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Analysis of genetic diversity and population structure of peanut cultivars and breeding lines from China,India and the US using simple sequence repeat markers

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Journal of Integrative Plant Biology 2016年第5期58卷 452-465页

作者： Hui Wang Pawan Khera Bingyan.Huang Mei Yuan Ramesh Katam weijian zhuang Karen Harris-Shultz Kim M.Moore Albert K.Culbreath Xinyou Zhang Rajeev K.Varshney Lianhui Xie Baozhu Guo Fujian Agricultural and Forestry University College of Plant ProtectionFuzhou 350002China Department of Plant Pathology University of GeorgiaTiftonGA 31794USA USDA-ARS Crop Protection and Management Research UnitTiftonGA 31794USA Shandong Peanut Research Institute qingdao 266100China International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics(ICRISAT) Patancheru 502324India Henan Academy of Agricultural Sciences Cash Crops Research InstituteZhengzhou 450002China Department of Biological Sciences Florida A&M UniversityTallahasseeFL 32307USA Fujian Agricultural and Forestry University College of Crop ScienceFuzhou 350002China USDA-ARS Crop Genetics and Breeding Research UnitTiftonGA 31794USA AgResearch Consultants Shingler Little River RoadSumnerGA 31789USA

Cultivated peanut is grown worldwide as rich- source of oil and protein. A broad genetic base is needed for cultivar improvement. The objectives of this study were to develop highly informative simple sequence repeat （SSR） markers and to assess the genetic diversity and popuJation structure of peanut cultivars and breeding lines from different breeding programs in China, India and the US. A total of 111 SSR markers were selected for this study, resulting in a total of 472 alleles. The mean values of gene diversity and polymorphic information content （PIC） were 0.480 and o.429, respectively. Country-wise analysis revealed that alleles per locus in three countries were similar. The mean gene diversity in the US, China and India was 0.363, o.489 and 0.47 with an average PIC of 0.323, 0.43 and o.412, respectively. Genetic analysis using the STRUCTURE divided these peanut lines into two populations （P1, P2）, which was consistent with the dendro- gram based on genetic distance （G1, G2） and the clustering of principal component analysis. The groupings were related to peanut market types and the geographic origin with a few admixtures. The results could be used by breeding programs to assess the genetic diversity of breeding materials to broaden the genetic base and for molecular genetics studies.

关键词： Arachis hypogaea breeding genetic diversity populationstructure simple sequence repeat

甘蔗茎解剖生理研究Ⅰ.不同品种茎贮藏组织解剖特征及其对糖分的影响

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作物学报 1989年第4期15卷 369-377,T002页

作者：庄伟建福建农学院

用细胞离析法和冰冻切片技术,研究了10个甘蔗品种的茎贮藏细胞和维管束的解剖特征。甘蔗不同品种茎贮藏细胞体积存在极显著差异。所有品种茎贮藏组织皆有柱状和球状两种贮藏薄壁细胞,高糖品种这两种细胞各约占50%。茎贮藏细胞体积跟蔗... 详细信息

用细胞离析法和冰冻切片技术,研究了10个甘蔗品种的茎贮藏细胞和维管束的解剖特征。甘蔗不同品种茎贮藏细胞体积存在极显著差异。所有品种茎贮藏组织皆有柱状和球状两种贮藏薄壁细胞,高糖品种这两种细胞各约占50%。茎贮藏细胞体积跟蔗糖含量存在极显著负相关、跟锤度存在显著负相关,尤以后期的细胞体积跟蔗糖含量的负相关关系最密切。随着生育期的进展,各个品种的茎贮藏细胞体积逐渐变小,而且有早熟品种变小较快;迟熟品种变小较慢的趋势。不同品种茎维管束密度存在极显著差异,维管束密度与蔗糖含量存在显著正相关,而与细胞体积没有关系。指出茎贮藏细胞小的品种蔗糖含量高、可能是由于茎组织细胞壁、细胞膜和液泡膜的总表面积大,而使吸收面积大,同时茎组织无阻空间大,因而吸收糖量大。说明糖分高低、是受细胞体积大小的影响。细胞体积随生育期的变化速率,也可能影响甘蔗糖分的含量。本研究结果为甘蔗育种提供参考依据。

关键词：甘蔗贮藏细胞组织解剖糖分

Preliminary identification of the function of Ralstonia solanacearum effector protein Rip75 and screening of candidate interaction proteins

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Preliminary identification of the function of Ralstonia sola...

直流气体绝缘输电线路关键问题及装备研发现状综述

中国植物病理学会2021年学术年会

作者： HEN Kun LI Huaqi GAO Meijia WANG Shanshan DANG Hao WEI Jiaxian zhuang weijian College of Plant Protection Fujian Agriculture and Forestry University College of Agronomy Fujian Agriculture and Forestry University

Bacterial wilt caused by Ralstonia solanacearum is harmful to many *** pathogen caused water shortage due to blocking effect after the propagation of plant vascular bundle,which affected the normal growth and development of plants,and caused the wilt and death,resulting in crop production reduction and huge economic *** the process of pathogen infection,the bacterial use type Ⅲ secretion system to inject a large number of effector proteins directly into host cells,which may affect the immune response of plants and lead to the host plant infected or non-host plants to have hypersensitive *** is a complex species,which can secrete more than 100 kinds of effector proteins,but the function of most of them is not *** whole genome of *** has been sequenced in this laboratory,and 75 effector proteins were predicted by T3 Es *** this study,we selected Rip75 as candidate effector protein gene to clone and preliminarily analyze the ***75,which encodes a total of 338 amino acids and has no conserved domain,can cause hypersensitive response in Nicotiana *** is a new effector protein that has not been reported in *** the mutant strain of Δrip75 was constructed by homologous *** inoculating peanut varieties resistant and susceptible to bacterial wilt,it was found that the pathogenicity of mutant strain Δrip75 to peanut was *** proteins（corresponding to AhPRPS,AhKUAl and AhSBT） interacting with Rip75 were screened by yeast two-hybrid method,and their interaction was verified by BIFC *** results preliminarily revealed the function of the effector protein Rip75 and speculated that it may be a toxicprotein,which provided a theoretical basis for the resistance and control of peanut bacterial wilt.

关键词： Ralstonia solanacearum Peanut Rip75 Effector Yeast two-hybrid

来源： cnki会议评论

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高压电器 2023年第9期59卷 1-11页

作者：梁芳蔚张长虹吕金壮梁作栋庄伟建陈庚范贤浩李传扬何金良清华大学电机工程与应用电子技术系电力系统及发电设备控制和仿真国家重点实验室北京100084 中国南方电网有限责任公司超高压输电公司检修试验中心广州510663 华北电力大学高电压和电磁兼容北京市重点实验室北京102206

直流气体绝缘金属封闭输电线路(GIL)可解决特殊地理环境下输电走廊空间限制问题,为构建“双碳”目标下中国未来能源结构提供装备基础。文中回顾了中国在直流GIL方面的研究进展,包括表面电荷及金属微粒动力学与抑制理论、导体表面形貌诱... 详细信息

直流气体绝缘金属封闭输电线路(GIL)可解决特殊地理环境下输电走廊空间限制问题,为构建“双碳”目标下中国未来能源结构提供装备基础。文中回顾了中国在直流GIL方面的研究进展,包括表面电荷及金属微粒动力学与抑制理论、导体表面形貌诱发的微电离理论等关键科学问题,以及绝缘件设计、微粒捕捉器设计等技术创新。此外,简要介绍了近年来中国在直流GIL的装备研发及设备评价标方面的进展。文中内容为未来直流GIL的研发及应用提供了参考。

关键词：直流GIL 表面电荷沿面闪络金属颗粒导体粗糙度

烟草根特异NtR19基因终止子的克隆及功能分析

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分子植物育种 2014年第3期12卷 466-471页

作者：蔡翠雅庄宇慧张冲曾缘欢陈顺辉庄伟建福建农林大学作物科学学院福州350002 福建省作物分子与细胞生物学重点实验室福州350002 湖南省湖南农业大学生物科学技术学院长沙410000 福建省烟草专卖局烟草农业科学研究所福州350003

为了开发具有自主知识产权的且来源于烟草的终止子,本研究根据烟草根特异NtR19基因的3'UTR序列设计引物,从烟草基因组中克隆并获得了该基因的终止子(T19),并构建植物表达载体转化翠碧一号烟草,通过分子检测和GUS染色验证了NtR19基因终... 详细信息

为了开发具有自主知识产权的且来源于烟草的终止子,本研究根据烟草根特异NtR19基因的3'UTR序列设计引物,从烟草基因组中克隆并获得了该基因的终止子(T19),并构建植物表达载体转化翠碧一号烟草,通过分子检测和GUS染色验证了NtR19基因终止子具有转录终止的功能,同时也说明NtR19基因全长mRNA的3'UTR可以作为终止子加以利用,使用来自烟草的终止子能在一定程度上解决外源基因安全性的研究,这对转基因的安全性提供了资源基础。

关键词：烟草 NtR19 终止子载体构建 GUS染色

AA野生种花生Ty1-copia类反转座子RT基因的克隆与序列分析

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广西植物 2022年第1期42卷 100-112页

作者：蔡铁城刘俊仙张冲刘菁阳太亿蒋菁贺梁琼韩柱强唐荣华庄伟建熊发前福建农林大学植物保护学院福州350002 广西农业科学院经济作物研究所南宁530007 广西农业科学院甘蔗研究所/农业农村部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室/广西甘蔗遗传改良重点实验室南宁530007

该研究旨在克隆Ty1-copia类反转录转座子RT(reverse transcriptase)基因,为分离花生属Ty1-copia类反转录转座子全长序列和研究其功能提供序列基础。根据RT基因的保守区设计简并引物,以两份AA染色体组野生种花生Arachis duranensis为试材... 详细信息

该研究旨在克隆Ty1-copia类反转录转座子RT(reverse transcriptase)基因,为分离花生属Ty1-copia类反转录转座子全长序列和研究其功能提供序列基础。根据RT基因的保守区设计简并引物,以两份AA染色体组野生种花生Arachis duranensis为试材,利用PCR扩增其基因组DNA,回收、克隆和测序目的条带后,对所获得序列进行生物信息学分析。结果表明:(1)目的条带大小约为260 bp,分别从两份野生种花生材料中克隆到41条和27条RT基因序列,68条序列的长度变化范围为256~270 bp,AT所占比例范围为55.86%~68.42%,AT与GC比例范围为1.27~2.17,核苷酸序列间相似性范围为49.8%~99.2%,存在较高异质性。(2)68条序列被分为6个家族,家族Ⅰ和Ⅳ为主要家庭。(3)68条序列中的19条发生了无义突变,***(PI219823)要比***(PI262133)的无义突变率高。(4)氨基酸序列间相似性为4.7%~100%,呈现高度异质性。(5)各家族中代表序列的蛋白质三级结构在整体构型上一致,但在螺旋结构数、折叠结构数、转角数和氢键数上存在较大差别。(6)序列间保守基序总体一致,但也存在一定变异,呈现一定异质性;系统进化树将68条序列分为10类,大部分序列都聚在A和B两大类中。(7)另有部分AA染色体组野生种花生的RT基因序列与其他物种植物的RT基因序列亲缘关系较近,推测不同物种植物间可能发生过Ty1-copia类反转录转座子的横向传递。该研究为花生属基于Ty1-copia类反转录转座子的新分子标记开发和应用奠定基础。

关键词：花生 Ty1-copia 类反转录转座子反转录酶野生种异质性

水稻隐花色素基因Cry1a/Cry2/Cry1b RNAi表达载体构建及遗传转化研究

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热带作物学报 2011年第10期32卷 1843-1848页

作者：李毓戴飞王乃元杨小飞庄伟建仇秀丽福建农林大学作物科学学院福建福州350002 福建农林大学作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室福建福州350002 福建省分子与细胞生物学重点实验室福建福州350002

构建一个包含3个水稻隐花色素基因片段的RNAi表达载体pSC1301-347-Cry1aCry2Cry1b并转化水稻,以期导致Cry1a、Cry1b与Cry2集体沉默,观察它们对水稻重要农艺性状的影响。结果表明,转基因水稻开花期显著延迟,结实率骤降,株高增加,剑叶变短... 详细信息

构建一个包含3个水稻隐花色素基因片段的RNAi表达载体pSC1301-347-Cry1aCry2Cry1b并转化水稻,以期导致Cry1a、Cry1b与Cry2集体沉默,观察它们对水稻重要农艺性状的影响。结果表明,转基因水稻开花期显著延迟,结实率骤降,株高增加,剑叶变短,谷粒变长、变宽;而剑叶宽、穗长与对照无显著差异。

关键词：水稻隐花色素基因 RNAi 载体构建遗传转化

青枯菌诱导的烟草叶片全长cDNA文库的构建和初步分析

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分子植物育种 2013年第5期11卷 624-629页

作者：张冲蔡铁城陈华曾建斌庄伟建福建农林大学生命科学学院福州350002 福建省作物分子与细胞生物学重点实验室福州350002

以优质高抗青枯病烤烟品种K326为材料，在苗期利用注射法接种烟草青枯菌，分不同时期取叶片，利用CTAB法提取接种和非接种的混合RNA，采用SMART（switching mechanism at 5’end of RNA transcript）技术合成双链cDNA，经Sfi Ⅰ酶切后... 详细信息

以优质高抗青枯病烤烟品种K326为材料，在苗期利用注射法接种烟草青枯菌，分不同时期取叶片，利用CTAB法提取接种和非接种的混合RNA，采用SMART（switching mechanism at 5’end of RNA transcript）技术合成双链cDNA，经Sfi Ⅰ酶切后胶回收纯化双链cDNA，连接到质粒载体pDNR—LIB上，电击转化大肠杆菌DH5α感受态细胞，成功构建了青枯菌诱导的烟草叶片全长cDNA文库。经鉴定，初级文库库容为1．902×10^6cfu／mL，重组率达到98％以上，插入片段集中在0．75～2．0kb之间，平均长度约为1300bp，经扩增后的文库滴度为2．97×10^9cfu／mL。随机挑取部分克隆测序，利用生物信息学软件进行初步分析获得部分EST数据。结果显示得到了高质量的全长cDNA文库，这为筛选和克隆青枯菌诱导的胁迫相关基因提供了资源基础。

关键词：烟草青枯病 SMART技术 cDNA文库

四倍体野生种花生Ty3-gypsy类反转录转座子RT基因的分离及序列分析

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分子植物育种 2023年第21期21卷 6972-6981页

作者：蔡铁城张冲刘菁阳太亿陈华蒋菁贺梁琼韩柱强唐荣华庄伟建刘俊仙熊发前福建农林大学植物保护学院福州350002 广西农业科学院经济作物研究所南宁530007 广西农业科学院甘蔗研究所中国农业科学院甘蔗研究中心农业农村部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室广西甘蔗遗传改良重点实验室南宁530007

本研究从四倍体野生种花生中分离了Ty3-gypsy类反转录转座子的反转录酶(RT)基因序列,分析了其序列特点和差异,为研究其转录活性和功能奠定基础。根据Ty3-gypsy类反转录转座子RT基因的保守区设计简并引物,PCR扩增四倍体野生种花生(Arachi... 详细信息

本研究从四倍体野生种花生中分离了Ty3-gypsy类反转录转座子的反转录酶(RT)基因序列,分析了其序列特点和差异,为研究其转录活性和功能奠定基础。根据Ty3-gypsy类反转录转座子RT基因的保守区设计简并引物,PCR扩增四倍体野生种花生(Arachis monticola)(PI468199)的DNA,目的条带经回收、克隆和测序后,进行生物信息学分析。结果显示,目的条带大小约为430 bp,共有29条AmRT2-X基因序列被分离出,这些序列长度变化范围为397~433 bp,AT所占比例范围为55.66%~65.97%,核苷酸序列间相似性在45.1%~97.2%之间,存在较高异质性;29条AmRT2-X基因序列被聚类划分为8个家族,家族A是包含序列最多的家族;翻译成氨基酸后,有10条AmRT2-X基因序列发生了无义突变;氨基酸序列间相似性在22.3%~98.6%之间,呈现高度异质性;绝大部分AmRT2-X基因序列的保守基序一致;系统进化树显示,所有RT基因序列被分为6类,其中,Ⅰ类包含20条AmRT2-X基因序列,Ⅱ类中的4条Am RT2-X基因序列与来自拟南芥、多花黑麦草、火龙果、牡丹、果梅、枣、山桑、白皮松等物种的序列之间亲缘关系较近;通过比对花生EST数据库,发现2条具有转录活性的四倍体野生种花生Ty3-gypsy类反转录转座子。本研究为Ty3-gypsy类反转录转座子全长序列的分离及其功能的研究提供一定基础。

关键词：花生 Ty3-gypsy类反转录转座子反转录酶异质性四倍体野生种