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盐胁迫下枯草芽孢杆菌降解组胺的转录组学分析

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中国食品学报 2024年第8期24卷 435-447页

作者：邓义佳王润东檀茜倩李学鹏张宇昊张宾励建荣渤海大学食品科学与工程学院辽宁锦州121013 西南大学食品科学学院重庆400715 川渝共建特色食品重庆市重点实验室重庆400715 浙江海洋大学食品与药学学院浙江舟山316022

为探究枯草芽孢杆菌在盐胁迫下降解组胺的机制,以枯草芽孢杆菌JZXJ-7为试验菌株,在添加170 mmol/L和340 mmol/L NaCl的液态培养环境中培养48 h,通过测定组胺降解率和菌落生长情况,同时对降解菌株进行转录组高通量测序,筛选不同NaCl添加... 详细信息

为探究枯草芽孢杆菌在盐胁迫下降解组胺的机制,以枯草芽孢杆菌JZXJ-7为试验菌株,在添加170 mmol/L和340 mmol/L NaCl的液态培养环境中培养48 h,通过测定组胺降解率和菌落生长情况,同时对降解菌株进行转录组高通量测序,筛选不同NaCl添加组的菌株在降胺过程中的差异基因表达和相关代谢通路分析。结果表明,添加170 mmol/L和340 mmol/L NaCl后组胺的降解率显著高于空白组(PgO功能富集分析主要涉及代谢过程、细胞转化、细胞解剖实体、结构分子活性、催化活性和结合能力等。KEgg代谢途径涉及丙酮酸代谢、磷酸戊糖途径、双组分系统和精氨酸生物合成等。研究结果说明,盐胁迫更有利于枯草芽孢杆菌促进基因表达,激活代谢通路,提高组胺降解率。本研究为后续菌株应用于食品发酵行业,进一步高效降解生物胺提供重要的理论基础和参考依据。

关键词：枯草芽孢杆菌组胺转录组降解率差异基因表达

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基于MHA-BiLSTM的尾矿坝位移预测

有色金属工程 2024年第10期14卷 147-157页

作者：杨玉好杨斌胡军李铭张壮超辽宁科技大学土木工程学院辽宁鞍山114051

尾矿坝变形受多因素影响,针对传统预测方法受到数据复杂性和非线性关系的限制,导致预测精度不足的问题,提出多头注意力机制(Multi-Head Attention)和双向长短时记忆网络(BiLSTM)结合预测尾矿坝位移的方法。在预测中,首先利用Z-score和Sa... 详细信息

尾矿坝变形受多因素影响,针对传统预测方法受到数据复杂性和非线性关系的限制,导致预测精度不足的问题,提出多头注意力机制(Multi-Head Attention)和双向长短时记忆网络(BiLSTM)结合预测尾矿坝位移的方法。在预测中,首先利用Z-score和Savitzky-golay滤波对原始数据消除异常值和噪声的干扰;然后,利用灰色关联度方法确定坝体位移影响因素;最后,采用MHA-BiLSTM模型对坝体位移进行预测。以辽宁省某尾矿库实测数据为例,为评估新模型的性能与传统BiLSTM模型进行对比,结果表明该方法能够更准确地预测出坝体位移变化情况。

关键词：多头注意力机制 BiLSTM网络 Z-score去除异常值 Savitzky-golay滤波坝体位移预测

基于增益控制的永磁同步电机低速转子位置估算方法

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微特电机 2024年第1期52卷 63-69页

作者：李文真许宇豪西安航空学院车辆工程学院西安710077 西安航空学院电子工程学院西安710077

当永磁同步电机工作在零低速域内时,受系统延迟时间的影响,采用高频脉振方波电压注入的传统差分解调法会出现系统失稳和动态性能下降的问题。提出了误差系数标幺下的增益控制策略。分析了不同延迟时间下传统差分解调法的开环增益变化趋... 详细信息

当永磁同步电机工作在零低速域内时,受系统延迟时间的影响,采用高频脉振方波电压注入的传统差分解调法会出现系统失稳和动态性能下降的问题。提出了误差系数标幺下的增益控制策略。分析了不同延迟时间下传统差分解调法的开环增益变化趋势,得出了延迟时间会影响增益幅值和符号的结论;通过求解延迟时间变化时的实际开环增益表达式,并用实际增益值对误差函数进行标幺,提升了系统的稳定性和收敛性。实验结果表明,该方法不仅提升了位置估算系统的稳定性,而且收敛速度快。

关键词：永磁同步电机增益控制方波注入转子位置估算

基于AHP-EWM结合Box-Behnken响应面法优化黄芩多指标成分的微波提取工艺

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华东理工大学学报（自然科学版） 2024年第5期50卷 678-686页

作者：蒋佳丽刘婷李宇浩韩伟薛东升华东理工大学药学院制药工程与过程化学教育部工程研究中心上海市新药设计重点实验室上海200237 上海凯宝药业股份有限公司上海201401

结合层次分析法(AHP)-熵权法(EWM),通过单因素实验考察功率、液固比、提取时间、提取次数和粒度对黄芩苷、汉黄芩苷、黄芩素和汉黄芩素得率及出膏率的影响。以综合评分为响应值,利用四因素三水平Box-Behnken(BBD)响应面法优化黄芩的微... 详细信息

结合层次分析法(AHP)-熵权法(EWM),通过单因素实验考察功率、液固比、提取时间、提取次数和粒度对黄芩苷、汉黄芩苷、黄芩素和汉黄芩素得率及出膏率的影响。以综合评分为响应值,利用四因素三水平Box-Behnken(BBD)响应面法优化黄芩的微波提取工艺,并通过扫描电子显微镜(SEM)观察提取前后药材粉末的微观形态变化。BBD响应面法得到的最优提取工艺条件为:微波功率390 W、液固比56 mL/g、提取时间472 s、粒度80目(180μm),此时黄芩苷、汉黄芩苷、黄芩素、汉黄芩素得率分别为16.82%、3.46%、0.30%、0.31%,出膏率73.73%,综合评分10.75。该工艺提取效果优于常见的回流提取方法,实现评价结果主客观的内在统一。

关键词：黄芩微波提取层次分析法熵权法 Box-Behnken响应面法

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基于可解释性神经网络的界面面积浓度预测

核技术 2024年第8期47卷 89-97页

作者：周钰浩许汪涛刘丽朱隆祥张卢腾潘良明重庆大学低品位能源利用技术及系统教育部重点实验室重庆400044 重庆大学动力工程及工程热物理博士后科研流动站重庆400044 重庆大学核工程与核技术系重庆400044

界面面积浓度(Interfacial Area Concentration,IAC)是两相流动的封闭两流体模型中界面传递项的关键参数,用于表征气液界面传输能力的强弱。对界面面积浓度的建模预测通常有经验关联式和界面面积输运方程等方法,但这些方法都有较大的数... 详细信息

界面面积浓度(Interfacial Area Concentration,IAC)是两相流动的封闭两流体模型中界面传递项的关键参数,用于表征气液界面传输能力的强弱。对界面面积浓度的建模预测通常有经验关联式和界面面积输运方程等方法,但这些方法都有较大的数据依赖性。而对神经网络模型增添可解释性可以为模型修正提供方向,严谨提升预测精度。为更好地预测两相流动的IAC,基于神经网络建立了IAC的预测模型,结合不同气泡行为、物理关系及统计分布并利用事后可解释性方法,对比分析了不同输入特征组合的神经网络模型预测能力;并通过神经网络每层的结构参数大小,分析输出比重挑选合适的数据预处理方法。通过事后可解释性分析得到空泡份额是IAC预测的重要因素,而对训练数据进行对数变换预处理能够显著提高模型对真实数据的预测能力。

关键词：界面面积浓度两相流神经网络模型事后可解释性

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基于约束轨迹聚类的事件日志批量修复方法

计算机集成制造系统 2024年第8期30卷 2797-2808页

作者：田银花李昕燃武于皓韩咚杜玉越王路山东科技大学智能装备学院山东泰安271000 山东科技大学继续教育学院山东泰安271000 山东科技大学计算机科学与工程学院山东青岛266590

企业业务运行过程中会产生大量的事件日志,事件日志是业务过程挖掘、监控和优化的基础和保障。然而,原始的事件日志由于缺乏结构及过于灵活导致难以直接应用于过程挖掘,对事件日志进行修复势在必行。现有日志修复方法需要结合过程模型... 详细信息

企业业务运行过程中会产生大量的事件日志,事件日志是业务过程挖掘、监控和优化的基础和保障。然而,原始的事件日志由于缺乏结构及过于灵活导致难以直接应用于过程挖掘,对事件日志进行修复势在必行。现有日志修复方法需要结合过程模型逐条检查轨迹,并对各类异常行为采用不同策略进行修复,导致修复效率低下、适用性不强。针对上述问题,利用轨迹聚类方法,结合文本相似度指标,提出一种基于约束轨迹聚类的批量日志修复方法。该方法通过对轨迹聚类的每个步骤施加约束条件,使得单个簇包含作为簇中心的拟合轨迹以及与该拟合轨迹相似的异常轨迹,且中心轨迹即为异常轨迹的修复结果。该方法不但无需分析异常行为,直接获得修复后的拟合轨迹,而且实现了对于异常轨迹的批量修复。实验表明,该方法在脱离过程模型并保证高修复准确率的前提下,能够在噪音过滤之后,有效且高效地对事件日志进行批量修复。

关键词：轨迹聚类文本相似度日志修复事件日志噪音过滤

沙门菌噬菌体YT90的分离鉴定及生物学特性分析

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南京农业大学学报 2024年第2期47卷 306-314页

作者：李刚董雨豪黄昊孙千惠刘永杰南京农业大学动物医学院江苏南京210095

[目的]本文旨在分离针对肠炎沙门菌的烈性噬菌体并研究其生物学特性。[方法]从山东烟台某鸭场采集58份粪便样品,以鸭源肠炎沙门菌sdc-11为宿主分离噬菌体,并对噬菌体分离株进行形态学观察,对其温度和pH值稳定性、感染复数(MOI)、一步生... 详细信息

[目的]本文旨在分离针对肠炎沙门菌的烈性噬菌体并研究其生物学特性。[方法]从山东烟台某鸭场采集58份粪便样品,以鸭源肠炎沙门菌sdc-11为宿主分离噬菌体,并对噬菌体分离株进行形态学观察,对其温度和pH值稳定性、感染复数(MOI)、一步生长曲线进行测定和分析,测试其对71株不同血清型沙门菌的裂解谱,以及对沙门菌sdc-11生物被膜形成的抑制和对成熟生物被膜的清除作用,最后进行基因组测序分析。[结果]分离获得1株长尾噬菌体,命名为YT90。该噬菌体在30~60℃和pH值4~10的条件下,均表现出较好的增殖能力,最佳MOI值为10^(-5),潜伏期10 min,裂解期90 min,裂解量为每细胞278 PFU;可裂解66.7%(14/21)肠炎沙门菌、66.7%(28/42)鼠伤寒沙门菌和75.0%(3/4)鸡白痢沙门菌;在96孔细胞板上,YT90具有抑制沙门菌sdc-11生物被膜形成的潜力,并能有效清除成熟生物被膜;全基因组测序发现,YT90的基因组全长121240 bp,不含已知的毒力因子和耐药相关基因,不编码整合酶;基于末端酶大亚基构建的进化树分析表明,YT90与沙门菌噬菌体gRNsp50关系最近,属于根西病毒亚科(guernseyvirinae)新泽西病毒属(Jerseyvirus)。[结论]从鸭场粪便样品中分离获得1株烈性噬菌体YT90,可裂解多种血清型沙门菌,耐受性强、潜伏期短、裂解量大,在防治沙门菌感染方面有较好的临床应用潜力。

关键词：沙门菌噬菌体生物被膜生物学特性

基于氨基酸描述符对血管紧张素转化酶抑制五肽定量构效关系分析

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食品科学 2024年第13期45卷 38-48页

作者：郭星晨李玉豪马金璞张钰璇李华鑫杨具田樊佩如高丹丹西北民族大学生物医学研究中心中国-马来西亚国家联合实验室甘肃兰州730030 西北民族大学生命科学与工程学院甘肃兰州730124 四川大学化学学院四川成都610207

本研究收集近些年报道的血管紧张素转化酶(angiotensin converting enzyme,ACE)抑制五肽的氨基酸序列及抑制活性(半抑制浓度(half maximal inhibitory concentration,IC_(50))),建立ACE抑制五肽肽库,并将其氨基酸残基用Z-scales、VHSE和SVHEHS氨基酸描述符分别进行表述,以氨基酸残基的疏水性、立体性以及电性参数作为自变量,ACE抑制五肽的lg IC_(50)作为因变量,利用Matlab软件用偏最小二乘法建立ACE抑制肽定量构效关系(quantitative structure-activity relationship,QSAR)模型,结果发现基于Z-scales描述符构建的ACE抑制五肽QSAR模型R2为0.6411,Q^(2)为0.5369,模型预测五肽gln-Arg-Pro-Asn-Met具有较高的ACE抑制活性,预测IC_(50)为0.0517μmol/L,实测IC_(50)为(0.0400±0.0083)μmol/L,预测值与实测值误差为0.0117μmol/L;基于VHSE描述符构建的QSAR模型R2为0.7636,Q^(2)为0.5081,模型预测五肽Leu-Arg-Ala-Phe-gln具有较高的ACE抑制活性,预测IC_(50)为0.0438μmol/L,实测值为(0.0273±0.0053)μmol/L,误差为0.0165μmol/L;基于SVHEHS描述符构建的QSAR模型R2为0.8405,Q^(2)为0.4005μmol/L,模型预测五肽Tyr-Phe-Pro-Phe-gln具有较高的ACE抑制活性,预测值为0.0055μmol/L,实测值为(0.0312±0.0042)μmol/L,误差为0.0257μmol/L。3种建模方法对比发现,基于SVHEHS描述符构建的模型拟合能力最强,但是其预测能力较弱,而Z-scales和VHSE描述符所建模型能很好地对五肽进行QSAR分析,通过模型分析发现ACE抑制肽活性与其氨基酸的疏水特征呈负相关,与立体特征呈正相关。将3种ACE抑制肽与ACE蛋白(2X8J)进行分子对接,结果表明3种ACE抑制肽均可与ACE蛋白进行结合。本研究可为开发ACE抑制肽药物提供新手段,为开发和利用食源性ACE抑制肽提供理论基础。

关键词：血管紧张素转化酶肽偏最小二乘定量构效关系氨基酸描述符

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基于超细材料的全风化花岗岩防渗注浆研究

地质科技通报 2024年第1期43卷 194-203页

作者：李永丰高宇豪陈天乐钟聚光胡岳李建中中国电建集团中南勘测设计研究院有限公司长沙410014 中南大学地球科学与信息物理学院长沙410083 中南大学有色金属成矿预测与地质环境监测教育部重点实验室长沙410083 重庆大学土木工程学院重庆400045 湖南平江抽水蓄能有限公司湖南岳阳410400

针对全风化花岗岩地层注浆过程中存在“吃水不吃浆”、可灌性差以及浆液的稳定性问题,提出了一种新的复合注浆材料,以提高完全风化花岗岩的防渗和力学性能。通过一系列室内试验研究了不同水固比、超细膨润土含量和超细硅酸盐水泥含量对... 详细信息

针对全风化花岗岩地层注浆过程中存在“吃水不吃浆”、可灌性差以及浆液的稳定性问题,提出了一种新的复合注浆材料,以提高完全风化花岗岩的防渗和力学性能。通过一系列室内试验研究了不同水固比、超细膨润土含量和超细硅酸盐水泥含量对注浆材料工程性能和浆液形成机制的影响,确定了水泥浆的最佳配方,采用微观形貌试验揭示了2种超细材料对浆液流动性、稳定性和结石体强度的作用机理,最后通过现场试验验证了注浆材料的可注性和有效性。结果表明,水固比为1.2、超细膨润土和超细硅酸盐水泥掺量分别为10%、普通硅酸盐水泥掺量80%配方的复合浆液具有很好的流动性、稳定性和抗压强度,漏斗黏度为35.5 s,析水率为2.4%,7 d和28 d的抗压强度均大于5 MPa;复合材料中的超细膨润土的掺量对浆液性能起主导作用,超细膨润土含量及其水化胶体的形态与分布决定浆液稳定性,而适量的超细硅酸盐水泥增加了细颗粒含量,使得胶结体更易填充颗粒间隙,改善了浆液可注性和结石体强度;该复合注浆材料在现场试验中表现优异,具有良好的注浆性能,注浆后形成的墙体在防渗效果和加固性能上均满足设计要求。

关键词：全风化花岗岩超细水泥超细膨润土压水试验微观结构

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