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Preoperative CT radiomics models for predicting composition of in vivo urinary calculi

中国医学影像技术 2024年第8期40卷 1216-1220页

作者： TANG Lei WANG Shixia LI Wuchao zeng xianchun AN Yunzhao SONG Bin Department of Medical Imaging Guizhou Provincial People's HospitalGuiyang 550002China Department of Urology Guizhou Provincial People's HospitalGuiyang 550002China Department of Radiology West China HospitalSichuan UniversityChengdu 610041China

Objective To observe the value of preoperative CT radiomics models for predicting composition of in vivo urinary *** Totally 543 urolithiasis patients were retrospectively enrolled and divided into calcium oxalate monohydrate stone group(group A,n=373),anhydrous uric acid stone group(group B,n=86),carbonate apatite group(group C,n=30),ammonium urate stone group(group D,n=28)and ammonium magnesium phosphate hexahydrate stone group(group E,n=26)according to the composition of calculi,also divided into training set and test set at the ratio of 7∶*** features were extracted and screened based on plain CT images of urinary *** binary task models(model A—E corresponding to group A—E)and a quinary task model were constructed using least absolute shrinkage and selection operator algorithm for predicting the composition of calculi in *** receiver operating characteristic curves were drawn,and the area under the curves(AUC)were calculated to evaluate the predictive efficacy of binary task models,while the accuracy,precision,recall and F1 score were used to evaluate the predictive efficacy of the quinary task *** All binary task models had good efficacy for predicting the composition of urinary calculi in vivo,with AUC of 0.860—0.948 in training set and of 0.856—0.933 in test *** accuracy,precision,recall and F1 score of the quinary task model for predicting the composition of in vivo urinary calculi was 82.25%,83.79%,46.23%and 0.596 in training set,respectively,while was 80.63%,75.26%,43.48%and 0.551 in test set,*** Binary task radiomics models based on preoperative plain CT had good efficacy for predicting the composition of in vivo urinary calculi,while the quinary task radiomics model had high accuracy but relatively poor stability.

关键词： urolithiasis tomography,X-ray computed radiomics

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支气管扩张症合并铜绿假单胞菌感染:2012-2022年的文献计量学分析及可视化研究

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中国感染与化疗杂志 2024年第1期24卷 8-18页

作者：李柔杨斌曾宪春温茹刘琳贵州大学医学院贵阳550025 贵州省人民医院中心实验室贵州省人民医院医学影像科贵州省人民医院呼吸与危重症医学科贵州省人民医院国家卫生健康委员会肺脏免疫性疾病诊治重点实验室

目的探讨支气管扩张症(支扩症)合并铜绿假单胞菌(PA)感染领域过去十年的研究现状及发展趋势,为该领域的科学研究提供新的思路和策略。方法以“bronchiectasis”or“cystic fibrosis”or“non-cystic fibrosis bronchiectasis”and“Pseu... 详细信息

目的探讨支气管扩张症(支扩症)合并铜绿假单胞菌(PA)感染领域过去十年的研究现状及发展趋势,为该领域的科学研究提供新的思路和策略。方法以“bronchiectasis”or“cystic fibrosis”or“non-cystic fibrosis bronchiectasis”and“Pseudomonas aeruginosa”检索2012—2022年Web of Science Core Collection(WoSCC)发表类型为论著和综述的英文文献,利用HisCite、VOSviewer和Citespace软件对文献发文量、期刊、作者和关键词等进行文献计量学及可视化分析。结果全球共5824篇支扩症合并PA感染的文章发表在1103种期刊上,年均发文量较稳定,以呼吸系统和微生物学期刊为主。共96个国家和地区、5005个机构、21769名作者在该领域发表文章,美国发表文章最多并构建了全球最大合作网络。该领域研究主要集中在肺囊性纤维化,聚类主题包括PA在宿主的适应和进化、炎症反应、抗生素耐药、临床结局和预后。慢性气道感染及各类临床评分标准是近年较为突出的主题。结论支扩症合并PA感染是呼吸系统和微生物学的关注重点,研究主要集中在细菌-宿主相互作用和临床影响,建议中国学者未来更多参与这一领域的基础和临床研究。

关键词：感染铜绿假单胞菌支气管扩张症文献计量学可视化研究

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蝎毒素抗菌肽CeAP1的生物信息学分析与生物活性鉴定

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中国病原生物学杂志 2024年第2期19卷 130-136页

作者：敖日格乐胡和珠拉胡伊力格其曾宪春内蒙古民族大学蒙医药学院内蒙古通辽028043 国家药品监督管理局中药(蒙药)质量控制重点实验室中国地质大学(武汉)生物地质与环境地质国家重点实验室

目的获得蝎毒素抗菌肽基因CeAP1并鉴定其编码多肽生物活性。方法采用生物信息学方法从墨西哥雕像木蝎(Centruroides exilicauda)基因组数据中筛选得到1个新的短链抗菌肽基因CeAP1,其成熟肽序列由17个氨基酸残基组成,二级结构呈现为α-... 详细信息

目的获得蝎毒素抗菌肽基因CeAP1并鉴定其编码多肽生物活性。方法采用生物信息学方法从墨西哥雕像木蝎(Centruroides exilicauda)基因组数据中筛选得到1个新的短链抗菌肽基因CeAP1,其成熟肽序列由17个氨基酸残基组成,二级结构呈现为α-螺旋结构,是一种两亲性α-螺旋型阳离子抗菌肽。采用生物信息学软件分析该基因及其编码多肽的结构等生物学特征,并研究其生物活性。结果抗菌肽CeAP1具有广谱抗菌活性,对金黄色葡萄球菌和巨大芽孢杆菌的最低抑菌浓度(minimal inhibitory concentration,MIC)值分别为16.0μmol/L和32.0μmol/L;尤其是对临床分离的多重耐药革兰阳性菌耐万古霉素肠球菌(vancomycin-resistant Enterococcus,VRE)和耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)均具有较强的抑菌活性,其中对VRE E156和VRE E161菌株的MIC值均为16.0μmol/L;对MRSA 16436和MRSA 16559菌株的MIC值均为32.0μmol/L,并且对人的红细胞有较低的溶血活性。此外,在4×MIC浓度下,CeAP1可在15 min内完全杀死所有培养的MRSA 16436菌株。结论抗菌肽CeAP1对耐万古霉素肠球菌和耐甲氧西林金黄色葡萄球菌具有较强的抗菌活性,可能用于治疗多重耐药菌感染的药物开发,具有潜在的药用价值。

关键词：蝎毒素抗菌肽生物活性耐万古霉素肠球菌耐甲氧西林金黄色葡萄球菌

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左心房原发性去分化脂肪肉瘤1例

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中国介入影像与治疗学 2024年第5期21卷 318-319页

作者：付利伟苏芝杰张训兰马海彦曾宪春遵义医科大学研究生院贵州遵义563000 贵州省人民医院医学影像科贵州贵阳550002

患者男,42岁,咳血痰1周,外院诊断为“左心房黏液瘤并双肺多发炎症”;既往体健。查体未见明显异常。心电图示窦性心动过速。心脏超声:左心房52 mm×25 mm团块状有分叶稍强回声,随心脏搏动而移动;提示黏液瘤。胸部CT:双肺多发斑片状高密度... 详细信息

患者男,42岁,咳血痰1周,外院诊断为“左心房黏液瘤并双肺多发炎症”;既往体健。查体未见明显异常。心电图示窦性心动过速。心脏超声:左心房52 mm×25 mm团块状有分叶稍强回声,随心脏搏动而移动;提示黏液瘤。胸部CT:双肺多发斑片状高密度影,以右肺为著(图1A),边缘模糊;左心房内类圆形低密度影,边界不清,CT值约36 HU,似累及右肺静脉(图1B);增强后左心房、双侧肺动脉、右肺静脉内团块状、条片状充盈缺损,局部突向左心室,约51 mm×38 mm×35 mm,呈轻中度不均匀强化,动脉期CT值约74 HU、静脉期CT值约48 HU(图1C、1D);最大密度投影(maximum intensity projection,MIP)图示上述低密度影局部由降主动脉供血(图1E);提示左心房黏液瘤并双侧肺动脉、右肺静脉瘤栓形成,双侧肺炎。于全麻下行左心房肿物切除术+肺动静脉栓塞清除术。

关键词：心房脂肪肉瘤体层摄影术,X线计算机

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双能量CT非线性融合技术在双下肢CTA检查中的应用

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中国中西医结合影像学杂志 2024年第2期22卷 212-216页

作者：陈昌美胡容刘宗才王荣品曾宪春贵州省人民医院医学影像科贵州贵阳550002 贵州医科大学公共卫生与健康学院贵州贵阳550025 贵州省第二人民医院感染管理科贵州贵阳550004

目的:探讨双能量CT非线性融合(NLB)技术在双下肢CTA检查中的应用价值。方法:回顾性收集疑似双下肢血管病变并行双能量CTA检查的患者52例,扫描后分别行线性融合(LB)技术和NLB技术重建,得到LB和NLB图像。对比LB、NLB及原始图像低kV(80 kV... 详细信息

目的:探讨双能量CT非线性融合(NLB)技术在双下肢CTA检查中的应用价值。方法:回顾性收集疑似双下肢血管病变并行双能量CTA检查的患者52例,扫描后分别行线性融合(LB)技术和NLB技术重建,得到LB和NLB图像。对比LB、NLB及原始图像低kV(80 kV组)3组图像质量,包括客观评价(CT值、SD、SNR、CNR)和主观评分,以及图像优良率和图像可诊断率。结果:3组图像主观评分差异有统计学意义(P0.05)。结论:双能量CT的NLB技术可提高双下肢CTA检查的图像质量,有望增加双下肢血管疾病的检出率及诊断准确率,值得临床深入研究。

关键词：体层摄影术,X线计算机下肢血管造影术线性融合技术非线性融合技术图像质量

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能谱CT平扫图像直方图纹理分析对肾盂旁囊肿与肾盂积水的鉴别价值

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中国中西医结合影像学杂志 2024年第2期22卷 202-206页

作者：陶健马海彦梁甜甜曾宪春王荣品贵州省人民医院放射科/精准影像诊疗示范型国际科技合作基地贵州贵阳550002

目的:探讨能谱CT平扫单能量图像结合直方图纹理分析对肾盂旁囊肿与肾盂积水的鉴别价值。方法:回顾性收集25例肾盂旁囊肿(肾盂旁囊肿组)和18例肾盂积水患者(肾盂积水组)。应用能谱成像分析平台测量2组40~140 keV(以10 keV为间隔)11个不... 详细信息

目的:探讨能谱CT平扫单能量图像结合直方图纹理分析对肾盂旁囊肿与肾盂积水的鉴别价值。方法:回顾性收集25例肾盂旁囊肿(肾盂旁囊肿组)和18例肾盂积水患者(肾盂积水组)。应用能谱成像分析平台测量2组40~140 keV(以10 keV为间隔)11个不同单能量CT值,并分别行统计学比较。单能量CT值差异有统计学意义的,在AW4.5工作站上重建相应单能量图像,采用GEOmni-Kinetics软件进行直方图纹理分析,选择病灶最大层面勾画ROI,生成基于灰度直方图纹理参数,包括最小值,最大值,均值,标准差,变异度,偏度,峰度,均一性,能量,熵,第5、10、25、50、75、90、95百分位数。采用单因素分析比较2组间参数的差异,基于ROC曲线评价各参数的鉴别价值。采用多因素logistic回归模型进行特征筛选并构建最终的预测模型,绘制最终模型的ROC曲线并分析其价值。结果:40~50 keV条件下,肾盂旁囊肿组的单能量CT值大于肾盂积水组,差异均有统计学意义(均P0.05)。40 keV条件下,2组均值,峰度,能量,熵,第5、10、25、50、75百分位数差异均有统计学意义(均P0.05);50 keV条件下,2组均值,第10、25、50百分位数差异均有统计学意义(均P0.05)。ROC曲线分析显示,40 keV图像纹理参数鉴别肾盂旁囊肿与肾盂积水的AUC为0.696~0.756,均大于50 keV图像纹理参数的AUC。多因素logistic回归分析显示,40 keV图像纹理参数的峰度、能量和第25百分位数是肾盂旁囊肿与肾盂积水的独立预测因子,三者联合诊断鉴别肾盂旁囊肿与肾盂积水的AUC为0.915,敏感度为93.3%、特异度为83.3%。结论:基于能谱CT平扫40 keV图像的直方图纹理参数构建的多因素logistic回归模型能有效鉴别肾盂旁囊肿与肾盂积水。

关键词：肾盂旁囊肿肾盂积水体层摄影术,X线计算机纹理分析诊断,鉴别

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睾丸恶性生殖细胞来源肿瘤的CT表现

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中国中西医结合影像学杂志 2024年第3期22卷 346-349页

作者：刘江勇王骋牟俊刘新峰曾宪春王荣品贵州省人民医院医学影像科贵州贵阳550002

目的:探讨睾丸恶性生殖细胞来源肿瘤的CT特征,提高对该类疾病的认识。方法:回顾性分析44例经手术病理证实的睾丸恶性生殖细胞来源肿瘤的CT表现。结果:44例均为单发,23例右侧,21例左侧;精原细胞瘤22例,卵黄囊瘤7例,胚胎性癌4例,混合性生... 详细信息

目的:探讨睾丸恶性生殖细胞来源肿瘤的CT特征,提高对该类疾病的认识。方法:回顾性分析44例经手术病理证实的睾丸恶性生殖细胞来源肿瘤的CT表现。结果:44例均为单发,23例右侧,21例左侧;精原细胞瘤22例,卵黄囊瘤7例,胚胎性癌4例,混合性生殖细胞肿瘤11例。CT表现为大小不等实性肿块,肿块密度不均,内见不同程度囊变坏死,未见明确钙化及脂肪成分;边缘不规则、呈分叶状,并具有侵犯邻近组织器官及远处转移等恶性肿瘤征象。增强扫描示7例卵黄囊瘤实性成分呈明显不均匀渐进性强化;余肿块实性成分呈不同程度强化,囊性坏死区无强化。结论:睾丸恶性生殖细胞来源肿瘤的CT表现具有一定的特征性,结合临床资料尤其是血清甲胎蛋白,有助于提高该类疾病的诊断准确率,但确诊仍依靠组织病理学检查。

关键词：睾丸肿瘤生殖细胞体层摄影术,X线计算机

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2021年康定市45岁及以上中老年人人体成分指标对糖、脂代谢异常的诊断效能分析

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预防医学情报杂志 2024年第2期40卷 117-123,131页

作者：何夏梦林嘉玲蒲芳芳魏瑶瑶曾献春石磊柳园胡雯四川大学华西医院临床营养科成都610041 四川天府新区人民医院成都610213 成都医学院检验医学院成都610500 四川大学华西公共卫生学院成都610041

目的分析四川省康定地区中老年人群体成分和糖、脂代谢的现况,研究人体成分指标对糖、脂代谢异常的诊断效能,为中老年人群慢病防控提供参考依据。方法于2021年9至10月,采用方便抽样的方法对四川省康定市中老年居民进行问卷调查、人体成... 详细信息

目的分析四川省康定地区中老年人群体成分和糖、脂代谢的现况,研究人体成分指标对糖、脂代谢异常的诊断效能,为中老年人群慢病防控提供参考依据。方法于2021年9至10月,采用方便抽样的方法对四川省康定市中老年居民进行问卷调查、人体成分检测及实验室检测,运用t检验比较糖、脂代谢异常人群和正常人群体成分的差异,采用Spearman相关性分析糖、脂代谢指标与人体成分指标间的相关性,运用ROC曲线研究人体成分指标对糖、脂代谢异常的诊断效能,以P<0.05为差异有统计学意义。结果共纳入1056例调查对象,其中男性722人,女性334人,平均年龄(56.42±6.85)岁,检出血糖调节受损占14.0%,血脂代谢异常占51.3%,糖、脂代谢均异常占10.0%。血糖调节受损组的骨骼肌质量指数(SMI)、体质指数(BMI)、体脂百分比(PBF)、内脏脂肪面积(VFA)和腰臀比(WHR)均高于其正常组(P均<0.05);血脂代谢异常组及糖、脂代谢均异常组的SMI、骨骼肌质量(SMM)、瘦组织质量(SLM)、BMI、PBF、VFA和WHR均分别高于其正常组(P均<0.05)。BMI、PBF、VFA、WHR与空腹血糖呈正相关(P均<0.05);PBF、VFA、WHR与总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)呈正相关(P均<0.05);SMI、SLM、SMM与TC、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)呈负相关(P均<0.05)。选取与血糖、血脂具有相关性的体成分指标,进行ROC曲线分析,BMI、PBF、VFA与WHR可预测血糖调节受损,其中WHR的诊断效能最高,理想界值点为0.88(P<0.05);SMI、SLM、SMM、BMI、PBF、VFA与WHR可预测血脂代谢异常和糖、脂代谢均异常风险,两者BMI的诊断效能均最高,理想界值点分别为24.65 kg/m^(2)和24.45 kg/m^(2)(P均<0.05)。结论四川省康定地区中老年人群存在糖、脂代谢异常,其中血脂代谢异常率最高,人体成分中WHR和BMI是预测糖、脂代谢异常的良好指标。

关键词：高原地区中老年人人体成分分析血糖血脂

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Molecular characterization of a K+ channel blocker in the scorpion Buthus martensii Karsch

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Chinese Science Bulletin 2000年第8期45卷 739-743页

作者： Shunyi Zhu xianchun zeng Wenxin Li Dahe Jiang Wuhan Univ Coll Life Sci Dept Virol & Mol Biol Wuhan 430072 Peoples R China

K+ channel blockers of scorpion venoms are of important value in studyingpharmacology and physiology of specific K+ channel of celis. Based on the amino acid sequences of BmP01 previously characterized as a small-conductance Ca2+-activated K+ channel blocker, two 'back to back' degenarate primers have been designed and synthesized for inverse PCR strategy, its full-length cDNA has been cloned from the venom gland of the Chinese scorpion Buthus martensii. The cDNA is composed of 3 parts: 5’ UTR, oRF and 3’ UTR. The flanking sequence of translation initiation codon ATG is AAAKTGA, which is highly conserved in scorpion Na+ channel toxin and protozoan genes, suggesting that these genes may have followed a common mechanism for translation initiation. The 3’ UTR contains poly(A) signal AATAAA. The open reading frame encodes a precursor of 57 residues with a signal peptide of 28 residues and a mature peptide of 29 residues. The signal peptide is rich in hydrophobic amino acid residues and its length is

关键词： Buthus martensii Karsch K+ channel blocker cDNA sequence analysis.

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Orchestrating seed storage protein and starch accumulation toward overcoming yield–quality trade-off in cereal crops

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Journal of Integrative Plant Biology 2024年第3期66卷 468-483页

作者： Shuanghe Cao Bingyan Liu Daowen Wang Awais Rasheed Lina Xie xianchun Xia Zhonghu He State Key Laboratory of Crop Gene Resources and Breeding/National Wheat Improvement Center Institute of Crop SciencesBeijing 100081China College of Agronomy Henan Agricultural UniversityZhengzhou 450002China International Maize and Wheat Improvement Center(CIMMYT)China Office Chinese Academy of Agricultural SciencesBeijing 100081China

Achieving high yield and good quality in crops is essential for human food security and ***,there is usually disharmony between yield and *** storage protein(SSP)and starch,the predominant components in cereal grains,determine yield and quality,and their coupled synthesis causes a yield–quality ***,dissection of the underlying regulatory mechanism facilitates simultaneous improvement of yield and ***,we summarize current findings about the synergistic molecular machinery underpinning SSP and starch synthesis in the leading staple cereal crops,including maize,rice and *** further evaluate the functional conservation and differentiation of key regulators and specify feasible research approaches to identify additional regulators and expand *** also present major strategies to leverage resultant information for simultaneous improvement of yield and quality by molecular ***,future perspectives on major challenges are proposed.

关键词： cereal crops grain yield and quality seed storage protein starch synergistic regulation

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