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DEXH-Box protein DHX30 is required for optimal function of the zinc-finger antiviral protein

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Protein & Cell 2010年第10期1卷 956-964页

作者： Peiying Ye Shufeng Liu yiping zhu Guifang Chen Guangxia Gao Center for Infection and Immunity Institute of BiophysicsChinese Academy of SciencesBeijing 100101China Graduate School of Chinese Academy of Sciences Beijing 100039China

The zinc-finger antiviral protein(ZAP)is a host factor that specifically inhibits the replication of certain viruses by eliminating viral mRNAs in the cytoplasm.In previous studies,we demonstrated that ZAP directly binds to the viral mRNAs and recruits the RNA exosome to degrade the target RNA.In this article,we provide evidence that a DEXH box RNA helicase,DHX30,is required for optimal antiviral activity of ZAP.Pull-down and co-immunoprecipitation assays demonstrated that DHX30 and ZAP interacted with each other via their N terminal domains.Downregulation of DHX30 with shRNAs reduced ZAP’s antiviral activity.These data implicate that DHX30 is a cellular factor involved in the antiviral function of ZAP.

关键词： zinc-finger antiviral protein RNA helicase DHX30

A positive feedback regulatory loop involving the lncRNA PVT1 and HIF-1αin pancreatic cancer

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Journal of Molecular Cell Biology 2021年第9期13卷 676-689页

作者： yiping zhu Fang Wu Weiwei Gui Nan Zhang Erik Matro Linghua zhu Daniel Turunen Eserberg Xihua Lin Department of General Surgery Sir Run Run Shaw HospitalSchool of MedicineZhejiang UniversityHangzhouChina Department of Endocrinology Sir Run Run Shaw HospitalSchool of MedicineZhejiang UniversityHangzhouChina School of Medicine Zhejiang UniversityHangzhouChina Biomedical Research Center and Key Laboratory of Biotherapy of Zhejiang Province Sir Run Run Shaw HospitalZhejiang UniversityHangzhouChina

Extreme hypoxia is among the most prominent pathogenic features of pancreatic cancer(PC).Both the long non-coding RNA(lncRNA)plasmacytoma variant translocation 1(PVT1)and hypoxic inducible factor-1α(HIF-1α)are highly expressed in PC patients and play a crucial role in disease progression.Reciprocal regulation involving PVT1 and HIF-1αin PC,however,is poorly understood.Here,we report that PVT1 binds to the HIF-1αpromoter and activates its transcription.In addition,we found that PVT1 could bind to HIF-1αand increases HIF-1αpost-translationally.Our findings suggest that the PVTl-HIF-1αpositive feedback loop is a potential therapeutic target in the treatment of PC.

关键词： PVT1 HIF-1α pancreatic cancer feedforward regulatory loop

Ecological niche and in-situ control of MIB producers in source water

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Journal of Environmental Sciences 2021年第12期33卷 119-128页

作者： Ming Su MD.Suruzzaman yiping zhu Jinping Lu Jianwei Yu Yu Zhang Min Yang Key Laboratory of Drinking Water Science and Technology Research Center for Eco-Environmental SciencesChinese Academy of SciencesBeijing 100085China State Key Laboratory of Environmental Aquatic Chemistry Research Center for Eco-Environmental SciencesChinese Academy of SciencesBeijing 100085China Shanghai Chengtou Raw Water Co.Ltd. Shanghai 200125China University of Chinese Academy of Sciences Beijing 100049China

Odor problems in source water caused by 2-methylisoborneol(MIB) have been a common issue in China recently, posing a high risk to drinking water safety. The earthy-musty odorant MIB has an extremely low odor threshold(4–16 ng/L) and is hard to remove via conventional processes in drinking water plants(DWP), and therefore could easily provoke complaints from consumers. This compound is produced by a group of filamentous cyanobacteria, mainly belonging to Oscillatoriales. Different from the well-studied surface-blooming Microcystis, filamentous cyanobacteria have specific niche characteristics that allow them to stay at a subsurface or deep layer in the water column. The underwater bloom of these MIB producers is therefore passively determined by the underwater light availability, which is governed by the cell density of surface scum. This suggests that drinking water reservoirs with relatively low nutrient contents are not able to support surface blooms, but are a fairly good fit to the specialized ecological niche of filamentous cyanobacteria;this could explain the widespread odor problems in source water. At present, MIB is mainly treated in DWP using advanced treatment processes and/or activated carbon, but these post-treatment methods have high cost, and not able to deal with water containing high MIB concentrations.Thus, in situ control of MIB producers in source water is an effective complement and is desirable. Lowering the underwater light availability is a possible measure to control MIB producers according to their niche characteristics, which can be obtained by either changing the water level or other measures.

关键词： 2-methylisoborneol(MIB) Filamentous cyanobacteria Odor Control Source water

青浦区白鹤镇村级河道底泥重金属污染调查与分析

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水资源开发与管理 2024年第4期10卷 53-59页

作者：朱益萍上海市青浦区白鹤水务管理所上海201700

为分析青浦区白鹤镇村级河道底泥污染特征及对环境的危害程度,本文选取镇内36条村级河道对底泥进行定点采样和研究分析,并利用潜在生态风险指数法、Pearson相关性和R型聚类分析法对底泥重金属进行污染风险评价和来源探讨。结果表明,各... 详细信息

为分析青浦区白鹤镇村级河道底泥污染特征及对环境的危害程度,本文选取镇内36条村级河道对底泥进行定点采样和研究分析,并利用潜在生态风险指数法、Pearson相关性和R型聚类分析法对底泥重金属进行污染风险评价和来源探讨。结果表明,各种重金属潜在生态风险指数(Eir)均值大小依次为Hg>Cr>As>Cu>Ni>Pb>Cd>Zn;Pearson相关性和R型聚类分析表明,底泥中重金属Cu、Cd、Zn、Cr、Hg主要与农药或化肥使用有关,Pb和As主要与道路交通污染有关,Ni主要与工业生产有关。通过分析河道底泥污染特征,可为底泥妥善处置及河道精准治理提供数据支撑。

关键词：村级河道底泥重金属污染调查

我国公共数字文化服务政策主题变迁与文本量化研究

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图书馆建设 2024年第1期 74-86页

作者：朱益平金悦樊丽珍南昌大学公共政策与管理学院江西省图书馆

以我国1996—2021年中央出台的公共数字文化服务政策文本为研究对象,基于共词分析法和聚类分析法对政策文本的发展历程、主题变迁等进行系统分析与总结;利用内容分析法与Nvivo软件,从基本政策工具维度对样本政策进行量化分析,揭示公共... 详细信息

以我国1996—2021年中央出台的公共数字文化服务政策文本为研究对象,基于共词分析法和聚类分析法对政策文本的发展历程、主题变迁等进行系统分析与总结;利用内容分析法与Nvivo软件,从基本政策工具维度对样本政策进行量化分析,揭示公共数字文化服务体系发展的内在规律,结果表明:政策主题持续丰富且呈阶段性变迁,但总体呈现出领域分散、内容过度集中的特点。在政策执行过程中,供给型、环境型、需求型政策工具交叉综合应用,但供给型、需求型政策工具的使用率存在一定不足,具体政策工具种类的使用也存在明显差异。我国未来政策的发展应从以下方面着手:形成多主体长效合作机制,提升政策主体的协同效能;把握数字中国下新发展机遇,拓宽和深入政策主题的关注领域;加强政策工具的合理运用,保障动态平衡、协同发展的政策运行状态。

关键词：公共数字文化服务主题变迁政策工具

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B7-DC (PD-L2) costimulation of CD4^(+) T-helper 1 response via RGMb

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Cellular & Molecular Immunology 2018年第10期15卷 888-897页

作者： Xinxin Nie Wenni Chen Ying zhu Baozhu Huang Weiwei Yu Zhanshuai Wu Sizheng Guo yiping zhu Liqun Luo Shengdian Wang Lieping Chen Laboratory of Immunotherapy Sun Yat-sen UniversityGuangzhouGuangdongChina Institute of Biophysics Chinese Academy of SciencesBeijingChina Department of Immunobiology Yale UniversityNew HavenCTUSA

The role of B7-DC in T-cell responses remains controversial because both coinhibitory and costimulatory functions have been reported in various experimental systems in vitro and in vivo.In addition to interacting with the coinhibitory receptor PD-1,B7-DC has also been shown to bind repulsive guidance molecule b(RGMb).The functional consequences of the B7-DC/RGMb interaction,however,remain unclear.More than a decade ago,we reported that replacement of a murine B7-DC mutant lysine with serine(K113S)at positive 113 resulted in a loss of binding capacity to PD-1.Nevertheless,K113S remained costimulatory for T cells in vitro,implicating a dual functionality for B7-DC in T-cell responses.Here we show that recombinant K113S protein interacts with RGMb with a similar affinity to wild-type B7-DC.More importantly,K113S costimulates CD4^(+)T-cell responses via RGMb and promotes Th1 polarization.RGMb is expressed on the surface of naive mouse T cells,macrophages,neutrophils and dendritic cells.Finally,K113S/RGMb costimulation suppresses Th2-mediated asthma and ameliorates small airway inflammation and lung pathology in an experimental mouse model.Our findings indicate that RGMb is a costimulatory receptor for B7-DC.These findings from the K113S variant provide not only a possible explanation for the B7-DC-triggered contradictory effects on T-cell responses,but also a novel approach to investigate the B7-DC/PD-1/RGMb axis.Recombinant K113S or its derivatives could potentially be developed as an agonist for RGMb to costimulate the Th1 response without triggering PD-1-mediated T-cell inhibition.

关键词： asthma B7-DC K113S RGMb Th1/Th2

基于改进YOLOv8s的大田甘蓝移栽状态检测算法

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智慧农业（中英文） 2024年第2期6卷 107-117页

作者：吴小燕郭威朱轶萍朱华吉吴华瑞广西大学计算机与电子信息学院广西南宁530000 国家农业信息化工程技术研究中心北京100097 北京市农林科学院信息技术研究中心北京100097 农业农村部数字乡村技术重点实验室北京100097 农业农村部农业信息技术重点实验室北京100097

[目的/意义]借助智能化识别及图像处理等技术来实现对移栽后蔬菜状态的识别和分析,将会极大提高识别效率。为了实现甘蓝大田移栽情况的实时监测和统计,提高甘蓝移栽后的成活率以及制定后续工作方案,减少人力和物力的浪费,研究一种自然... 详细信息

[目的/意义]借助智能化识别及图像处理等技术来实现对移栽后蔬菜状态的识别和分析,将会极大提高识别效率。为了实现甘蓝大田移栽情况的实时监测和统计,提高甘蓝移栽后的成活率以及制定后续工作方案,减少人力和物力的浪费,研究一种自然环境下高效识别甘蓝移栽状态的算法。[方法]采集移栽后的甘蓝图像,利用数据增强方式对数据进行处理,输入YOLOv8s(You Only Look Once Version 8s)算法中进行识别,通过结合可变形卷积,提高算法特征提取和目标定位能力,捕获更多有用的目标信息,提高对目标的识别效果;通过嵌入多尺度注意力机制,降低背景因素干扰,增加算法对目标区域的关注,提高模型对不同尺寸的甘蓝的检测能力,降低漏检率;通过引入Focal-EIoU Loss(Focal Extended Intersection over Union Loss),优化算法定位精度,提高算法的收敛速度和定位精度。[结果和讨论]提出的算法经过测试,对甘蓝移栽状态的召回率R值和平均精度均值(Mean Average Precision,mAP)分别达到92.2%和96.2%,传输速率为146帧/s,可满足实际甘蓝移栽工作对移栽状态识别精度和速度的要求。[结论]提出的甘蓝移栽状态检测方法能够实现对甘蓝移栽状态识别的准确识别,可以提升移栽质量测量效率,减少时间和人力投入,提高大田移栽质量调查的自动化程度。

关键词：甘蓝移栽 YOLOv8s 目标检测多尺度注意力机制可变形卷积

基于改进UperNet的结球甘蓝叶球识别方法

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智慧农业（中英文） 2024年第3期6卷 128-137页

作者：朱轶萍吴华瑞郭旺吴小燕江苏大学计算机科学与通信工程学院江苏镇江212013 国家农业信息化工程技术研究中心北京100097 北京市农林科学院信息技术研究中心北京100097 农业农村部数字乡村技术重点实验室北京100097

[目的/意义]叶球是结球甘蓝的重要部分,其生长发育对田间管理至关重要。针对叶球分割识别存在大田背景复杂、光照不均匀和叶片纹理相似等问题,提出一种语义分割算法UperNet-ESA,旨在能快速、准确地分割田间场景中结球甘蓝的外叶和叶球,... 详细信息

[目的/意义]叶球是结球甘蓝的重要部分,其生长发育对田间管理至关重要。针对叶球分割识别存在大田背景复杂、光照不均匀和叶片纹理相似等问题,提出一种语义分割算法UperNet-ESA,旨在能快速、准确地分割田间场景中结球甘蓝的外叶和叶球,以实现田间结球甘蓝的智能化管理。[方法]首先,采用统一感知解析网络(Unified Perceptual Parsing Network,UperNet)作为高效语义分割框架,将主干网络改为先进的ConvNeXt,使得模型在提升分割精度的同时也能具有较低的模型复杂度;其次,利用高效通道注意力机制(Efficient Channel Attention,ECA)融入特征提取网络的各阶段,进一步捕捉图像的细节信息;最后,通过将特征选择模块(Feature Selection Model,FSM)和特征对齐模块(Feature Alignment Model,FAM)集成到特征金字塔框架中,得到更为精确的目标边界预测结果。[结果和讨论]在自制结球甘蓝图像数据集上进行实验,与目前主流的UNet、PSPNet和DeeplabV3+语义分割模型相比,改进UperNet方法的平均交并比为92.45%,平均像素准确率为94.32%,推理速度为16.6 f/s,能够达到最佳精度-速度平衡效果。[结论]研究成果可为结球甘蓝生长智能化监测提供理论参考,对甘蓝产业发展具有重要的应用前景。

关键词：结球甘蓝语义分割叶球识别注意力机制特征选择特征对齐

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遥感技术在阿根廷西北部米纳皮基塔斯地区斑岩型铜金矿找矿调查中的应用

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地质通报 2024年第4期43卷 582-593页

作者：李汉武赵宇浩方针郑璐朱意萍中国地质调查局南京地质调查中心江苏南京210016 阿根廷汉纳克矿业公司阿根廷胡胡伊Y4643

阿根廷西北部的铜金多金属成矿带是南美安第斯成矿带的主要组成部分。该成矿带主要发育斑岩型铜金矿,是阿根廷最主要的铜金多金属矿产资源分布区,但该区交通差、地形地质构造复杂、岩性多样,极大地影响了地质找矿的进展。以阿根廷西北... 详细信息

阿根廷西北部的铜金多金属成矿带是南美安第斯成矿带的主要组成部分。该成矿带主要发育斑岩型铜金矿,是阿根廷最主要的铜金多金属矿产资源分布区,但该区交通差、地形地质构造复杂、岩性多样,极大地影响了地质找矿的进展。以阿根廷西北部胡胡伊省的米纳皮基塔斯地区为研究区,以ETM+卫星影像为数据源,进行环形构造、菱形构造、深大断裂和破碎带的遥感解译;基于Aster遥感影像数据开展了成像光谱法和主成分分析法矿化蚀变异常信息提取分析。结果显示,铝羟基类蚀变矿物组合和铁染蚀变矿物异常区与主要控矿构造较一致,通过分析认为该区域成矿条件优越。在此基础上,结合斑岩型矿床成矿地质条件等资料,建立该地区遥感地质找矿模型,划分出了重要找矿远景区。该方法具有良好的找矿效果,对阿根廷西北部地区的找矿调查工作具有重要指导作用。

关键词：阿根廷 ETM+ Aster 蚀变异常信息提取斑岩型铜金矿