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Developmental dynamics of the single nucleus regulatory landscape of pig hippocampus

Science China(Life Sciences) 2023年第11期66卷 2614-2628页

作者： Siyu Yang Dong Chen Lei Xie xiaoxiao Zou yanyuan xiao Lin Rao Tianxiong Yao Qing Zhang Liping Cai Fei Huang Bin Yang Lusheng Huang State Key Laboratory of Pig Genetic Improvement and Production Technology Jiangxi Agricultural UniversityNanchang 330045China

The hippocampus is a brain region associated with memory,learning and spatial navigation,its aging-related dysfunction is a common sign of Alzheimer’s *** is a good model for human neurodegenerative disease,but our understanding of the regulatory program of the pig hippocampus and its cross-species conservation in humans remains ***,we profiled chromatin accessibility in 33,409 high-quality nuclei and gene expression in 8,122 high-quality nuclei of the pig hippocampus at four postnatal *** identified 510,908 accessible chromatin regions(ACRs)in 12 major cell types,among which progenitor cells such as neuroblasts and oligodendrocyte progenitor cells showed a dynamic decrease from early to later developmental *** revealed significant enrichment of transposable elements in cell type-specific ACRs,particularly in *** identified oligodendrocytes as the most prominent cell type with the greatest number of genes that showed significant changes during the *** identified ACRs and key transcription factors underlying the trajectory of neurogenesis(such as POU3F3 and EGR1)and oligodendrocyte differentiation(RXRA and FOXO6).We examined 27 Alzheimer’s disease-related genes in our data and found that 15 showed cell type-specific activity(TREM2,RIN3 and CLU),and 15 genes displayed age-associated dynamic activity(BIN1,RABEP1 and APOE).We intersected our data with human genome-wide association study results to detect neurological disease-associated cell *** present study provides a single nucleusaccessible chromatin landscape of the pig hippocampus at different developmental stages and is helpful for the exploration of pigs as a biomedical model in human neurodegenerative diseases.

关键词： hippocampus pig chromatin accessibility gene expression nuclei accessible chromatin regions development

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Mapping and analysis of a spatiotemporal H3K27ac and gene expression spectrum in pigs

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Science China(Life Sciences) 2022年第8期65卷 1517-1534页

作者： Yaling Zhu Zhimin Zhou Tao Huang Zhen Zhang Wanbo Li Ziqi Ling Tao Jiang Jiawen Yang Siyu Yang yanyuan xiao Carole Charlier Michel Georges Bin Yang Lusheng Huang State Key Laboratory of Pig Genetic Improvement and Production Technology Jiangxi Agricultural UniversityNanchang 330045China Laboratory Animal Research Center School of Basic Medical SciencesAnhui Medical UniversityHefei 230032China Unit of Animal Genomics GIGA-Institute and Faculty of Veterinary MedicineUniversity of Liege4000 LiegeBelgium

The limited knowledge of genomic noncoding and regulatory regions has restricted our ability to decipher the genetic mechanisms underlying complex traits in pigs. In this study, we characterized the spatiotemporal landscape of putative enhancers and promoters and their target genes by combining H3K27ac-targeted Ch IP-Seq and RNA-Seq in fetal(prenatal days 74–75) and adult(postnatal days 132–150) tissues(brain, liver, heart, muscle and small intestine) sampled from Asian aboriginal Bama Xiang and European highly selected Large White pigs of both sexes. We identified 101,290 H3K27ac peaks, marking 18,521promoters and 82,769 enhancers, including peaks that were active across all tissues and developmental stages(which could indicate safe harbor locus for exogenous gene insertion) and tissue-and developmental stage-specific peaks(which regulate gene pathways matching tissue-and developmental stage-specific physiological functions). We found that H3K27ac and DNA methylation in the promoter region of the XIST gene may be involved in X chromosome inactivation and demonstrated the utility of the present resource for revealing the regulatory patterns of known causal genes and prioritizing candidate causal variants for complex traits in pigs. In addition, we identified an average of 1,124 super-enhancers per sample and found that they were more likely to show tissue-specific activity than ordinary peaks. We have developed a web browser to improve the accessibility of the results(http://***/pencode/?genome=sus Scr11).

关键词： H3K27ac ChIP-Seq RNA-Seq pig XIST complex traits

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Tumor angiogenesis and its clinical significance in pediatric malignant liver tumor

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World Journal of Gastroenterology 2005年第5期11卷 741-743页

作者： xiao-YiSun Zai-DeWu xiao-FengLiao Ji-yanyuan DepartmentofPediatricSurgery TongjiHospitalAffiliatedtoTongjiMedicalCollegeHuazhongUniversityofScienceandTechnologyWuhan430030HubeiProvinceChina

AIM: To investigate the expression of vascular endothelial growth factor (VEGF) and microvascular density (MVD) count in pediatric malignant liver tumor and their clinical significances. METHODS: Fourteen children with malignant liver tumors including seven hepatocellular carcinomas (HCCs), five hepatoblastomas, one malignant mesenchymoma and one rhabdomyosarcoma were studied. Twelve adult HCC samples served as control group. All samples were examined with streptavidin-biotin peroxidase (SP) immunohistochemical staining for VEGF expression and MVD count. RESULTS: VEGF positive expression in all pediatric malignant liver tumors was significantly higher than that in adult HCC (0.4971±0.14 vs0.4027±0.03, P0.05). All 7 children in HCC group died within 2 years, whereas the prognosis in pediatric non-HCC group was better, in which two patients survived more than 5 years. CONCLUSION: Children with malignant liver tumors, especially with HCC, may have extensive angiogenesis that induces a rapid tumor growth and leads to a poor prognosis.

关键词： Liver tumor Angiogenesis Vascular endothelial growth factor Microvascular density

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基于人力资本分布方差的中国国民经济生产函数研究

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经济学（季刊） 2012年第1期11卷 559-594页

作者：冯晓朱彦元杨茜同济大学经济与教育研究所同济大学经济与管理学院中国地质大学(武汉)经济与管理学院

由于存在劳动力剩余,用就业总量和反映人力资本积累规模的数量指标均难以有效解释中国经济增长。因此,本文用质量指标替代数量指标,选取全部就业人员中具有高中(含职业教育)至大学本科阶段学历者受教育水平的分布方差来测度人力资本,并... 详细信息

由于存在劳动力剩余,用就业总量和反映人力资本积累规模的数量指标均难以有效解释中国经济增长。因此,本文用质量指标替代数量指标,选取全部就业人员中具有高中(含职业教育)至大学本科阶段学历者受教育水平的分布方差来测度人力资本,并构建相应的国民经济生产函数,解释中国1997—2009年间的产出增长。研究结果表明:本文提出的方法是有效的,当前中国人力资本投资的边际产出效果高于实物资本投资,职业教育的边际产出贡献高于高等教育。

关键词：人力资本分布方差劳动力剩余经济增长

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德国企业在华投资特征研究和基于区位理论的前景展望

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德国研究 2008年第4期23卷 47-52+79页

作者：杨茜冯晓朱彦元同济大学经济与管理学院同济大学中德工程学院

随着中德经贸关系的发展,德国企业在华投资日益增加。本文根据区位理论和产业链理论,解释了对德企在华投资产生影响的关键因素,借助数学模型剖析了德企对华直接投资(FDI)的区位要求,进而展望了今后中德经济合作的可能和前景。

关键词：德国企业在华投资区位选择中德合作前景

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一类分数阶微分方程非分离边值问题的推广（英文）

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上海师范大学学报（自然科学版） 2019年第3期48卷 292-301页

作者：邢艳元肖华峰吕梁学院数学系山西吕梁033000 广州大学数学与信息科学学院广东广州510006

主要借助Banach不动点定理和Leray-Schauder度理论,考虑了一类分数阶微分方程非分离边值问题解的存在性和唯一性,并给出例子,推广了已有的结论。

关键词：分数阶微分方程 Leray-Schauder度不动点定理

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基于动态图纸的变电站二次回路仿真培训系统

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现代电力 2014年第5期31卷 90-94页

作者：苏晓冯可程延远王全贾筱莹中国南方电网有限责任公司超高压输电公司南宁局广西南宁530021 北京科东电力控制系统有限责任公司北京100192

介绍了一种动态化变电站二次设计图纸的二次回路仿真培训系统。该系统采用自动建模技术将CAD版的变电站二次设计图纸自动转化为动态仿真图纸,并与变电站一二次设备三维仿真系统一一对应,可在三维场景里对二次回路元件进行测量、操作,同... 详细信息

介绍了一种动态化变电站二次设计图纸的二次回路仿真培训系统。该系统采用自动建模技术将CAD版的变电站二次设计图纸自动转化为动态仿真图纸,并与变电站一二次设备三维仿真系统一一对应,可在三维场景里对二次回路元件进行测量、操作,同时,也可在仿真图纸界面看到对应的二次回路原理图、节点图等实时反映的元件状态变化。系统采用一种简单实用的二次回路计算方法可快速准确地计算变电站二次回路各节点电气量,为二次回路仿真测量、元件动作逻辑提供数据支持。该系统在南方电网超高压输变电公司南宁局投入使用,以500kV南宁变二次回路为仿真对象,实现了二次回路仿真。

关键词：二次回路仿真培训动态图纸快速建模

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Zinccopperite-A New Variety of Zinc-CopperIntermetallic Compounds Discovered in aPorphyry-Copper Deposit

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Acta Geologica Sinica(English Edition) 1998年第3期72卷 308-313页

作者： xiao Yuanfu SUN Yan LU Yan WEN Chunqi WANG Jiangzhen Department of Geology Chengdu Institute of Technology Shilidian Chengdu Sichuan 610059

: Zinccopperite (tentatively named) is a rare native alloy mineral discovered in quartz monzonite—porphyry in the Xifanping area, yanyuan County, Sichuan Province. It is a new variety of zinc—copper alloy mineral found for the first time in the porphyry-copper deposit in China. Its intergrown minerals are K—feldspar (mainly perthite), albite—oligoclase, quartz and biotite; and the associated minerals include pyrite and chalcopyrite. It is characterized by a golden reflection colour, being isotropic (isometric), with the grain size ranging from 10 to 50 μm, microhardness VHN10 = 190 kg/mm2, and reflectance RVM = 67.97%. Electron microprobe (Model JXA—733) analysis shows Cu = 59.15%–62.55% and Zn = 36.32%–39.85%. The crystallochemical formula is Cu6.27-7.0Zn4.0, simplified as Cu7Zn4.

关键词： zinccopperite native alloy mineral porphyry-copper deposit quartz monzonitic porphyry Xifanping yanyuan County

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甲基丙烯酸甲酯改性硅树脂制备金属防腐涂层

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武汉大学学报（理学版） 2018年第1期64卷 46-52页

作者：甘启茂廉艳媛杨伟光肖婷婷王莉张燕张晓宏黄荣华武汉大学动力与机械学院湖北武汉430072 浙江大学建筑工程学院浙江杭州310058 西安近现代化工研究所陕西西安710065

以三甲氧基硅烷（trimethoxysilane,TMOS）与甲基丙烯酸甲酯（methylmethacrylate,MMA）为原料,氯铂酸为催化剂进行硅氢加成得到产物MMA-TMOS,再与甲基三甲氧基硅烷和苯基三甲氧基硅烷进行水解、缩合制备甲基丙烯酸甲酯改性有机硅树脂（... 详细信息

以三甲氧基硅烷（trimethoxysilane,TMOS）与甲基丙烯酸甲酯（methylmethacrylate,MMA）为原料,氯铂酸为催化剂进行硅氢加成得到产物MMA-TMOS,再与甲基三甲氧基硅烷和苯基三甲氧基硅烷进行水解、缩合制备甲基丙烯酸甲酯改性有机硅树脂（MMA modifiedsiliconeresin,MMA-SR）;以甲基苯基二甲氧基硅烷进行水解、缩合制备硅油（siliconeoil,SO）.以石油醚作为溶剂,树脂与硅油按一定质量比,并加入一定量有机锡催化剂、双氨类偶联剂以及填料进行混合制成有机硅涂料,在马口铁表面形成保护涂层,采用DSC曲线、粘附性、邵尔A硬度、断裂弯曲半径、开路电压（OCV）和保护涂层的电化学阻抗谱（EIS）来评估涂层的耐热性,机械性能和耐腐蚀性.改性后的有机硅涂料各项性能明显提高,邵尔A硬度最高达60度,附着力1级,弯曲半径2.5mm;其热分解温度为338.6℃,略低于未改性涂料的341.5℃,基本保持了有机硅树脂的热稳定性;在3%NaCl溶液中浸泡4d,涂料开路电位相对于未改性涂料正移0.476V,电化学阻抗也提高了8.6×10~7Ω·cm^2,防腐蚀性能得到一定增强.

关键词：甲基丙烯酸甲酯改性有机硅树脂力学性能热稳定性防腐性能

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基于自动区域故障模式与后果分析法的配电网可靠性评估

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三峡大学学报（自然科学版） 2015年第2期37卷 55-58页

作者：李闫远刘会家肖隆恩曹静谢峰三峡大学电气与新能源学院湖北宜昌443002 宜昌市供电公司输电运检室湖北宜昌443002 宜昌市电力勘测设计院有限公司湖北宜昌443002

提出了一种基于配电块的简化网络可靠性FMEA算法.根据不同开关的功能,以自动开关装置为边界形成自动区域,将配电网络简化为只含开关、配电块及负荷的等效网络,每个自动区域仅含一个自动开关和若干个手动开关,由自动区域特性可知与该区... 详细信息

提出了一种基于配电块的简化网络可靠性FMEA算法.根据不同开关的功能,以自动开关装置为边界形成自动区域,将配电网络简化为只含开关、配电块及负荷的等效网络,每个自动区域仅含一个自动开关和若干个手动开关,由自动区域特性可知与该区域直接相连的所有支路的负荷点有相同的故障率,对于和自动区域直接相连的负荷而言,区域内元件故障对负荷点造成的故障停运时间相同.基于配电块的故障模式后果分析法,提出了形式化的简化配电网络可靠性评估算法.该算法只需一次枚举大大减少了重复枚举的数量,通过RBTS算例分析,证明了该方法的有效性.

关键词：配电块自动开关装置可靠性评估 FMEA算法遍历搜索

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