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Subcutaneous and intramuscular fat transcriptomes show large differences in network organization and associations with adipose traits in pigs

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Science China(Life Sciences) 2021年第10期64卷 1732-1746页

作者： Yifeng Zhang yingchun sun Zhongzi Wu Xinwei Xiong Junjie Zhang Junwu Ma Shijun Xiao Lusheng Huang Bin Yang State Key Laboratory of Pig Genetic Improvement and Production Technology Jiangxi Agricultural UniversityNanchang 330045China

Subcutaneous fat(SCF)and intramuscular fat(IMF)deposition is relevant to health in humans,as well as meat production and quality in *** this study,we generated RNA sequence data for 122 SCF,120 IMF,and 87 longissimus dorsi muscle(LDM)samples using 155 F6 pigs from a specially designed heterogeneous population generated by intercrossing four highly selected European commercial breeds and four indigenous Chinese pig *** phenotypes including waist back fat thickness and intramuscular fat content were also measured in the 155 F6 *** found that the genes in SCF and IMF differed largely in both expression levels and network connectivity,and highlighted network modules that exhibited strongest gain of connectivity in SCF and IMF,containing genes that were associated with the immune process and DNA double-strand repair,*** identified 215 SCF genes related to kinase inhibitor activity,mitochondrial fission,and angiogenesis,and 90 IMF genes related to lipolysis and fat cell differentiation,displayed a tissue-specific association with back fat thickness and IMF content,*** found that cis-expression QTL for trait-associated genes in the two adipose tissues tended to have tissuedependent predictability for the two adipose *** splicing of genes was also found to be associated with SCF or IMF deposition,but the association was much less extensive than that based on expression *** study provides a better understanding of SCF and IMF gene transcription and network organization and identified critical genes and network modules that displayed tissue-specific associations with subcutaneous and intramuscular fat *** features are helpful for designing breeding programs to genetically improve the two adipose traits in a balanced way.

关键词： pig transcriptome subcutaneous fat intramuscular fat network gene connectivity gene splicing

Construction of a transposase accessible chromatin landscape reveals chromatin state of repeat elements and potential causal variant for complex traits in pigs

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Journal of Animal Science and Biotechnology 2023年第2期14卷 529-545页

作者： Tao Jiang Ziqi Ling Zhimin Zhou Xiaoyun Chen Liqing Chen Sha Liu yingchun sun Jiawen Yang Bin Yang Jianzhen Huang Lusheng Huang State Key Laboratory of Pig Genetic Improvement and Production Technology Jiangxi Agricultural UniversityNanchang 330045China

Background:A comprehensive landscape of chromatin states for multiple mammalian tissues is essential for elucidating the molecular mechanism underlying regulatory variants on complex ***,the genome-wide chromatin accessibility has been only reported in limited tissue types in ***:Here we report a genome-wide landscape of chromatin accessibility of 20 tissues in two female pigs at ages of 6 months using ATAC-seq,and identified 557,273 merged peaks,which greatly expanded the pig regulatory ele-ment *** revealed tissue-specific regulatory elements which were associated with tissue-relevant biologi-cal *** identified both positive and negative significant correlations between the regulatory elements and gene transcripts,which showed distinct distributions in terms of their strength and distances from corresponding *** investigated the presence of transposable elements(TEs)in open chromatin regions across all tissues,these included identifications of porcine endogenous retroviruses(PERVs)exhibiting high accessibility in liver and homology of porcine specific virus sequences to universally accessible transposable ***,we prior-itized a potential causal variant for polyunsaturated fatty acid in the ***:Our data provides a novel multi-tissues accessible chromatin landscape that serve as an important resource for interpreting regulatory sequences in tissue-specific and conserved biological functions,as well as regula-tory variants of loci associated with complex traits in pigs.

关键词： Chromatin accessibility Pig Tissue specific Transcriptome Transposable elements

Whole-genome sequence-based association study for immune cells in an eight-breed pig heterogeneous population

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Journal of Genetics and Genomics 2022年第11期49卷 1068-1071页

作者： Qing Zhang Jing Li Yifeng Zhang Huanfa Gong Zhimin Zhou Wenwu Xu Zhongzi Wu yingchun sun Tao Jiang Ziqi Ling Shijun Xiao Lusheng Huang Bin Yang State Key Laboratory for Swine Genetic Improvement and Production Technology College of Animal Science and TechnologyJiangxi Agricultural UniversityNanchangJiangxi 330045China

Pigs are an important domestic animal for meat production and animal models for biomedical research such as research on infectious diseases(Meurens et al.,2012).Immune cells,including T cells,B cells,monocytes,and macrophages,are among the major indicators of immune status in health and *** the genetic basis of immune cell phenotypes would be helpful for improving the immunity of pigs genetically and reducing the disease occurrence,antibiotic usage.

关键词： Whole immunity breed

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逆全球化趋向下的文化安全与文化治理

浙江学刊 2021年第5期 32-40页

作者：孙英春中国传媒大学政府与公共事务学院北京100024

逆全球化使全球文化融合与多样性并存的历史进程面临重大挑战,决定了文化安全诉求的紧迫性,以及文化安全与文化治理议题之间更密切的关联。对广大非西方国家和霸权国家之外的一些西方国家而言,有必要确立"多层文化治理"的系统性认知框... 详细信息

逆全球化使全球文化融合与多样性并存的历史进程面临重大挑战,决定了文化安全诉求的紧迫性,以及文化安全与文化治理议题之间更密切的关联。对广大非西方国家和霸权国家之外的一些西方国家而言,有必要确立"多层文化治理"的系统性认知框架和实践定位,用以审视、把握本土、区域和全球社会各层次文化实践的复杂性和关联性,以及各层次文化事务的勾连互动,发挥全球文化的整体系统以及各"子系统"之间复杂互动的"系统效应",借助全球、区域治理推进本土文化治理,依托本土、区域治理深化全球文化治理。基于"多层文化治理"框架,各国应积极发展走向"多层善治"的治理观念、策略、机制和能力,协同配置各层次的文化资源和使用方式,携手重建能够在各层次上协调彼此权益的竞争合作关系,通过集体努力使全球化归入正轨。

关键词：逆全球化文化安全文化治理多层文化治理 “多层善治”

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论全球性与人类公共伦理

浙江学刊 2023年第2期 33-40页

作者：孙英春中国传媒大学政府与公共事务学院北京100024

全球场域“双重结构”中的人类交往,凸显多元行为体的相互建构、共同演化以及共同走向“类的共同体”的世界历史进程。全球性是这一进程的产物,核心特征是重视人类本位以及人类交往的“非中心化”。开启人类公共伦理讨论,指向的是构建... 详细信息

全球场域“双重结构”中的人类交往,凸显多元行为体的相互建构、共同演化以及共同走向“类的共同体”的世界历史进程。全球性是这一进程的产物,核心特征是重视人类本位以及人类交往的“非中心化”。开启人类公共伦理讨论,指向的是构建基于全球性的公共性伦理框架,维护全球场域的公共性和多元行为体的合作共存,发展彼此承认、承诺的伦理原则、道德规范和集体行动策略。因全球性彰显的“类本质”,全球治理成为推动人类关系“再造”以及人类主体重构的“人类治理”,构建人类公共伦理并推动伦理内化则是全球治理的主要内容以及人类关系重建的组成部分。

关键词：全球性人类公共伦理全球场域人类治理伦理内化

国际社会化与“人类共同体”:走向“多向互动”的合作机制

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浙江学刊 2019年第3期 14-21页

作者：孙英春中国传媒大学国际关系研究所教授博士生导师北京100024

国际行为体以国际规范为中介深入国际社会化的进程,限制、塑造着每一行为体的路径选择,也预制了"人类共同体"作为国际行为体集体走向"共同命运""相互依存"的远景。"人类共同体"也是国际行为体建构、分享共同身份的"社会关系集合",为各... 详细信息

国际行为体以国际规范为中介深入国际社会化的进程,限制、塑造着每一行为体的路径选择,也预制了"人类共同体"作为国际行为体集体走向"共同命运""相互依存"的远景。"人类共同体"也是国际行为体建构、分享共同身份的"社会关系集合",为各行为体的社会化提供了大致相同的框架、目标和路径。当前国际行为体的相互建构、整体联动呈现出不同于"单向社会化"的"多向互动"机制,行为体应据此看待自身与外部社会结构的关系,为寻求最佳权益、改进人类互动提供恰当的观念与策略。

关键词：国际社会化国际规范 “人类共同体” “多向互动”

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澳大利亚整体政府信息化治理

中国行政管理 2014年第9期 112-118页

作者：孙迎春国家行政学院译审管理学博士北京100089

为了突破新公共管理改革带来的管理碎片化和政府空心化困境,发达国家整体政府建设的显著特征就是以跨部门协同的方式应对社会突发性和复杂性问题。尽管行政改革确实能部分地解决部门间的利益冲突、职能重叠和各自为政等问题,但从整体治... 详细信息

为了突破新公共管理改革带来的管理碎片化和政府空心化困境,发达国家整体政府建设的显著特征就是以跨部门协同的方式应对社会突发性和复杂性问题。尽管行政改革确实能部分地解决部门间的利益冲突、职能重叠和各自为政等问题,但从整体治理实践活动的各个环节来看,忽视跨部门信息共享与协同,很难达到整体性治理模式的预期目标,因为整体治理需要依赖信息网络技术搭建政府管理服务平台、改善政府内部的业务流程。本文利用澳大利亚鲜活的实践案例,系统梳理整体政府信息化治理的发展背景、体制结构和运行机制,借以为中国推行国家治理和提高政府治理能力提供及时有效的工具参考和借鉴。

关键词：跨部门协同信息化治理整体政府澳大利亚

中国文化现代化的三个维度:民族本源、地区基础、全球视野

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国际观察 2007年第5期 8-14页

作者：孙英春中国传媒大学国际传播学院

作为观察和思考中国文化现代化路径的三个维度,民族本源、地区基础和全球视野呈现了民族文化现代化的国内国际发展的层次与过程,以及全球社会中文化分化与整合的逻辑。民族本源强调的是本地文化传统之于现代化的现实意义;地区基础针对... 详细信息

作为观察和思考中国文化现代化路径的三个维度,民族本源、地区基础和全球视野呈现了民族文化现代化的国内国际发展的层次与过程,以及全球社会中文化分化与整合的逻辑。民族本源强调的是本地文化传统之于现代化的现实意义;地区基础针对的是基于共同利益,强化区域文化认同,促进地区内部的文化合作和文化共同体建设;全球视野的维度立足于文化开放时代,面对的是在全球社会中开展文化对话,以"和谐"观念推进全球伦理建设的远景目标。

关键词：中国文化现代化文化传统文化认同全球伦理

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英国政府服务标准化实践与启示

中国行政管理 2017年第2期 137-142页

作者：孙迎春国家行政学院国际行政院校联合会科学委员暨领导力与公共部门治理工作组联席组长北京100089

在现代政府的建设与发展中,无论是理论发展还是实践探索,英国政府一直都走在世界前沿,引领着国际公共行政发展方向和政府现代化改革潮流。在这一过程中,作为制度建设和机制创新的基石和动力,政府服务标准化建设起到了非常重要的推促作用... 详细信息

在现代政府的建设与发展中,无论是理论发展还是实践探索,英国政府一直都走在世界前沿,引领着国际公共行政发展方向和政府现代化改革潮流。在这一过程中,作为制度建设和机制创新的基石和动力,政府服务标准化建设起到了非常重要的推促作用,从强调政府责任到市场竞争,从关注服务质量到服务协同,充分彰显出"制度先于改革并进一步推促和保障改革"的英国特色,也为中国政府服务标准化建设提供了非常有价值的借鉴。

关键词：标准化政府服务现代化改革英国