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Ecological selection of bacterial taxa with larger genome sizes in response to polycyclic aromatic hydrocarbons stress

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Journal of Environmental Sciences 2022年第2期34卷 82-93页

作者： yuzhu dong Shanghua Wu Haonan Fan Xianglong Li Yijing Li Shengjun Xu Zhihui Bai Xuliang Zhuang Key Laboratory of Environmental Biotechnology Research Center for Eco-Environmental SciencesChinese Academy of SciencesBeijing 100085China College of Resources and Environment University of Chinese Academy of SciencesBeijing 200049China College of Sino-Danish Center University of Chinese Academy of SciencesBeijing 100049China

Polycyclic aromatic hydrocarbons(PAHs)are ubiquitous priority pollutants that cause great damage to the natural environment and health.Average genome size in a community is critical for shedding light on microbiome's functional response to pollution stress within an environment.Here,microcosms under different concentrations were performed to evaluate the selection of PAHs stress on the average genome size in a community.We found the distinct communities of significantly larger genome size with the increase of PAHs concentration gradients in soils,and consistent trends were discovered in soils at different latitudes.The abundance of Proteobacteria and Deinococcus-Thermus with relatively larger genomes increased along with PAHs stress and well adapted to polluted environments.In contrast,the abundance of Patescibacteria with a highly streamlined and smaller genome decreased,implying complex interactions between environmental selection and functional fitness resulted in bacteria with larger genomes becoming more abundant.Moreover,we confirmed the increased capacity for horizontal transfer of degrading genes between communities by showing an increased connection number per node positively related to the nid A gene along the concentration gradients in the co-occurrence network.Our findings suggest PAHs tend to select bacterial taxa with larger genome sizes,with significant consequences for community stability and potential biodegradation strategies.

关键词： Pollution stress Polycyclic aromatic hydrocarbons(PAHs) Genome size Horizontal gene transfer Soil microbial community

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野生大豆内生真菌YD09鉴定及促生耐盐特性研究

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大豆科学 2024年第1期43卷 88-94页

作者：高丽丽林星月朱淼王泽东雨竹马莲菊沈阳师范大学生命科学学院辽宁沈阳110034

为从野生大豆中筛选具有促生抗逆的内生菌,利用组织分离法从野生大豆根中分离内生真菌,根据菌株形态和ITS序列系统发育树对菌株进行鉴定,研究菌株自身耐盐特性、胞内和胞外产物对大豆幼苗生长及耐盐性的影响。结果显示:分离得到1株内生... 详细信息

为从野生大豆中筛选具有促生抗逆的内生菌,利用组织分离法从野生大豆根中分离内生真菌,根据菌株形态和ITS序列系统发育树对菌株进行鉴定,研究菌株自身耐盐特性、胞内和胞外产物对大豆幼苗生长及耐盐性的影响。结果显示:分离得到1株内生真菌,基于菌株形态学和rRNA基因ITS序列系统发育分析,鉴定为交链孢霉菌(Alternaria alternata),命名为YD09。菌株YD09耐NaCl浓度可达30%。菌株YD09作用于大豆幼苗,具有良好的促生效果,且可使幼苗耐NaCl浓度达到200 mmol·L^(-1)。菌株YD09胞内产物对大豆幼苗具有明显的促生效果,胞外产物能提高大豆幼苗对盐胁迫的抗性。综上,菌株YD09具有较好的促生、耐盐能力,能够缓解盐胁迫对大豆幼苗的伤害,可作为农业生产上应用的新菌种资源。

关键词：野生大豆内生真菌鉴定耐盐

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Endomembrane-biased dimerization of ABCG16 and ABCG25 transporters determines their substrate selectivity in ABA-regulated plant growth and stress responses

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Molecular Plant 2024年第3期17卷 478-495页

作者： Yeling Zhou yuzhu Wang dong Zhang Jiansheng Liang institute of Plant and Food Science Department of BiologySchool of Life SciencesSouthern University of Science and Technology(SUSTech)Shenzhen 518055China Key Laboratory of Molecular Design for Plant Cell Factory of Guangdong Higher Education Institutes Southern University of Science and Technology(SUSTech)Shenzhen 518055China jiangsu Key Laboratory of Crop Genetics and Physiology/Co-lnnovation Center for Modern Production Technology of Grain Crops Key Laboratory of Plant Functional Genomics of the Ministry of EducationYangzhou UniversityYangzhou 225009China

ATP-binding cassette(ABC)transporters are integral membrane proteins that have evolved diverse func-tions fulfilled via the transport of various substrates.In Arabidopsis,the G subfamily of ABC proteins is particularly abundant and participates in multiple signaling pathways during plant development and stress responses.In this study,we revealed that two Arabidopsis ABCG transporters,ABCG16 and ABCG25,engage in ABA-mediated stress responses and early plant growth through endomembrane-specific dimerization-coupled transport of ABA and ABA-glucosyl ester(ABA-GE),respectively.We first revealed that ABCG16 contributes to osmotic stress tolerance via ABA signaling.More specifically,ABCG16 induces cellular ABA efflux in both yeast and plant cells.Using FRET analysis,we showed that ABCG16 forms oblig-atory homodimers for ABA export activity and that the plasma membrane-resident ABCG16 homodimers specifically respond to ABA,undergoing notable conformational changes.Furthermore,we demonstrated that ABCG16 heterodimerizes with ABCG25 at the endoplasmic reticulum(ER)membrane and facilitates the ER entry of ABA-GE in both Arabidopsis and tobacco cells.The specific responsiveness of the ABCG16-ABCG25 heterodimer to ABA-GE and the superior growth of their double mutant support an inhib-itory role of these twoABCGs in early seedling establishment via regulation of ABA-GE translocation across the ER membrane.Our endomembrane-specific analysis of the FRET signals derived from the homo-or heterodimerized ABcG complexes allowed us to link endomembrane-biased dimerization to the transloca-tion of distinct substrates by ABcG transporters,providing a prototypic framework for understanding the omnipotence of ABcG transporters in plant development and stress responses.

关键词： abscisic acid ABCG transporter dimerization endomembrane substrate selectivity

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某高填方工程强夯地基处理设计施工要点

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江苏建材 2024年第1期 95-97页

作者：董玉柱雷东升苗晓飞曹廷中建二局第四建筑工程有限公司天津300457 郑州财经学院河南郑州45000 中建五局第三建设(深圳)有限公司广东深圳518110

根据晋城某工程湿陷性黄土地区高填方强夯回填设计施工情况,分析深厚湿陷性黄土填土强夯的设计及施工中的技术要点,探讨强夯中一些参数的确定方法等。

关键词：设计强夯试夯施工

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连铸机扇形段用调心滚子轴承失效分析

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科学技术创新 2024年第7期 225-228页

作者：董玉柱郭宏军许荣昌夏佃秀孙宗辉田盛林吴赛赛杨旭济南大学机械工程学院山东济南山东省宇捷轴承制造有限公司山东聊城山东钢铁集团有限公司山东济南

本文采用了光学显微镜、扫描电子显微镜及硬度仪等设备,对失效的连铸机扇形段调心滚子轴承进行了分析,以探求其失效的原因。结果表明:轴承安装时存在一定的偏载,随着轴承的不断运转,偏载会越来越严重地挤压轴承的滚子,加上在重载环境下... 详细信息

本文采用了光学显微镜、扫描电子显微镜及硬度仪等设备,对失效的连铸机扇形段调心滚子轴承进行了分析,以探求其失效的原因。结果表明:轴承安装时存在一定的偏载,随着轴承的不断运转,偏载会越来越严重地挤压轴承的滚子,加上在重载环境下会产生更剧烈的磨损,使轴承内圈升温,最终导致轴承滚子严重挤压变形和内圈硬度下降。调心滚子轴承的内圈硬度下降最严重,其中大量珠光体的存在是其硬度降低的关键原因。

关键词：连铸机扇形段调心滚子轴承偏载珠光体

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Tentative Plan for Jinqiao Export-Oriented Processing Zone

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China City Planning Review 1992年第3期9卷 78-84页

作者： Wang Jialu dong yuzhu Shanghai Institute of Urban Planning and Design

To develop export-oriented processingoperations in Pudong New Area is the bestway to make use of, in a comprehensivemanner, the high-quality labour, stablesupply of raw materials, extensive interna-tional market, the ... 详细信息

关键词： Tentative Plan for Jinqiao Export-Oriented Processing Zone

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基于时序网络仿真和贡献率的预警作战体系任务支持能力评估

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兵工学报 2024年第4期45卷 1237-1251页

作者：俞锦涛肖兵崔玉竹亓冬严韬空军预警学院信息对抗系湖北武汉430019 空军预警学院预警情报系湖北武汉430019 之江实验室浙江杭州311121 武警士官学校浙江杭州310030 空军预警学院空天预警系湖北武汉430019

针对预警作战体系任务支持能力评估出现的网络化建模存在能力误差、任务能力缺乏动态特性以及评估结果与现实效果存在一定误差等问题,提出基于时序网络仿真和贡献率的作战体系任务支持能力评估方法。基于预警作战体系的静态网络模型,将... 详细信息

针对预警作战体系任务支持能力评估出现的网络化建模存在能力误差、任务能力缺乏动态特性以及评估结果与现实效果存在一定误差等问题,提出基于时序网络仿真和贡献率的作战体系任务支持能力评估方法。基于预警作战体系的静态网络模型,将其拓展到时序网络层面,并定义时序路径和时序效能环;根据任务层次分解将任务需求和能力进行匹配;建立时序网络和多Agent仿真的映射关系,构建贴近实际作战的仿真框架;利用贡献率的思想在蒙特卡洛仿真数据基础上分析预警作战体系的任务支持能力,将非对称高斯隶属函数表示的不确定指标和统计结果表示的精确指标用相似度权重进行集成,计算得到不同作战单元在体系中的任务支持能力。实验结果表明,所提方法有效可行,能够贴近装备实际能力,缩小与现实结果的评估误差,为体系能力评估和装备需求论证提供了技术支撑。

关键词：时序网络时序效能环预警作战体系蒙特卡洛仿真任务支持能力

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一株类节杆菌协同还原六价铬和降解阿特拉津的研究

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环境科学学报 2023年第4期43卷 236-242页

作者：李祥龙吴尚华樊浩楠董钰珠白志辉庄绪亮中国科学院生态环境研究中心北京100085 中国科学院大学北京100049 雄安创新研究院雄安新区071899 中国科学院青藏高原研究所北京100101

六价铬(Cr(Ⅵ))和阿特拉津复合污染在环境中普遍存在,给生态安全和人类健康带来严重危害.为了实现对Cr(Ⅵ)和阿特拉津复合污染的协同修复,本研究在复合污染场地筛选出一株同时具有阿特拉津降解能力和Cr(Ⅵ)还原能力的类节杆菌Paenarthro... 详细信息

六价铬(Cr(Ⅵ))和阿特拉津复合污染在环境中普遍存在,给生态安全和人类健康带来严重危害.为了实现对Cr(Ⅵ)和阿特拉津复合污染的协同修复,本研究在复合污染场地筛选出一株同时具有阿特拉津降解能力和Cr(Ⅵ)还原能力的类节杆菌Paenarthrobacter sp.AT.在单一污染条件下,菌株AT可以在24 h内将初始浓度为400 mg·L^(-1)的阿特拉津完全降解,将初始浓度为10 mg·L^(-1)的Cr(VI)完全还原;同时,菌株还具有很强的阿特拉津和Cr(Ⅵ)耐受性.菌株AT被鉴定含有trz N、atz B和atz C阿特拉津降解功能基因,将阿特拉津降解为无毒终产物氰尿酸,同时生成乙胺和异丙胺两种代谢副产物,其中,乙胺在溶液中持续积累,而异丙胺则短暂积累再被降解.在复合污染条件下,菌株AT对初始浓度为200 mg·L^(-1)阿特拉津的降解率为100%,对初始浓度为10 mg·L^(-1)的Cr(Ⅵ)的还原率为44%.本研究证实了微生物可以利用有机污染物作为氮源实现对重金属的转化,为开发绿色低碳微生物修复技术提供了借鉴.

关键词：六价铬阿特拉津类节杆菌微生物修复复合污染

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改进的多传感器信息融合算法及其应用

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传感器与微系统 2024年第7期43卷 161-164页

作者：刘玉柱屈蔷曹东南京航空航天大学自动化学院江苏南京211106

针对量测噪声未知的问题,提出一种改进的多传感器信息融合方法,首先对量测噪声进行实时跟踪与估计,接着基于估计的量测噪声进行最优加权融合,解决常规加权法权值不是最优的问题,最后将融合的结果进行卡尔曼滤波,得到系统的状态估计。将... 详细信息

针对量测噪声未知的问题,提出一种改进的多传感器信息融合方法,首先对量测噪声进行实时跟踪与估计,接着基于估计的量测噪声进行最优加权融合,解决常规加权法权值不是最优的问题,最后将融合的结果进行卡尔曼滤波,得到系统的状态估计。将改进的多传感器信息融合方法应用某型无人机(UAV)垂向高度信息融合系统中,经仿真验证,表明该方法具有一定的工程实用价值。

关键词：卡尔曼滤波信息融合多传感器噪声估计

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万古霉素、哌拉西林/他唑巴坦、美罗培南在危重症患者中TDM靶值和PK/PD靶值的影响因素分析及微生物疗效分析

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中国医院药学杂志 2023年第20期43卷 2307-2312页

作者：董育珠陶丽韩鹃廉衡杜倩张雷重庆医科大学附属第三医院药剂科重庆401120 重庆医科大学附属第三医院急诊与重症医学中心重庆401120 深圳华大基因股份有限公司广东深圳518000

目的:探讨影响万古霉素、哌拉西林/他唑巴坦、美罗培南3种药物治疗药物监测(therapeutic drug monitoring,TDM)靶值和药动学/药效学(pharmacokinetic/pharmacodynamic,PK/PD)靶值未达标的危险因素以及2种靶值和微生物疗效的关系,为精准... 详细信息

目的:探讨影响万古霉素、哌拉西林/他唑巴坦、美罗培南3种药物治疗药物监测(therapeutic drug monitoring,TDM)靶值和药动学/药效学(pharmacokinetic/pharmacodynamic,PK/PD)靶值未达标的危险因素以及2种靶值和微生物疗效的关系,为精准用药提供科学依据。方法:纳入2021年3月至2022年3月接受万古霉素、哌拉西林/他唑巴坦、美罗培南中至少1种抗菌药物联合治疗的危重症患者。利用优化采样方案采集每位患者的3~4份血浆样本,借助非房室模型结合经典药动学理论计算PK/PD参数。采用多因素分析探究3种药物TDM靶值和PK/PD靶值未达标的相关危险因素。结果:共纳入接受万古霉素、哌拉西林/他唑巴坦或美罗培南治疗的25名危重症患者的96份血浆样本,共计151份血药浓度-时间数据。万古霉素、哌拉西林/他唑巴坦和美罗培南的谷浓度(trough concentration,Cmin)达标率低,分别为20.00%、22.22%和23.53%;万古霉素PK/PD靶值达标率、未达标率和超标率分别为20.00%、60.00%和20.00%。哌拉西林/他唑巴坦和美罗培南的PK/PD靶值达标率分别为11.11%和17.65%,未达标率分别高达88.89%和76.47%。影响因素探究发现肌酐清除率是影响3种抗菌药物Cmin和PK/PD靶值不达标的独立危险因素。细菌根除组患者的万古霉素Cmin[(15.329±7.522)mg·L^(-1)vs.(6.273±0.754)mg·L^(-1),P=0.019]和AUC0~24 h/MIC(578.47±413.86 vs.175.94±17.07,P=0.028)均显著高于细菌未根除组。结论:万古霉素、哌拉西林/他唑巴坦、美罗培南在危重症患者中的TDM靶值和PK/PD靶值达标率低,未达标率高,普遍存在低暴露和过暴露情况。提高TDM靶值和PK/PD靶值达标率均可能提高患者细菌根除率,因此十分有必要在此类患者中开展TDM,为精准给药提供参考。

关键词：万古霉素哌拉西林/他唑巴坦美罗培南血药浓度治疗药物监测靶值药动学/药效学靶值微生物疗效

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