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Phyton-International Journal of Experimental Botany 2023年第9期92卷 2555-2576页

作者： Jing Yang Tianxiunan Pu Ke Wan Linqi Wang yuanshuai shi Xu Luo Jie Tan Dongmei Wang Yang Liu College of Tobacco Science of Guizhou University Guizhou Key Laboratory for Tobacco QualityGuiyang550025China

Drought has severely affected the yield and quality of commercial crops.The BRI1 family plays an important role in plant response to drought stress,and BRL3 gene plays an important role in the study of drought in Arabidopsis thaliana.In this study,NtBRL3 was constructed as a vector and genetically transformed to obtain‘N.Tobacco K326’overexpression of NtBRL3.The enzyme activities of transgenic tobacco and wild-type tobacco were measured and transcriptome and metabolome analyses were performed.The results showed that the antioxidant enzymes of transgenic tobacco were more active under drought conditions,and 85 significantly differentially metabolites and 106 significantly differentially expressed genes were identified in the metabolome and transcriptome analyses,respectively.Transgenic tobacco NtBRL3ox demonstrated an excessive accumulation of droughtrelated metabolites,sugars such as sucrose and maltotetraose,and amino acids such as proline,compared with WT.We discovered drought-related differential genes in the root transcriptome,among which LOX6,RD22,WSD1,CCD8,and UGT were key genes which play an important role in plant response to drought stress.Our results demonstrate that NtBRL3 overexpression in K326 enhances drought resistance in transgenic tobacco.

关键词： Nicotiana tabacum L.K326 transcriptome metabolome BRL3 gene drought stress

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尾矿污染地下水管控修复技术与实例分析

化工环保 2024年第1期44卷 146-152页

作者：韩伟石元帅马超王健奇王玉晶范书凯生态环境部固体废物与化学品管理技术中心北京100029 内蒙古包钢钢联股份有限公司内蒙古包头014010 包钢集团节能环保中心内蒙古包头014010 矿冶科技集团有限公司北京100160

尾矿库因势能高、尾矿量大且组分复杂等特点而成为重点环境监管对象。本文分析了尾矿污染地下水的成因与特征,梳理了管控修复技术,总结了不同技术的特点及适用场景,介绍了典型的技术应用案例,并展望了未来的技术发展方向。指出,“堵、... 详细信息

尾矿库因势能高、尾矿量大且组分复杂等特点而成为重点环境监管对象。本文分析了尾矿污染地下水的成因与特征,梳理了管控修复技术,总结了不同技术的特点及适用场景,介绍了典型的技术应用案例,并展望了未来的技术发展方向。指出,“堵、截、隔、治”的组合手段是治理尾矿污染地下水的重要措施,可为尾矿库地下水污染的风险管控和修复提供参考。

关键词：尾矿库环境风险环境修复风险管控污染地下水

基于重测序的BBLa过表达烟草雄性不育变异检测分析

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种子 2024年第2期43卷 37-43页

作者：王麟麒罗徐万克石远帅崔杨子力刘洋贵州大学烟草学院/贵州省烟草品质研究重点实验室贵阳550025

BBLa基因编码小檗碱桥状酶(Berberine bridge enzyme-like, BBLa),烟草小檗碱桥状酶参与烟碱生物合成的最终催化步骤。课题组前期研究发现,BBLa过表达烟草T0代植株中出现雄蕊败育表型。为进一步了解该雄性不育表型的遗传机制,本研究以... 详细信息

BBLa基因编码小檗碱桥状酶(Berberine bridge enzyme-like, BBLa),烟草小檗碱桥状酶参与烟碱生物合成的最终催化步骤。课题组前期研究发现,BBLa过表达烟草T0代植株中出现雄蕊败育表型。为进一步了解该雄性不育表型的遗传机制,本研究以过表达BBLa烟草雄性不育表型OE1和野生型烟草WT为材料,基于全基因组重测序技术,对单核苷酸多态性(SNP)、插入-缺失(InDel)及染色体结构变异(SV)3种变异类型进行标记注释,平均测序深度≥14×,平均覆盖率≥95%。结果表明,在2个样本中共检测到7 505 620个SNP、628 034个InDel、79 576个SV。通过2个样本的SNP差异比对筛选,最终得到174个候选基因。

关键词：烟草重测序 BBLa基因雄性不育

烟草NtCYP734A1基因的克隆及表达分析

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种子 2024年第3期43卷 102-109页

作者：万克段丽丽王麟麒石远帅罗徐刘洋贵州大学烟草学院/贵州省烟草品质研究重点实验室贵阳550025 贵州大学农学院/贵州省烟草品质研究重点实验室贵阳550025

油菜素内酯是一种参与胁迫响应的甾醇类植物激素,CYP734A1基因是油菜素内酯代谢通路上的关键基因。为探索CYP734A1基因在烟草响应非生物胁迫时发挥的功能,本研究以普通烟草品种K326为材料,克隆CYP734A1基因,通过生物信息学技术分析NtCYP... 详细信息

油菜素内酯是一种参与胁迫响应的甾醇类植物激素,CYP734A1基因是油菜素内酯代谢通路上的关键基因。为探索CYP734A1基因在烟草响应非生物胁迫时发挥的功能,本研究以普通烟草品种K326为材料,克隆CYP734A1基因,通过生物信息学技术分析NtCYP734A1蛋白的理化性质及进化关系,运用实时荧光定量法分析CYP734A1基因在不同组织、不同非生物胁迫处理下的基因表达模式。结果表明,CYP734A1基因全长1638 bp,编码545个氨基酸;亚细胞定位预测NtCYP734A1蛋白存在于内质网。qRT-PCR分析表明,烟草CYP734A1基因在不同组织均有表达,叶中表达量最高,茎中的表达量最低。非生物胁迫处理下,CYP734A1基因在各组织的表达量显著改变,在干旱、盐和低温胁迫下根的CYP734A1基因表达上调;在干旱、盐、高温和低温共4种胁迫下,叶中CYP734A1基因表达下调。

关键词：烟草 CYP734A1基因油菜素内酯表达分析

ALYREF mediates RNA m^(5)C modification to promote hepatocellular carcinoma progression

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Signal Transduction and Targeted Therapy 2023年第4期8卷 1375-1377页

作者： Chen Xue Xinyu Gu Qiuxian Zheng Qingmiao shi Xin Yuan yuanshuai Su Junjun Jia Jianwen Jiang Juan Lu Lanjuan Li State Key Laboratory for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases National Clinical Research Center for Infectious DiseasesNational Medical Center for Infectious DiseasesCollaborative Innovation Center for Diagnosis and Treatment of Infectious DiseasesThe First Affiliated HospitalZhejiang University School of MedicineHangzhouZhejiangChina Division of Hepatobiliary and Pancreatic Surgery Department of SurgeryThe First Affiliated HospitalZhejiang University School of MedicineHangzhouZhejiangChina

Dear Editor,The incidence of hepatocellular carcinoma(HCC)is increasing in many countries due to hepatic virus infection and unhealthy diet habits,and the unsatisfactory overall survival rate calls for novel treatments with higher efficacy.1 Recent studies have shown that RNA modifications are likely to participate in the progression of HCC,2 suggesting new methods for tumor growth control.Specifically,5-methylcytosine(m5C)is one of the most interesting RNA modification types,as accumulating evidence suggests its role in the promotion of HCC tumorigenesis.3 The RNA methyltransferase Aly/REF export factor(ALYREF)is considered one type of“reader”protein located in the nucleus that recognizes and binds directly with m5C sites in RNA and facilitates the export of RNA from the nucleus to the cytoplasm.4 Notably,ALYREF is considered a promising target for diagnosis and prognosis prediction.5 However,until now,the low number of related studies has limited the understanding of the mechanism of the HCC-promoting effects of ALYREF.

关键词： hepatocellular diagnosis likely

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MicroRNA与动物发育

生物技术通报 2010年第1期26卷 30-36,43页

作者：付元帅施志仪上海海洋大学生物技术研究中心上海210306

MicroRNA(miRNA)是一类约22nt大小的内源性非编码RNA,它们通过剪切靶基因的转录产物或者抑制转录产物的翻译从而起到转录后调控靶基因表达的作用。在动物体内,通过基因敲除等方法所进行的大量研究表明了miRNA参与了胚胎早期发育、脑及... 详细信息

MicroRNA(miRNA)是一类约22nt大小的内源性非编码RNA,它们通过剪切靶基因的转录产物或者抑制转录产物的翻译从而起到转录后调控靶基因表达的作用。在动物体内,通过基因敲除等方法所进行的大量研究表明了miRNA参与了胚胎早期发育、脑及神经发育、心脏发育、肌肉及骨骼发育等动物发育的各个方面。miRNA是动物发生发育过程中重要的调控因子。主要介绍了近年来miRNA在动物生长发育过程中的研究进展。

关键词： miRNA 早期胚胎发育脑及神经发育心脏发育骨骼及肌肉发育

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牙鲆变态中甲状腺激素调控的靶基因

中国水产科学 2020年第9期27卷 1010-1020页

作者：陶家康付元帅施志仪上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海海洋大学上海水生动物遗传育种协同创新中心上海海洋大学教育部水产遗传资源开发利用重点实验室

本研究旨在采用新的方法找出甲状腺激素受体(TRs)介导的甲状腺激素(TH)调控的靶基因。以牙鲆(Paralichthys olivaceus)为实验样本,表达并纯化了牙鲆p3×Flag-TRαA和p3×Flag-TRβ融合蛋白,采用一种目的基因循环扩增与筛选的方法,寻找T... 详细信息

本研究旨在采用新的方法找出甲状腺激素受体(TRs)介导的甲状腺激素(TH)调控的靶基因。以牙鲆(Paralichthys olivaceus)为实验样本,表达并纯化了牙鲆p3×Flag-TRαA和p3×Flag-TRβ融合蛋白,采用一种目的基因循环扩增与筛选的方法,寻找TH直接调控的靶基因,最终筛选得到TRαA的候选靶基因11个, TRβ的候选靶基因12个,其中TRαA和TRβ存在4个相同的候选靶基因:frizzled-3-like、TBC1结构域激酶(tbck)、氨酰tRNA合成酶复合多功能相互作用蛋白1(aimp1)和MYC相关因子X (max)。利用荧光定量PCR技术检验了这4个基因在牙鲆不同组织、不同变态发育期以及外源性甲状腺激素和硫脲处理后各个变态发育时期的表达情况,发现在TH含量升高时,靶基因表达量降低;TH含量降低时,靶基因的表达量上升,从而验证靶基因受到TH的负向调控,证实TH在促进牙鲆变态中也存在抑制靶基因转录的情况。本研究旨为研究TH调控牙鲆变态的发育网络提供基础资料。

关键词：牙鲆甲状腺激素甲状腺激素受体 DNA-蛋白质互作靶基因

miR-124和Otx2在牙鲆变态发育期间的表达调控及其靶向关系验证

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中国水产科学 2019年第6期26卷 1040-1048页

作者：季文瑶付元帅施志仪谢燕上海海洋大学水产与生命学院农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海海洋大学教育部水产遗传资源开发利用重点实验室上海海洋大学上海水产养殖工程技术研究中心

牙鲆(Paralichthysolivaceus)是研究鱼类变态发育的理想模型,其右眼移位及生活习性的改变受甲状腺激素(TH)调控。同时microRNA (miRNAs)在变态期间发挥关键性作用。为研究TH、pol-miR-124及Otx2在牙鲆变态中的调控机制,本实验通过生物... 详细信息

牙鲆(Paralichthysolivaceus)是研究鱼类变态发育的理想模型,其右眼移位及生活习性的改变受甲状腺激素(TH)调控。同时microRNA (miRNAs)在变态期间发挥关键性作用。为研究TH、pol-miR-124及Otx2在牙鲆变态中的调控机制,本实验通过生物信息学方法预测pol-miR-124潜在靶基因Otx2,首先利用qRT-PCR检测在牙鲆各组织、正常变态及外源TH处理仔鱼后pol-miR-124和Otx2的表达模式。然后克隆400bp含有"种子序列"的Otx23′UTR区序列,构建野生型重组载体pmirGLO-Otx2并转染293T细胞检测双荧光素酶活性确定靶向关系。qRT-PCR结果表明:pol-miR-124和Otx2均在脑和眼睛组织中特异性高表达;在仔鱼变态28 dph表达量最高与变态进程相一致; TH作用下,在20 dph、24 dph时期, pol-miR-124的表达量低于正常组,而Otx2的表达量高于正常组;在28 dph、32dph、36dph时期,pol-miR-124的表达量高于正常组,但Otx2的表达量低于正常组,两者呈现出相反的表达趋势;双荧光素酶结果显示pol-miR-124靶向负调控Otx2。本实验旨为揭示牙鲆视觉感光系统的发育机制奠定研究基础,同时为探讨牙鲆变态发育机制提供了新的理论依据。

关键词：牙鲆甲状腺激素 pol-miR-124 Otx2

牙鲆let-7基因的克隆与表达及其靶基因预测

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中国水产科学 2011年第6期18卷 1211-1218页

作者：施志仪吴明林付元帅上海海洋大学水产与生命学院

let-7是时序发育过程中的重要调控因子,在促进幼体向成体转变过程中起着极其重要的作用。为探讨let-7对牙鲆(Paralichthys olivaceus)从幼体到成体转变的变态发育过程的影响,本实验对let-7进行了克隆与表达研究,并预测了其可能的靶基因... 详细信息

let-7是时序发育过程中的重要调控因子,在促进幼体向成体转变过程中起着极其重要的作用。为探讨let-7对牙鲆(Paralichthys olivaceus)从幼体到成体转变的变态发育过程的影响,本实验对let-7进行了克隆与表达研究,并预测了其可能的靶基因。利用普通PCR技术从牙鲆中成功鉴定出let-7及其前体序列,该前体序列在不同的物种间具有高度的保守性。运用实时荧光定量RT-PCR方法分析let-7在牙鲆变态发育不同阶段的表达,结果发现,水温(16±0.5)℃条件下,在牙鲆变态发育的前5个阶段(孵化后17、20、23、29、36 d),let-7的表达量逐渐上升,在变态末期(36 dph)达到高峰,变态结束(41 dph)时表达量呈现下降的趋势。实时荧光定量数据表明,甲状腺激素(T3)上调牙鲆肾细胞中let-7的表达,在浓度为75 nmol/L时,表达量达到最高。靶基因预测发现,let-7作用于多样的靶基因,其靶基因可能参与生长发育、细胞分化、信号转导、病毒免疫等生物过程。本研究建立了let-7在牙鲆变态发育过程中的表达谱,并在细胞水平研究了T3对let-7表达量的影响,预测了其可能的靶基因,为研究let-7在牙鲆变态发育过程中的调控机制奠定了基础。

关键词：牙鲆 let-7 克隆与表达变态甲状腺激素靶基因

添加液态烷烃氧载体对法夫酵母发酵生产虾青素的影响

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食品与发酵工业 2005年第6期31卷 43-46页

作者：刘元帅石国领吴建勇香港理工大学应用生物及化学技术学系国家环境保护总局环境工程评估中心北京100000

在法夫酵母培养过程中,氧的供给是细胞生长和虾青素合成的重要因素。试验中测得法夫酵母摇瓶培养时比耗氧速率(qp)为60mg(O2)/(g.h)(cell),临界溶氧浓度10%。试验还考察了多种液态烷烃作为氧载体对法夫酵母生长和类胡萝卜素合成的影响,... 详细信息

在法夫酵母培养过程中,氧的供给是细胞生长和虾青素合成的重要因素。试验中测得法夫酵母摇瓶培养时比耗氧速率(qp)为60mg(O2)/(g.h)(cell),临界溶氧浓度10%。试验还考察了多种液态烷烃作为氧载体对法夫酵母生长和类胡萝卜素合成的影响,发现正十六烷作为氧载体效果较好,其最佳条件是在法夫酵母接种同时添加10%(v/v)的正十六烷。在此条件下,细胞干重达到10.1g/L,类胡萝卜素产量13.2mg/L,分别比对照增加22%和43%。同时,单位细胞类胡萝卜素产量从1.11mg/g增加到1.31mg/g,合成能力提高了18%。

关键词：法夫酵母氧载体虾青素发酵生产烷烃液态添加类胡萝卜素正十六烷培养过程细胞生长耗氧速率摇瓶培养溶氧浓度酵母生长最佳条件能力提高合成试验产量