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PIEZO1影响HaCaT细胞的趋电性迁移

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生物化学与生物物理进展 2024年第3期51卷 673-684页

作者：张桂诚龚鹏王一凡赵三军云南师范大学生命科学学院昆明650500

目的伤口中心产生的内源性电场是指导细胞定向迁移促进伤口愈合的重要因子。PIEZO1是机械门控阳离子通道家族成员之一,它参与细胞迁移,影响细胞的趋化迁移,并且受到电压的调节,在伤口愈合过程中发挥重要作用。但PIEZO1是否参与影响电场... 详细信息

目的伤口中心产生的内源性电场是指导细胞定向迁移促进伤口愈合的重要因子。PIEZO1是机械门控阳离子通道家族成员之一,它参与细胞迁移,影响细胞的趋化迁移,并且受到电压的调节,在伤口愈合过程中发挥重要作用。但PIEZO1是否参与影响电场指导的细胞定向迁移过程尚不清晰,本文以HaCaT细胞为模型探讨PIEZO1及其下游相关蛋白质对细胞趋电性迁移的影响。方法应用活细胞工作站追踪HaCaT细胞在微直流电场中的迁移,使用抑制剂及RNAi技术调控PIEZO1功能和表达,研究PIEZO1对于细胞趋电性迁移的影响;用蛋白质印迹(Western blot)检验细胞的整合素(integrin)β1与FAK磷酸化水平在电场作用下的变化情况,探讨PIEZO1与integrinβ1及FAK等对电场信号的响应及细胞趋电性迁移的影响。结果PIEZO1广谱抑制剂钌红、GsMTx4和RNAi处理显著抑制了HaCaT细胞向正极趋电性迁移的能力;电场和GsMTx4单独作用升高FAK磷酸化和integrinβ1表达,GsMTx4阻止电场进一步升高FAK的磷酸化水平和integrinβ1表达;siRNA干扰PIEZO1表达后显著下调FAK的磷酸化水平,并且电场对FAK磷酸化和integrinβ1表达的促进作用受到抑制;Integrinβ1和FAK的抑制剂使HaCaT细胞的趋电性迁移能力均显著降低。结论PIEZO1参与HaCaT细胞的趋电性迁移,是影响HaCaT细胞趋电性迁移的重要分子之一;抑制integrinβ1和FAK会影响HaCaT细胞的电性迁移;电场信号可能通过PIEZO1介导的信号通路调控integrinβ1的表达和FAK的活化进而影响细胞趋电性迁移。

关键词：电场趋电性细胞迁移 HaCaT细胞 PIEZO1 整合素β1 FAK

植被覆盖度增加对辽宁地区气温变化的影响研究

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大气科学 2024年第2期48卷 463-479页

作者：易雪李得勤杨森李涛公颖潘晓崔锦中国气象局沈阳大气环境研究所沈阳110166 东北冷涡研究重点开放实验室沈阳110166 西安财经大学统计学院西安710010

植被覆盖度(Fractional Vegetation Coverage,简称FVC)是陆面参数中重要的参数之一,植被覆盖度变化直接影响地表能量的再分配进而影响区域乃至全球气候变化,研究植被覆盖度增加对区域气候的影响对未来区域气候变化的预估具有重要意义,... 详细信息

植被覆盖度(Fractional Vegetation Coverage,简称FVC)是陆面参数中重要的参数之一,植被覆盖度变化直接影响地表能量的再分配进而影响区域乃至全球气候变化,研究植被覆盖度增加对区域气候的影响对未来区域气候变化的预估具有重要意义,这对适应和缓解全球气候变暖至关重要。本文利用2001~2018年中分辨率成像光谱仪(MODIS)产品的植被归一化指数(Normalized Difference Vegetation Index,简称NDVI)数据制作植被覆盖度,在辽宁地区分别进行了WRF模式默认植被覆盖度和实际植被覆盖度的长时间(2001~2018年)模式模拟试验,结论如下:(1)辽宁地区因植被覆盖度增加全省年平均气温降低了0.48℃,其中夏季降温幅度最大,降温0.71℃,春、秋两季平均降温0.35℃和0.66℃,冬季降温幅度最小0.2℃。植被覆盖度增加对日最高、最低气温也有明显的降温作用,其中日最低气温对植被覆盖度增加的响应大于最高气温,且植被覆盖度增加与气温降温的空间分布具有较好一致性。(2)2001~2018年年均和四季植被覆盖度的显著增加对年均和四季平均气温、日最高气温、日最低气温均有降温趋势,尤其是对日最低气温降温作用更明显。(3)植被覆盖度增加导致气温降低的主要原因是由于蒸散发的增加导致潜热通量增加,感热通量减少;而对于日最低气温降低,主要是由于植被覆盖度增加导致地表温度降低进而引起夜间向上长波辐射减少。总体而言,植被覆盖度增加越多降温效果越明显,进而减缓辽宁省气候变暖。

关键词：植被覆盖度气温 WRF 模式辽宁

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西瓜ClPP2C3克隆及表达分析

生物技术通报 2024年第1期40卷 243-249页

作者：朱毅柳唐镜宫国义张洁王晋芳张海英中国农业大学园艺学院北京100193 北京市农林科学院蔬菜研究所北京100097 广西壮族自治区农业科学院园艺研究所南宁530007

【目的】蛋白磷酸酶2C(protein phosphatase 2C,PP2C)是动植物中均存在的一类蛋白磷酸酶,拟探究其在西瓜果实成熟过程中发挥的重要作用。【方法】通过逆转录PCR(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)从栽培类型西瓜... 详细信息

【目的】蛋白磷酸酶2C(protein phosphatase 2C,PP2C)是动植物中均存在的一类蛋白磷酸酶,拟探究其在西瓜果实成熟过程中发挥的重要作用。【方法】通过逆转录PCR(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)从栽培类型西瓜‘97103’中克隆ClPP2C3,并对其进行生物信息学、表达模式和亚细胞定位分析。【结果】西瓜ClPP2C3的cDNA序列长度为1317 bp,编码438个氨基酸,其分子量大小为47.81 kD,蛋白质等电点为5.12。ClPP2C3包含1个PP2C保守结构域,与负调控果实成熟的番茄SlPP2C3、草莓FaABI1具有较高的同源性。西瓜ClPP2C3在细胞核表达。ClPP2C3在含糖量高的栽培品种中表达量显著高于含糖量低的野生品种。栽培品种ClPP2C3的2kb片段长度启动子活性显著高于野生品种,而1kb片段长度启动子活性之间无显著差异。【结论】由1-2kb区间SNP导致的启动子活性差异对不同含糖量品种ClPP2C3表达量存在影响。

关键词：西瓜 ClPP2C3 基因克隆亚细胞定位启动子活性差异分析

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地下水环境智慧监管技术集成与平台应用研究

中国环境监测 2024年第1期40卷 45-52页

作者：易树平方铖刘君全龚曼妮周兰兰邓易南方科技大学广东深圳518055 国家环境保护流域地表水-地下水污染综合防治重点实验室广东深圳518055 浙江省台州生态环境监测中心浙江台州318000 深圳市南科环保科技有限公司广东深圳518055 重庆邮电大学重庆400065

针对“双源”地下水(地下水污染源和集中式地下水型饮用水源)环境监管需求,研发了一套集地下水污染在线监测预警、评价溯源、预测应急于一体的可视化技术集成与应用平台。该平台将物联网、地下水数值模拟、大数据、云计算等技术集成应... 详细信息

针对“双源”地下水(地下水污染源和集中式地下水型饮用水源)环境监管需求,研发了一套集地下水污染在线监测预警、评价溯源、预测应急于一体的可视化技术集成与应用平台。该平台将物联网、地下水数值模拟、大数据、云计算等技术集成应用于环境监管,实现了工业园区地下水环境实时动态监测评价及预警、地下水污染路径溯源计算、地下水事故污染预测及应急支撑等网络服务与计算功能,并通过地下空间三维数字化处理,构建了“所见即所得”的三维虚拟现实界面,实现了对地下水环境的便捷、高效监管与决策。该平台兼容手机、平板电脑、台式计算机等固定和移动设备,可为“双源”地下水污染监控、管理和应急提供实时、高效的科技支撑。

关键词：地下水环境在线监测溯源计算预测预警可视化监管智慧环保

肝细胞癌相关的核编码线粒体基因及临床信息的综合预后模型

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上海交通大学学报（医学版） 2024年第1期44卷 1-12页

作者：克德尔亚·艾山江傅怡赖冬林邬海龙龚伟上海交通大学医学院附属新华医院普外科上海200092 上海健康医学院协同科研中心上海201318 南昌大学江西医学院第一附属医院南昌330006 上海健康医学院药学院上海201318 上海市胆道疾病研究重点实验室上海交通大学医学院胆道疾病研究所上海市胆道疾病研究中心上海200092

目的·建立一个基于线粒体基因和临床信息的肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)总生存率(overall survival,OS)的预后模型。方法·从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)下载369例HCC患者和50例肝脏正常对照的基因表达... 详细信息

目的·建立一个基于线粒体基因和临床信息的肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)总生存率(overall survival,OS)的预后模型。方法·从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)下载369例HCC患者和50例肝脏正常对照的基因表达谱和临床数据。核编码的线粒体基因(nuclear encoded mitochondrial gene,NEMG)从MitoCarta3.0数据库获得。使用“DEseq2”R包和单变量Cox分析选择与HCC患者OS相关并参与氧化磷酸化、三羧酸循环和细胞凋亡通路的NEMG[(泛素细胞色素C还原酶铰链蛋白(ubiquinol cytochrome C reductase hinge protein,UQCRH)、腺苷三磷酸柠檬酸裂解酶(ATP citrate lyase,ACLY)、磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶2(phosphoenolpyruvate carboxykinase 2,PCK2)、Bcl-2同源拮抗剂1(Bcl-2 homologous antagonist/killer 1,BAK1)、Bcl-2相关X蛋白(Bcl-2-associated X protein,BAX)和Bcl-2/腺病毒E1B相互作用蛋白3样(Bcl-2/adenovirus E1B interacting protein 3-like,BNIP3L)]。应用多变量Cox回归来确定HCC OS的独立危险因素。建立一个基于独立危险因素(6个NEMG风险特征和TNM分期)的综合预后模型和预后列线图,计算中位预后评分。以中位预后评分作为分界点,将HCC患者分为高风险组和低风险组。进行Kaplan-Meier生存曲线分析,并进行对数秩检验来评估低风险组和高风险组患者OS的差异。使用“timeROC”软件包计算受试者操作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线下面积(area under the curve,AUC)。用基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)下载HCC队列(GSE14520)验证综合预后模型对1、3、5年OS的预测性能。通过实时荧光定量聚合酶链反应(real-time quantitative polymerase chain reaction,qPCR)在来自上海交通大学医学院附属新华医院的34例HCC临床样本中验证6-NEMG的相对表达水平。结果·ROC分析结果显示,与仅6-NEMG风险特征(1、3、5年AUC分别为0.77、0.66、0.65)或仅TNM分期(1、3、5年AUC分别为0.66、0.67、0.63)相比,该综合预后模型对1年(AUC,0.78)、3年(AUC,0.73)和5年(AUC,0.69)HCC OS显示出更好的预测性能。Kaplan-Meier生存曲线分析结果显示高风险组患者的OS明显比低风险组差(P=0.001)。此外,在GEO外部队列中发现该预后模型的预测性能较好(1、3、5年AUC分别为0.67、0.66、0.74),高、低风险组患者的预后差异有统计学意义(P=0.001),与TCGA数据的结果一致。在临床HCC队列中,与癌旁肝脏组织相比,除BNIP3L外,其他5个NEMG在肿瘤组织的表达水平上调或者下调。相关性分析显示,在GSE14520与临床HCC队列中预后评分与HCC肿瘤的大小和数量呈正相关。结论·构建并验证了一个将6-NEMG风险特征与TNM分期相结合的HCC预后预测模型。该模型可能有助于HCC患者的预后预测。

关键词：核编码线粒体基因肝细胞癌癌症基因组图谱(TCGA) 基因表达数据库(GEO) 总生存率

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基于长短期记忆网络的移动轨迹目的地预测

计算机工程与科学 2024年第3期46卷 525-534页

作者：晋广印赵旭俊龚艺璇太原科技大学计算机科学与技术学院山西太原030024

移动轨迹目的地预测是基于位置服务的重要一环,现有的预测方法存在历史轨迹不能完全覆盖所有可能的查询轨迹(数据稀疏)问题,没有考虑前缀轨迹点对预测结果的影响差异(长期依赖问题)。为了解决上述问题,提出了轨迹分布式表示方法。首先,... 详细信息

移动轨迹目的地预测是基于位置服务的重要一环,现有的预测方法存在历史轨迹不能完全覆盖所有可能的查询轨迹(数据稀疏)问题,没有考虑前缀轨迹点对预测结果的影响差异(长期依赖问题)。为了解决上述问题,提出了轨迹分布式表示方法。首先,将轨迹进行网格划分,把表示位置的高维独热码向量进行降维处理,生成包含地理拓扑关系的低维嵌入向量。其次,对目的地进行聚类,把聚类中心作为簇中轨迹的标签,缩小相似轨迹的差异,放大不相似轨迹的特征,有效克服了数据稀疏问题。在目的地预测中,将自注意力机制引入长短期记忆网络,提出了基于长短期记忆网络的目的地预测模型SATN-LSTM,挖掘序列中的关键点并根据其重要程度分配权重,较好地解决了长期依赖问题。最后,在真实轨迹数据集上进行了多次实验,验证了模型的有效性,并与现有的模型进行对比,验证了本模型具有更好的准确性。

关键词：目的地预测网格划分自注意力机制移动轨迹

中等断面隧道长进尺直孔掏槽爆破开挖与超欠挖控制现场试验

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爆破 2024年第2期41卷 32-39页

作者：龚伟毅姚颖康杜宇翔中铁十二局集团第一工程有限公司西安710038 江汉大学精细爆破国家重点实验室武汉430056 江汉大学湖北(武汉)爆炸与爆破技术研究院武汉430056

中等断面隧道受施工范围限制易导致爆破难度大,循环进尺短,超欠挖问题严重,长进尺开挖和超欠挖控制是降本增效的有效途径。基于某中等断面隧道工程设计了长进尺直孔掏槽爆破方案,进行了40个循环的爆破开挖现场试验,结果表明:(1)按照爆... 详细信息

中等断面隧道受施工范围限制易导致爆破难度大,循环进尺短,超欠挖问题严重,长进尺开挖和超欠挖控制是降本增效的有效途径。基于某中等断面隧道工程设计了长进尺直孔掏槽爆破方案,进行了40个循环的爆破开挖现场试验,结果表明:(1)按照爆破手册设计中等断面隧道开挖爆破参数,往往大块率高,掌子面不平整,适当增加直孔掏槽孔单孔装药量(现场试验掏槽药量占比由12.8%增至18.1%),可获得较好的爆破效果;(2)在初步设计参数基础上调整了中等断面隧道周边孔单孔装药量,线装药密度最终确定为0.27 kg/m,轮廓成形效果好,半孔率达90%以上,现场40个爆破循环超挖平均值为18.6 cm,分析可知超挖量主要由轮廓线处留置错台造成,在超挖控制方面,除了周边孔参数的合理设计外,应在钻孔施工过程中尽可能减小错台宽度,从而降低超挖;(3)直孔掏槽方案能很好地匹配凿岩台车钻孔施工,实现机械化长进尺爆破开挖,但超欠挖精细控制和爆破施工成本控制是重难点问题,需从钻孔人员操作技术和现场施工管理模式方面进行优化提升。研究成果可为中等断面隧道机械化钻爆施工、长进尺爆破开挖与超欠挖精细控制设计和施工提供参考依据。

关键词：中等断面隧道直孔掏槽长进尺开挖超欠挖控制精细爆破

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新型钢抛光液中磨料的种类及其性能研究进展

表面技术 2024年第3期53卷 88-100,122页

作者：陈倚张偲淼屈蔚然郑书佳孙一嘉弓爱君北京科技大学化学与生物工程学院北京100083 北京科技大学功能分子与晶态材料科学与应用北京市重点实验室北京100083

磨料在抛光液中主要起机械作用,磨料的理化性质,如硬度、粒径、浓度等,是影响化学机械抛光(Chemical Mechanical Polishing,CMP)性能的重要因素,对抛光效率有较大影响。针对我国抛光液对外依赖、需求量大,但精度等指标达不到市场要求等... 详细信息

磨料在抛光液中主要起机械作用,磨料的理化性质,如硬度、粒径、浓度等,是影响化学机械抛光(Chemical Mechanical Polishing,CMP)性能的重要因素,对抛光效率有较大影响。针对我国抛光液对外依赖、需求量大,但精度等指标达不到市场要求等问题,同时由于磨料在抛光液的抛光性能中起着至关重要的作用,因此寻求效果更好的改性磨料或新型磨料材料,以促进化学机械抛光技术的发展势在必行。故此,归纳汇总近年来国内外研制出的新型钢抛光液,聚焦于抛光液磨料这一重要组分中不同物质的物化性质及其作用,对抛光性能(如材料去除率、表面粗糙度和光泽度等)的影响等,分类别阐述了不同物质的优劣势、复配协同作用以及在现有抛光液中的效果,为之后抛光液配方研究中磨料的选择提供参考。归纳总结发现,混合与复合磨料较单一磨料有较大的提升,稀土掺杂、核/壳结构等改进存在较大的研究价值,组分间的复配协同作用对抛光性能的提升有一定作用。最后,基于目前钢抛光液应用中存在的问题以及现有的具有前景的技术,对钢抛光液中磨料的发展进行了展望。

关键词：化学机械抛光抛光液钢磨料抛光机理

Optical design of a novel near-infrared phase contrast imaging(NI-PCI)diagnostic on the HL-2A tokamak

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Plasma Science and Technology 2024年第3期26卷 31-37页

作者：徐皓龚少博余羿许敏兰涛王志斌石中兵聂林赵光义刘灏周艺轩袁子豪肖晨雨陈坚 Sino-French Institute of Nuclear Engineering and Technology Sun Yat-sen UniversityZhuhai 519082People's Republic of China Southwestern Institute of Physics Chengdu 610041People's Republic of China School of Nuclear Science and Technology University of Science and Technology of ChinaHefei 230026People's Republic of China

The optical design of near-infrared phase contrast imaging(NI-PCI)diagnosis on HL-2A is introduced in this paper.This scheme benefits from the great progress of near-infrared laser technology and is a broadening of traditional phase contrast technology.This diagnostic can work as a keen tool to measure plasma wavenumber spectra by inferring string-integrated plasma density fluctuations.Design of both the front optical path which is the path before the laser transmitting into the tokamak plasma and the rear optics which is the path after the laser passing through the plasma is detailed.The 1550 nm laser is chosen as the probe beam and highprecision optical components are designed to fit the laser beam,in which a phase plate with a 194-nm-deep silver groove is the key.Compared with the conventional 10.6μm laser-based PCI system on HL-2A,NI-PCI significantly overcomes the unwanted phase scintillation effect and promotes the measurement capability of high-wavenumber turbulence with an increased maximal measurable wavenumber from 15 cm^(-1)to 32.6 cm^(-1).

关键词： phase contrast imaging near infrared laser plasma laser diagnostic