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BioTreasury:a community-based repository enabling indexing and rating of bioinformatics tools

Science China(Life Sciences) 2024年第2期67卷 221-229页

作者： Qi Zhao Xin Zhou Jingxing Wu Jieyi Cai Xiaoqiong Bao Lin Tang Chaoye Wang Chunlei Liu Yukai Wang yuyan teng Mohan Zheng Weiping Mu Zhixiang Zuo Yubin Xie Xiaotong Luo Jian Ren School of Life Sciences State Key Laboratory of Oncology in South ChinaCancer CenterGuangdong Provincial Clinical Research Center for CancerSun Yat-sen UniversityGuangzhou 510060China Institute of Precision Medicine The First Affiliated HospitalSun Yat-sen UniversityGuangzhou 510080China Guangdong Institute of Gastroenterology Department of General SurgeryGuangdong Provincial Key Laboratory of Colorectal and Pelvic Floor DiseasesThe Sixth Affiliated HospitalSun Yat-sen UniversityGuangzhou 510275China

The exponential growth of bioinformatics tools in recent years has posed challenges for scientists in selecting the most suitable one for their data analysis ***,to aid scientists in making informed choices,a community-based platform that indexes and rates bioinformatics tools is urgently *** this study,we introduce Bio Treasury(http://***),an integrated communitybased repository that provides an interactive platform for users and developers to share their experiences in various bioinformatics *** Treasury offers a comprehensive collection of well-indexed bioinformatics software,tools,and databases,totaling over 10,000 *** the past two years,we have continuously improved and maintained Bio Treasury,adding several exciting features,including creating structured homepages for every tool and user,a hierarchical category of bioinformatics tools and classifying tools using large language model(LLM).Bio Treasury streamlines the tool submission process with intelligent ***,Bio Treasury provides a wide range of social features,for example,enabling users to participate in interactive discussions,rate tools,build and share tool collections for the *** believe Bio Treasury can be a valuable resource and knowledge-sharing platform for the biomedical *** empowers researchers to effectively discover and evaluate bioinformatics tools,fostering collaboration and advancing bioinformatics research.

关键词： bioinformatics tools index tool database rating system large language model tool collections shari

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Influence of geological factors on coal permeability in the Sihe coal mine

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International Journal of Coal Science & Technology 2022年第1期9卷 58-70页

作者： Guangui Zou Qianhua Zhang Suping Peng Jiasheng She Deliang teng Chaochao Jin yuyan Che State Key Laboratory of Coal Resources and Safe Mining BeijingChina College of Geoscience and Surveying Engineering China University of Mining&TechnologyBeijingChina

Permeability of coal reservoirs influence the extraction of coal gas from coal *** coal samples were collected at an anticline and a syncline of the No.3 coal seam in the Sihe coal ***,permeability,pore size,vitrinite reflectance,and liquid nitrogen adsorption of the samples were *** curvatures at the sample locations,and the distance between the sampling locations and the nearest faults were calculated based on seismic *** influences of the evaluated parameters on permeability were *** factors that influence permeability of the No.3 coal seam were extracted using principal component analysis(PCA).Based on the porosity–permeability model derived from the Archie formula and classic Kozeny–Carman equation,we deduced that the permeability of coal increased with an increase in *** an increase in average vitrinite reflectance,permeability decreases first and then *** results showed that coal permeability was regulated by three key components representing three *** first component included pore size,depth,and pore complexity accounting for 52.59%of the variability indicating that it was the most important in controlling *** second component included specific surface area,structural curvature,and porosity,and the third component comprised of specific surface area,porosity,and average vitrinite ***,pore diameter and complexity had significant effects on coal *** results show that researchers and stakeholders must consider the interactions among multiple factors rather than single factors to understand the influences on permeability to facilitate efficient utilization of coalbed methane resources.

关键词： Coal mine Permeability Geological factors Principal component analysis

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不同遮光措施对豌豆、萝卜、向日葵芽苗菜生长、产量及品质的影响

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蔬菜 2024年第3期 36-42页

作者：滕燕燕陈佳马一桅赵春海刘鑫烔范新琳张鹏燕王玉彦青岛恒星科技学院山东青岛266100 滨州职业学院山东滨州256603

为研究在自然光照条件下不同遮光措施对几种芽苗菜生长、产量及营养品质的影响,选用遮光率分别为90%、65%、50%的常规遮阳网对豌豆、萝卜和向日葵3种芽苗菜进行遮光处理,以不遮光处理为对照,测定分析不同处理栽培盘内温、湿度变化及芽... 详细信息

为研究在自然光照条件下不同遮光措施对几种芽苗菜生长、产量及营养品质的影响,选用遮光率分别为90%、65%、50%的常规遮阳网对豌豆、萝卜和向日葵3种芽苗菜进行遮光处理,以不遮光处理为对照,测定分析不同处理栽培盘内温、湿度变化及芽苗菜的生长、产量、品质等指标的变化情况。结果表明:遮光处理对栽培盘内温度的影响具有时段性。在白天(06:00—18:00),遮光处理均不同程度降低了栽培盘内的温度,且遮光率越高、光照越强,温度降低幅度越大,在15:00,90%、65%遮光率处理的温度分别较对照降低14.9%、11.4%;遮光处理栽培盘内湿度均较对照有所增加。遮光处理的3种芽苗菜百株地上部鲜质量、产量、VC含量和口感评定分值均有不同程度增加,百株地上部干质量、叶绿素含量、纤维素含量均有所下降,其中65%遮光率处理的萝卜苗百株地上部鲜质量、VC含量、口感评定分值均最高,产量居第2位,分别较对照显著增加27.6%、3.8%、52.6%和38.6%;65%遮光率处理的豌豆苗产量最高,较对照显著增加5.4%,90%遮光率处理的豌豆苗VC含量、口感评定分值均最高,较对照分别显著增加4.6%、169.2%,纤维素含量最低,较对照显著降低53.0%;90%遮光率处理的向日葵苗苗高、产量、VC含量、口感评定分值均最高,较对照分别显著增加19.2%、6.7%、4.3%、70.6%,纤维素含量最低,较对照显著降低46.6%。综合评价得出,在温室、大棚芽苗菜生产中,萝卜苗生产可采用65%遮光率处理;以产量为目的的豌豆苗生产可采用65%遮光率处理,追求品质生产的可采用90%遮光率处理;向日葵苗生产可采用90%遮光率处理。

关键词：遮光率芽苗菜温度湿度生长产量品质

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污泥绿化垃圾共热解对热解炭性能的影响

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能源与环保 2023年第8期45卷 170-176页

作者：马腾尹丽洁王萌胡雨燕徐嘉琪同济大学机械与能源工程学院上海200092 上海多源固废协同处理和能源化工程技术研究中心上海201615

以上海市常见的绿化树种香樟木的枝叶为代表,研究了绿化垃圾与污泥的混合比例、热解温度以及发酵对热解炭性能的影响。研究发现,随着热解温度的升高,热解炭的产率逐渐降低,比表面积逐渐增大,表面官能团逐渐减少。发酵后热解炭产率高于... 详细信息

以上海市常见的绿化树种香樟木的枝叶为代表,研究了绿化垃圾与污泥的混合比例、热解温度以及发酵对热解炭性能的影响。研究发现,随着热解温度的升高,热解炭的产率逐渐降低,比表面积逐渐增大,表面官能团逐渐减少。发酵后热解炭产率高于未发酵的热解炭,比表面积增加,表面官能团出现了脂肪性—CH_(3)和—CH的不对称伸缩振动峰,并且污泥在与香樟木枝叶充分发酵后,热解炭对于污泥的附着能力提升。随着绿化垃圾比例的增加,热解炭的产率逐渐降低,比表面积以及孔隙数量逐渐增加。

关键词：污泥绿化垃圾共热解热解炭

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高海拔地区开展妇科腹腔镜手术的可行性临床研究

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重庆医学 2011年第12期40卷 1214-1215,1218页

作者：余敏李玉艳高静腾现勇解放军第八医院妇产科西藏日喀则857000 第三军医大学西南医院妇产科重庆400038

目的探索高海拔地区（海拔3 860 m）开展妇科腹腔镜手术的可行性.方法 2010年4～10月开展妇科腹腔镜手术22例,统计分析其手术时间、出血量、住院时间等临床资料.结果所有手术成功完成,无手术并发症发生,手术时间（91.90±33.67）min,... 详细信息

目的探索高海拔地区（海拔3 860 m）开展妇科腹腔镜手术的可行性.方法 2010年4～10月开展妇科腹腔镜手术22例,统计分析其手术时间、出血量、住院时间等临床资料.结果所有手术成功完成,无手术并发症发生,手术时间（91.90±33.67）min,术中出血量（72.14±50.51）mL,术后住院时间（2.52±1.08）d,总住院时间（4.10±1.26）d,术后脉搏血氧饱和度为85%～100%.结论高海拔地区开展妇科腹腔镜安全可行,值得推广.

关键词：高海拔腹腔镜平滑肌瘤卵巢囊肿宫外孕

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山旱塬区花牛苹果树干茎流及其与环境因子的关系

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经济林研究 2017年第1期35卷 30-35页

作者：周玉燕廖空太张莉杨国州滕保琴甘肃省林业工作站管理局甘肃兰州730046

为探明山旱塬区苹果园耗水规律以及影响果树耗水的主导因子,确定水分承载力,合理配置有限的水资源,于2014~2015年采用SF-L树干茎流仪和Watch Dog 2900ET自动气象站对山旱塬区花牛苹果树干茎流及环境因子进行了连续观测,分析了花牛苹果... 详细信息

为探明山旱塬区苹果园耗水规律以及影响果树耗水的主导因子,确定水分承载力,合理配置有限的水资源,于2014~2015年采用SF-L树干茎流仪和Watch Dog 2900ET自动气象站对山旱塬区花牛苹果树干茎流及环境因子进行了连续观测,分析了花牛苹果树干茎流速率的变化规律及其与环境因子的相关关系。结果表明,在果树生长周期,各月份根据日均茎流速率由大到小排列依次为5月、6月、7月、8月、9月,随着月份的递增,茎流峰值出现时间逐渐延迟;5~9月份苹果树干茎流速率变化规律表现为昼高夜低,7:00~9:00树干茎流速率开始急速上升,12:00~15:00达到最大值,17:00~18:00开始逐步下降,21:00趋于稳定;不同天气条件下苹果树干茎流速率为晴天大于雨天;对茎流速率与环境因子的相关性分析结果表明,太阳辐射强度、相对湿度、空气温度、饱和水气压差、露点温度与树干茎流速率呈极显著性相关,风速对茎流速率也有一定影响。

关键词：苹果园树干茎流环境因子山旱塬区

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不同水肥配置对旱砂田枣树生长发育、产量品质及土壤养分的影响

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中国林副特产 2018年第5期 12-14页

作者：滕保琴周玉燕甘肃省林业科技推广总站兰州730046

通过对旱砂田枣园开展覆黑膜、施肥、"覆黑膜+施肥"等措施进行对比试验,研究不同水肥配置对枣树生长发育、产量品质及土壤养分的影响。结果表明,覆黑膜、施肥、"覆黑膜+施肥"等处理均能提高旱砂田枣树的生长发育及产量品质,同时具有改... 详细信息

通过对旱砂田枣园开展覆黑膜、施肥、"覆黑膜+施肥"等措施进行对比试验,研究不同水肥配置对枣树生长发育、产量品质及土壤养分的影响。结果表明,覆黑膜、施肥、"覆黑膜+施肥"等处理均能提高旱砂田枣树的生长发育及产量品质,同时具有改良土壤的作用。综合比较,旱砂田枣园采取"覆黑膜+施肥"复合措施对提高枣树生长发育及产量品质的效果最为显著,覆黑膜处理的效果稍优于施肥。

关键词：覆黑地膜施肥旱砂田枣树生长发育产量品质

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海上风牧融合的难题与挑战

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海洋开发与管理 2023年第9期40卷 19-29页

作者：孙腾龚语嫣冯翠翠何旭辉张函化天然曲良叶观琼浙江大学海洋学院舟山316021 浙江大学海南研究院三亚572025 中国海油海洋环境与生态保护公益基金会北京100010

在海洋战略和清洁能源战略背景下,我国围绕海洋牧场和海上风电开展了规模化建设并取得了巨大成就。但工程成本高昂、海洋生境破碎化和用海冲突等问题日益显著,国内外由此开展了海上风电和海洋牧场融合发展的试点与探索。文章整理分析了... 详细信息

在海洋战略和清洁能源战略背景下,我国围绕海洋牧场和海上风电开展了规模化建设并取得了巨大成就。但工程成本高昂、海洋生境破碎化和用海冲突等问题日益显著,国内外由此开展了海上风电和海洋牧场融合发展的试点与探索。文章整理分析了国内外相关研究和试点工作,针对海上风牧融合发展的现状以及在经济和政策可行性、选址与规划、鱼种选择、配套设备开发、生态影响评估(噪声、电磁场、底座干扰和重金属迁移等)等方面的难题与挑战提出建议。

关键词：海上风电海洋牧场融合发展难题与挑战生态影响评估

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西藏日喀则地区女性月经初潮年龄状况及影响因素分析

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重庆医学 2014年第35期43卷 4749-4750,4754页

作者：高静余敏李玉艳滕现勇泽仁措姆西藏军区总医院妇产科拉萨850000 解放军第八医院妇产科西藏日喀则地区857000 第三军医大学西南医院妇产科生殖医学中心重庆430038

目的调查和分析西藏日喀则地区女性的月经初潮年龄状况及影响因素。方法调查2010年7-12月在解放军第八医院初诊的2 492例女性妇科患者,其中藏族1 492例,汉族941例,分析初潮年龄与民族、海拔及城乡间的关系。结果藏族女性初潮年龄显著高... 详细信息

目的调查和分析西藏日喀则地区女性的月经初潮年龄状况及影响因素。方法调查2010年7-12月在解放军第八医院初诊的2 492例女性妇科患者,其中藏族1 492例,汉族941例,分析初潮年龄与民族、海拔及城乡间的关系。结果藏族女性初潮年龄显著高于汉族女性[（15.090±1.898）岁vs.（13.920±1.538）岁,P〈0.05）];不同海拔组间初潮年龄差异有统计学意义（P〈0.01）,随海拔增加,初潮年龄逐渐增大,Pearson相关值为0.323;藏族女性居于城镇的初潮年龄显著小于乡村女性[（14.760±1.784）岁vs.（15.580±1.873）岁,P〈0.05）]。结论藏族女性初潮年龄晚于汉族女性,随着海拔增加初潮时间逐渐延后。

关键词：藏族月经初潮海拔年龄

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Experimental Study on Key Techniques for Indoor Cultivation of Sprout Vegetables in Families

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Medicinal Plant 2021年第3期12卷 36-38页

作者： Hongxia ZHANG Li FENG Yanyan teng Mingli YU Yiwei MA Zhuqi ZHANG yuyan WANG Binzhou Vocational College Binzhou 256600 China Bincheng District Agricultural and Rural Bureau Binzhou 256600 China Shuangyashan Agricultural Broadcasting and Television School Shuangyashan 155100 China Agricultural College Qingdao Hengxing University of Science and Technology Qingdao 266100 China

This paper introduced the advantages of planting sprout vegetables in family rooms,expounded assembly principle of indoor cultivating device and the key techniques for indoor cultivating sprout vegetables in *** the experiment,we assembled a set of indoor cultivating device for sprout vegetables,and summarized the indoor cultivating techniques of sprout vegetables in *** indoor planting device was suitable for family members to cultivate sprout vegetables in the living rooms,kitchen,balcony and other corner space by using their spare *** could not only provide high-quality vegetables for families,but also beautify the indoor environments of family rooms,and increase the oxygen content in *** set of indoor cultivating device and techniques was suitable for planting various sprout vegetables(*** seedling,water spinach seedling,pea seedling,pine willow seedling,sunflower seedling and various bean seedlings,etc.).This is a set of high-efficient spatial planting technique in families,and also an effective way to increase organic vegetable supply for family.

关键词： Sprout vegetables Organic vegetables Advantages Key techniques Indoor planting Indoor cultivating device Family

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