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A chromosome-level genome assembly of the wild rice Oryza rufipogon facilitates tracing the origins of Asian cultivated rice

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Science China(Life Sciences) 2021年第2期64卷 282-293页

作者： Xianrong Xie Huilong Du Huiwu Tang Jianian Tang Xiyu Tan Weizhi Liu Tie Li zhansheng lin Chengzhi Liang Yao-Guang Liu State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-Bioresources College of Life SciencesSouth China Agricultural UniversityGuangzhou 510642China State Key Laboratory of Plant Genomics Institute of Genetics and Developmental BiologyInnovation Academy for Seed DesignChinese Academy of SciencesBeijing 100101China Guangdong Laboratory for lingnan Modern Agriculture Guangzhou 510642China University of Chinese Academy of Sciences Beijing 100049China College of Agriculture and Biology Zhongkai University of Agriculture and EngineeringGuangzhou 510225China

Oryza rufipogon *** a wild progenitor of the Asian cultivated rice Oryza *** better understand the genomic diversity of the wild rice,high-quality reference genomes of *** populations are needed,which also facilitate utilization of the wild genetic resources in rice *** this study,we generated a chromosome-level genome assembly of *** using a combination of short-read sequencing,single-molecule sequencing,BioNano and Hi-C *** genome sequence(399.8 Mb)was assembled into 46 scaffolds on the 12 chromosomes,with contig N50 and scaffold N50 of 13.2 Mb and 20.3 Mb,*** genome contains 36,520 protein-coding genes,and 49.37% of the genome consists of repetitive *** genome has strong synteny with those of the *** subspecies indica and japonica,but containing some large structural *** analysis unveiled the polyphyletic origins of ***,in which the japonica and indica genome formations involved different divergent ***(including ***)lineages,accompanied by introgression of genomic regions between japonica and *** high-quality reference genome provides insight on the genome evolution of the wild rice and the origins of the *** subspecies,and valuable information for basic research and rice breeding.

关键词： genome genome sequencing evolution Oryza rufipogon rice

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The ScCas9^(++) variant expands the CRISPR toolbox for genome editing in plants

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Journal of Integrative Plant Biology 2021年第9期63卷 1611-1619页

作者： Taoli Liu Dongchang Zeng Zhiye Zheng zhansheng lin Yang Xue Tie Li Xianrong Xie Genglu Ma Yao-Guang Liu Qinlong Zhu State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-Bioresources Guangzhou 510642China College of Life Sciences South China Agricultural UniversityGuangzhou 510642China Guangdong Laboratory for lingnan Modern Agriculture Guangzhou 510642China

The development of clustered regularly interspaced palindromic repeats(CRISPR)-associated protein(Cas) variants with a broader recognition scope is critical for further improvement of CRISPR/Cas systems. The original Cas9 protein from Streptococcus canis(ScCas9) can recognize simple NNG-protospacer adjacent motif(PAM)targets, and therefore possesses a broader range relative to current CRISPR/Cas systems, but its editing efficiency is low in plants. Evolved ScCas9^(+) and ScCas9^(++) variants have been shown to possess higher editing efficiencies in human cells, but their activities in plants are currently unknown. Here, we utilized codon-optimized ScCas9, ScCas9^(+) and ScCas9^(++) and a nickase variant ScCas9n^(++) to systematically investigate genome cleavage activity and cytidine base editing efficiency in rice(Oryza sativa L.). This analysis revealed that ScCas9^(++) has higher editing efficiency than ScCas9 and ScCas9^(+) in rice. Furthermore, we fused the evolved cytidine deaminase PmCDA1 with ScCas9n^(++) to generate a new evoBE4max-type cytidine base editor, termed PevoCDA1-ScCas9n^(++) . This base editor achieved stable and efficient multiplex-site base editing at NNG-PAM sites with wider editing windows(C_(-1)-C_(17)) and without target sequence context preference. Multiplex-site base editing of the rice genes OsWx(three targets) and OsEui1(two targets) achieved simultaneous editing and produced new rice germplasm. Taken together, these results demonstrate that ScCas9^(++) represents a crucial new tool for improving plant editing.

关键词： CRISPR genome editing base editing ScCas9^(++) rice

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钢筋混凝土框架优化设计

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华侨大学学报（自然科学版） 1989年第1期10卷 42-49页

作者：林赞生麦淑良华侨大学土木工程系

本文把钢筋混凝土框架的优化设计问题表示为一般的极值求解问题,避免了以往采用的复杂优化理论,易于为工程人员接受,文中采用了一种可行性调整,从而反收敛条件与目标函数联系起来.本文方法对于工程实际中设计变量不多的情况尤为方便.文... 详细信息

本文把钢筋混凝土框架的优化设计问题表示为一般的极值求解问题,避免了以往采用的复杂优化理论,易于为工程人员接受,文中采用了一种可行性调整,从而反收敛条件与目标函数联系起来.本文方法对于工程实际中设计变量不多的情况尤为方便.文后给出算例.

关键词：钢筋混凝土框架优化设计

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透水混凝土骨料颗粒-水泥浆体间黏结特性模拟试验

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公路工程 2023年第2期48卷 116-122页

作者：林占胜单景松李瑾段同军山东省路桥集团有限公司山东济南250014 山东科技大学土木工程与建筑学院山东青岛266590 山东泰山抽水蓄能电站有限责任公司山东泰安271000

透水混凝土是一种由粗骨料、水泥、水等拌合压实而成的多孔混合材料,骨料形态和水泥浆体特性对骨料颗粒间的黏结有直接影响。以骨料种类、骨料表面粗糙度、水泥浆包裹厚度为影响因素,开展骨料颗粒间黏结性能研究。首先将玄武岩和花岗岩... 详细信息

透水混凝土是一种由粗骨料、水泥、水等拌合压实而成的多孔混合材料,骨料形态和水泥浆体特性对骨料颗粒间的黏结有直接影响。以骨料种类、骨料表面粗糙度、水泥浆包裹厚度为影响因素,开展骨料颗粒间黏结性能研究。首先将玄武岩和花岗岩切割成圆形试块,并打磨表面使其具有不同的粗糙度,然后控制水泥浆层厚度,将两个岩石圆柱块黏结制作成一个拉拔试样,养护后采用高精度电子万能试验机对拉拔试样进行拉拔试验,得到不同条件下拉力-位移曲线和岩样间抗拉强度。结果表明:拉力-位移曲线表现为3个阶段,即线弹性阶段、塑性阶段和加速破坏阶段。岩样间抗拉强度随水泥浆厚度的增加而逐渐增强,经目数为150的金刚石磨片所打磨处理后的花岗岩试样受水泥浆厚度影响最为明显,水泥浆厚度对玄武岩试样抗拉强度影响规律受粗糙度的影响较小。相同水泥浆层厚度条件下,岩样抗拉强度随粗糙度的增加而显著增强,同样粗糙度和水泥浆厚度条件下,玄武岩试样抗拉强度高于花岗岩试样。

关键词：骨料种类粗糙度包裹厚度黏结特性抗拉强度

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不平衡受力条件下基坑支护关键施工技术

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山东交通科技 2024年第2期 16-18页

作者：林占胜郑帅武凯朱凤磊宋家辉山东省路桥集团有限公司山东济南250014 山东建筑大学山东济南250101

分析了京台高速公路齐河至济南段改扩建工程黄河大桥主桥P3#墩施工基坑支护变形和受力情况,经方案比选,采用“锁扣钢管桩作为基坑支护+钻孔灌注桩加固防护”的施工方法,并对施工关键技术进行了优化,较好地解决了钢管桩在不平衡受力条件... 详细信息

分析了京台高速公路齐河至济南段改扩建工程黄河大桥主桥P3#墩施工基坑支护变形和受力情况,经方案比选,采用“锁扣钢管桩作为基坑支护+钻孔灌注桩加固防护”的施工方法,并对施工关键技术进行了优化,较好地解决了钢管桩在不平衡受力条件下施工难题。

关键词：基坑支护施工技术受力分析钢管桩不平衡受力

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抗结核治疗对携带HBV的肺结核病患者肝功能的影响

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胃肠病学和肝病学杂志 2004年第5期13卷 517-520页

作者：潘蕾贾战生陈琳傅恩清李光玉第四军医大学唐都医院感染病中心西安710038 第四军医大学唐都医院呼吸内科西安710038

目的　探讨抗TB治疗过程中HBV携带与肝功能损害的关系 ,比较HPBE(S)和HLAMKO两种化疗方案对肝功的影响。方法　选择HBV携带的TB患者 47例 ,非HBV携带的TB患者 170例 ,随机分成HPBE(S)和HLAMKO两个治疗组 ,于治疗前和治疗后每 2wk检测肝... 详细信息

目的　探讨抗TB治疗过程中HBV携带与肝功能损害的关系 ,比较HPBE(S)和HLAMKO两种化疗方案对肝功的影响。方法　选择HBV携带的TB患者 47例 ,非HBV携带的TB患者 170例 ,随机分成HPBE(S)和HLAMKO两个治疗组 ,于治疗前和治疗后每 2wk检测肝功能 ,并观察临床症状。结果　 47例HBV携带的TB患者发生肝功损害 2 6例 ( 5 9% ) ,明显高于非HBV携带者40例 ( 2 4% ) ;在所有 2 17例患者中 ,不同程度肝功能损害者共 66例 ( 3 0 4% ) ,其中应用HPBE(S)方案组 115例发生肝损害 5 3例( 4 6 1% ) ,HLAMKO方案组 10 5例发生肝功异常者 13例 ( 12 7% )。结论　HBV携带的TB患者应选肝损害小的HLAMKO抗结核治疗方案。

关键词：患者 HBV携带者抗结核治疗肝功能损害肝损害肺结核病治疗后肝功损害治疗过程治疗前

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单桩荷载位移的三维有限元分析

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工业建筑 2006年第Z1期36卷 752-754页

作者：陈林李占省浙江省水利河口研究院杭州310020 水利部小浪底水利枢纽建设管理局郑州450000

桩基础沉降受到很多因素的影响,目前仍是一个复杂而未能很好解决的一个问题。以某大厦工程的试桩作为研究对象,以有限元理论为基本分析方法,建立了三维有限元模型,通过参数的不同取值计算得到单桩荷载位移曲线,并与静载实测曲线进行了... 详细信息

桩基础沉降受到很多因素的影响,目前仍是一个复杂而未能很好解决的一个问题。以某大厦工程的试桩作为研究对象,以有限元理论为基本分析方法,建立了三维有限元模型,通过参数的不同取值计算得到单桩荷载位移曲线,并与静载实测曲线进行了比较。

关键词：灌注桩桩顶竖向位移接触单元模型

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HER2阳性乳腺癌治疗模式的进展和优化

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中国肿瘤生物治疗杂志 2020年第5期27卷 469-476页

作者：杨艳芳姜战胜顾林天津医科大学肿瘤医院国家肿瘤临床医学研究中心天津市“肿瘤防治”重点实验室天津市恶性肿瘤临床医学研究中心乳腺癌防治教育部重点实验室乳腺二科天津300060 天津医科大学肿瘤医院国家肿瘤临床医学研究中心天津市“肿瘤防治”重点实验室天津市恶性肿瘤临床医学研究中心乳腺癌防治教育部重点实验室中西医结合科天津300060

随着抗人表皮生长因子受体2(human epidermal growth factor receptor 2,HER2)抗肿瘤药物的不断出现及广泛应用,HER2阳性乳腺癌患者的治疗以及预后得到了显著的改善。PEONY研究结果的发布再次奠定了帕妥珠单抗+曲妥珠单抗的双靶治疗模... 详细信息

随着抗人表皮生长因子受体2(human epidermal growth factor receptor 2,HER2)抗肿瘤药物的不断出现及广泛应用,HER2阳性乳腺癌患者的治疗以及预后得到了显著的改善。PEONY研究结果的发布再次奠定了帕妥珠单抗+曲妥珠单抗的双靶治疗模式在新辅助治疗领域中的地位;结合TRYPHAENA和TRAIN-2两项研究,紫杉类+铂类应该是抗HER2双靶治疗的首选化疗方案,疗程宜6个周期。结合中国乳腺癌新辅助治疗专家共识和辅助APT研究的最新随访结果,新辅助治疗适用人群为肿瘤直径超过3 cm和/或淋巴结阳性的患者,新辅助治疗后如果没有获得pCR,T-DM1应该是辅助治疗的首选模式,帕妥珠单抗+曲妥珠单抗的双靶辅助模式期待PEONY研究的后续生存随访;对于没有淋巴结转移的小肿瘤(≤3 cm)低危患者可以考虑免除新辅助治疗,采取直接手术+术后给予曲妥珠单抗联合单药紫杉醇的辅助治疗模式。曲妥珠单抗+帕妥珠单抗联合紫杉类药物依然是晚期HER2阳性患者的标准一线治疗;对于中国患者而言,吡咯替尼联合卡培他滨可以作为二线的优选;T-DM1可以作为三线及后线选择;曲妥珠单抗、帕妥珠单抗、T-DM1治疗失败的情况下,DS-8201成为新的选择模式;伴有脑转移的HER2阳性晚期乳腺癌患者则可以考虑图卡替尼与曲妥珠单抗和卡培他滨的联合治疗模式。

关键词：人表皮生长因子受体2 乳腺癌治疗模型进展优化

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台湾研发服务业与制造业联动发展及其对广东的启示

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科技管理研究 2015年第22期35卷 70-75,84页

作者：梁永福张展生林雄暨南大学广东广州510632 广东省生产力促进中心广东广州510070

以台湾时间序列数据为样本,建立向量自回归模型进行单位根检验和协整分析,并与广东进行比较,结果表明台湾制造业是研发服务业的格兰杰因,反之不成立,且长期里两者存在均衡关系。广东研发服务业与制造业互为格兰杰因,但从长期来看两者未... 详细信息

以台湾时间序列数据为样本,建立向量自回归模型进行单位根检验和协整分析,并与广东进行比较,结果表明台湾制造业是研发服务业的格兰杰因,反之不成立,且长期里两者存在均衡关系。广东研发服务业与制造业互为格兰杰因,但从长期来看两者未能形成一种稳定的联动关系。

关键词：研发服务业制造业联动发展台湾地区

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VEGF 在三阴性乳腺癌中的表达及临床意义

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中国肿瘤临床 2012年第8期29卷 439-442页

作者：杨艳芳刘君姜战胜顾林乳腺癌防治教育部重点实验室天津市肿瘤防治重点实验室天津医科大学附属肿瘤医院乳腺二科天津市300060 天津医科大学附属肿瘤医院中西医结合科天津市300060

目的:探讨VEGF在三阴性乳腺癌中的表达及临床意义。方法:选取天津医科大学附属肿瘤医院2007年11月至2008年6月间560例乳腺癌,用免疫组织化学方法检测肿瘤组织VEGF的表达状态,分析其与各临床病理特征的关系,以及在三阴性乳腺癌中的表达... 详细信息

目的:探讨VEGF在三阴性乳腺癌中的表达及临床意义。方法:选取天津医科大学附属肿瘤医院2007年11月至2008年6月间560例乳腺癌,用免疫组织化学方法检测肿瘤组织VEGF的表达状态,分析其与各临床病理特征的关系,以及在三阴性乳腺癌中的表达和预后作用。结果:乳腺癌患者中VEGF的阳性表达率为36.1%(202/560),其中三阴性乳腺癌中阳性表达率为45.0%(49/109),明显高于非三阴组33.9%(P=0.031)。VEGF的表达与患者年龄、肿瘤部位、病理类型、肿瘤大小、淋巴结状态、病理分期、组织学分级和p53状态均无明显相关(P>0.05),但在低年龄组(66.7%vs.41.7%)、淋巴结转移组(51.1%vs.37.1%)和p53阳性组(51.8%vs.34.0%)方面发现VEGF表达有增多的趋势。三阴性乳腺癌VEGF阳性者较阴性者易发生复发和转移(23.9%vs.9.7%),3年无疾病复发率明显低于VEGF阴性组(76.6%vs.90.3%,P=0.044)。结论:VEGF可以作为三阴性乳腺癌影响复发的预后因素之一,有可能成为三阴性乳腺癌靶向治疗的研究靶点。

关键词： VEGF 三阴性乳腺癌预后

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