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Complete genome sequence of high-yield strain S. lincolnensis B48 and identification of crucial mutations contributing to lincomycin overproduction

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Synthetic and Systems Biotechnology 2020年第2期5卷 37-48页

作者： Ruida Wang Fanjing Kong Haizhen Wu Bingbing hou yajing Kang Yuan Cao Shiwei Duan Jiang Ye Huizhan Zhang State Key Laboratory of Bioreactor Engineering East China University of Science and TechnologyShanghai200237China Department of Applied Biology East China University of Science and TechnologyShanghai200237China Medical Genetics Center School of MedicineNingbo UniversityNingbo315211China

The lincosamide family antibiotic lincomycin is a widely used antibacterial pharmaceutical generated by Streptomyces lincolnensis,and the high-yield strain B48 produces 2.5 g/L lincomycin,approximately 30-fold as the wild-type strain NRRL ***,the genome of *** B48 was completely sequenced,revealing a^10.0 Mb single chromosome with 71.03%G+C *** on the genomic information,lincomycinrelated primary metabolism network was constructed and the secondary metabolic potential was *** order to dissect the overproduction mechanism,a comparative genomic analysis with NRRL 2936 was *** large deletions(LDI-III),one large inverted duplication(LID),one long inversion and 80 small variations(including 50 single nucleotide variations,13 insertions and 17 deletions)were found in B48 *** several crucial mutants contributing to higher production phenotype were *** of a MarRtype regulator-encoding gene slinc377 from LDI,and the whole 24.7 kb LDII in NRRL 2936 enhanced lincomycin titer by 244%and 284%,***,lincomycin production of NRRL 2936 was increased to 7.7-fold when a 71 kb supercluster BGC33 from LDIII was *** for the duplication region,overexpression of the cluster situated genes lmbB2 and lmbU,as well as two novel transcriptional regulator-encoding genes(slinc191 and slinc348)elevated lincomycin titer by 77%,75%,114%and 702%,***,three negative correlation genes(slinc6156,slinc4481 and slinc6011)on lincomycin biosynthesis,participating in regulation were found *** surprisingly,inactivation of RNase J-encoding gene slinc6156 and TPR(tetratricopeptide repeat)domain-containing protein-encoding gene slinc4481 achieved lincomycin titer equivalent to 83%and 68%of B48,respectively,to 22.4 and 18.4-fold compared to NRRL ***,the comparative genomics approach combined with confirmatory experiments identified that large fragment deletion,long sequence duplicatio

关键词： Lincomycin Comparative genomics Regulation Overproduction

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河道水生植物治理产品概念设计

设计 2020年第15期33卷 F0003-F0003页

作者：顾岱秀(文/图) 侯亚婧(文/图) 张玉春(文/图) 南京工程学院

为了解决因全球气候变暖与水体富营养化所导致的内河等中小型水域水生植物泛滥问题,该设计提出了水空两栖的河道水生植物治理产品设计概念,结合先进的科技成果从产品造型、功能结构与色彩方案三个方面进行综合设计。仿生造型设计选取与... 详细信息

为了解决因全球气候变暖与水体富营养化所导致的内河等中小型水域水生植物泛滥问题,该设计提出了水空两栖的河道水生植物治理产品设计概念,结合先进的科技成果从产品造型、功能结构与色彩方案三个方面进行综合设计。仿生造型设计选取与水生植物存在着捕食关系的昆虫作为设计参考对象,隐喻水生植物治理产品的工作意义,其造型也与创新的无人机技术完美契合。依据对水空两栖河道水生植物治理产品的功能分析,设计了包含探测部件、切割部件、用于将已收割水生植物收集到网袋的水泵、主控制终端、驱动部件、蓄电池供能部件以及水空轮部件,共7部分组件。

关键词：水生植物科技成果驱动部件无人机技术控制终端产品造型产品概念设计产品设计

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基于分子机制的逍遥散方证相关研究思路

世界中医药 2017年第3期12卷 484-487页

作者：严志祎焦海燕马庆宇李晓娟潘秋霞王亭晔侯雅静王方方刘玥芸陈家旭岳利峰北京中医药大学中医学院北京100029 北京中医药大学东直门医院北京100700

逍遥散作为疏肝健脾的经典方剂,在临床上广泛应用于治疗各科疾病所涉及的肝郁脾虚证之中,长久以来也进行了大量关于逍遥散调节作用与肝郁脾虚证发病机制内在联系与规律的研究。文章从分子机制研究的侧面着手,探讨了逍遥散方证研究的思路... 详细信息

逍遥散作为疏肝健脾的经典方剂,在临床上广泛应用于治疗各科疾病所涉及的肝郁脾虚证之中,长久以来也进行了大量关于逍遥散调节作用与肝郁脾虚证发病机制内在联系与规律的研究。文章从分子机制研究的侧面着手,探讨了逍遥散方证研究的思路,以期为今后包括逍遥散与肝郁脾虚证在内的方证研究提供思路与方法。

关键词：肝郁脾虚证逍遥散方正相关分子机制

3D microgel with extensively adjustable stiffness and homogeneous microstructure for metastasis analysis of solid tumor

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Chinese Chemical Letters 2023年第11期34卷 243-247页

作者： Xiaonan Zheng Ying hou Qiang Zhang yajing Zheng Zengnan Wu Xueji Zhang Jin-Ming Lin Laboratory of Bioengineering and Sensing Technology Research Center for Bioengineering and Sensing TechnologySchool of Chemistry&Biological EngineeringUniversity of Science and Technology BeijingBeijing 100083China Beijing Key Laboratory of Microanalytical Methods and Instrumentation Key Laboratory of Bioorganic Phosphorus Chemistry and Chemical Biology(Ministry of Education)Department of ChemistryTsinghua UniversityBeijing 100084China School of Biomedical Engineering Health Science CentreShenzhen UniversityShenzhen 518060China

3D microgels with various mechanical properties have been important platforms tumor metastasis analysis,and widely adjustable stiffness is crucial for deeper ***,by mixing biodegradable polylactic acid(PLA)nanofibers in the modified alginate with different concentrations of Ca^(2+),we significantly enhance the stiffness range of microgels while retaining the pore size,which provides bionic microenvironment for tumor *** a proof of concept,we simulated the mechanical characteristics of breast tumors by encapsulating cells in 3D microgels with diverse stiffness,and analyzed cellular behaviors of two typical breast cancer cell lines:MCF-7 and *** showed that with the addition of 2.0%(w/v)PLA short nanofibers,the Young’s modulus of modified alginate increased more than *** preserving high survival and proliferation rates,both cells also displayed stronger migration ability in soft microgel spheres,where RT-qPCR analysis revealed the underlying changes at the genetic *** systematic study demonstrated our method is powerful for creating widely adjustable 3D mechanical microenvironment,and the results of cellular behavior analysis shows its promising application prospects in tumorigenesis and progression.

关键词： Extracellular matrix stiffness Composite hydrogel Polylactic acid(PLA) Nanofibers Metastasis analysis Breast cancer

4种胶乳免疫比浊法淀粉样蛋白A试剂检测性能及结果一致性评价

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标记免疫分析与临床 2024年第6期31卷 1151-1156页

作者：王丹晨夏良裕侯立安国秀芝李洪雷张颖刘欣刘荔苏玉君梁小悦王亚静中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院检验科北京100730

目的评估4种淀粉样蛋白A(SAA)试剂分析性能和结果一致性。方法性能评价。收集临床检测剩余样本,参考CLSI相关文件,评估4种淀粉样蛋白A试剂的精密度、线性、稀释验证、干扰、携带污染及参考区间,并对4种试剂(分别标记A~D)进行方法学比对... 详细信息

目的评估4种淀粉样蛋白A(SAA)试剂分析性能和结果一致性。方法性能评价。收集临床检测剩余样本,参考CLSI相关文件,评估4种淀粉样蛋白A试剂的精密度、线性、稀释验证、干扰、携带污染及参考区间,并对4种试剂(分别标记A~D)进行方法学比对及偏移评估。结果A、B、C、D4种试剂检测SAA的重复性和实验室内不精密度均0.99)。4种试剂的稀释回收率为90.0%~103.1%、90.3%~138.1%、116.9%~131.2%、97.5%~102.0%。检测20例表观健康人,每种试剂均有18例(90%)检测结果在制造商提供的参考区间内。共纳入47临床样本进行比对,与4种试剂检测结果的均值相比,分别有11例(23.4%)、13例(27.7%)、3例(6.4%)、6例(12.8%)偏差超过±15%。样本中游离胆红素≤364.8μmol/L、结合胆红素≤327.7μmol/L、血红蛋白≤4.98g/L、乳糜≤1599.2 FTU时,百分偏差均在±10%以内。结论本研究评估的4种胶乳免疫比浊法SAA试剂在全自动生化分析上检测的精密度、线性、抗干扰能力均符合制造商声称要求,但部分试剂稀释回收性能不符合要求,不同试剂检测临床样本结果一致性有待提高,临床实验室在选用前应严格评估。

关键词：淀粉样蛋白A 病毒方法学比对感染评价研究

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一种基于生物免疫机制的基因免疫检测算法

计算机工程与应用 2005年第4期41卷 38-40,45页

作者：张雅静侯朝桢烟台大学计算机学院山东烟台264005 北京理工大学自动控制系北京100081

该文基于生物免疫原理中检测机制的研究提出了一种基因免疫检测算法。该算法综合了生物免疫系统的先天性免疫和适应性免疫机制,在负选择和克隆选择的基础上又加入了阳性选择和疫苗机制,并利用基因检测实现了检测的DNA优先级策略。仿真... 详细信息

该文基于生物免疫原理中检测机制的研究提出了一种基因免疫检测算法。该算法综合了生物免疫系统的先天性免疫和适应性免疫机制,在负选择和克隆选择的基础上又加入了阳性选择和疫苗机制,并利用基因检测实现了检测的DNA优先级策略。仿真实验表明,该算法大幅度提高了检测效率,并有效缩短了计算时间。

关键词：负选择阳性选择克隆选择疫苗基因

1例血小板增多致假性高钾血症分析及报告流程改进

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标记免疫分析与临床 2024年第7期31卷 1365-1367,1372页

作者：尚鲁俊夏良裕王鸥侯立安张颖刘荔苏玉君刘欣王健梁小悦王亚静徐二木刘茜中国医学科学院、北京协和医学院、北京协和医院检验科北京100730 中国医学科学院、北京协和医学院、北京协和医院内分泌科北京100730 贵州省人民医院检验科贵州贵阳550002

严重的高钾血症是一项必须立即进行临床干预的紧急医疗事件,而假性高钾血症会干扰高钾血症的诊断,实验室应及时识别和处理以避免误诊误治。本文报道一则案例,患者因高血压随诊发现血清钾增高,随后因血钾结果异常多次于急诊和门诊就诊,... 详细信息

严重的高钾血症是一项必须立即进行临床干预的紧急医疗事件,而假性高钾血症会干扰高钾血症的诊断,实验室应及时识别和处理以避免误诊误治。本文报道一则案例,患者因高血压随诊发现血清钾增高,随后因血钾结果异常多次于急诊和门诊就诊,经历了高钾-降钾-低钾-补钾的过程,最终确诊为血小板增多症导致的假性高钾血症。我们通过优化实验室信息系统自动识别血小板增高导致的假性高钾血症,同时改进此类样本检测结果的报告方式,以避免血小板升高引起假性高钾血症导致临床误诊误治的风险。

关键词：高钾血症假性高钾血症血小板增多症

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直接抗病毒药物治疗慢性丙型肝炎的方案选择

中华肝脏病杂志 2018年第3期26卷 169-172页

作者：何雅婧刘智泓侯金林南方医科大学南方医院肝病中心暨感染内科广州510515

丙型肝炎病毒感染的治疗任重而道远。直接抗病毒药物（DAAs）通过靶向丙型肝炎病毒的复制过程，使彻底治愈丙型肝炎成为可能，同时治疗方案也变得规范、简单。但专科医生在选择抗病毒方案时，仍应充分考虑那些影响药物疗效及安全性的相... 详细信息

丙型肝炎病毒感染的治疗任重而道远。直接抗病毒药物（DAAs）通过靶向丙型肝炎病毒的复制过程，使彻底治愈丙型肝炎成为可能，同时治疗方案也变得规范、简单。但专科医生在选择抗病毒方案时，仍应充分考虑那些影响药物疗效及安全性的相关因素。现就DAAs的发展历程、国内DAAs方案的疗效及特点等方面进行综述。

关键词：肝炎丙型慢性治疗抗病毒治疗临床研究直接抗病毒药物

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N-Ts氰胺在有机合成中的研究与应用

有机化学 2023年第1期43卷 74-93页

作者：王川川马志伟侯学会杨龙华陈亚静河南牧业经济学院理学部郑州450052 郑州大学药学院郑州450001

N-Ts氰胺是有机合成中非常高效和实用的一种多功能合成前体,其在构建含氮骨架领域中获得了较多应用.根据反应类型划分,总结了近年来N-Ts氰胺在有机合成中的研究进展,主要包括其在氰基化反应、经氰胺负离子参与的环化反应、氰胺化反应、... 详细信息

N-Ts氰胺是有机合成中非常高效和实用的一种多功能合成前体,其在构建含氮骨架领域中获得了较多应用.根据反应类型划分,总结了近年来N-Ts氰胺在有机合成中的研究进展,主要包括其在氰基化反应、经氰胺负离子参与的环化反应、氰胺化反应、磺酰化反应及经氰基官能团参与的环化反应等方面的应用,并对该领域的研究前景进行了展望.

关键词： N-Ts氰胺氰基化氰胺化磺酰化环化反应