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A New Machine-Learning Extracting Approach to Construct a Knowledge Base: A Case Study on Global Stromatolites over Geological Time

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地球科学学刊:英文版 2023年第5期34卷 1358-1373页

作者： Xiaobo Zhang Hao Li Qiang Liu Zhenhua Li Claire E.Reymond Min Zhang yuangeng huang Hongfei Chen Zhong-Qiang Chen School of Computer China University of GeosciencesWuhan 430078China Hubei Key Laboratory of Intelligent Geo-Information Processing China University of GeosciencesWuhan 430074China School of Earth Resources China University of GeosciencesWuhan 430074China State Key Laboratory of Biogeology and Environmental Geology China University of GeosciencesWuhan 430078China

Within any scientific disciplines, a large amount of data are buried within various literature depositories and archives, making it difficult to manually extract useful information from the datum swamps. The machine-learning extraction of data therefore is necessary for the big-data-based studies. Here, we develop a new text-mining technique to reconstruct the global database of the Precambrian to Recent stromatolites, providing better understanding of secular changes of stromatolites though geological time. The step-by-step data extraction process is described as below. First, the PDF documents of stromatolite-containing literatures were collected, and converted into text formation. Second, a glossary and tag-labeling system using NLP(Natural Language Processing) software was employed to search for all possible candidate pairs from each sentence within the papers collected here. Third, each candidate pair and features were represented as a factor graph model using a series of heuristic procedures to score the weights of each pair feature. Occurrence data of stromatolites versus stratigraphical units(abbreviated as Strata), facies types, locations, and age worldwide were extracted from literatures, respectively, and their extraction accuracies are 92%/464, 87%/778, 92%/846, and 93%/405 from 3 750 scientific abstracts, respectively, and are 90%/1 734, 86%/2 869, 90%/2 055 and 91%/857 from 11 932 papers, respectively. A total of 10 072 unique datum items were identified. The newly obtained stromatolite dataset demonstrates that their stratigraphical occurrences reached a pronounced peak during the Proterozoic(2 500 – 541 Ma), followed by a distinct fall during the Early Phanerozoic, and overall fluctuations through the Phanerozoic(541–0 Ma). Globally, seven stromatolite hotspots were identified from the new dataset, including western United States, eastern United States, western Europe, India, South Africa, northern China, and southern China. The proportional occurrences of inland aquatic stromatolites remain rathe

关键词： machine learning knowledge base construction stromatolites Precambrian knowledge graph

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羌塘盆地索瓦组碳酸盐岩红层成因和环境意义

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沉积学报 2024年第3期42卷 812-822页

作者：刘牧季长军黄元耕丁一陈荣庆陈明思杨钹陈代钊中国科学院地质与地球物理研究所中国科学院新生代地质与环境重点实验室北京100029 中国科学院地球科学研究院北京100029 中国地质科学院北京100037 中国地质大学(武汉) 生物地质与环境地质国家重点实验室武汉430078 成都理工大学油气藏地质及开发工程全国重点实验室成都610059

【目的】海相红层分布在地质历史时期各个阶段,被解读为特殊环境的产物,并引起广泛关注。【方法】西藏双湖县毕洛错出露的侏罗系索瓦组表现为红色碳酸盐岩,围绕其致色成因与沉积意义,综合采用沉积学、矿物学和地球化学方法展开探讨。【... 详细信息

【目的】海相红层分布在地质历史时期各个阶段,被解读为特殊环境的产物,并引起广泛关注。【方法】西藏双湖县毕洛错出露的侏罗系索瓦组表现为红色碳酸盐岩,围绕其致色成因与沉积意义,综合采用沉积学、矿物学和地球化学方法展开探讨。【结果】通过对索瓦组野外沉积学和镜下薄片鉴定,发现岩石以鲕粒—球粒支撑灰岩为主,富含头足、双壳、苔藓虫、腹足及其他底栖生物碎屑,鲕核以生物碎屑和陆源石英碎屑为主,呈现高能滩相沉积特征;光谱学研究和扫描电镜显示,致红色原因主要为亚微米级—微米级半自形—他形晶的赤铁矿,致色矿物集中在鲕粒圈层结构中,胶结物基本不含致色矿物,说明同沉积过程与早期成岩时期,尤其是鲕粒和球粒形成时期表面微需氧嗜铁微生物,对致色铁的氧化起到了重要作用。另外,碳酸盐矿物的地球化学分析结果显示,岩石的红色度与陆源碎屑输入的通量具有正相关性,且呈现正Ce/Ce*异常、富中稀土式配分曲线的特征,代表了铁氧化物经历了还原性溶解后的重结晶作用。【结论】据此,研究重建了索瓦组红层致色过程:陆源含铁矿物输入为致红色提供了物质基础,在动荡水体的同沉积过程中,鲕粒表层开始以胶体形式附着Fe(Ⅲ)。随后在早成岩过程中,还原性流体促使含铁矿物溶解,为嗜铁微生物提供游离状态的铁离子,使其重结晶,通过化学成因或生物成因最终形成羟基铁并致红色。

关键词：海相红层羌塘盆地索瓦组碳酸盐岩赤铁矿稀土元素成岩作用

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沉积地层中草莓状黄铁矿分析方法及其在古海洋学上的应用

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沉积学报 2020年第1期38卷 150-165页

作者：常晓琳黄元耕陈中强侯明才成都理工大学沉积地质研究院成都610059 地质过程与矿产资源国家重点实验室(中国地质大学) 武汉430074 生物地质与环境地质国家重点实验室(中国地质大学) 武汉430074 油气藏地质及开发工程国家重点实验室(成都理工大学) 成都610059

草莓状黄铁矿是黄铁矿的特殊形态,其定义为由相近大小、相似形态的黄铁矿微晶颗粒组成的球形、亚球形聚合体。草莓状黄铁矿粒径分析已广泛应用于各个地质历史时期的古海洋环境恢复研究中,但其形成机理、判别标准与实验方法仍存在分歧。... 详细信息

草莓状黄铁矿是黄铁矿的特殊形态,其定义为由相近大小、相似形态的黄铁矿微晶颗粒组成的球形、亚球形聚合体。草莓状黄铁矿粒径分析已广泛应用于各个地质历史时期的古海洋环境恢复研究中,但其形成机理、判别标准与实验方法仍存在分歧。因此对沉积地层中草莓状黄铁矿的形成机理、在古海洋环境恢复中的指示意义及判别标准、实验与数据分析方法等进行总结阐述,有助于理解草莓状黄铁矿的粒径大小与形态对氧化还原条件的指示意义。草莓状黄铁矿在不同氧化还原环境下的形成机理存在差异,其粒径大小、数量以及分布范围可综合反映沉积时水体的氧化还原条件;而草莓状黄铁矿微晶几何形态及整体形貌特征也与古海洋氧化还原环境密切相关。此外,虽然有学者指出该方法可能存在一些问题,但只要在分析过程中结合沉积特征、古生态特征、地球化学指标等多方面证据对环境进行综合判别,甄别特殊条件下沉积的草莓状黄铁矿,则可有效避免这些问题。最后,针对后期氧化作用对草莓状黄铁矿粒径分布的影响进行了评价,结果显示经过后期氧化作用的草莓状黄铁矿粒径变化很小,不会对其在恢复古海洋氧化还原环境的应用上产生影响。

关键词：草莓状黄铁矿形成机制古海洋氧化还原环境黄铁矿氧化作用

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肾移植术后黄疸(附11例报告)

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中华器官移植杂志 1996年第2期17卷 78-79页

作者：钱立新尤国才眭元庚徐正铨朱孝平南京医科大学第一附属医院泌外科 210029

肾移植术后可因胆汁代谢异常而发生黄疸。其原因多为在肝病基础上,术后应用免疫抑制剂的肝损害。本组黄疸发生率6.9%(11/160),9例治愈。2例因肝功能衰竭死亡。黄疸治疗在于三个方面:调整免疫抑制剂药物、保肝退黄降酶、支持治疗。

关键词：肾移植手术后黄疸

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兔受精卵着床前母体的妊娠识别——Ⅰ.血小板计数法

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江苏农业学报 1986年第1期 33-36页

作者：黄夺先周元根范必勤江苏省农业科学院畜牧兽医研究所

母兔配种后第2天血小板数明显减少(P0.05)。孕兔血小板数下降取决于生殖道内有受精卵的存在。受精卵移入母兔子宫,5小时内出现血小板数显著降低(P<0.01),且与移入受精卵数明显相关(r=0.5134)。母兔结扎两侧输卵管后授精,血小板数无变化... 详细信息

母兔配种后第2天血小板数明显减少(P0.05)。孕兔血小板数下降取决于生殖道内有受精卵的存在。受精卵移入母兔子宫,5小时内出现血小板数显著降低(P<0.01),且与移入受精卵数明显相关(r=0.5134)。母兔结扎两侧输卵管后授精,血小板数无变化,排除了精液的影响。本研究结果提示,兔血小板数减少是母体妊娠的初始反应。

关键词：血小板受精受精卵

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