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Characterizing structural variants based on graph-genotyping provides insights into pig domestication and local adaption

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Journal of Genetics and Genomics 2024年第4期51卷 394-406页

作者： xin Li Quan Liu Chong Fu Mengxun Li Changchun Li xinyun Li shuhong Zhao Zhuqing zheng Key Lab of Agricultural Animal Genetics Breeding and Reproduction of Ministry of Education and Key Laboratory of Swine Genetics and Breeding of Ministry of AgricultureCollege of Animal Science and TechnologyHuazhong Agricultural UniversityWuhanHubei 430070China Institute of Agricultural Biotechnology Jingchu University of TechnologyJingmenHubei 448000China The Cooperative Innovation Center for Sustainable Pig Production WuhanHubei 430070China Hubei Hongshan Laboratory WuhanHubei 430070China

Structural variants(SVs),such as deletions(DELs)and insertions(INSs),contribute substantially to pig genetic diversity and phenotypic *** a library of SVs discovered from long-read primary assemblies and short-read sequenced genomes,we map pig genomic SVs with a graph-based method for re-genotyping SVs in 402 *** results demonstrate that those SVs harboring specific trait-associated genes may greatly shape pig domestication and local *** characterization of SVs reveals that some population-stratified SVs may alter the transcription of genes by affecting regulatory *** identify that the genotypes of two DELs(296-bp DEL,chr7:52,172,101e52,172,397;278-bp DEL,chr18:23,840,143 e23,840,421)located in muscle-specific enhancers are associated with the expression of target genes related to meat quality(FSD2)and muscle fiber hypertrophy(LMOD2 and WASL)in *** results highlight the role of SVs in domestic porcine evolution,and the identified candidate functional genes and SVs are valuable resources for future genomic research and breeding programs in pigs.

关键词： Pigs Structural variation Selection signatures Regulatory elements

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屋面雨水集汇过程中新污染物分布及归趋特性

环境科学 2024年第7期45卷 4032-4043页

作者：巨昕玥高赞郑文昊张琼华西安建筑科技大学环境与市政工程学院西安710055 西安建筑科技大学西北水资源与环境生态教育部重点实验室西安710055

雨水中新污染物(ECs)识别逐渐受到广泛关注,掌握其在降水过程赋存及迁变特性成为雨水资源化利用的关键.选取典型屋面,研究了2023年春季3~5月期间6场降雨事件不同集汇过程中雨水水质状况及ECs赋存差异,采用主成分分析(PCA)和相关性分析,... 详细信息

雨水中新污染物(ECs)识别逐渐受到广泛关注,掌握其在降水过程赋存及迁变特性成为雨水资源化利用的关键.选取典型屋面,研究了2023年春季3~5月期间6场降雨事件不同集汇过程中雨水水质状况及ECs赋存差异,采用主成分分析(PCA)和相关性分析,探明了屋面雨水集汇过程中ECs归趋特性.结果表明,54种目标ECs在净湿沉降、干湿沉降和屋面径流过程中共检出44种,总浓度范围为63.0~432.4 ng·L^(-1)(平均值为166.8 ng·L^(-1)).其中,双酚A(BPA)浓度水平最高,其范围为14.7~265.6 ng·L^(-1)(平均值为62.5 ng·L^(-1)),其次为氧氟沙星(OFX)和甲氧基肉桂酸乙基己酯(EHMC);溶解性有机质(DOM)、氮污染物和颗粒物是影响ECs赋存特性的重要因子,Mantel相关系数最高可达0.98(P<0.01);初期雨水集汇过程中净湿沉降的ECs浓度最高,而后期干湿沉降和屋面径流的ECs浓度较高,干、湿沉降对屋面径流的ECs平均贡献率分别为21.48%和78.52%,药品与个人护理品(PPCPs)、内分泌干扰物(EDCs)和农药等在集汇过程中超30%沉积在屋面.研究结果可为城市屋面径流中的ECs识别和控制以及雨水安全利用提供科学理论依据.

关键词：新污染物(ECs) 屋面径流湿沉降干沉降集汇过程

Stepped-up development of accelerator mass spectrometry method for the detection of ^(60)Fe with the HI-13 tandem accelerator

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Nuclear Science and Techniques 2024年第4期35卷 136-143页

作者： Yang Zhang Sheng-Quan Yan Ming He Qing-Zhang Zhao Wen-Hui Zhang Chao-xin Kan Jian-Ming Zhou Kang-Ning Li Xiao-Fei wang Jian-Cheng Liu Zhao-Hua Peng Zhuo Liang Ai-Ling Li Jian zheng Qi-Wen Fan Yun-ju Li You-Bao wang Zhi-Hong Li Yang-Ping Shen Ding Nan Wei Nan Yu-Qiang Zhang Jia-Ying-Hao Li jun-Wen Tian Jiang-Lin Hou Chang-xin Guo Zhi-Cheng Zhang Ming-Hao Zhu Yu-Wen Chen Yu-Chen Jiang Tao Tian Jin-Long Ma Yi-Hui Liu Jing-Yu Dong Run-Long Liu Mei-Yue-Nan Ma Yong-Shou Chen Wei-Ping Liu Bing Guo China Institute of Atomic Energy P.O.Box 275(10)Beijing 102413China College of Science Southern University of Science and TechnologyShenzhen 518055China School of Physics Xi’an Jiaotong UniversityXi’an 710049China

The Moon provides a unique environment for investigating nearby astrophysical events such as *** samples retain valuable information from these events,via detectable long-lived“fingerprint”radionuclides such as^(60)*** this work,we stepped up the development of an accelerator mass spectrometry(AMS)method for detecting^(60)Fe using the HI-13tandem accelerator at the China Institute of Atomic Energy(CIAE).Since interferences could not be sufficiently removed solely with the existing magnetic systems of the tandem accelerator and the following Q3D magnetic spectrograph,a Wien filter with a maximum voltage of±60 kV and a maximum magnetic field of 0.3 T was installed after the accelerator magnetic systems to lower the detection background for the low abundance nuclide^(60)Fe.A 1μm thick Si_(3)N_(4) foil was installed in front of the Q3D as an energy *** particle detection,a multi-anode gas ionization chamber was mounted at the center of the focal plane of the ***,an^(60)Fe sample with an abundance of 1.125×10^(-10)was used to test the new AMS *** results indicate that^(60)Fe can be clearly distinguished from the isobar^(60)*** sensitivity was assessed to be better than 4.3×10^(-14)based on blank sample measurements lasting 5.8 h,and the sensitivity could,in principle,be expected to be approximately 2.5×10^(-15)when the data were accumulated for 100 h,which is feasible for future lunar sample measurements because the main contaminants were sufficiently separated.

关键词： Accelerator mass spectrometry Wien filter Isobar separation Supernovae Chang'e-5 lunar samples

外源褪黑素介导抗氧化和苯丙烷代谢提高燕麦叶斑病抗性的研究

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草业学报 2024年第10期33卷 135-146页

作者：王正李新张建贵柴继宽赵桂琴牛奎举甘肃农业大学草业学院草业生态系统教育部重点实验室甘肃兰州730070

为探究外源褪黑素对燕麦抗叶斑病的诱导效应及诱导抗病机理,本研究以‘牧乐思’燕麦品种为试验材料,叶面喷施不同浓度褪黑素(0、10、100、250、500和1000μmol·L^(-1))后接种燕麦徳氏霉病原菌,以未接种病原菌为对照,接种病原菌9 d后统... 详细信息

为探究外源褪黑素对燕麦抗叶斑病的诱导效应及诱导抗病机理,本研究以‘牧乐思’燕麦品种为试验材料,叶面喷施不同浓度褪黑素(0、10、100、250、500和1000μmol·L^(-1))后接种燕麦徳氏霉病原菌,以未接种病原菌为对照,接种病原菌9 d后统计病情指数和采集叶片测定抗氧化系统、苯丙烷代谢相关生理指标和相关酶基因相对表达量。结果表明,叶斑病明显抑制燕麦生长,喷施不同浓度褪黑素后叶斑病病情指数明显降低,其中100μmol·L^(-1)褪黑素处理下病原菌体外诱导效率、过氧化氢酶、苯丙氨酸解氨酶活性和抗坏血酸过氧化物酶基因表达量最高,分别高于只接种病原菌处理50.72%、80.32%、3.88%和148.00%;250μmol·L^(-1)褪黑素处理下超氧阴离子产生速率和丙二醛含量最低,分别低于只接种病原菌处理28.27%和86.62%,超氧化物歧化酶、过氧化物酶、抗坏血酸过氧化物酶、肉桂酸-4-羟化酶、4-香豆酸∶辅酶A连接酶活性、木质素、总酚、类黄酮含量和超氧化物歧化酶、过氧化物酶、过氧化氢酶、苯丙氨酸解氨酶、4-香豆酸∶辅酶A连接酶、肉桂酸-4-羟化酶基因表达量最高,分别高于只接种病原菌处理128.23%、137.14%、74.00%、52.65%、26.73%、1.40%、10.33%、13.70%、352.56%、80.32%、65.71%、26.65%、52.65%和20.11%;500μmol·L^(-1)褪黑素处理下过氧化氢含量最低,低于只接种病原菌处理75.45%,叶绿素含量最高,高于只接种病原菌处理81.35%。综合各项指标结果,筛选出最适诱导浓度为250μmol·L^(-1),试验结果可为燕麦防治叶斑病提供新途径。

关键词：燕麦褪黑素诱导抗病性叶斑病

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UHPLC-TOF-MS结合网络药理学及实验验证研究交泰丸治疗抑郁症的作用机制

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中国中药杂志 2024年第7期49卷 1896-1904页

作者：黄茜戴国梁杨欣怡曹阳居文政南京中医药大学附属医院临床药理科江苏南京210029

利用UHPLC-TOF-MS技术分析交泰丸在正常大鼠体内入血成分,通过网络药理学和动物实验研究交泰丸治疗抑郁症的作用机制。利用UHPLC-TOF-MS技术检测大鼠灌胃交泰丸后的入血成分,结合DisGeNET、SwissTargetPrediction等数据库筛选抑郁症与... 详细信息

利用UHPLC-TOF-MS技术分析交泰丸在正常大鼠体内入血成分,通过网络药理学和动物实验研究交泰丸治疗抑郁症的作用机制。利用UHPLC-TOF-MS技术检测大鼠灌胃交泰丸后的入血成分,结合DisGeNET、SwissTargetPrediction等数据库筛选抑郁症与交泰丸入血成分的交集靶点,构建蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络。将关键靶点导入DAVID平台进行基因本体论(Gene Ontology,GO)分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路注释,结合成分、靶点和通路,利用Cytoscape 3.9.1软件构建“成分-靶点-通路”网络,预测交泰丸治疗抑郁症的关键靶点及通路。建立大鼠慢性不可预知性温和应激(chronic unpredictable mild stress,CUMS)抑郁模型,进行行为学实验,ELISA法检测大鼠血清炎症因子和脑内神经递质水平,蛋白免疫印迹(Western blot)法检测大鼠海马组织中关键靶点表达。结果鉴定出交泰丸在正常大鼠体内入血成分共17个,10个为生物碱类化合物。入血成分与疾病共有交集靶点124个,根据PPI网络结果筛选出核心靶点52个,其中包括NLRP3和caspase-1等,KEGG富集结果显示主要涉及NOD样受体通路等15条典型通路。动物实验研究结果显示,交泰丸可显著改善CUMS抑郁模型大鼠的抑郁样行为,提高脑内神经递质5-羟色胺(5-hydroxytryptamine,5-HT)、多巴胺(dopamine,DA)及去甲肾上腺素(norepinephrine,NE)的水平,降低血清白细胞介素-1β(interlenkin-1β,IL-1β)、肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)及白细胞介素-6(interlenkin-6,IL-6)水平,下调海马区NLRP3和caspase-1蛋白表达水平,抑制NLRP3介导的NOD样受体信号通路。综上所述,交泰丸可能通过抑制NLRP3炎症小体,抑制NLRP3介导的NOD样受体通路,发挥抗抑郁的作用。

关键词：交泰丸抑郁症网络药理学 UHPLC-TOF-MS 炎症

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基于信息技术的物理化学实验教学研究与实践

化工管理 2024年第11期 34-37页

作者：郑勇耿翠环王鑫王书红张换平安阳工学院化学与环境工程学院安阳市低温电解铝与节能减排重点实验室河南安阳455000

物理化学实验是本科高校化工类专业普遍开设的一门基础必修课程,文章针对该课程传统的教学方法存在的问题,从可视化实验教学、专业计算机软件的应用、虚拟仿真教学、线上辅助教学四个方面进行了分析与探讨,提出了充分利用现代信息技术... 详细信息

物理化学实验是本科高校化工类专业普遍开设的一门基础必修课程,文章针对该课程传统的教学方法存在的问题,从可视化实验教学、专业计算机软件的应用、虚拟仿真教学、线上辅助教学四个方面进行了分析与探讨,提出了充分利用现代信息技术的优势,进一步优化教学方法等措施,提高了教师团队的专业教学水平,调动了学生的学习积极性,拓宽了学生的知识面,增强了分析和解决专业问题的能力。

关键词：物理化学实验教学改革信息技术高等院校

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水力条件对PRO工艺效能影响及膜污染机理

中国环境科学 2024年第4期44卷 2103-2110页

作者：郑成龙朱明飞崔雯王一涵鞠欣雨张欢欢路孝振王琳张志斌山东建筑大学市政与环境工程学院山东济南250101 山东建筑大学资源与环境创新研究院山东济南250101

研究以单宁酸和海藻酸钠为模型污染物,考察了有效渗透压差、汲取液侧操作压力、错流剪切力等水力条件对压力阻尼渗透工艺效能的影响,并利用XDLVO理论分析了膜污染机理.结果表明,相比海藻酸钠,单宁酸主要吸附在膜的多孔支撑层内部,造成... 详细信息

研究以单宁酸和海藻酸钠为模型污染物,考察了有效渗透压差、汲取液侧操作压力、错流剪切力等水力条件对压力阻尼渗透工艺效能的影响,并利用XDLVO理论分析了膜污染机理.结果表明,相比海藻酸钠,单宁酸主要吸附在膜的多孔支撑层内部,造成的膜污染更为严重.当PRO过滤单宁酸时,较高的有效渗透压差和较大的错流剪切力提高了PRO工艺的水通量和功率密度水平,同时加重了膜污染,但是PRO膜对单宁酸的截留率均在85%以上.汲取液侧施加较高的操作压力,一方面减小了有效渗透压差,降低了水通量水平;另一方面提高了功率密度水平并缓解了膜污染,当操作压力从1bar增至4bar时,初始水通量降至10.5L/m^(2)h,而产能提高了200%.XDLVO计算结果表明,单宁酸的界面自由能更高,更容易相互聚合并粘附在PRO膜上,结合水力条件的影响,其造成的通量损失比海藻酸钠更严重.

关键词：压力阻尼渗透水力条件功率密度 XDLVO理论

An Observation on the Microphase Separation of Poly(methyl methacrylate)-block-Polystyrene Copolymer

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Chinese Chemical Letters 2001年第5期12卷 467-470页

作者： Jie DENG xin Song LI zheng Mei wang Gang SHAO ju zheng LIU Department of Chemical Engineering Southeast UniversityNanjing 210096

The phase behavior of a well-defined poly(methyl methacrylate)- b- polystyrene block copolymer was studied by transmission electron microscope. The results show that a microphase transition may have occurred in the copolymer film. A kind of lamellae and an ordered bicontinuous double-diamond morphology are observed clearly. The lamellar morphology reveals a larger period of about 400 nm.

关键词： Block copolymer phase separation atom transfer radical polymerization TEM

Investment risk evaluation of inland floating photovoltaic power plants in China using the HFLTS-TFN method

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Clean Energy 2021年第3期5卷 536-550页

作者： Yanli Xiao xin ju Bo Yu zheng wang Chuanbo Xu Economic and Technical Research Institute State Grid Ningxia Electric Power Co.Ltd.YinchuanNingxiaChina School of Economics and Management North China Electric Power UniversityBeijingChina

Inland floating photovoltaic power plants(IFPPPs)are the key to making full use of water advantages to develop solar resources in the *** the investment risk is an important prerequisite for promoting the projects on a large *** paper proposes a model to assess the investment risk of IFPPPs in ***,this paper identifies the investment risk factors and establishes an evaluation indicator system from four ***,the indicator data are collected and described by adopting hesitant fuzzy linguistic term sets and triangular fuzzy numbers to ensure soundness and ***,a weighted method combining the best-worst method and the entropy method are utilized to determine the indicator weights under the consideration of the impact of subjective preferences and objective ***,the results show that the overall risk level of China’s IFPPPs is‘medium low’.Fifth,sensitivity analysis and comparative analysis are implemented to examine the stability of the evaluation ***,this paper also provides some risk-response strategies for the development of China’s IFPPPs from economy,society,technology and environment.

关键词： inland floating photovoltaic power plants risk assessment HFLTS-TFN BWM