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Survey sequencing and flow cytometry reveal the genomic backgrounds of seven wild species of sweetpotato

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乡村振兴视角下大学生返乡创业引导机制研究——以河南省为例

第二十届中国作物学会学术年会

作者：王珧 Deng Yitong zhao lukuan Zhou Zhilin 曹清河 Xuzhou Institute of Agricultural Sciences in Jiangsu Xuhuai District (XIAS)

【Backgrounds】Ipomoea is the biggest genera in the family Convolvulaceae, owning 800-900 species. There are diploid, tetraploid, and hexaploid species in Ipomoea, while many wild species have excellent resistance genes. Sweetpotato(Ipomoea batatas(L.) Lam.) is the seventh largest food crop in the world and is widely planted in tropical and subtropical areas due to its wide adaptability. Wild sweetpotatoes are an important source of excellent genetic and genetic diversity of sweetpotatoes. However, genomic and genetic research on sweetpotato is limited, and the origin of the species remains inconclusive. Only a few sweetpotato genera have genome sketches, making it difficult to breed new varieties using wild species of sweetpotato. About 13 wild species of this genus belong to the Ipomoea section Batatas. The genomic information of the Ipomoea section Batatas can be used to study the sweetpotato genome and the evolutionary patterns, as well as to reveal the relationship between the genes of different species, thereby elucidating the origin and evolution of this species. 【Material and Methods】To facilitate the development of sweetpotato varieties using genomic and genetic approaches, we assessed the genome size and ploidy level of seven closely related wild species(I. lacunosa, I. tilliacea, I. tenussima, I. leucantha, I. purpurea, I. tabascana, and I. trifida(6x)) of sweet potato by flow cytometry and chromosome counting, and acquired their genomic backgrounds using high-throughput sequencing. 【Results and Analysis】 Based on the 17-mer frequency distribution, the genome size of these species ranged from 477.27 Mbp to 1,505.04 Mbp. Most of the diploid species had a genome size of about 500 Mb, and the two diploid wild species I. leucantha and I. purpurea had much greater genome sizes than the remaining diploid species, showing highly significant differences in genome size. A large proportion of repeats(55.22%–81.07%) in the genomes of the seven species, I. trifida(6x)(

关键词：

来源： cnki会议评论

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当代经理人 2024年第2期 77-88页

作者：赵路宽李琦喆宁夏大学郑州经贸学院

为了推进乡村全面振兴,需要加大乡村本土人才培养,有序引导城市各类专业技术人才下乡服务,全面提高农民综合素质。现有研究虽已将大学生返乡现状和影响因素作为研究重点,但少有基于乡村振兴视角对大学生返乡创业所面临处境做的研究。本... 详细信息

为了推进乡村全面振兴,需要加大乡村本土人才培养,有序引导城市各类专业技术人才下乡服务,全面提高农民综合素质。现有研究虽已将大学生返乡现状和影响因素作为研究重点,但少有基于乡村振兴视角对大学生返乡创业所面临处境做的研究。本文选取乡村振兴背景下河南省大学生返乡创业影响因素作为研究的对象。通过查阅文献和资料整理方法对乡村振兴现有政策进行梳理归纳,采用调查问卷和实地调研的方式,对大学生个人因素、教育因素、政策因素、环境因素进行较为详尽的分析,剖析主要问题,探讨构建返乡创业引导机制。

关键词：大学生返乡创业风险预防引导机制

农村宅基地退出:福利效应、差异测度与影响因素——基于宁夏平罗县、贺兰县的实证

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干旱区资源与环境 2024年第4期38卷 58-68页

作者：韩秀丽田彦花石荣许霁林赵路宽宁夏大学经济管理学院银川750021 西北农林科技大学经济管理学院杨凌712100

文中基于宁夏平罗县和贺兰县宅基地退出农户的实证调查,通过测定宅基地退出前后农户福利变化和农户间福利差异,并运用分位数回归模型实证分析引起农户福利变化的影响因素。研究结果显示,宅基地退出后农户总体福利水平提升了,同时农户间... 详细信息

文中基于宁夏平罗县和贺兰县宅基地退出农户的实证调查,通过测定宅基地退出前后农户福利变化和农户间福利差异,并运用分位数回归模型实证分析引起农户福利变化的影响因素。研究结果显示,宅基地退出后农户总体福利水平提升了,同时农户间福利水平差距也在逐步扩大。年龄、受教育程度、劳动力数量、安置方式、是否拥有城镇住房、是否自愿退出、是否了解政策和退出整体满意度对农户福利变化具有显著的正向影响。进一步研究发现,受教育程度对农户福利变化的影响整体呈现上升趋势,安置方式对农户福利变化的影响在中高分位点上显著且其系数有上升趋势,是否自愿退出对中低分位数上农户福利变化影响的边际效应较大,是否了解政策对农户福利变化的影响在中高分位点上不如低分位点上有力。因此,不仅要加大对农户教育和非农就业的支持、采取合适的安置方式以及尊重农户的退出意愿来进一步改善农户的福利水平,而且要在普适性政策的基础上采取差异化的措施,以缩小农户间的福利差异。

关键词：宅基地退出福利效应福利差异影响因素分位数回归模型

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中国甘薯登记品种SSR标记遗传多样性分析

西北植物学报 2019年第7期39卷 1212-1220页

作者：赵路宽苏一钧戴习彬王珧袁蕊曹清河中国农业科学院甘薯研究所江苏徐淮地区徐州农业科学研究所江苏徐州221131 海南大学园艺学院海口570228

该研究基于TP-M13-SSR分子标记荧光毛细管检测技术,以中国已入库登记的99份甘薯品种为材料,利用SSR标记建立登记品种的“01”数据库,导入DPS软件计算不同品种之间的遗传距离,采用MEGA的邻接法进行聚类分析,并利用Structure混合模型对材... 详细信息

该研究基于TP-M13-SSR分子标记荧光毛细管检测技术,以中国已入库登记的99份甘薯品种为材料,利用SSR标记建立登记品种的“01”数据库,导入DPS软件计算不同品种之间的遗传距离,采用MEGA的邻接法进行聚类分析,并利用Structure混合模型对材料进行遗传结构分析,以探讨各品种的遗传构成以及品种间的亲缘关系,揭示中国甘薯登记品种在DNA水平的相似度,为甘薯品种鉴定、亲本选配和品种改良等提供参考。结果显示:(1)28对引物共扩增出162条谱带,多态率为96.30%,每对引物平均获得5.57条多态性谱带。(2)构建了99份甘薯登记品种的遗传进化树,99份品种的遗传距离在0~0.4646之间,平均遗传距离为0.3077;在遗传距离为0.2670处将99份品种分为3个类群,且同一生态薯区的品种或具有同一亲本的品种首先被聚在一起,但不同生态薯区的品种在各类群中相对分散分布。(3)品种间的遗传基础较窄,部分生态薯区的品种相似性较高;群体结构分析将材料分为3个亚群,与聚类分析分群结果基本一致,其中31份材料拥有混合来源,遗传背景较为复杂。

关键词：甘薯登记品种 SSR 遗传多样性

甘薯Ib CHLI1基因的克隆及生物信息学分析

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分子植物育种 2024年第22期22卷 7327-7336页

作者：高兵倩王珧刘洋赵路宽邓逸桐曹清河邹华文长江大学农学院荆州434023 中国农业科学院甘薯研究所江苏徐淮地区徐州农业科学研究所徐州221132

甘薯[Ipomoea batatas (L.) Lam.]是重要的粮食、保健、工业原料和能源作物,而一些甘薯品种因叶型或叶色丰富被作为观赏植物或绿化植物。CHLI1基因编码叶绿素合成途径中镁离子螯合酶(MgCh)的Chl I亚基,对叶绿素的合成以及叶绿体的发育... 详细信息

甘薯[Ipomoea batatas (L.) Lam.]是重要的粮食、保健、工业原料和能源作物,而一些甘薯品种因叶型或叶色丰富被作为观赏植物或绿化植物。CHLI1基因编码叶绿素合成途径中镁离子螯合酶(MgCh)的Chl I亚基,对叶绿素的合成以及叶绿体的发育至关重要,并影响植物叶片着色。本实验以‘徐薯29号’为材料,采用RT-PCR方法克隆CHLI1基因对其进行生物信息学分析,并进行了不同部位的表达模式分析。结果表明,甘薯IbCHLI1基因最大阅读框(ORF)长度为1 281 bp,编码426个氨基酸,蛋白质相对分子质量为46 184.90 Da,其分子式为C_(2032)H_(3332)N_(568)O_(632)S_(11),原子总数为6 575,理论等电点为5.68;该蛋白属于亲水性非分泌蛋白,定位在叶绿体中,稳定性较好,不存在跨膜结构域以及信号肽,有多个磷酸化位点;该蛋白二级结构主要包括α-螺旋(42.25%)、无规卷曲(35.21%)、延伸链(15.96%)和β-转角(6.57%),三级结构预测结果显示该蛋白含有核苷三磷酸水解酶的P-loop环,保守结构域预测结果显示该蛋白是含有AAA结构域的ATP结合蛋白,属于Chl I超家族;系统进化分析发现该蛋白与三裂叶野牵牛(Ipomoea triloba)的CHLI1蛋白亲缘关系最近,序列相似性达到99.30%。组织特异性表达分析结果显示Ib CHLI1基因在甘薯不同组织中存在明显的组织表达特异性,在叶片中表达量最高,在根中表达量最低。以上对IbCHLI1基因在甘薯中的初步分析将为后续利用基因工程手段创制观赏甘薯新种质提供理论依据。

关键词：甘薯[Ipomoea batatas(L.)Lam.] 镁离子螯合酶(MgCh) CHLI1 基因克隆生物信息学

甘薯镁螯合酶 IbCHLH 基因克隆及表达分析

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江苏师范大学学报（自然科学版） 2024年第4期42卷 14-20页

作者：王珧赵路宽高兵倩周志林曹清河江苏徐淮地区徐州农业科学研究所江苏徐州221131 江苏师范大学生命科学学院江苏徐州221116

CHLH是多功能蛋白,在叶绿素合成途径和脱落酸(ABA)信号传导中起重要作用.本文在徐薯29号中克隆了IbCHLH基因,进行了生物信息学分析,并利用荧光定量PCR(q-PCR)技术检测非生物胁迫和外源激素作用下的表达水平.结果显示,IbCHLH基因CDS序列... 详细信息

CHLH是多功能蛋白,在叶绿素合成途径和脱落酸(ABA)信号传导中起重要作用.本文在徐薯29号中克隆了IbCHLH基因,进行了生物信息学分析,并利用荧光定量PCR(q-PCR)技术检测非生物胁迫和外源激素作用下的表达水平.结果显示,IbCHLH基因CDS序列全长4146 bp,编码1381个氨基酸,分子质量153.53 kDa;IbCHLH为亲水性蛋白,无跨膜结构,丝氨酸(Ser)磷酸化位点最多,推测其活性可能受到磷酸化的调控.系统进化树分析显示,甘薯IbCHLH蛋白和***亲缘关系最近,***次之.干旱胁迫24 h时,IbCHLH表达量最高;外源激素ABA处理24 h内,4 h时IbCHLH表达量达最高.综上,甘薯IbCHLH基因可能参与了对干旱的抗性调节和ABA的调控.

关键词：甘薯镁螯合酶 IbCHLH 叶绿素脱落酸(ABA)

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25份甘薯登记品种基因组大小测定

江苏师范大学学报（自然科学版） 2019年第3期37卷 31-34页

作者：苏一钧王珧戴习彬赵路宽张安曹清河江苏徐淮地区徐州农业科学研究所/中国农业科学院甘薯研究所江苏徐州221131 海南大学园艺学院海南海口570228

以25份甘薯登记品种幼嫩根系为实验材料,采用改良硫酸镁裂解液的方法和PI荧光染色技术,以已知大豆(Glycine max(Linn.) Merr.) Williams 82基因组大小为对照,使用流式细胞术对25份甘薯登记品种基因组大小进行测定.结果表明:25份甘薯登... 详细信息

以25份甘薯登记品种幼嫩根系为实验材料,采用改良硫酸镁裂解液的方法和PI荧光染色技术,以已知大豆(Glycine max(Linn.) Merr.) Williams 82基因组大小为对照,使用流式细胞术对25份甘薯登记品种基因组大小进行测定.结果表明:25份甘薯登记品种基因组大小范围为1.469~1.716 pg,平均为1.568 pg,其中泉薯17的最大,为1.716 pg;漯紫1号的最小,为1.469 pg.测定结果可为甘薯全基因组测序、泛基因组测序和基因组重测序等研究提供数据参考.

关键词：甘薯登记品种流式细胞术基因组大小

基于InDel标记分析305份中国甘薯登记品种遗传多样性

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植物遗传资源学报 2024年第4期25卷 576-585页

作者：唐芬赵路宽苏一钧肖世卓袁蕊翁宗宽戴习彬周志林陈艳丽曹清河海南大学南繁研究院(三亚南繁研究院) 三亚572025 江苏徐淮地区徐州农业科学研究所/江苏徐州甘薯研究中心徐州221131 海南大学热带农林学院/海南省热带园艺作物品质调控重点实验室海口570228

对甘薯育成品种进行亲缘关系评价,是了解其遗传背景并有效利用种质资源的重要前提。利用本课题组前期开发的23对InDel引物对305份中国甘薯登记品种进行基因型分析,共扩增出56个条带,其中53个条带具有多态性,多态率达94.6%。多态信息量(P... 详细信息

对甘薯育成品种进行亲缘关系评价,是了解其遗传背景并有效利用种质资源的重要前提。利用本课题组前期开发的23对InDel引物对305份中国甘薯登记品种进行基因型分析,共扩增出56个条带,其中53个条带具有多态性,多态率达94.6%。多态信息量(PIC)、Nei′s遗传多样性指数(H)、观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)的平均值分别为0.4098、0.4451、0.6003、0.4460。群体结构分析表明,群体数在K=2时ΔK达到最大值,K=4时有个小高峰;北方薯区和长江流域薯区在2个组群内均匀分布,南方薯区大部分(72.97%)汇聚在组群2。主坐标分析(PCoA)中南方薯区有部分汇聚,整体没有划分出明显的簇群。聚类结果将群体划分为4个主要类群,北方薯区和长江流域薯区的品种在类群Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ中均匀分布,南方薯区主要(77.03%)集中于类群IV,这一聚类结果与群体结构研究、主坐标分析基本一致。通过系谱分析筛选出登记品种的13个主要亲本材料,各育种单位存在重复利用亲本进行正反交培育的情况。本研究将分子标记结果与系谱信息相结合,初步表明中国甘薯登记品种的亲缘关系较近,遗传背景狭窄,为甘薯的种质创新、新品种选育提供参考。

关键词：甘薯登记品种 InDel 遗传多样性群体结构

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Proteomic study provides new clues for complications of hemodialysis caused by dialysis membrane

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Science Bulletin 2017年第18期62卷 1251-1255页

作者： Kaiguang Yang Jianhui Liu Jingdi Sun Yuan Zhou Qun zhao Senwu Li lukuan Liu Lihua Zhang Jiuyang zhao Yukui Zhang CAS Key Laboratory of Separation Science for Analytical Chemistry Dalian Institute of Chemical Physics Chinese Academy of Sciences Dalian 116023 China University of Chinese Academy of Sciences Beijing 100049 China The Second Affiliated Hospital of Dalian Medical University Dalian 116023 China

The complications of hemodialysis accompanied the hemodialysis and threaten the patients’*** the loss of nutrient substance,such as amino acid and vitamin,we found new clues that the adsorbed proteins on common-used polysulfone-based dialysis membrane might be the reason according to the qualitative proteomic study by ionic liquid assisted sample preparation *** results indicated that the adsorbed proteins on the membrane were related with complement activation,blood coagulation,and leukocyte-related biological *** quantitative proteome further demonstrated some significant changes of signal proteins in the post-dialysis plasma after the hemodialysis,such as beta-2-microglobulin and platelet factor-4,which would further verify these new clues.

关键词： Proteomic study Complications of hemodialysis Dialysis membrane Ionic liquid