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EVIHVR: A platform for analysis of expression, variation and identification of human virus receptors

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Infectious Medicine 2022年第1期1卷 59-62页

作者： Zheng zhang zena Cai Longfei Mao Xing-Yi Ge Yousong Peng Bioinformatics Center College of BiologyHunan Provincial Key Laboratory of Medical VirologyHunan UniversityChangshaChina

Motivation:Virus receptors are presented on the cell surfaces of a host and are key for viral infection of host cells.However,no unified resource for the study of viral receptors is currently available.Results:To address this problem,we built EVIHVR,a platform for analyzing the expression and variation,and for the identification of human virus receptors.EVIHVR provides three functions:(1)Receptor expression function for browsing and analyzing the expression of human virus receptors in various human tissues/cells;(2)Receptor gene polymorphism function for analyzing the genetic polymorphism of human virus receptors in different human populations and human tissues;and(3)Predict receptor function for identifying potential virus receptors based on differential expression analysis.EVIHVR can become a useful tool for the analysis and identification of human virus receptors.

关键词： Virus receptor Genetic polymorphism Receptor identification Human-infecting virus Web services

纳米尺度多级孔金属-有机骨架材料应用研究进展

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稀有金属 2023年第7期47卷 1013-1019页

作者：李静静梁宽张泽娜张海麒奚红霞段崇雄佛山科学技术学院材料科学与氢能学院广东佛山528231 华南理工大学化学与化工学院广东广州510640

纳米尺度多级孔金属-有机骨架材料(NH-MOFs)融合了纳米尺度MOFs和多级孔MOFs的优势,拥有更大的比表面积、孔隙率和更多暴露的活性位点。NH-MOFs具有广泛的应用潜力,在各个领域引起了极大的关注,特别是在催化领域。NH-MOFs的纳米尺度晶... 详细信息

纳米尺度多级孔金属-有机骨架材料(NH-MOFs)融合了纳米尺度MOFs和多级孔MOFs的优势,拥有更大的比表面积、孔隙率和更多暴露的活性位点。NH-MOFs具有广泛的应用潜力,在各个领域引起了极大的关注,特别是在催化领域。NH-MOFs的纳米尺度晶体尺寸带来了更短的传质路径和更快的扩散速率,这种特性能够有效地提高反应物质在材料内部的传输效率,加速反应的进行,多级孔结构进一步增加了内部孔道的连通性,为分子的扩散和传输提供了更为便捷的通道,此外多级孔结构还导致更多的活性位点暴露在表面,进一步增强了催化活性和反应效率。这种高度可控的活性位点分布有助于优化催化反应的动力学和热力学特性,从而提高反应的效率和选择性。介绍了NH-MOFs在催化领域的研究进展,讨论了NH-MOFs未来大规模工业化生产和商业化应用存在的问题与挑战,最后对NH-MOFs未来的应用前景进行了展望。

关键词：金属-有机骨架材料纳米尺度多级孔结构催化应用

PARP-1缺陷对苯并[a]芘致肺损伤过程中表皮生长因子受体的调控

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卫生研究 2022年第5期51卷 787-790页

作者：付英斌古盼张泽娜杨学琴吴德生刘建军黄海燕深圳市疾病预防控制中心深圳518055 深圳市职业病防治院深圳518020

目的探讨聚(腺苷二磷酸-核糖)聚合酶-1[poly(ADP-ribose)polymerase-1,PARP-1]缺陷(PARP-1^(-/-))对苯并[a]芘(B[a]P)致肺损伤过程中表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor, EGFR)的调控。方法以PARP-1小鼠和野生型小鼠为研究对象,每组40只,雌雄各半。实验组采用动式吸入染毒途径暴露10.0μg/m^(3)B[a]P,6 h/d, 5 d/周,对照组给予溶剂二甲基亚砜相同处理,暴露180天后,借助RT-PCR、Western blot和免疫荧光检测技术分析各组动物肺组织中表皮生长因子受体的表达变化。结果与对照组相比,野生型小鼠B[a]P染毒后肺组织中的EGFR表达明显升高(P<0.05),PARP-1^(-/-)小鼠B[a]P染毒后肺组织中的EGFR激活受抑制(P<0.05)。结论 PARP-1缺陷可对抗B[a]P诱导的EGFR异常激活。

关键词：苯并[a]芘聚(腺苷二磷酸-核糖)聚合酶-1 表皮生长因子受体

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综述润滑油的调和方法及设备

广东化工 2007年第6期34卷 86-88,78页

作者：张泽娜广东省石油化工设计院广东广州510130

调和是润滑油生产工艺过程中必不可少的环节。本文综合地介绍了在润滑油生产过程当中经常使用到的调和方法和调和设备,以及这些调和方法和调和设备在实际的润滑油工程项目中的应用,并简单介绍了润滑油生产的工艺流程。

关键词：润滑油调和方法调和设备工程应用

基于数据挖掘张均倡治疗非酒精性脂肪肝的用药规律

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实用中医内科杂志 2023年第8期37卷 114-117,I0015页

作者：郑泽娜张均倡羊燕群高建华南方医科大学深圳医院广东深圳518000 深圳市中医院广东深圳518000

目的通过数据挖掘技术,总结张均倡教授治疗非酒精性脂肪肝的处方用药规律,分析张均倡教授治疗非酒精性脂肪肝的临床诊疗、辨证用药思路。方法收集张均倡名中医工作室治疗非酒精性脂肪肝的临床医案,经过规范化处理,创建中药处方数据库... 详细信息

目的通过数据挖掘技术,总结张均倡教授治疗非酒精性脂肪肝的处方用药规律,分析张均倡教授治疗非酒精性脂肪肝的临床诊疗、辨证用药思路。方法收集张均倡名中医工作室治疗非酒精性脂肪肝的临床医案,经过规范化处理,创建中药处方数据库,应用中医传承辅助平台(V2.5)和,利用SPSS进行聚类分析,利用SPSS Modeler 14.1软件进行组方关联及复杂网络分析对其中的用药规律进行分析。结果筛选出非酒精性脂肪肝的处方220首,分析得出最常用的药物为茯苓、陈皮、丹参等10种,性寒、温、平,以甘味为主,主要归脾、肺、肝经,核心中药8味,核心组合共25组,演化出新方4首。结论张均倡教授认为非酒精性脂肪肝从“脾虚、痰瘀互结”论治,以脾虚为本,痰瘀互结为因,重视“肝、肺、脾”,治疗上强调健脾以滋后天,祛痰湿与化瘀血并重。

关键词：数据挖掘非酒精性脂肪肝用药规律

Rapid identification of human-infecting viruses

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Rapid identification of human-infecting viruses

益气健脾方对老年慢性肾功能不全患者营养状况影响的临床研究及机制探讨

第一届全国生物信息与传染病交叉论坛

作者： Zheng zhang zena Cai Zhiying Tan Congyu Lu Taijiao Jiang Gaihua zhang Yousong Peng College of Biology Hunan University

Motivation: Viruses have caused much mortality and morbidity to humans and pose a serious threat to global public health. The virome with the potential of human infection is still far from complete. Novel viruses have been discovered at an unprecedented pace as the rapid development of viral metagenomics. However, there is still a lack of methodology for rapidly identifying novel viruses with the potential of human infection. Methods: Here, we collected the virus-host relationship and the viral genomic sequences from the database of Virus-Host DB(available at https://www.***.jp/virushostdb/) on July 15, 2018(Mihara et al., 2016). The viroid, satellites and the viruses with genomic sequence less than 1 kb were removed. The resulting dataset of 9428 viruses includes 1236 viruses infecting humans(defined as human-infecting viruses) and 8192 viruses infecting other species. This study built several machine learning models to discriminate human-infecting viruses from other viruses based on the frequency of k-mers in the viral genomic sequences. Results: The k-nearest neighbor(KNN) model can predict the human-infecting viruses with an accuracy of over 90%. The performance of this KNN model built on the short contigs(≥1 kb) is comparable to those built on the viral genomes(All the data and codes used in this study are publicly available at https://***/Fzhang1992/human-infectingirusinder). We used a total of 14,242,328 viral reads and 396 viral contigs which obtained from Moustafa’s study(Moustafa et al., 2017) to further validate this KNN model with an accuracy of over 80% based on very short raw reads(150 bp). Conclusion: This study built novel computational models to predict the humaninfecting viruses in the perspective of virome. The high accuracy and sensitivity of the KNN model built on the viral contigs of various lengths suggest that the model can be used to identify the human-infecting viruses from the viral metagenomic sequences. This work provides an effective strategy for the identification of novel humani

关键词： human-infecting virus machine learning viral metagenomics virome

来源： cnki会议评论

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中华中医药学刊 2020年第3期38卷 234-237页

作者：郑泽娜汪东涛羊燕群张静邹小虎广州中医药大学第四临床医学院广东深圳518033 南方医科大学深圳医院中医科广东深圳518000

目的探讨益气健脾方对老年慢性肾功能不全患者营养状况的影响及作用机制。方法将60例老年慢性肾功能不全营养不良患者随机分为对照组和研究组,每组30例。在常规治疗基础上,对照组予以复方α-酮酸片每次2.52 mg,3次/d,口服;研究组在对照... 详细信息

目的探讨益气健脾方对老年慢性肾功能不全患者营养状况的影响及作用机制。方法将60例老年慢性肾功能不全营养不良患者随机分为对照组和研究组,每组30例。在常规治疗基础上,对照组予以复方α-酮酸片每次2.52 mg,3次/d,口服;研究组在对照组基础上予以益气健脾方每次150 mL,2次/d,口服。两组患者均治疗3个月。比较两组间临床疗效、血清生化营养学指标水平、肾功能、血清炎症因子水平,及药物不良反应发生率。结果对照组总有效率66.67%(20/30)低于研究组总有效率90.00%(27/30),差异有统计学意义(P0.05)。结论益气健脾方能有效改善老年慢性肾功能不全患者的营养状况,其作用可能与提高肾功能及缓解微炎症状态有关,而且具有较高安全性。

关键词：慢性肾功能不全老年益气健脾方营养状况

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海量存储系统可用性静态测试评估方案

网络安全技术与应用 2011年第4期 33-35,58页

作者：潘清王霄军庄泽南张晓清装备指挥技术学院北京101416

本文分析和研究了海量存储系统可用性关键技术和体系结构,设计制定可用性静态测试评估方案,方案分为定性检查和准则评估两个部分。通过可用性静态测试评估,可以对目标系统的可用性做出直观和准确的初步评价。

关键词：可用性静态测试海量存储系统可用性准则

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两种方法在儿童肺炎支原体抗体检测中的比较

国际检验医学杂志 2018年第A2期39卷 58-61页

作者：徐羽中张琬宁曾东良郭辉深圳宝安人民医院检验科广东深圳518101 南方医科大学检验系广东广州510515

目的对比分析酶联免疫法和被动凝集法在儿童肺炎支原体抗体检测中的应用价值,探讨两种方法的局限性和前景。方法选取深圳市宝安区人民医院2018年1月至3月233例确诊为肺炎支原体感染患儿,采用酶联免疫法和被动凝集法分别检测患儿血清中... 详细信息

目的对比分析酶联免疫法和被动凝集法在儿童肺炎支原体抗体检测中的应用价值,探讨两种方法的局限性和前景。方法选取深圳市宝安区人民医院2018年1月至3月233例确诊为肺炎支原体感染患儿,采用酶联免疫法和被动凝集法分别检测患儿血清中的肺炎支原体抗体。结果在233例患儿标本中,酶联免疫法检出阳性230例,阳性率98.71%;被动凝集法检出阳性223例,阳性率95.71%。其中酶联免疫法检测出的男性患儿阳性率为98.17%,女性患儿阳性率为99.19%;被动凝集法检测出的男性患儿阳性率为96.33%,女性患儿阳性率为95.16%。经统计学比较,两种方法间差异无统计学意义(P=0.065),男女阳性率间差异无统计学意义(P=0.904)。结论两种方法有较好的一致性,均可应用于肺炎支原体抗体检测。避免钩状效应等因素的影响,可以提高肺炎支原体抗体的检出率。

关键词：肺炎支原体抗体儿童酶联免疫法被动凝集法