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The Genome of Medicinal Plant Macleaya cordata Provides New Insights into Benzylisoquinoline Alkaloids Metabolism

Molecular Plant 2017年第7期10卷 975-989页

作者： Xiubin Liu Yisong Liu Peng Huang Yongshuo Ma Zhixing Qing Qi Tang Huifen Cao Pi Cheng Yajie Zheng Zejun Yuan Yuan Zhou Jinfeng Liu Zhaoshan Tang yixiu zhuo Yancong Zhang Linlan Yu Jialu Huang Peng Yang Qiong Peng dinbo Zhang Wenkai Jiang Zhonghua Zhang Kui Lin Dae-Kyun Ro Xiaoya Chen Xingyao Xiong Yi Shang Sanwen Huang Jianguo Zeng National and Local Union Engineering Research Center of Veterinary Herbal Medicine Resource and Initiative Hunan Co-Innovation Center for Utilization of Botanical Functional Ingredients Horticulture and Landscape College Veterinary Medicine College Hunan Agricultural University Changsha 410128 China Institute of Vegetables and Flowers Chinese Academy of Agricultural Sciences Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops of the Ministry of Agriculture Sino-Dutch Joint Laboratory of Horticultural Genomics Beijing 100081 China Agricuitural Genome Institute at Shenzhen Chinese Academy of Agricultural Sciences Shenzhen 518124 China School of Pharmacy Hunan University of Chinese Medicine Changsha 410208 China MOE Key Laboratory for Biodiversity Science and Ecological Engineering and College of Life Sciences Beijing Normal University Beijing 100875 China Micolta Bioresource Inc. Changsha 410016 China Herbal Extract Engineering Research Center Changsha 410331 China Biotechnology Research Center Hunan Academy of Agricultural Sciences Changsha 410125 China Novogene Bioinformatics Institute Beijing 100083 China Department of Biological Sciences University of Calgary Calgary T2N1N4 Canada National Key Laboratory of Plant Molecular Genetics National Plant Gene Research Center Institute of Plant Physiology and Ecology Shanghai Institutes forBiological Sciences Chinese Academy of Sciences Shanghai 200032 China Plant Science Research Center Shanghai Chenshan Botanical Garden Shanghai 201602 China

The overuse of antibiotics in animal agriculture and medicine has caused a series of potential threats to public health. Macleaya cordata is a medicinal plant species from the Papaveraceae family, providing a safe resource for the manufacture of antimicrobial feed additive for livestock. The active constituents from M. cordata are known to include benzylisoquinoline alkaloids （BIAs） such as sanguinarine （SAN） and chelerythrine （CHE）, but their metabolic pathways have yet to be studied in this non-model plant. The active biosynthesis of SAN and CHE in M. cordata was first examined and confirmed by feeding ^13C-labeled tyrosine. To gain further insights, we de novo sequenced the whole genome of M. cordata, the first to be sequenced from the Papaveraceae family. The M. cordata genome covering 378 Mb encodes 22,328 predicted protein-coding genes with 43.5% being transposable elements. As a member of basal eudicot, M. cordata genome lacks the paleohexaploidy event that occurred in almost all eudicots. From the genomics data, a complete set of 16 metabolic genes for SAN and CHE biosynthesis was retrieved, and 14 of their biochemical activities were validated. These genomics and metabolic data show the conserved BIA metabolic pathways in M. cordata and provide the knowledge foundation for future productions of SAN and CHE by crop improvement or microbial pathway reconstruction.

关键词： Macleaya cordata genome Benzylisoquinoline alkaloids Secondary metabolism Sanguinarine Chelerythrine Isotopic labeling

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海南省三座典型垃圾填埋场渗滤液及周边地下水中抗生素的污染特征研究

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环境科学研究 2023年第9期36卷 1779-1790页

作者：邓星亮杨安富杜涛林天吴克富卓奕秀董璐吴晓晨海南大学生态与环境学院海南海口570100 海南省环境科学研究院海南海口570100

近年来,垃圾填埋场渗滤液及周边环境中抗生素污染的问题已经受到越来越多的关注.然而,海南省这方面的信息相对较为缺乏.本研究选取了海南省三座典型的垃圾填埋场,探究了渗滤液及周边地下水中磺胺类(SAs)、喹诺酮类(QNs)、林可酰胺类(LC... 详细信息

近年来,垃圾填埋场渗滤液及周边环境中抗生素污染的问题已经受到越来越多的关注.然而,海南省这方面的信息相对较为缺乏.本研究选取了海南省三座典型的垃圾填埋场,探究了渗滤液及周边地下水中磺胺类(SAs)、喹诺酮类(QNs)、林可酰胺类(LCMs)和四环素类(TCs)共17种抗生素的污染特征,并评估了其生态风险.结果表明:①三座典型垃圾填埋场中,LCMs类抗生素的平均检出率达70.83%,高于其他三类抗生素,其中林可霉素(LIN)、克林霉素(CLIN)和磺胺嘧啶(SDZ)的平均检出率相对较高,分别达83.33%、58.33%和58.33%.②同一座垃圾填埋场渗滤液样品和周边地下水样品中检出的抗生素种类和总浓度都具有高度的一致性;渗滤液样品中检出浓度相对较高的抗生素为LIN(1495.80~10648.80 ng/L)、SDZ(1473.07~5910.07 ng/L)和磺胺二甲基异嘧啶(SIM,518.67~1807.73 ng/L);周边地下水样品中检出浓度相对较高的抗生素为SIM(ND~58.10 ng/L)、磺胺喹恶啉(SQX,ND~17.77 ng/L)、西诺沙星(CNX,ND~27.71 ng/L)和CLIN(ND~18.11 ng/L).③QNs类抗生素的生态风险水平较其他三类抗生素要高,且具有较高生态风险水平的抗生素为磺胺吡啶(SPD)、SDZ、磺胺噻唑(STZ)、氧氟沙星(OFL)、加替沙星(GTFX)、CNX和LIN.研究显示,三座垃圾填埋场中部分抗生素均通过固体垃圾和渗滤液迁移扩散至周边地下水中,其带来的污染和生态风险需引起我们的重视.

关键词：垃圾填埋场渗滤液地下水抗生素生态风险

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基于突发词聚类的微博突发事件检测方法

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计算机应用 2014年第2期34卷 486-490,505页

作者：郭跇秀吕学强李卓网络文化与数字传播北京市重点实验室(北京信息科技大学) 北京100101

微博突发事件检测是网络舆情分析的重要分支,近年来已受到国内外学者的广泛关注。分析用户行为特征,提出一种用户影响力计算方法,并将其与微博文本特征、传播特征相结合,提出词语突发度概念作为突发词的判定标准,进而抽取突发词集;引入... 详细信息

微博突发事件检测是网络舆情分析的重要分支,近年来已受到国内外学者的广泛关注。分析用户行为特征,提出一种用户影响力计算方法,并将其与微博文本特征、传播特征相结合,提出词语突发度概念作为突发词的判定标准,进而抽取突发词集;引入凝聚式层次聚类算法,对突发词集进行聚类,并筛选出合适的突发词类簇用以描述突发事件,从而实现微博突发事件检测。通过实验检测,结果是正确率为63.64%,召回率为87.5%,F值为0.74,表明该方法可以在大量微博数据中有效检测到突发事件。

关键词：突发事件用户影响力突发词聚类

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