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Transfer learning enhanced graph neural network for aldehyde oxidase metabolism prediction and its experimental application

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Acta Pharmaceutica Sinica B 2024年第2期14卷 623-634页

作者： Jiacheng Xiong Rongrong Cui zhaojun Li Wei Zhang Runze Zhang Zunyun Fu Xiaohong Liu Zhenghao Li Kaixian chen Mingyue Zheng Drug Discovery and Design Center State Key Laboratory of Drug ResearchShanghai Institute of Materia MedicaChinese Academy of SciencesShanghai 201203China University of Chinese Academy of Sciences Beijing 100049China College of Computer and Information Engineering Dezhou UniversityDezhou 253023China AI Department Suzhou Alphama Biotechnology Co.Ltd.Suzhou 215000China Shanghai Institute for Advanced Immunochemical Studies and School of Life Science and TechnologyShanghaiTech UniversityShanghai 200031China State Key Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology Nanjing UniversityNanjing 210023China

Aldehyde oxidase(AOX)is a molybdoenzyme that is primarily expressed in the liver and is involved in the metabolism of drugs and other ***-mediated metabolism can result in unexpected outcomes,such as the production of toxic metabolites and high metabolic clearance,which can lead to the clinical failure of novel therapeutic *** models can assist medicinal chemists in rapidly evaluating the AOX metabolic risk of compounds during the early phases of drug discovery and provide valuable clues for manipulating AOX-mediated metabolism *** this study,we developed a novel graph neural network called AOMP for predicting AOX-mediated *** integrated the tasks of metabolic substrate/non-substrate classification and metabolic site prediction,while utilizing transfer learning from 13C nuclear magnetic resonance data to enhance its performance on both *** significantly outperformed the benchmark methods in both cross-validation and external *** AOMP,we systematically assessed the AOX-mediated metabolism of common fragments in kinase inhibitors and successfully identified four new scaffolds with AOX metabolism liability,which were validated through in vitro ***,for the convenience of the community,we established the first online service for AOX metabolism prediction based on AOMP,which is freely available at https://***.

关键词： Drugmetabolism Aldehyde oxidase Transferlearning Graph neural network Kinase inhibitor

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Targeting carnitine palmitoyl transferase 1A(CPT1A)induces ferroptosis and synergizes with immunotherapy in lung cancer

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Signal Transduction and Targeted Therapy 2024年第4期9卷 1675-1689页

作者： Lei Ma Chong chen Chunxing Zhao Tong Li Lingyu Ma Jiayu Jiang zhaojun Duan Qin Si Tsung-Hsien Chuang Rong Xiang Yunping Luo Department of Immunology Institute of Basic Medical SciencesChinese Academy of Medical SciencesSchool of Basic MedicinePeking Union Medical CollegeBeijing 100005China Collaborative Innovation Center for Biotherapy Institute of Basic Medical SciencesChinese Academy of Medical SciencesSchool of Basic MedicinePeking Union Medical CollegeBeijing 100005China Department of Lung Cancer Surgery Tianjin Medical University General HospitalTianjin 300052China Immunology Research Center National Health Research InstitutesZhunanMiaoliTaiwanROC Department of Immunology Nankai UniversityTianjin 300071China

Despite the successful application of immune checkpoint therapy,no response or recurrence is typical in lung *** stem cells(CSCs)have been identified as a crucial player in immunotherapy-related ***,a form of cell death driven by iron-dependent lipid peroxidation,is highly regulated by cellular metabolism remolding and has been shown to have synergistic effects when combined with *** adaption of CsCs drives tumor resistance,yet the mechanisms of their ferroptosis defense in tumor immune evasion remain ***,through metabolomics,transcriptomics,a lung epithelialspecific Cptla-knockout mouse model,and clinical analysis,we demonstrate that CPT1A,a key rate-limiting enzyme of fatty acid oxidation,acts with L-carnitine,derived from tumor-associated macrophages to drive ferroptosis-resistance and CD8^(+)T cells inactivation in lung ***,CPT1A restrains ubiquitination and degradation of c-Myc,while c-Myc transcriptionally activates CPT1A *** CPT1A/c-Myc positive feedback loop further enhances the cellular antioxidant capacity by activating the NRF2/GPX4 system and reduces the amount of phospholipid polyunsaturated fatty acids through ACSL4 downregulating,thereby suppressing ferroptosis in ***,targeting CPT1A enhances immune checkpoint blockadeinduced anti-tumor immunity and tumoral ferroptosis in tumor-bearing *** results illustrate the potential of a mechanismguided therapeutic strategy by targeting a metabolic vulnerability in the ferroptosis of CsCs to improve the efficacy of lung cancer immunotherapy.

关键词： immunotherapy metabolism peroxidation

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High Areal Capacity and Long Cycle Life Flexible Mild Quasi-Solid-State Ag-Zn Battery with Dendrite-Free Anode

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Energy & Environmental Materials 2024年第1期7卷 38-45页

作者： Yanzhe Zhu Renbo Zhu Fandi chen Shuo Zhang Yu-Chieh Kuo Peiyuan Guan Mengyao Li Yunjian Liu zhaojun Han Tao Wan Dawei Wang Caiyun Wang Dewei Chu School of Materials Science and Engineering The University of New South Wales School of Material science and Engineering Jiangsu University School of Chemical Engineering The University of New South Wales Intelligent Polymer Research Institute AIIM Innovation Campus University of Wollongong

Silver-zinc(Ag-Zn) batteries are a promising battery system for flexible electronics owing to their high safety,high energy density,and stable output ***,poor cycling performance,low areal capacity,and inferior flexib... 详细信息

关键词： binder-free electrodes dendrite-free flexible Ag–Zn battery mild electrolyte quasi-solid-state

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重型非公路汽车湿式离合器表面系数对接合特性影响的研究

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机械传动 2014年第8期38卷 47-50,55页

作者：陈兆俊大连职业技术学院汽车工程学院辽宁大连116037

针对湿式离合器在接合过程中存在的磨损和高温的问题,通过引用湿式离合器表面系数,以重型非公路汽车湿式离合器为研究对象,运用微凸体分布模型,研究湿式离合器在不同材料状态下摩擦因数和制动接合特性变化规律。分析结果表明,使用韦伯... 详细信息

针对湿式离合器在接合过程中存在的磨损和高温的问题,通过引用湿式离合器表面系数,以重型非公路汽车湿式离合器为研究对象,运用微凸体分布模型,研究湿式离合器在不同材料状态下摩擦因数和制动接合特性变化规律。分析结果表明,使用韦伯微凸体分布分析效果比使用传统分布模型接合时间长,接近实际工况;通过引入表面系数和韦伯分布后,在离合器接合初始阶段存在转矩波动,该转矩波动是造成震颤的主要原因;在接合末期存在制动转矩增加,可以通过引入斜率为正的摩擦因数-速度曲线解决,此外磨平材料的啮合时间要比跑合阶段的时间短。

关键词：湿式离合器表面系数接合特性

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Effects of endogenous L-cystathionine on enzymatic assays of serum homocysteine in samples from renal dialysis patients

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国际检验医学杂志 2012年第24期33卷 2969-2973页

作者： chen zhaojun Zhang Lahong Pan Feng Zheng Gaoming Li Huan Gao Li Michael Nicolaou Department of Laboratory the Affiliated Hospital of Hangzhou Normal University Nicopharm Pharmaceutical Solutions Inc. San DiegoCA 92117USA

Homocysteine (Hcy) is a thiol-containing amino acid produced by the intracellular demethylation of *** 80% of circulating Hcy in the blood is protein bound by disulfide *** remaining unbound Hcy combines by oxidation ... 详细信息

关键词：氨基酸蛋氨酸细胞血液医学研究

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多孔淀粉对卵巢切除大鼠脂质代谢的影响

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食品科学 2017年第3期38卷 214-219页

作者：张晶陈兵陈朝军刘雄西南大学食品科学学院重庆400715 贵州省马铃薯研究所贵州贵阳550006

目的:研究多孔淀粉对卵巢切除大鼠脂质代谢的影响。方法:将24只雌性SD大鼠按体质量随机分为3组,其中一组进行伪切除手术,其余两组进行双侧卵巢切除手术,手术后恢复1周,分别饲喂相应饲料。4周后,检测大鼠血脂、肝脂、粪便中中性固醇含量... 详细信息

目的:研究多孔淀粉对卵巢切除大鼠脂质代谢的影响。方法:将24只雌性SD大鼠按体质量随机分为3组,其中一组进行伪切除手术,其余两组进行双侧卵巢切除手术,手术后恢复1周,分别饲喂相应饲料。4周后,检测大鼠血脂、肝脂、粪便中中性固醇含量和胆汁酸含量以及肠道中典型微生物数量、短链脂肪酸浓度等指标。结果:多孔淀粉的替代添加可以显著降低大鼠血浆中甘油三酯(triglyceride,TG)、TG与高密度脂蛋白胆固醇(high-density lipoprotein cholesterol,HDL-C)的比值(TG/HDL-C)、肝脏中总胆固醇(total cholesterol,TC)、TG和脂肪总质量,显著减少腹部脂肪堆积(P<0.05);显著增加粪便中中性固醇和胆汁酸的排泄量(P<0.05);同时促进肠道中益生菌增殖和短链脂肪酸浓度的提高。结论:多孔淀粉对雌激素缺乏引起的高脂血症具有较好的降脂、降胆固醇效果,对内源性脂质代谢紊乱具有较好的缓解作用。

关键词：多孔淀粉卵巢切除大鼠血脂胆固醇

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变温热源热管式热电制冷器结构设计和性能分析

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东南大学学报（自然科学版） 2022年第2期52卷 309-319页

作者：孟凡凯陈赵军徐辰欣海军工程大学动力工程学院武汉430033

基于有限时间热力学理论,设计了一种冷却空气的通道结构,建立了基于热管散热的变温热源热电制冷器有限时间热力学模型.通过数值模拟方法对装置冷、热端热阻进行了分析,得到了沿管道流动方向制冷模块冷、热端温度和冷空气温度的变化规律... 详细信息

基于有限时间热力学理论,设计了一种冷却空气的通道结构,建立了基于热管散热的变温热源热电制冷器有限时间热力学模型.通过数值模拟方法对装置冷、热端热阻进行了分析,得到了沿管道流动方向制冷模块冷、热端温度和冷空气温度的变化规律;以制冷率密度和制冷系数为性能指标,分析了输入电流、入口温度、空气流速等关键运行参数和模块填充系数、热电单元长度、管道宽度和吸液芯厚度等设计参数对装置性能的影响,并讨论了空气间隙热漏影响.结果表明:入口温度为290 K时,0.2 m宽的管道管内冷空气温度每米流程下降约14 K;与同工况下不考虑空气间隙热漏情形相比,考虑空气间隙热漏时最大制冷率密度和最大制冷系数分别为0.48 W/cm^(2)和1.11,分别降低了4.00%和5.13%.

关键词：热电制冷器热管变温热源制冷率密度制冷系数有限时间热力学

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密闭空间热电制冷器的瞬态特性分析

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工程热物理学报 2023年第1期44卷 8-17页

作者：徐辰欣孟凡凯陈赵军海军工程大学动力工程学院武汉430033

综合考虑包括汤姆逊效应在内的热电材料内部效应,采用制冷率密度分析方法,建立了热电制冷器在绝热表面空间内和非绝热表面空间内的计算模型。通过分析制冷率、冷热端温度、冷热端点温差等关键参数的瞬态变化对热电制冷器性能的影响,得... 详细信息

综合考虑包括汤姆逊效应在内的热电材料内部效应,采用制冷率密度分析方法,建立了热电制冷器在绝热表面空间内和非绝热表面空间内的计算模型。通过分析制冷率、冷热端温度、冷热端点温差等关键参数的瞬态变化对热电制冷器性能的影响,得到了制冷空间温度、制冷系数、输入功率等性能参数随时间的变化规律。分别改变工作电流和模块数量,对比分析了两种模型的最低制冷温度、降至目标温度耗时和制冷系数的变化,得到了密闭空间热电制冷器工作参数的瞬态变化规律与瞬态特性。

关键词：热电制冷瞬态制冷温度制冷系数绝热空间

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桥面环氧覆层路用性能及加铺技术研究

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公路工程 2014年第4期39卷 145-148页

作者：陈兆军湖南省高速公路管理局郴州管理处湖南郴州423000 长沙理工大学湖南长沙410076

以抗拉强度、伸长率、弹性模量为指标,研究不同种类固化剂对弹性环氧胶黏剂性能的影响,并选取3组固化剂复配的环氧体系进行综合性能测试,对环氧胶黏剂配方进行优化;同时,以洛杉矶磨耗值、磨光值为指标,对骨料进行选择,并从环氧胶黏剂固... 详细信息

以抗拉强度、伸长率、弹性模量为指标,研究不同种类固化剂对弹性环氧胶黏剂性能的影响,并选取3组固化剂复配的环氧体系进行综合性能测试,对环氧胶黏剂配方进行优化;同时,以洛杉矶磨耗值、磨光值为指标,对骨料进行选择,并从环氧胶黏剂固化产物性能、骨料级配及性能、环氧覆层路用性能方面,对桥面环氧覆层性能进行综合测试。最后,结合工程实际,针对环氧覆层铺装制定相应的施工工艺。研究表明,不同固化剂组合在性能方面会有区别,将自制的改性胺类与韧性酚醛胺复合后,其固化性能较好;同时,作为环氧覆层铺装集料,金刚砂、玄武岩、花岗岩碎石较为适合,而河砂的耐磨性能差。研究可为桥面环氧覆层应用提供一定参考。

关键词：桥面环氧覆层环氧胶黏剂骨料选择配方优化铺设工艺

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掺加玄武岩纤维的沥青路面结构层选取对比研究

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公路工程 2014年第4期39卷 272-275页

作者：陈兆军湖南省高速公路管理局郴州管理处湖南郴州423000 长沙理工大学湖南长沙410076

借鉴纤维提高沥青混合料路用性能这一优点,选用新型的路用玄武岩纤维,以常见密级配、间断级配沥青混合料AC—30、AC—20以及SMA—13为依托,对基质沥青纤维胶浆和改性沥青纤维胶浆及其相应的沥青混合料的高温稳定性能进行了研究。研究结... 详细信息

借鉴纤维提高沥青混合料路用性能这一优点,选用新型的路用玄武岩纤维,以常见密级配、间断级配沥青混合料AC—30、AC—20以及SMA—13为依托,对基质沥青纤维胶浆和改性沥青纤维胶浆及其相应的沥青混合料的高温稳定性能进行了研究。研究结果表明:玄武岩纤维对基质沥青和改性沥青胶浆抗车辙因子均有显著提高,抗剪切能力明显增强;玄武岩纤维沥青混合料的动稳定度和残留稳定度均得到提高,不同的沥青混合料玄武岩纤维最佳掺量不同,且对AC—20混合料的改善效果最为明显。研究成果可为玄武岩纤维在道路工程中的应用提供参考。

关键词：道路工程玄武岩纤维沥青胶浆沥青混合料结构层选取

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