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The miR159a-DUO1 module regulates pollen development by modulating auxin biosynthesis and starch metabolism in citrus

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Journal of Integrative Plant Biology 2024年第7期66卷 1351-1369页

作者： Yanhui Xu Wenxiu Tian Minqiang Yin zhenmei cai Li Zhang Deyi Yuan Hualin Yi Juxun Wu National Key Laboratory for Germplasm Innovation&Utilization of Horticultural Crops Huazhong Agricultural UniversityWuhan 430070China Key Laboratory of Cultivation and Protection for Non‐Wood Forest Trees of the Ministry of Education and Key Laboratory of Non‐Wood Forest Products of the Forestry Ministry Central South University of Forestry and TechnologyChangsha 410004China

Achieving seedlessness in citrus varieties is one of the important objectives of citrus *** sterility associated with abnormal pollen development is an important factor in ***,our understanding of the regulatory mechanism underlying the seedlessness phenotype in citrus is still ***,we determined that the miR159a-DUO1 module played an important role in regulating pollen development in citrus,which further indirectly modulated seed development and fruit *** the overexpression of csi-miR159a and the knocking out of DUO1 in Hong Kong kumquat(Fortunella hindsii)resulted in small and seedless fruit ***,pollen was severely aborted in both transgenic lines,with arrested pollen mitotic I and abnormal pollen starch *** additional cross-pollination experiments,DUO1 was proven to be the key target gene for miR159a to regulate male sterility in *** on DNA affinity purification sequencing(DAP-seq),RNA-seq,and verified interaction assays,YUC2/YUC6,SS4 and STP8 were identified as downstream target genes of DUO1,those were all positively regulated by *** transgenic *** lines,the miR159a-DUO1 module down-regulated the expression of YUC2/YUC6,which decreased indoleacetic acid(IAA)levels and modulated auxin signaling to repress pollen mitotic *** miR159a-DUO1 module reduced the expression of the starch synthesis gene SS4 and sugar transport gene STP8 to disrupt starch metabolism in ***,this work reveals a new mechanism by which the miR159a-DUO1 module regulates pollen development and elucidates the molecular regulatory network underlying male sterility in citrus.

关键词： auxin citrus male sterility miRNA pollen development seedlessness starch metabolism

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新冠肺炎患者总病程及影响因素分析

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现代医药卫生 2021年第11期37卷 1800-1803页

作者：贾平高税刘平郑珊珊蔡珍梅杜先智重庆市长寿区人民医院呼吸与危重症医学科 401220 重庆医科大学附属第二医院呼吸与危重症医学科重庆400010

目的研究影响新冠肺炎总病程长短的因素。方法收集2020年1-3月收治的70例新冠肺炎患者的临床资料,对其性别、年龄、从感染到发病时间、住院时间、发病前2周内是否规范使用抗病毒药物治疗及治疗种类、病程中最低淋巴细胞计数、最高C反应... 详细信息

目的研究影响新冠肺炎总病程长短的因素。方法收集2020年1-3月收治的70例新冠肺炎患者的临床资料,对其性别、年龄、从感染到发病时间、住院时间、发病前2周内是否规范使用抗病毒药物治疗及治疗种类、病程中最低淋巴细胞计数、最高C反应蛋白、病程中核酸检测阳性的次数、是否合并其他基础疾病等进行分析,对上述影响因素进行单因素回归分析,再进行线性回归分析,建立logistic多因素回归模型。结果患者感染至发病时间、发病前2周内是否规范使用抗病毒药物治疗及治疗种类、病程中最低淋巴细胞计数、最高C反应蛋白、病程中核酸检测阳性的次数为新冠肺炎患者病程发展的危险因素(OR=1.000,P<0.05)。患者多因素回归模型结果显示,患者感染到发病时间越短,患者患病严重程度越高(OR=1.141,P=0.007);患者发病前2周内规范使用抗病毒药物治疗越多,患者病程中病情越轻(OR=0.991,P<0.001);患者病程中最低淋巴细胞计数越低,患者病情越严重(OR=0.062,P<0.001);患者病程中C反应蛋白水平越高,患者病情越严重(OR=0.266,P<0.001);患者病程中核酸检测阳性的次数越多,患者病情越严重(OR=1.135,P=0.005)。结论新冠肺炎患者在其疾病发展过程中,患者感染住院至发病时间、发病前2周内是否规范使用抗病毒药物治疗及治疗种类、病程中最低淋巴细胞计数、最高C反应蛋白、病程中核酸检测阳性的次数对患者影响最大,可判断为影响因素。

关键词：新冠肺炎病程影响因素临床分析

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基于GAT双聚合运算与归纳式矩阵补全的关联预测

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计算机工程 2022年第12期48卷 72-78页

作者：张奕郑婧蔡钢生王真梅桂林理工大学信息科学与工程学院广西桂林541004 广西嵌入式技术与智能系统重点实验室广西桂林541004

可计算模型能够有效替代生物实验进行长链非编码RNA(lncRNA)-疾病的关联预测,但由于存在已知数据稀疏性问题,导致现有模型的预测精度不高。针对这一局限性,提出基于图注意力网络与归纳式矩阵补全技术的双融合机制lncRNA-疾病关联预测模... 详细信息

可计算模型能够有效替代生物实验进行长链非编码RNA(lncRNA)-疾病的关联预测,但由于存在已知数据稀疏性问题,导致现有模型的预测精度不高。针对这一局限性,提出基于图注意力网络与归纳式矩阵补全技术的双融合机制lncRNA-疾病关联预测模型(DFMP-LDA)。引入n头注意力机制,设计带有双重聚合器的图注意力网络,增强lncRNA节点与疾病节点的特征,避免数据稀疏性导致模型预测精度不高的问题。在此基础上,针对传统图注意力网络不能直接应用于潜在lncRNA-疾病对关联预测的问题,引入归纳式矩阵补全技术,应用增强后的节点特征重建lncRNA-疾病关联网络,进一步提高模型的预测精度。5折交叉验证结果表明,DFMP-LDA预测lncRNA-疾病关联的AUC值为0.9322,AUPR值为0.7705,在时间成本上分别较DMF-LDA、SDLDA、TPGLDA模型节省33.89%、32.17%、16.12%,预测性能较优。

关键词：图注意力网络归纳式矩阵补全关联预测双重聚合器特征增强

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基于语义与全局双重注意力机制的长链非编码RNA-疾病关联预测模型

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计算机应用 2023年第7期43卷 2125-2132页

作者：张奕蔡钢生王真梅桂林理工大学信息科学与工程学院广西桂林541006 广西嵌入式技术与智能系统重点实验室(桂林理工大学) 广西桂林541006

针对现有长链非编码RNA(lncRNA)-疾病关联预测模型在综合利用异构生物网络的交互、语义信息上存在局限性的问题,提出一种基于语义与全局双重注意力机制的lncRNA-疾病关联预测模型(SGALDA)。首先,基于相似性和已知关联构建一个lncRNA-疾... 详细信息

针对现有长链非编码RNA(lncRNA)-疾病关联预测模型在综合利用异构生物网络的交互、语义信息上存在局限性的问题,提出一种基于语义与全局双重注意力机制的lncRNA-疾病关联预测模型(SGALDA)。首先,基于相似性和已知关联构建一个lncRNA-疾病-微小RNA(miRNA)异构网络,并基于消息传递类型设计特征提取模块来提取和融合异构网络上同质、异质节点的邻域特征,以捕捉异构网络上的多层面交互关系。其次,基于元路径将异构网络分解为多个语义子网络,并分别在各个子网络上应用图卷积网络(GCN)来提取节点的语义特征,以捕捉异构网络上的高阶交互关系。然后,基于语义与全局双重注意力机制融合节点的语义和邻域特征,以获得更具代表性的节点特征。最后,利用lncRNA节点特征和疾病节点特征的内积运算重建lncRNA-疾病关联。5折交叉验证结果显示,SGALDA的受试者工作特征曲线下面积(AUROC)为0.9945±0.0002,PR曲线下面积(AUPR)为0.9167±0.0011,在所有对比模型中均为最高,验证了SGALDA良好的预测性能。对乳腺癌、胃癌的案例研究进一步证实了SGALDA识别潜在lncRNA-疾病关联的能力,说明SGALDA有潜力成为一种可靠的lncRNA-疾病关联预测模型。

关键词：关联预测异构网络元路径双重注意力图卷积网络长链非编码RNA

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大清河-白洋淀流域生态功能评价及分区初探

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环境科学学报 2022年第1期42卷 131-140页

作者：廖珍梅杨薇蔡宴朋王烜熊文抒北京师范大学环境学院水环境模拟国家重点实验室北京100875 北京师范大学环境学院水沙科学教育部重点实验室北京100875 广东工业大学环境生态工程研究院广东省流域水环境治理与水生态修复重点实验室广州510006

基于生态系统服务功能对流域生态环境进行功能分区是流域生态环境保护与修复的重要基础.本研究使用InVEST模型,对大清河-白洋淀流域2010、2015及2018年的生境质量、碳储量及土壤侵蚀等生态系统服务功能进行评价.结果表明:2010—2015年... 详细信息

基于生态系统服务功能对流域生态环境进行功能分区是流域生态环境保护与修复的重要基础.本研究使用InVEST模型,对大清河-白洋淀流域2010、2015及2018年的生境质量、碳储量及土壤侵蚀等生态系统服务功能进行评价.结果表明:2010—2015年流域生态环境相对稳定;2015—2018年生境质量提升,土壤侵蚀缓解,但碳储量有所下降;流域内72.91%的区域处于中度敏感状态,3.99%的区域处于高度敏感状态,生态功能现状不容乐观.在此基础上叠加分析各子功能评价地图,将研究区划分为3个一级功能区及7个二级功能区,旨在今后对各功能区采取针对性的利用和管理策略,以维持和改善生境质量,为区域可持续发展提供支撑.

关键词：生态系统服务评价功能分区 InVEST模型大清河-白洋淀流域

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巡回护士加强眼睛护理干预对患者手术中眼睛的保护效果

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中国医药指南 2023年第32期21卷 175-177页

作者：蔡艺敏陈珍梅厦门大学附属第一医院杏林分院福建厦门361000

目的分析巡回护士眼睛护理干预对患者手术中眼睛的保护效果。方法随机将2023年6月1日至2023年6月30日130例手术患者随机分为对照组、观察组各65例,其中对照组采用常规眼睛护理干预,而观察组则采用巡回护士眼睛护理干预,对比护理后两组... 详细信息

目的分析巡回护士眼睛护理干预对患者手术中眼睛的保护效果。方法随机将2023年6月1日至2023年6月30日130例手术患者随机分为对照组、观察组各65例,其中对照组采用常规眼睛护理干预,而观察组则采用巡回护士眼睛护理干预,对比护理后两组患者的眼睛并发症发生率、保护眼睛操作时间及手术护理的满意度。结果相比对照组,观察组眼睛畏光、流泪、异物感、结膜充血、角膜损伤等并发症发生率更低(P<0.05);观察组患者在保护眼睛操作时无需涂抹、擦拭眼膏,贴敷前虽然要耗费一定的折叠时间,但揭除敷料方便,总操作时间更短(P<0.05);观察组护理满意度更高(P<0.05)。结论手术中巡回护士加强患者眼睛护理,可以降低患者眼睛损伤,患者舒适度更高,术中眼部护理满意度高。

关键词：巡回护士手术患者眼睛护理并发症

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预见性护理对神经外科手术患者压力性损伤防范的应用效果分析

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中外医疗 2021年第29期40卷 151-155页

作者：陈珍梅柯艺灵蔡艺敏厦门大学附属第一医院杏林分院麻醉手术室福建厦门361022

目的探析神经外科手术患者术中实施预见性护理的压力性损伤预防效果。方法便利选取2018年1—12月该院神经外科收治的55例急诊手术患者纳入参照组,以2019年1—12月收治的55例急诊手术患者纳入研究组。参照组行常规压力性损伤预防护理,研... 详细信息

目的探析神经外科手术患者术中实施预见性护理的压力性损伤预防效果。方法便利选取2018年1—12月该院神经外科收治的55例急诊手术患者纳入参照组,以2019年1—12月收治的55例急诊手术患者纳入研究组。参照组行常规压力性损伤预防护理,研究组同时行预见性护理,包括术前风险评估、术中体位摆放、术中综合保护、避免术中器械压力性损伤、重点部位监护以及术后观察与交接,应用手术室压力性损伤风险门罗评分表评测两组患者术后及住院期间压力性损伤发生风险,并比较两组患者压力性损伤的发生情况。结果研究组术后0.5 h未发生压力性损伤,术后72 h发生1期压力性损伤1例,2期压力性损伤1例;参照组术后0.5 h发生1期压力性损伤6例,术后72 h发生1期压力性损伤6例,2期压力性损伤3例,3期压力性损伤1例。研究组术后0.5 h、72 h的压力性损伤发生率分别为0.00%、3.64%,参照组分别为10.91%、18.18%,差异有统计学意义(χ^(2)=4.407、5.986,P<0.05);观察组护理总满意度高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论在神经外科手术患者中参实施压力性损伤预见性护理,可有效降低压力性损伤风险,减少术中压力性损伤发生,有着重要临床意义。

关键词：预见性护理神经外科手术压力性损伤防范

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一例以痛风为主要表现的糖原累积症Ⅰa型患者的遗传学分析

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中华医学遗传学杂志 2020年第10期37卷 1162-1166页

作者：蔡丹卢春燕安振梅田浩明张玉梅陈涛四川大学华西医院内分泌代谢科成都610041 成都市郫都区人民医院内分泌科 611730

目的探讨1例以痛风为主要临床表现的糖原累积症Ⅰa型患者的遗传学病因。方法收集患者的临床资料,对患者及其父母进行二代测序,对疑似致病变异用Sanger测序进行验证。结果患者为30岁女性,主要表现为高尿酸血症、慢性痛风性关节炎、空腹... 详细信息

目的探讨1例以痛风为主要临床表现的糖原累积症Ⅰa型患者的遗传学病因。方法收集患者的临床资料,对患者及其父母进行二代测序,对疑似致病变异用Sanger测序进行验证。结果患者为30岁女性,主要表现为高尿酸血症、慢性痛风性关节炎、空腹低血糖、高甘油三酯血症、高乳酸血症、肝肿大、泌尿系结石,并逐渐出现肝脏结节、肾功能不全。测序发现其携带G6PC基因c.648G>T和c.260delG复合杂合变异,分别遗传自其父亲(表型正常)和母亲(患高尿酸血症),其中c.260delG移码变异既往未见报道。生物信息学分析预测二者均为致病性。结论患者被诊断为G6PC基因缺陷导致的糖原累积症Ⅰa。患高尿酸血症和(或)痛风的青年女性,在合并其他糖脂代谢异常时,应注意排除糖原累积症Ⅰa型。

关键词：糖原累积症Ⅰa型痛风高尿酸血症 G6PC基因

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不同地域海岛棉基于表型的遗传多样性研究

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分子植物育种 2018年第9期16卷 3039-3057页

作者：路普周忠丽蔡小彦王星星王玉红张振梅王坤波刘方中国农业科学院棉花研究所棉花生物学国家重点实验室安阳455000

本研究基于13个表型特征对9个国家的208份海岛棉材料进行了遗传多样性分析。试验显示,208份海岛棉表型性状平均变异系数18.33%,平均多样性指数1.30。对不同来源海岛棉表型性状进行多重比较分析发现,伸长率和马克隆值差异不显著,铃形差... 详细信息

本研究基于13个表型特征对9个国家的208份海岛棉材料进行了遗传多样性分析。试验显示,208份海岛棉表型性状平均变异系数18.33%,平均多样性指数1.30。对不同来源海岛棉表型性状进行多重比较分析发现,伸长率和马克隆值差异不显著,铃形差异显著,其他性状差异极显著。对各性状间的相关分析发现38对性状极显著相关,12对性状显著相关。通过因子分析将表型性状简化为5个互不相关的主成分,累计贡献率达81.69%。通过聚类分析,将208份材料在阈值21.5处划分为6个类群。试验表明:海岛棉种质各性状具有广泛变异性和多样性;中国主产区海岛棉材料遗传多样性最为丰富,但产量性状较差,美洲海岛棉材料的纤维品质优势明显;表型性状的5个主成分分别为纤维品质因子、棉铃特征因子、果枝特征因子、株高因子和马克隆值因子;各类群具有明显的区域性和品质差异性。这些结果为拓宽中国海岛棉的遗传基础,提高中国海岛棉育种效率有重要参考价值。

关键词：海岛棉表型性状遗传多样性聚类分析

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工程机械轮胎胎面基部胶配方的开发

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轮胎工业 2019年第10期39卷 607-610页

作者：贾振梅李向军高雪梅蔡利超双钱集团上海轮胎研究所有限公司上海200245 双钱集团(江苏)轮胎有限公司江苏如皋226500

研究炭黑/白炭黑用量比对工程机械轮胎胎面基部胶性能的影响。结果表明:随着炭黑用量的减小、白炭黑用量的增大,胶料的Payne效应逐渐减弱,t10和t90呈逐渐延长趋势;硫化胶的100%和300%定伸应力逐渐减小,拉断伸长率逐渐增大,耐屈挠性能提... 详细信息

研究炭黑/白炭黑用量比对工程机械轮胎胎面基部胶性能的影响。结果表明:随着炭黑用量的减小、白炭黑用量的增大,胶料的Payne效应逐渐减弱,t10和t90呈逐渐延长趋势;硫化胶的100%和300%定伸应力逐渐减小,拉断伸长率逐渐增大,耐屈挠性能提高,生热降低;将炭黑/白炭黑用量比为23/30的试验配方用于制备成品轮胎,轮胎的高速耐久性能大幅提高。

关键词：工程机械轮胎胎面基部胶白炭黑 Payne效应生热高速耐久性能

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