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The super-pangenome of Populus unveils genomic facets for its adaptation and diversification in widespread forest trees

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Molecular Plant 2024年第5期17卷 725-746页

作者： Tingting s.i Xinxin Zhang Yukang Hou Changfu Jia Xuming Dan yulin Zhang Yuanzhong Jiang Qiang Lai Jiajun Feng Jianju Feng Tao Ma Jiali Wu shuyu Liu Lei Zhang Zhiqin Long Liyang Chen Nathaniel R.street Par K.ingvarsson Jianquan Liu Tongming Yin Jing Wang Key Laboratory for Bio-Resources and Eco-Environment of Ministry of Education College of Life SciencesSichuan UniversityChengduSichuanChina College of Horticulture and Forestry Tarim UniversityAlar 843300China Umea Plant s.ience Centre Department of Plant PhysiologyUmea UniversityUmeaVasterbottenSweden Linnean Centre for Plant Biology Department of Plant BiologyUppsala BioCenterSwedish University of Agricultural SciencesUppsalaSweden The Key Laboratory of Tree Genetics and Biotechnology of Jiangsu Province and Education Department of China Nanjing Forestry UniversityNanjingJiangsuChina

Understanding the underlying mechanisms and links between genome evolution and adaptive innovations stands as a key goal in evolutionary ***,among the world’s most widely distributed and cultivated trees,exhibit extensive phenotypic diversity and environmental *** this study,we present a genus-level super-pangenome comprising 19 Populus genomes,revealing the likely pivotal role of private genes.in facilitating local environmental and climate *** the integration of pangenomes with transcriptomes,methylomes,and chromatin acces.ibility mapping,we unveil that the evolutionary trajectories of pangenes and duplicated genes are closely linked to local genomic landscapes of regulatory and epigenetic architectures,notably CG methylation in gene-body *** comparative genomic analyses have enabled the identification of 142202 structural variants across species that intersect with a significant number of genes and contribute substantially to both phenotypic and adaptive *** have experimentally validated a∼180-bp presence/absence variant affecting the expres.ion of the CUC2 gene,crucial for leaf serration ***,we developed a user-friendly web-based tool encompas.ing the multi-omics resources associated with the Populus super-pangenome(http://***).Together,the present pioneering super-pangenome resource in forest trees not only aids.in the advancement of breeding efforts of this globally important tree genus but also offers valuable insights.into potential avenues for comprehending tree biology.

关键词： Populus pangenomes whole-genome duplication structural variation genome evolution

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基于Transformer的三维人体姿态估计及其动作达成度评估

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仪器仪表学报 2024年第4期45卷 136-144页

作者：杨傲雷周应宏杨帮华徐昱琳上海大学机电工程与自动化学院上海200444 上海市电站自动化技术重点实验室上海200444

针对人机交互、医疗康复等领域存在的人体姿态分析与评估问题,本文提出了一种基于Transformer的三维人体姿态估计及其动作达成度评估方法。首先,本文定义了人体姿态的关键点及关节角,并在深度位姿估计网络(DPEN)的基础上,提出并构建了... 详细信息

针对人机交互、医疗康复等领域存在的人体姿态分析与评估问题,本文提出了一种基于Transformer的三维人体姿态估计及其动作达成度评估方法。首先,本文定义了人体姿态的关键点及关节角,并在深度位姿估计网络(DPEN)的基础上,提出并构建了一个基于Transformer的三维人体姿态估计模型(TPEM),Transformer的引入能够更好的提取人体姿态的长时序特征;其次,利用TPEM模型对三维人体姿态估计结果,设计了基于加权3D关节角的动态时间规整算法,在时序上对不同人物同一动作的姿态进行姿态关键帧的规整匹配,并据此提出了动作达成度评估方法,用于给出动作的达成度分数;最后,通过在不同数据集上进行实验验证,TPEM在Human3.6 M数据集上实现了平均关节点误差为37.3 mm,而基于加权3D关节角的动态时间规整算法在Fit3D数据集上的平均误差帧数为5.08,展现了本文所提方法在三维人体姿态估计与动作达成度评估方面的可行性和有效性。

关键词：三维人体姿态估计深度学习动态时间规整动作评估

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Optimal Timing of Antiretroviral Therapy initiation in Acquired immunodeficiency syndrome-Associated Toxoplas.ic Encephalitis:A Prospective Observational Multicenter study in China

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infectious Diseases & immunity 2024年第1期4卷 4-9页

作者： Yao Li Haidong Jiang Yanming Zeng Yanqiu Lu siyuan Chen yulin Zhang Zhongsheng Jiang Tongtong Yang shuiqing Liu Yaokai Chen Department of infectious Diseases Chongqing Public Health Medical CenterChongqing 400036China Center for infectious Diseases Beijing Youan HospitalCapital Medical UniversityBeijing 100069China Department of infectious Diseases Liuzhou People's HospitalLiuzhou 545006GuangxiChina Department of infectious Disease The Public Health Clinical Center of ChengduChengdu 610066SichuanChina Department of infectious Disease Guiyang Public Health Clinical CenterGuiyang 550004GuizhouChina

Background:Toxoplas.ic encephalitis(TE)is the most frequent cause of expansive brain lesions among patients with acquired immunodeficiency syndrome(AiDs).However,the optimal timing of antiretroviral therapy(ART)initiation in these patients remains *** study aims to inves.igate the differences.in outcomes of ART initiation at different times.in order to help clarify the treatment timing of AiDs-associated ***:This multicenter prospective observational study included 87 patients recruited from 11 research centers.in China(from March 2019 to December 2022).Of the patients,38 were as.igned to the early ART group(initiating ART within 2 weeks after anti-Toxoplasma treatment initiation),and the remaining 49 patients received deferred ART(initiating ART at least 2 weeks after anti-Toxoplasma treatment initiation).The main outcomes.includedmortality and emergence of immune recons.itution inflammatory syndrome(iRis).Human immunodeficiency virus(HiV)-1 viral load and CD4^(+)T-cell counts at weeks 24 and 48 were ***:The number of deaths(1 vs.5,P=0.225)and incidence of iRis(2.6%vs.0,P=0.437)were not significantly different between the early and deferred ART groups at week *** ART initiation did not contribute significantly to HiV-1 viral load control(ies/mL,n=8 vs.n=3 at week 24,P=0.142;n=7 vs.n=7 atweek 48,P=1.000).The median CD4^(+)T-cell counts between the two groups were not significantly different,either at week 24(155 vs.91 cells/mm^(3),P=0.837)or atweek 48(181 vs.146 cells/mm^(3),P=0.219).Conclusion:in patients with AiDs-associated TE,early ART initiation was not significantly different from deferred ART initiation in terms of incidence of mortality,iRis,and HiV virological and immunological *** registration:This study was registered(registration number:ChiCTR1900021195)as one of 12 clinical trials under the title of a general project at the Chinese Clinical Trial Registry(***)on February 1,***

关键词： HiV Toxoplasma gondii Timing of antiretroviral therapy Virological outcome immunological response

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基于肠道菌群调控肾素-血管紧张素系统在支气管哮喘中的作用机制

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中国微生态学杂志 2024年第5期36卷 497-503页

作者：唐珍孟宝朱玉林安徽医科大学第一附属医院儿科安徽合肥230022 安徽医科大学第一附属医院感染科首都医科大学附属北京儿童医院国家呼吸系统疾病临床医学研究中心

目的探究肾素-血管紧张素系统在哮喘患者肠道微生态中的作用。方法将20只Balb/c雌性小鼠随机分为对照组、哮喘组、抗生素组和鼠李糖乳酪杆菌(LGG)组,每组5只。通过卵白蛋白致敏并激发的方法建立哮喘小鼠模型,小鼠饮用水中添加新鲜广谱... 详细信息

目的探究肾素-血管紧张素系统在哮喘患者肠道微生态中的作用。方法将20只Balb/c雌性小鼠随机分为对照组、哮喘组、抗生素组和鼠李糖乳酪杆菌(LGG)组,每组5只。通过卵白蛋白致敏并激发的方法建立哮喘小鼠模型,小鼠饮用水中添加新鲜广谱抗菌药物进行肠道菌群耗竭。采用苏木精―伊红染色观察各组小鼠肺组织的病理变化;流式细胞术检测脾中Th1/Th2比例;RT-PCR法检测肺组织中GATA3、T-bet、ACE、ACE2、AngⅡ、AT1R、AT2R的mRNA表达以及细胞因子受体iL-4、iL-5、iL-13、iFN-γ的mRNA表达水平;收集粪便样本进行16s rRNA基因高通量测序,分析肠道菌群组成与多样性。结果与对照组相比,哮喘组小鼠气道炎症程度显著增加;脾脏中Th1/2比例升高;肺组织中炎症因子受体iL-4、iL-5、iL-13 mRNA表达升高,iFN-γmRNA表达降低,GATA3、ACE、AngⅡ、AT1R、AT2R的mRNA表达升高,T-bet、ACE2 mRNA表达降低;肠道微生物中门、纲、目、科、属、种水平无显著差异。相比于哮喘组,抗生素组与LGG组均能减轻哮喘小鼠气道炎症,抑制ACE/AngⅡ/AT1R轴,但LGG组效果更为显著,且肠道菌群多样性程度更高。结论补充LGG可以保护肠道微生态的平衡,其产生的代谢物可能经血液循环,通过抑制ACE/AngⅡ/AT1R轴,抑制Th2相关细胞因子的释放,对哮喘产生治疗作用,其中的具体机制仍需进一步验证。

关键词：哮喘肠道菌群鼠李糖乳酪杆菌肾素-血管紧张素系统

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基于蝙蝠优化算法的智能机器人路径规划方法

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沈阳工业大学学报 2024年第2期46卷 191-196页

作者：罗育林胡长江邓敦杰大连理工大学电子信息与电气工程学院辽宁大连116000 南方电网深圳数字电网研究院有限公司广东深圳518000 桂林电子科技大学海洋工程学院广西桂林541004

为了解决智能机器人规划路径时,由于未能获取机器人信号目标强度,路径规划存在适应度值低和规划时间长的问题,提出基于蝙蝠优化算法的智能机器人路径规划方法。建立机器人模型并获取机器人目标信号强度,利用粒子群算法搜索机器人移动目... 详细信息

为了解决智能机器人规划路径时,由于未能获取机器人信号目标强度,路径规划存在适应度值低和规划时间长的问题,提出基于蝙蝠优化算法的智能机器人路径规划方法。建立机器人模型并获取机器人目标信号强度,利用粒子群算法搜索机器人移动目标,结合蝙蝠算法和黄金正弦算法获取种群平均位置,通过分阶段搜索流程,实现机器人移动路径规划。结果表明:所提方法的路径规划时间仅为2.0 s,适应度达到了24.1,不可行解个数为零,该方法有效提高了适应度值,降低了规划时间,具备可行性和实际应用价值。

关键词：蝙蝠优化算法目标信号强度智能机器人路径规划规划方法黄金正弦算法粒子群算法机器人模型

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淬火-回火工艺对高速翻转犁用28MnB5铁基合金的组织及性能影响

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稀有金属 2024年第2期48卷 187-195页

作者：郭顺倪豪豪黄豪常亚南鞠玉琳江苏大学材料科学与工程学院江苏镇江212013 郑州市龙丰农业机械装备制造有限公司河南郑州450041

为了解决现有国产高速翻转犁入土部件因硬度和强度不足而导致的服役寿命偏低的问题,对28MnB5铁基合金采用了淬火-回火(QT)的热处理工艺,并探讨了该工艺对28MnB5铁基合金微观组织与力学性能的影响机制。结果表明,热轧态28MnB5铁基合金的... 详细信息

为了解决现有国产高速翻转犁入土部件因硬度和强度不足而导致的服役寿命偏低的问题,对28MnB5铁基合金采用了淬火-回火(QT)的热处理工艺,并探讨了该工艺对28MnB5铁基合金微观组织与力学性能的影响机制。结果表明,热轧态28MnB5铁基合金的组织主要由铁素体和珠光体交替分布而成的带状组织组成。与热轧态28MnB5铁基合金显著不同,经淬火-回火工艺处理后(QT态)的28MnB5铁基合金的组织主要由尺寸细小且均匀分布的板条马氏体组成,其单个板条马氏体的面积主要集中在0~5μm^(2)范围内。力学性能测试结果表明,经过淬火-回火处理后的QT态28MnB5铁基合金的硬度和强度具有显著提升,具体表现为屈服强度从561 MPa提高至1451 MPa,抗拉强度从744 MPa提高至1843 MPa,洛氏硬度从HRC 18.8提高至HRC 51.3。这主要归因于28MnB5铁基合金中的B元素在淬火过程中显著提高了铁基合金的淬透性,获得了近乎全马氏体的QT态28MnB5铁基合金。研究成果可望为具备高硬度高强度性能的农机入土部件制造提供可行的技术方案。

关键词： 28MnB5铁基合金马氏体小角度晶界高强度高速翻转犁

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不同乳源乳脂肪球的体外消化特性

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中国食品学报 2024年第7期24卷 70-78页

作者：王煜林宝音朝克图吉日木图内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室呼和浩特010018 苏尼特右旗畜牧工作站内蒙古锡林郭勒盟011299

基于模拟婴幼儿胃肠道消化,采用粒径分布、Zeta电势和激光共聚焦扫描电镜观察不同乳源(牛、羊、驼)乳脂肪球(MFG)在消化各阶段物理特性的差异,采用气相色谱-质谱联用及滴定法,探究在不同消化阶段游离脂肪酸及脂解速率的变化,完善脂质消... 详细信息

基于模拟婴幼儿胃肠道消化,采用粒径分布、Zeta电势和激光共聚焦扫描电镜观察不同乳源(牛、羊、驼)乳脂肪球(MFG)在消化各阶段物理特性的差异,采用气相色谱-质谱联用及滴定法,探究在不同消化阶段游离脂肪酸及脂解速率的变化,完善脂质消化的变化规律。结果表明,不同乳源MFG的颗粒粒径随消化时间的延长,均呈减小的趋势,与激光共聚焦显微镜染色后观察结果一致。在肠消化末端,驼乳MFG的平均粒径为(0.46±0.07)μm,显著低于牛乳MFG的粒径(P牛乳>驼乳。不同乳源MFG在肠道消化期间的脂解速率无明显差异,而驼乳MFG相较于其它两种乳源在不同消化阶段,棕榈油酸(C16∶0)的含量显著更高(P<0.05),长链脂肪酸比例更低。研究结果为驼乳产品的加工以及新型配方奶粉的制备提供新思路。

关键词：乳脂肪球消化特性乳源

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Tongue image feature correlation analysis.in benign lung nodules and lung cancer

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Digital Chinese Medicine 2024年第2期7卷 120-128页

作者： s.i yulin LiU Jiayi CHUN Yi LiU Lingshuang XU Jiatuo The Academic Affairs Office Shanghai University of Traditional Chinese MedicineShanghai 201203China school of Traditional Chinese Medicine Shanghai University of Traditional Chinese MedicineShanghai 201203China Longhua Hos.ital Affiliated to shanghai University of Traditional Chinese Medicine Shanghai 200032China

Objective To analyze the differences.in the correlation of tongue image indicators among patients with benign lung nodules and lung *** From July 1;2020 to March 31;2022;clinical information of lung cancer patients and benign lung nodules patients was collected at the Oncology Department of Longhua Hos-pital Affiliated to shanghai University of Traditional Chinese Medicine and the Physical Ex-amination Center of shuguang Hos.ital Affiliated to shanghai University of Traditional Chi-nese Medicine;*** obtained tongue images from patients with benign lung nod-ules and lung cancer using the TFDA-1 digital tongue diagnosis.instrument;and analyzed these images with the TDAs V2.0 *** extracted indicators.included color space pa-rameters.in the Lab system for both the tongue body(TB)and tongue coating(TC)(TB/TC-L;TB/TC-a;and TB/TC-b);textural parameters[TB/TC-contrast(CON);TB/TC-angular second moment(AsM);TB/TC-entropy(ENT);and TB/TC-MEAN];as well as TC parameters(perAll and perPart).The bivariate correlation of TB and TC features was analyzed using Pearson’s or spearman’s correlation analysis;and the overall correlation was analyzed using canonical correlation analysis(CCA).Results samples from 307 patients with benign lung nodules and 276 lung cancer patients were included after excluding outliers and extreme *** correlation analysis.indi-cated that the correlation of TB-L with TC-L;TB-b with TC-b;and TB-b with perAll in lung cancer group was higher than that in benign nodules ***;the correlation of TB-a with TC-a;TB-a with perAll;and the texture parameters of the TB(TB-CON;TB-AsM;TB-ENT;and TB-MEAN)with the texture parameters of the TC(TC-CON;TC-AsM;TC-ENT;and TC-MEAN)in benign nodules group was higher than lung cancer *** further demon-strated a strong correlation between the TB and TC parameters.in lung cancer group;with the first and second pairs of typical variables.in benign nodules and lung cancer groups.in

关键词： Benign lung nodules Lung cancer Tongue image Correlation analysis Differential diagnosis

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论许钦文乡土小说中的疾病书写

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四川职业技术学院学报 2024年第1期34卷 128-133页

作者：陈瑜琳云南师范大学文学院云南昆明650500

许钦文作为20世纪20年代乡土写实派代表作家之一,他的作品中多次出现疾病书写,包括由暴力引起的身体疾病和疯癫形式的精神疾病。这些对疾病的书写背后承载着作家对社会、文化的沉思和批判。同时许钦文对疾病的书写来自于其深刻的疾病体... 详细信息

许钦文作为20世纪20年代乡土写实派代表作家之一,他的作品中多次出现疾病书写,包括由暴力引起的身体疾病和疯癫形式的精神疾病。这些对疾病的书写背后承载着作家对社会、文化的沉思和批判。同时许钦文对疾病的书写来自于其深刻的疾病体验和以文救人的文艺观。

关键词：许钦文疾病隐喻文艺观乡土小说

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人乳头瘤病毒型别竞争与型别替换的流行病学研究进展

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病毒学报 2024年第4期40卷 914-920页

作者：陈雨周裕林姚星妹厦门大学附属妇女儿童医院(厦门市妇幼保健院)中心实验室厦门3610031 厦门大学公共卫生学院厦门361003

人乳头瘤病毒(Human papillomavirus,HPV)是最常见的性传播病原体,可导致多种癌症,目前已经发现200多种基因型。预防性HPV疫苗有望减少甚至消灭由疫苗型别导致的疾病负担,但目前的疫苗并未覆盖HPV所有型别,人们始终关注广泛实施HPV疫苗... 详细信息

人乳头瘤病毒(Human papillomavirus,HPV)是最常见的性传播病原体,可导致多种癌症,目前已经发现200多种基因型。预防性HPV疫苗有望减少甚至消灭由疫苗型别导致的疾病负担,但目前的疫苗并未覆盖HPV所有型别,人们始终关注广泛实施HPV疫苗接种后,疫苗型别流行率降低空出的生态位是否将被非疫苗型别替代?目前对于HPV疫苗接种后是否存在型别替换的研究也取得了一定进展。本文拟对HPV疫苗型别竞争与型别替换的研究进展做一综述。

关键词：人乳头瘤病毒(Human papillomavirus,HPV) 型别竞争型别替换

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