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Oxymatrine Inhibits Bocavirus MVC Replication, Reduces Viral Gene Expression and Decreases Apoptosis Induced by Viral Infection

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Virologica Sinica 2019年第1期34卷 78-87页

作者： yanqin ding Na Li Jinhan Sun Linran Zhang Jianhui Guo Xueqi Hao Yuning Sun Department of Biochemistry and Molecular Biology Key Laboratory of Fertility Preservation and Maintenance of Ministry of EducationSchool of Basic Medical ScienceNingxia Medical University School of Clinical Medicine Hainan Medical University Department of Respiratory and Critical Care General Hospital of Ningxia Medical UniversityNingxia Medical University

Oxymatrine(OMT), as the main active component of Sophoraflavescens, exhibits a variety of pharmacological properties,including anti-oxidative, anti-inflammatory, anti-tumor, and anti-viral activities, and currently is extensively employed to treat viral hepatitis; however, its effects on parvovirus infection have yet to be reported. In the present study, we investigated the effects of OMT on cell viability, virus DNA replication, viral gene expression, cell cycle, and apoptosis in Walter Reed canine cells/3873 D infected with minute virus of canines(MVC). OMT, at concentrations below 4 mmol/L(no cellular toxicity), was found to inhibit MVC DNA replication and reduce viral gene expression at both mRNA and protein levels, which was associated with the inhibition of cell cycle S-phase arrest in early-stage of MVC ***, OMT significantly increased cell viability, decreased MVC-infected cell apoptosis, and reduced the expression of activated caspase 3. Our results suggest that OMT has potential application in combating parvovirus infection.

关键词： Oxymatrine (OMT) Minute virus of canines (MVC) Infection Replication Apoptosis

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不同生长期核桃根际微生物群落特征

生态学杂志 2023年第9期42卷 2061-2071页

作者：程齐宁鑫乔旻航杜秉海马海林孙姗姗刘凯丁延芹山东农业大学生命科学学院山东泰安271018 山东省盐碱地植物-微生物联合修复工程技术研究中心山东泰安271018 山东省林业科学研究院济南250014

植物根系能够在复杂的土壤环境中招募对自身有益的微生物构建根际微生物群落。为了探明不同生长期核桃根际微生物群落的特征,本研究采集了核桃萌芽期、开花期和结果期的根际和非根际土壤样品,进行了高通量测序、差异物种分析、功能分析... 详细信息

植物根系能够在复杂的土壤环境中招募对自身有益的微生物构建根际微生物群落。为了探明不同生长期核桃根际微生物群落的特征,本研究采集了核桃萌芽期、开花期和结果期的根际和非根际土壤样品,进行了高通量测序、差异物种分析、功能分析和微生物生态网络相关性分析。结果表明:核桃根际在不同生长期的优势种群存在一定程度的差异,萌芽期相对丰度显著增加的菌属有芽孢杆菌属(Bacillus)和unclassified Fungi,开花期有unclassified Chloroplast、枝孢属(Cladosporium)、链格孢属(Alternaria)和无茎真菌属(Acaulium),结果期有unclassified Micrococcaceae、假单胞菌属(Pseudomonas)、链霉菌属(Streptomyces)、赤霉菌属(Gibberella)和被孢霉属(Mortierella);其中,芽孢杆菌属(3.0%)、unclassified Chloroplast(4.5%)、假单胞菌属(17.9%)分别为萌芽期、开花期和结果期主要有益菌属。同时,不同生长期的根际土壤细菌和真菌群落结构存在显著差异(P<0.05)。拓扑学特征表明,根际土壤中微生物生态网络相较于非根际土壤关联性更强、复杂程度更高;根际土壤细菌群落的网络复杂性在结果期最高,群落间的正相互作用在萌芽期最高,而真菌群落的网络复杂性在萌芽期最高,群落间的正相互作用在结果期最高。本研究为采集土壤样品,筛选核桃促生和生防有益功能菌提供了理论依据。

关键词：核桃生长期根际微生物高通量测序差异物种分析微生物生态网络

基因组关联分析地衣芽孢杆菌LCDD6对核桃苗的促生作用

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应用与环境生物学报 2022年第3期28卷 588-595页

作者：邴辉王仲康杜秉海马海林汪城墙陈安镜刘方春丁延芹山东农业大学生命科学学院泰安271018 山东省林业科学研究院济南250014 山东省盐碱地植物-微生物联合修复工程技术中心泰安271018

为挖掘地衣芽孢杆菌LCDD6的应用价值,将LCDD6基因组测序并进行初步分析;通过鉴定培养基检测菌株的促生功能;将LCDD6发酵液灌根处理核桃苗,60 d后测定核桃苗长势、核桃叶片的光合作用和植株系统抗性;利用Illumina Miseq高通量测序分析根... 详细信息

为挖掘地衣芽孢杆菌LCDD6的应用价值,将LCDD6基因组测序并进行初步分析;通过鉴定培养基检测菌株的促生功能;将LCDD6发酵液灌根处理核桃苗,60 d后测定核桃苗长势、核桃叶片的光合作用和植株系统抗性;利用Illumina Miseq高通量测序分析根际土壤的微生物菌群结构.预测到与促生、生防相关的功能基因/基因簇10个;LCDD6具有产吲哚乙酸(IAA)、铁载体、降解蛋白和解磷的能力;与LB对照组相比,处理组核桃苗株高、茎粗、分枝数分别增加了24.68%、7.03%和28.35%,植株鲜重和干重分别提高了12.96%和21.55%;叶片叶绿素含量提高了47.50%,达到极显著性差异(P<0.01),在暗适应下光系统Ⅱ的最大光化学效率提高了9.43%,达到显著性差异(P<0.05);叶片SOD、POD和CAT酶活分别增强了20.58%、26.10%和16.67%;根际土壤微生物菌群的丰富度提高,有益菌的相对含量增加.本研究表明LCDD6对核桃幼苗具有稳定的促生生防作用和丰富的基因资源,在绿色农业发展中具有重要的研究和应用价值.(图7表4参43)

关键词：地衣芽孢杆菌LCDD6 基因组核桃苗促生生防

改性活性炭构建菌载体及其吸附玉米中黄曲霉毒素B1的工艺研究

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中国油脂 2024年第2期49卷 63-69页

作者：丁梓雪常程程杨帆王彦钦孟宪刚兰州交通大学生物与制药工程学院兰州730070

旨在为生物处理黄曲霉毒素污染的粮食饲料提供技术支持,以活性炭(SH)为原料进行改性制备磁性活性炭(CSH),选用能高效降解黄曲霉毒素B1(AFB1)的芽孢杆菌属菌株WTX1与CSH载体共培养构建磁性菌载体(FCSH),脱除受污染玉米中的AFB1,对CSH进行... 详细信息

旨在为生物处理黄曲霉毒素污染的粮食饲料提供技术支持,以活性炭(SH)为原料进行改性制备磁性活性炭(CSH),选用能高效降解黄曲霉毒素B1(AFB1)的芽孢杆菌属菌株WTX1与CSH载体共培养构建磁性菌载体(FCSH),脱除受污染玉米中的AFB1,对CSH进行BET比表面积、氮吸附-脱附等温线及其对AFB1的等温吸附曲线分析,考察FCSH构建条件和FCSH吸附条件对AFB1脱除效果的影响,并利用傅里叶变换红外光谱(FTIR)和扫描电镜对吸附AFB1前后的FCSH进行表征。结果表明:CSH为大孔结构,其对AFB1的等温吸附符合Freundlich方程;在固定化时间16 h、固定化转速和吸附转速160 r/min、固定化温度和吸附温度35℃、吸附pH 8、振荡时间48 h条件下,FCSH对AFB1脱除率为97.45%;通过FTIR及扫描电镜证实了FCSH对AFB1的吸附作用,且FCSH对AFB1的吸附效果强于CSH。综上,所制备的FCSH能高效脱除玉米中的AFB1。

关键词：磁性活性炭芽孢杆菌菌载体黄曲霉毒素B1 生物脱除

基于比较基因组学的高地芽孢杆菌6ww6分子标识筛选及其快速鉴定

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微生物学报 2022年第10期62卷 3741-3750页

作者：李旭健杜秉海殷志秋程齐周丹丹汪城墙李慧刘凯丁延芹山东农业大学生命科学学院山东泰安271018 山东省盐碱地植物-微生物联合修复工程技术中心山东泰安271018 山东农业大学资源与环境学院山东泰安271018

【目的】高地芽孢杆菌(Bacillus altitudinis)6ww6是一株根际耐盐促生菌,可以作为微生物肥料的优选菌种。为了加强菌种知识产权保护,建立菌株快速检测方法。【方法】本研究通过基因组比对分析、TBLASTn检索、NR库检索验证并剔除有其他... 详细信息

【目的】高地芽孢杆菌(Bacillus altitudinis)6ww6是一株根际耐盐促生菌,可以作为微生物肥料的优选菌种。为了加强菌种知识产权保护,建立菌株快速检测方法。【方法】本研究通过基因组比对分析、TBLASTn检索、NR库检索验证并剔除有其他同源的结果序列,最终得到菌株6ww6的孤儿基因,设计引物进行PCR鉴定。【结果】筛选出5个特异性基因J939_13195、J9319_05960、J9319_13355、J9319_05965和J9319_13350。引物5960F和5960R可以单一性扩增出菌株6ww6的目的基因J9319_05960,确定其为菌株6ww6的特异性分子标识。【结论】本研究确定了菌株6ww6的唯一性身份编码,建立了以比较基因组学和孤儿基因为基础的菌株水平上的鉴定方法。该方法具有快速、精确、能鉴定到菌株水平的优点,对于有价值微生物的知识产权保护提供了有力的抓手。

关键词：微生物肥料比较基因组学菌株分子标识高地芽孢杆菌6wW6 知识产权

同一家系男性X连锁Alport综合征患者临床表型异质性分析

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中华实用儿科临床杂志 2016年第17期31卷 1318-1320页

作者：张琰琴丁洁王芳北京大学第一医院儿科 100034

目的分析同一家系男性X连锁Alport综合征患者临床表型的差异，结合文献探讨相同COL4A5基因突变的男性X连锁Alport综合征患者临床表型可能的影响因素。方法收集同一家系2例男性（Ⅲ1和Ⅱ4）X连锁Alport综合征患者就诊及随访5年的临床资... 详细信息

目的分析同一家系男性X连锁Alport综合征患者临床表型的差异，结合文献探讨相同COL4A5基因突变的男性X连锁Alport综合征患者临床表型可能的影响因素。方法收集同一家系2例男性（Ⅲ1和Ⅱ4）X连锁Alport综合征患者就诊及随访5年的临床资料。应用间接免疫荧光学方法检测皮肤基底膜α5（Ⅳ）链表达。应用反转录-聚合酶链反应直接测序和PCR直接测序方法分别从皮肤成纤维细胞mRNA和外周血基因组DNA水平检测COL4A5基因突变。结果患者Ⅲ1就诊年龄为14岁，临床表现为镜下血尿，尿蛋白阴性；皮肤基底膜α5（Ⅳ）链染色阴性。随访5年期间，临床表现为持续性镜下血尿，尿蛋白阴性，尿微量白蛋白19.2～31.8 mg/L，未治疗。目前该患者19岁，尿检潜血＋＋＋，蛋白－；尿微量白蛋白19.20 mg/L；肾功能正常。患者Ⅱ4就诊年龄为29岁，于22岁发现血尿、蛋白尿，曾口服雷公藤治疗1年余，24岁出现＂尿毒症＂，行血液透析治疗，29岁（就诊前2个月）接受肾移植手术治疗，肾功能等指标良好。随访5年期间，尿常规及肾功能检查均正常。患者Ⅲ1和患者Ⅱ4均检测到COL4A5基因41外显子c.3650G〉A（p.G1217D）突变。结论同一家系具有相同COL4A5基因突变的男性X连锁Alport综合征患者在相似年龄段临床表型可截然不同，提示在判断疾病进展和预后时需注意，推测其机制可能是存在体细胞嵌合现象。

关键词： Alport综合征血尿蛋白尿肾炎遗传性

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害虫种群经济阈值的概念及其数字模型

Zoological Research 1988年第2期9卷 151-160页

作者：丁岩钦中国科学院动物研究所北京

害虫种群的经济阈值是害虫管理系统中的一个主要组成成份,因为害虫的控制必须讲求经济效益,决定采取防治措施时,首先需要考虑防治的挽回收益是否大于防治成本,亦就是要求防治后的挽回收益价值一定要大于至少等于防治费用。因此决定某种... 详细信息

害虫种群的经济阈值是害虫管理系统中的一个主要组成成份,因为害虫的控制必须讲求经济效益,决定采取防治措施时,首先需要考虑防治的挽回收益是否大于防治成本,亦就是要求防治后的挽回收益价值一定要大于至少等于防治费用。因此决定某种害虫的防治与否和如何防治,并不单纯取决于虫情,而主要取决于虫害所造成的经济损失、防治效果、防治费用以及最终的产值挽回收益。

关键词：害虫种群经济阈值概念经济阈值数字模型经济为害水平

Correction to: Oxymatrine Inhibits Bocavirus MVC Replication, Reduces Viral Gene Expression and Decreases Apoptosis Induced by Viral Infection

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Virologica Sinica 2019年第6期34卷 729-729页

作者： yanqin ding Na Li Jinhan Sun Linran Zhang Jianhui Guo Xueqi Hao Yuning Sun Department of Biochemistry and Molecular Biology Key Laboratory of Fertility Preservation and Maintenance of Ministry of EducationSchool of Basic Medical ScienceNingxia Medical UniversityYinchuan 750004China School of Clinical Medicine Hainan Medical UniversityHaikou 571199China Department of Respiratory and Critical Care General Hospital of Ningxia Medical UniversityNingxia MedicalUniversityYinchuan 750004China

In the original version of Fig.2,the marker line between column 2 and column 6 is redundant(Fig.2A),and MVC label and MVCIOMT label were accidentally swapped(Fig.2B).The correct Fig.2 is provided below.

关键词： MVC Replication swap

烟草根际铁载体产生菌G-229-21T的筛选、鉴定及拮抗机理

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微生物学报 2008年第5期48卷 631-637页

作者：田方丁延芹朱辉姚良同靳奉理杜秉海山东农业大学生命科学学院山东农业大学农业微生物学重点实验室泰安271018

【目的】从烟草根际筛选烟草疫霉[Phytophthora parasitica ***(Breda de Hann)Tucker]拮抗菌,探索其拮抗机理。【方法】限铁(2.0μmol/LFeCl3)蔗糖-天冬酰胺平板对峙法筛选烟草疫霉拮抗菌;刃天青(CAS)法检测其铁载体的产生及其对铁离... 详细信息

【目的】从烟草根际筛选烟草疫霉[Phytophthora parasitica ***(Breda de Hann)Tucker]拮抗菌,探索其拮抗机理。【方法】限铁(2.0μmol/LFeCl3)蔗糖-天冬酰胺平板对峙法筛选烟草疫霉拮抗菌;刃天青(CAS)法检测其铁载体的产生及其对铁离子的亲和能力。结合形态、生理生化、16SrRNA序列同源性和系统发育分析及种特异性分子法对其进行鉴定。XAD-2吸附层析法提取其铁载体,分光光度法检测其铁载体类型。不同铁离子浓度下,比较其铁载体对烟草疫霉的抑制作用。【结果】我们筛选到一株限铁条件下烟草疫霉拮抗菌G-229-21T,该菌产生高亲和力铁载体,被初步鉴定为Pseudomonas mediterranea。该菌产生的羧酸型铁载体,在低铁条件下(0.16μmol/L～10μmol/LFeCl3)对烟草疫霉的抑制率达92.3%以上,而在富铁条件下(100μmol/LFeCl3)抑制率仅为2.0%。【结论】首次报道*** G-229-21T产生高亲和力羧酸型铁载体,该铁载体在低铁条件下对烟草疫霉有显著的抑制作用。

关键词： Pseudomonas mediterranea 铁载体筛选鉴定拮抗机理