔国良冯小可吴娟苗正月林贞妍蒋金桃魏睦新南京医科大学第一附属医院中医科南京210029 南京医科大学中西医结合研究所南京210029

目的:基于网络药理学预测和胃癌前病变(PLGC)大鼠模型验证的方法,探讨化痰消瘀方治疗胃癌前病变的分子机制。方法:利用网络药理学技术筛选化痰消瘀方治疗胃癌前病变的关键活性成分及其作用靶点,并进行蛋白质间相互作用分析,GO功能富集和... 详细信息

目的:基于网络药理学预测和胃癌前病变(PLGC)大鼠模型验证的方法,探讨化痰消瘀方治疗胃癌前病变的分子机制。方法:利用网络药理学技术筛选化痰消瘀方治疗胃癌前病变的关键活性成分及其作用靶点,并进行蛋白质间相互作用分析,GO功能富集和KEGG通路富集。建立PLGC大鼠模型,给予化痰消瘀方干预治疗12 w,苏木精-伊红染色法观察大鼠胃黏膜组织的病理学改变,AB-PAS染色法观察大鼠胃黏膜组织的肠上皮化生病理改变,免疫组化法对预测结果中PI3K/Akt信号通路的相关蛋白表达进行分析。结果:网络药理学结果显示:化痰消瘀方含有98个活性成分,作用于129个靶点,主要涉及酶结合、药物反应、细胞凋亡调控等生物学途径以及PI3K/Akt、TNF等信号通路。动物实验验证结果显示:与模型对照组比较,化痰消瘀方干预治疗后可改善PLGC大鼠胃黏膜组织病理学改变,并减轻肠上皮化生等病理改变,PI3K/Akt信号通路中相关蛋白p-Akt、p-PI3K、mTOR表达下调,PTEN表达上调。结论:化痰消瘀方通过多成分、多靶点、多通路共同作用治疗PLGC,其中PI3K/Akt信号通路是其作用的主要通路之一。

关键词：网络药理学化痰消瘀方胃癌前病变磷脂酰肌醇3-激酶蛋白激酶B

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

欢迎您,

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

欢迎您,

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

在线全文

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：