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Proteomics provides individualized options of precision medicine for patients with gastric cancer

Science China(Life Sciences) 2021年第8期64卷 1199-1211页

作者： Wenwen Huang Dongdong Zhan Yazhuo Li Nairen Zheng Xin Wei Bin Bai Kecheng Zhang Mingwei Liu Xuefei Zhao xiaotian Ni xia xia Jinwen Shi Cheng Zhang Zhihao Lu Jiafu Ji Juan Wang Shiqi Wang Gang Ji Jipeng Li Yongzhan Nie Wenquan Liang xiaosong Wu Jianxin Cui yongsheng Meng Feilin Cao Tieliu Shi Weimin Zhu Yi Wang Lin Chen Qingchuan Zhao Hongwei Wang Lin Shen Jun Qin Department of Gastrointestinal Oncology Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational Research(Ministry of Education/Beijing)Peking University Cancer Hospital and InstituteBeijing 100142China State Key Laboratory of Proteomics Beijing Proteome Research CenterNational Center for Protein Sciences(Beijing)Beijing Institute of LifeomicsBeijing 102206China Department of Pathology The Fourth Medical Center of PLA General HospitalBeijing 100048China State Key Laboratory of Cancer Biology National Clinical Research Center for Digestive Diseases and Department of Digestive SurgeryXijing Hospital of Digestive DiseasesFourth Military Medical UniversityXi’an 710032China Department of General Surgery&Institute of General Surgery Chinese PLA General Hospital First Medical CenterBeijing 100853China Department of Gastrointestinal Surgery Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational Research(Ministry of Education/Beijing)Peking University Cancer Hospital and InstituteBeijing 100142China Department of tumor biobank Shanxi Cancer HospitalTaiyuan 030013China Center for Bioinformatics and Computational Biology Shanghai Key Laboratory of Regulatory BiologyInstitute ofBiomedical Sciences and School of Life SciencesEast China Normal UniversityShanghai 200241China State Key Laboratory of Genetic Engineering and Collaborative Innovation Center for Genetics and Development School of Life SciencesInstitute of Biomedical SciencesFudan UniversityShanghai 200433China Life Sciences Institute Zhejiang UniversityHangzhou 310058China

While precision medicine driven by genome sequencing has revolutionized cancer care,such as lung cancer,its impact on gastric cancer(GC)has been *** patients are routinely treated with chemotherapy,but only a fraction of them receive the clinical *** is an urgent need to develop biomarkers or algorithms to select chemo-sensitive patients or apply targeted ***,we carried out retrospective analyses of 1,020 formalin-fixed,paraffin-embedded GC surgical resection samples from 5 hospitals and developed a mass spectrometry-based workflow for proteomic subtyping of *** identified two proteomic subtypes:the chemo-sensitive group(CSG)and the chemo-insensitive group(CIG)in the discovery *** 5-year overall survival of CSG was significantly improved in patients who had received adjuvant chemotherapy after surgery compared with those who received surgery only(64.2%vs.49.6%;Cox P-value=0.002),whereas no such improvement was observed in CIG(50.0%vs.58.6%;Cox P-value=0.495).We validated these results in an independent validation ***,differential proteome analysis uncovered 9 FDA-approved drugs that may be applicable for targeted therapy of GC.A prospective study is warranted to test these findings for future GC patient care.

关键词： patients chemotherapy cancer

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基于全转速综合性能评价的可变循环发动机配气优化

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机械工程学报 2012年第18期48卷 117-123页

作者：邸立明李文跃夏怀成赵永生燕山大学车辆与能源学院秦皇岛066004 燕山大学机械工程学院秦皇岛066004

针对可变循环发动机(Variable-cycle engine,VCE)二行程模式配气形式的特殊性和配气参数优化问题,以某单缸四行程发动机为基础,建立VCE四行程和二行程工作模式仿真模型,利用缸压试验验证模型的正确性,提出基于多性能评价指标的发动机综... 详细信息

针对可变循环发动机(Variable-cycle engine,VCE)二行程模式配气形式的特殊性和配气参数优化问题,以某单缸四行程发动机为基础,建立VCE四行程和二行程工作模式仿真模型,利用缸压试验验证模型的正确性,提出基于多性能评价指标的发动机综合性能量化指标复合性能系数,通过算例和模糊物元法验证了其有效性。根据复合性能系数最大化原则,对VCE二行程模式的三种缸侧排气口方案进行系列化仿真分析,得出在四圆角矩形排气口方案的气口下边沿与下止点重合情况下,当进气门在下止点前46°开启,下止点后86°关闭,排气口宽为30 mm,高为14 mm时,在全转速范围内的综合性能最好。研究表明,复合性能系数能高效地对发动机全转速范围的综合性能进行量化评价比较。

关键词：可变循环发动机参数优化综合评价性能系数

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基于Trx1/TXNIP通路探讨通督调神针法改善缺血再灌注大鼠海马凋亡机制研究

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辽宁中医杂志 2024年第1期51卷 188-191,I0007页

作者：王涛吴子建李佩芳李梦韩永升刘琨张道宗吴杰刘辉刘霞安徽中医药大学第二附属医院安徽合肥230061 安徽中医药大学安徽合肥230012 皖南医学院安徽芜湖241002

目的探讨通督调神针法激活脑缺血再灌注大鼠Trx1,抑制海马凋亡作用机制研究。方法取雄性SD大鼠40只,随机分为空白组,假手术组,模型组及电针组,每组10只。模型组采用Zea-Longa线栓法制备缺血性脑卒中模型,待缺血2 h后,退出线栓进行再灌... 详细信息

目的探讨通督调神针法激活脑缺血再灌注大鼠Trx1,抑制海马凋亡作用机制研究。方法取雄性SD大鼠40只,随机分为空白组,假手术组,模型组及电针组,每组10只。模型组采用Zea-Longa线栓法制备缺血性脑卒中模型,待缺血2 h后,退出线栓进行再灌注。假手术组大鼠仅分离颈总动脉后2 h缝合即可,采用神经功能行为学评分判断大鼠是否成模。成模后电针组选取百会、大椎进行治疗,疗程7 d。治疗结束后收集大脑,TTC染色计算脑梗死面积,qPCR检测大鼠Trx1、TXNIP、Caspase3、Bcl2、Bax基因表达,Elisa检测大鼠海马组织ROS表达,Tunel染色检测大鼠海马组织凋亡情况。结果与假手术组相比较,模型组的脑梗死面积及神经功能行为学评分显著增加(P<0.05);qPCR结果显示,Trx1、Bcl2 mRNA表达显著降低,TXNIP、Caspase3、Bax mRNA表达显著增高(P<0.05);ROS含量显著增高(P<0.05),海马组织凋亡程度显著增加。通督调神针法可以显著降低大鼠神经功能行为学评分、大脑梗死面积及海马凋亡程度,增加Trx1、Bcl2 mRNA表达,降低TXNIP、Caspase3、Bax mRNA表达,降低ROS含量。结论通督调神针法可能通过激活Trx1,抑制TXNIP诱导的凋亡反应,从而发挥缺血再灌注损伤之后大脑保护作用。

关键词：通督调神缺血再灌注电针凋亡

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过量表达水稻OsP5CS1和OsP5CS2基因提高烟草脯氨酸的生物合成及其非生物胁迫抗性(英文)

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应用与环境生物学报 2014年第4期20卷 717-722页

作者：张霞唐维刘嘉刘永胜四川大学生命科学学院/生物资源与生态环境教育部重点实验室/水力学与山区河流开发保护国家重点实验室合肥工业大学食品与生物工程学院

为了解水稻OsP5CS基因在非生物胁迫中的生物学功能及其生理生化作用,将P5CS基因的两个水稻同源基因OsP5CS1和OsP5CS2同时构建到植物表达载体pHB上,并通过农杆菌介导的遗传转化法转入烟草,经过鉴定转基因植株,成功获得9个独立的转基因阳... 详细信息

为了解水稻OsP5CS基因在非生物胁迫中的生物学功能及其生理生化作用,将P5CS基因的两个水稻同源基因OsP5CS1和OsP5CS2同时构建到植物表达载体pHB上,并通过农杆菌介导的遗传转化法转入烟草,经过鉴定转基因植株,成功获得9个独立的转基因阳性植株.选取野生型和其中的3个转基因植株后代,分别测定它们在不同的胁迫条件下幼苗的根长、鲜重以及脯氨酸、过氧化氢和丙二醛的含量.结果显示:在200 mmol/L NaCl、300 mmol/L甘露醇(Mannitol)、300μmol/L CuSO4胁迫条件下转基因植株的平均根长、平均鲜重、平均脯氨酸、平均过氧化氢含量和平均丙二醛的含量分别为野生型的1.3-2.3、1.9-3.9、1.8-3.2、51%-61%和62%-76%.因此在烟草中过表达OsP5CS基因,可以显著增加脯氨酸含量,降低烟草在非生物胁迫条件下的氧化损伤.图6参31

关键词：非生物胁迫 OsP5CS 脯氨酸转基因烟草

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基于农户视角农业绿色全要素生产率的测度与分析

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中国生态农业学报（中英文） 2023年第5期31卷 820-834页

作者：程永生张德元汪侠阜阳师范大学商学院阜阳236032 安徽大学创新发展战略研究院合肥230601

提升农业绿色全要素生产率,加快农业绿色转型是全面建成社会主义现代化强国的必然选择。研究以中国家庭追踪调查(China Family Panel Studies,CFPS)的全国性大容量样本农户数据为蓝本,在微观测度方法比较分析的基础上,基于技术优化的Mal... 详细信息

提升农业绿色全要素生产率,加快农业绿色转型是全面建成社会主义现代化强国的必然选择。研究以中国家庭追踪调查(China Family Panel Studies,CFPS)的全国性大容量样本农户数据为蓝本,在微观测度方法比较分析的基础上,基于技术优化的Malmquist-Luenberger指数为基准,测度分析了农户层农业绿色全要素生产率的状况,并进一步选用核密度估计法和Dagum基尼系数法,揭示了微观样本农业绿色全要素生产率的动态演变规律及其区域差异特征。主要研究发现如下:1)技术优化的Malmquist-Luenberger指数测度显示,2014年、2016年和2018年3期样本农户的农业绿色全要素生产率均值为1.0030,总体发展态势良好;农业绿色技术变化、绿色技术效率变化的共同作用是驱动农户层面农业绿色发展变化的主要引致因素,且后者的影响程度远大于前者;农户资源配置、管理模式及组织方式的改善优化,在现阶段是农户发展绿色农业的提升关键,其影响相对高于农户农业生产技术的革新。2)通过核密度估算发现,2016年和2018年样本农户的绿色全要素生产率集中度较高,农业绿色技术效率并未出现两级分化,但农业绿色技术进步呈现上升趋势。3)Dagum基尼系数法结果表明,农户层面农业绿色全要素生产率的区域差距不断缩小,区域差距的降幅达22.32%,超变密度是引致主因;在区域内差距上,东、西、中部地区内部,农户的绿色农业差距依次递减;在区域间差距上,东西、东中、中西部间差距不断缩小、协同性不断增强,但差距易受到环境因素影响。

关键词：农户视角农业绿色全要素生产率技术优化的Malmquist-Luenberger测度差距识别

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基于热加工图及响应面法的手把体多目标优化

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华中科技大学学报（自然科学版） 2015年第3期43卷 63-68页

作者：夏玉峰纪帅张严东田永生重庆大学材料科学与工程学院重庆400044

以手把体为例,综合考虑应变速率及变形温度对材料微观组织结构和性能的影响,运用DEFORM材料库中的应力应变数据,建立了45钢的热加工图,初步为手把体锻造提供合适的工艺参数范围.进一步以初始锻造温度、飞边槽桥部高度、模具下压速率为... 详细信息

以手把体为例,综合考虑应变速率及变形温度对材料微观组织结构和性能的影响,运用DEFORM材料库中的应力应变数据,建立了45钢的热加工图,初步为手把体锻造提供合适的工艺参数范围.进一步以初始锻造温度、飞边槽桥部高度、模具下压速率为优化变量,以锻件最大损伤值、终锻成形载荷、坯料填充率为优化目标,采用Design-Expert软件进行了响应面拟合建模分析,得到三个目标量的二阶响应面模型,并进行优化分析,经数值模拟验证其误差范围小于5%.生产实践结果表明:多目标优化后的工艺参数能够获得形貌完整的锻件,并有效地减小最大损伤值,降低成形载荷,显著地提高了材料利用率.

关键词：锻造工艺参数微观组织热加工图响应面多目标优化

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一种地物关系约束下的线阵影像坐标反投影计算方法

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测绘学报 2017年第5期46卷 583-592页

作者：莫德林张永生王涛杨国鹏夏琴信息工程大学地理空间信息学院武汉大学测绘遥感信息工程国家重点实验室解放军95899部队

坐标反投影计算是线阵影像基于严格模型几何校正的关键步骤。本文在分析线阵摆扫式影像的成像方式及其特点的基础上,针对传统基于像方的顺序或迭代搜索方法效率低下的问题,提出了一种利用地物关系约束的坐标反投影计算方法。首先将当前... 详细信息

坐标反投影计算是线阵影像基于严格模型几何校正的关键步骤。本文在分析线阵摆扫式影像的成像方式及其特点的基础上,针对传统基于像方的顺序或迭代搜索方法效率低下的问题,提出了一种利用地物关系约束的坐标反投影计算方法。首先将当前相邻点的最佳扫描行作为先验值,估算其与当前点最佳扫描行的距离,定位初始最佳扫描行;然后以初始最佳扫描行为中心构建搜索窗口,进行最佳扫描行精确搜索;最后根据最佳扫描行对应的外方位元素进行坐标反投影计算。通过对机载线阵摆扫式模拟影像数据和推扫式真实影像数据的试验,验证了该方法的可行性、准确性和高效性。

关键词：反投影计算地物关系约束线阵摆扫最佳扫描线搜索

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西秦岭东段印支期花岗质岩浆作用及构造演化:地球化学、锆石U-Pb年代学及Hf同位素约束

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岩石学报 2021年第6期37卷 1691-1712页

作者：李雪峰李永胜董国臣吕鑫夏清中国地质大学(北京)地球科学与资源学院北京100083 中国地质调查局发展研究中心北京100037

西秦岭造山带东段发育大量印支期花岗岩,由北向南贯通整个西秦岭造山带。本文选取西秦岭东段的柴家庄、太白、周家山和迷坝4个花岗质岩体进行岩石学、地球化学、锆石U-Pb定年和Lu-Hf同位素研究。这些花岗质岩体的岩性主体为石英闪长岩-... 详细信息

西秦岭造山带东段发育大量印支期花岗岩,由北向南贯通整个西秦岭造山带。本文选取西秦岭东段的柴家庄、太白、周家山和迷坝4个花岗质岩体进行岩石学、地球化学、锆石U-Pb定年和Lu-Hf同位素研究。这些花岗质岩体的岩性主体为石英闪长岩-花岗闪长岩-二长花岗岩,属高钾钙碱性系列,形成时代在237~219Ma之间,并显示出两期岩浆活动的特点,早期柴家庄岩体形成于236.6±2.9Ma,晚期的太白、周家山和迷坝岩体形成于220.12~218.9Ma。早期柴家庄二长花岗岩显示出类似埃达克岩的一些地球化学特点,如高含量的Sr(578×10-6~661×10-6)和高的(La/Yb)N比值(37.44~41.73),低含量的Y(3.48×10-6-5.50×10-6)和Yb(0.3×10-6~0.5×10-6),以及弱的负Eu异常(δEu=0.85~1);在晚期花岗岩中,迷坝和周家山岩体同样表现高Sr含量(Sr>400×10-6)、低Yb含量(Yb<2×10-6)的特点,但太白花岗岩则类似于喜马拉雅型花岗岩(Sr<400×10-6,Yb<2×10-6)。锆石Hf同位素组成显示,柴家庄、太白、周家山和迷坝岩体的εHf(t)值分别为-5.1~2.2、-4.8~-0.9、-6.0~-2.7和-6.3~-3.9,对应的二阶段模式年龄(tDM2)依次为2153~1495Ma、2120~1767Ma、2227~1932Ma、2249~2033Ma,表明西秦岭东段花岗质岩体的源区主要为古元古代-中元古代壳源物质,柴家庄岩体可能有部分新生下地壳物质加入,并且整体表现出结晶基底组成由北向南逐渐变老的趋势。显示埃达克岩特点的花岗岩可能形成于加厚下地壳的部分熔融,而其喜马拉雅型的花岗岩则是正常下地壳部分熔融的产物。三叠纪时期发生的陆陆碰撞导致地壳加厚,加厚下地壳在不同深度发生的部分熔融,形成本区具有埃达克或者喜马拉雅型地球化学特点的花岗质岩体。

关键词：早中生代花岗岩类锆石U-Pb定年 Lu-Hf同位素西秦岭

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A PD-L1-targeting chimeric switch receptor enhances efficacy of CAR-T cell for pleural and peritoneal metastasis

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Signal Transduction and Targeted Therapy 2022年第12期7卷 4405-4421页

作者： Qizhi Ma xia He Benxia Zhang Fuchun Guo Xuejin Ou Qiyu Yang Pei Shu Yue Chen Kai Li Ge Gao Yajuan Zhu Diyuan Qin Jie Tang xiaoyu Li Meng Jing Jian Zhao Zeming Mo Ning Liu Yao Zeng Kexun Zhou Mingyang Feng Weiting Liao Wanting Lei Qiu Li Dan Li yongsheng Wang Thoracic Oncology Ward Cancer Centerand State Key Laboratory of BiotherapyWest China HospitalSichuan UniversityChengduChina State Key Laboratory of Biotherapy West China HospitalSichuan UniversityChengduChina Cancer Center West China HospitalSichuan UniversityChengduChina Institute of Respiratory Health Frontiers Science Center for Disease-related Molecular Networkand Precision Medicine Research CenterPrecision Medicine Key Laboratory of Sichuan ProvinceWest China HospitalSichuan UniversityChengduChina

Pleural and peritoneal metastasis accompanied by malignant pleural effusion(MPE)or malignant ascites(MA)is frequent in patients with advanced solid tumors that originate from the lung,breast,gastrointestinal tract and *** delivery of CAR-T cells represents a new strategy to control tumor dissemination in serous ***,malignant effusions constitute an immune-suppressive environment that potentially induces CAR-T cell ***,we demonstrated that the anti-tumor cytotoxicity of conventional 2nd-generation CAR-T cells was significantly inhibited by both the cellular and non-cellular components of MPE/MA,which was primarily attributed to impaired CAR-T cell proliferation and cytokine production in MPE/MA ***,we found that PD-L1 was widely expressed on freshly-isolated MPE/MA *** on this feature,a novel PD-L1-targeting chimeric switch receptor(*** CSR)was designed,which can bind to PD-L1,switching the inhibitory signal into an additional 4-1BB *** co-expressed with a 2nd-generation CAR,*** CSR-modified CAR-T cells displayed superior fitness and enhanced functions in both culture medium and MPE/MA environment,causing rapid and durable eradication of pleural and peritoneal metastatic tumors in xenograft *** investigations revealed elevated expressions of T-cell activation,proliferation,and cytotoxicity-related genes,and we confirmed that PD-L1 scFv and 4-1BB intracellular domain,the two important components of *** CSR,were both necessary for the functional improvements of CAR-T ***,our study shed light on the clinical application of *** CSR-modified dual-targeting CAR-T *** on this study,a phase I clinical trial was initiated in patients with pleural or peritoneal metastasis(NCT04684459).

关键词： metastasis pleural peritoneal

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促进还是抑制?中国环境规制的绿色发展效应:基于FDI视角

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资源与生态学报:英文版 2023年第5期14卷 951-964页

作者：程永生张德元汪侠阜阳师范大学商学院安徽阜阳236032 安徽大学创新发展战略研究院合肥230601

提升以绿色全要素生产率(GTFP)为表征的绿色发展效应,是新时代实现高质量发展的关键。利用2001–2021年省际面板数据,将能源与环境因素同时纳入分析框架,运用基于SBM方向性距离函数的Malmquist-Luenberger指数测算GTFP及其分解项构建动... 详细信息

提升以绿色全要素生产率(GTFP)为表征的绿色发展效应,是新时代实现高质量发展的关键。利用2001–2021年省际面板数据,将能源与环境因素同时纳入分析框架,运用基于SBM方向性距离函数的Malmquist-Luenberger指数测算GTFP及其分解项构建动态面板模型,采用GMM方法实证检验三种类型环境规制、FDI对GTFP的直接和间接影响效应。结果显示,中国GTFP年均增长2.13%,绿色技术进步是GTFP增长的源泉,GTFP区域差距呈扩大趋势;命令控制型环境规制不存在非线性效应,经济激励型和自愿协议型环境规制与GTFP之间分别表现出“U”形和倒“U”形关系;控制型规制没有通过FDI对GTFP产生间接效应,而激励型和协议型规制则可以通过FDI间接促进GTFP的提升;不同类型环境规制、FDI的GTFP提升效应呈现出区域异质性特征。探究环境规制的绿色发展效应及其特征,对于选取合理化环境规制类型,采用差异化环境规制强度,实施双轮驱动助推GTFP增长,实现环境规制与FDI良性互动,对促进经济高质量发展,具有重要的理论意义和现实价值。

关键词：环境规制外商直接投资绿色全要素生产率高质量发展

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