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Whole Genome Analyses of Chinese Population and De Novo Assembly of A Northern Han Genome

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Genomics, Proteomics & Bioinformatics 2019年第3期17卷 229-247页

作者： Zhenglin Du Liang Ma Hongzhu Qu Wei Chen Bing Zhang xi Lu Weibo Zhai xin Sheng Yongqiao Sun Wenjie Li Meng Lei Qiuhui Qi Na Yuan Shuo Shi Jingyao Zeng Jinyue Wang yadong Yang Qi Liu Yaqiang Hong Lili Dong Zhewen Zhang Dong Zou Yanqing Wang Shuhui Song Fan Liu xiangdong Fang Hua Chen xin Liu Jingfa xiao Changqing Zeng Beijing Institute of Genomics Chinese Academy of SciencesBeijing 100101China BIG Data Center Beijing Institute of GenomicsChinese Academy of SciencesBeijing 100101China CAS Key Laboratory of Genomic and Precision Medicine Beijing Institute of GenomicsChinese Academy of SciencesBeijing 100101China CAS Key Laboratory of Genome Sciences and Information Beijing Institute of GenomicsChinese Academy of SciencesBeijing 100101China University of Chinese Academy of Sciences Beijing 100049China

To unravel the genetic mechanisms of disease and physiological traits,it requires comprehensive sequencing analysis of large sample size in Chinese ***,we report the primary results of the Chinese Academy of Sciences Precision Medicine Initiative(CASPMI)project launched by the Chinese Academy of Sciences,including the de novo assembly of a northern Han reference genome(NH1.0)and whole genome analyses of 597 healthy people coming from most areas in *** the two existing reference genomes for Han Chinese(YH and HX1)were both from the south,we constructed NH1.0,a new reference genome from a northern individual,by combining the sequencing strategies of PacBio,10×Genomics,and Bionano *** this integrated approach,we obtained an N50 scaffold size of 46.63 Mb for the NH1.0 genome and performed a comparative genome analysis of NH1.0 with YH and *** order to generate a genomic variation map of Chinese populations,we performed the whole-genome sequencing of 597 participants and identified 24.85 million(M)single nucleotide variants(SNVs),3.85 M small indels,and 106,382 structural *** the association analysis with collected phenotypes,we found that the T allele of rs1549293 in KAT8 significantly correlated with the waist circumference in northern Han ***,significant genetic diversity in MTHFR,TCN2,FADS1,and FADS2,which associate with circulating folate,vitamin B12,or lipid metabolism,was observed between northerners and ***,for the homocysteine-increasing allele of rs1801133(MTHFR 677T),we hypothesize that there exists a “comfort”zone for a high frequency of 677T between latitudes of 35–45 degree *** together,our results provide a high-quality northern Han reference genome and novel population-specific data sets of genetic variants for use in the personalized and precision medicine.

关键词： De novo assembly Reference genome Variation map Phenotype association Large population

Multifunctional biomimetic tactile system via a stick-slip sensing strategy for human–machine interactions

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npj Flexible Electronics 2022年第1期6卷 498-506页

作者： Yue Li Manjun Zhao yadong Yan Luanxi He Yingyi Wang Zuoping xiong Shuqi Wang Yuanyuan Bai Fuqin Sun Qifeng Lu Yu Wang Tie Li Ting Zhang School of Nano-Tech and Nano-Bionics University of Science and Technology of ChinaHefeiAnhuiPR China i-Lab Nano-X Vacuum Interconnected WorkstationKey Laboratory of Multifunction Nanomaterials and Smart SystemsSuzhou Institute of Nano-Tech and Nano-Bionics(SINANO)Chinese Academy of Sciences(CAS)SuzhouPR China School of Electronic Science and Engineering University of Electronic Science and Technology of ChinaChengduPR China School of Biological Science and Medical Engineering Beihang UniversityBeijingPR China Department of Health and Environmental Sciences School of ChipsXJTLU Entrepreneur College(Taicang)Xi’an Jiaotong Liverpool UniversitySuzhouJiangsuPR China Gusu Laboratory of Materials Science SuzhouPR China Center for Excellence in Brain Science and Intelligence Technology Chinese Academy of ScienceShanghaiPR China

A tactile sensor system enables natural interaction between humans and machines;this interaction is crucial for dexterous robotic hands,interactive entertainment,and other smart ***,the lack of sliding friction detection significantly limits the accuracy and scope of interactions due to the absence of sophisticated information,such as slippage,material and roughness of held ***,inspired by the stick-slip phenomena in the sliding process,we have developed a multifunctional biomimetic tactile system based on the stick-slip sensing strategy,which is a universal method to detect slippage and estimate the surface properties of objects by *** system consists of a flexible fingertip-inspired tactile sensor,a read-out circuit and a machinelearning *** on the stick-slip sensing strategy,our system was endowed with high recognition rates for slippage detection(100.0%),material classification(93.3%)and roughness discrimination(92.8%).Moreover,robotic hand manipulation,interactive games and object classification are demonstrated with this multifunctional system for comprehensive and promising human-machine interactions.

关键词： interactive system roughness

复杂地形多源数据融合GNSS高程转换及实时服务

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测绘科学 2023年第3期48卷 111-119页

作者：成兵张熙石鑫高微何亚东自然资源部第三大地测量队成都610000

针对大范围、大高差复杂地形GNSS高程转换难题,以及新型基础测绘数据采集对快速实时获取正常高的需求,该文提出融合多源数据的GNSS高程转换及实时服务方法。该方法采用重力场模型或似大地水准面获取高程异常中长波信息,结合GNSS/水准数... 详细信息

针对大范围、大高差复杂地形GNSS高程转换难题,以及新型基础测绘数据采集对快速实时获取正常高的需求,该文提出融合多源数据的GNSS高程转换及实时服务方法。该方法采用重力场模型或似大地水准面获取高程异常中长波信息,结合GNSS/水准数据分离出高精度短波信息,进行融合建模,表达局部复杂地形变化,提高高程转换精度;采用“双伪参数加密”方法,对高程转换参数进行动态加密,实现高程基准安全、实时服务。选取丘陵、山地、高山地3种地形的GNSS/水准数据进行分析,验证该方法可行性,结果表明:融合多源数据的高程转换精度提升显著,采用不同重力场模型差异较小,多种几何模型中,多面函数精度最优,3种地形外符合精度分别优于1.5、2.3和2.4cm,该方法满足复杂地形高程转换及实时服务需求。

关键词： GNSS高程转换多源数据融合重力场模型高程异常复杂地形多面函数高程实时服务

大口径非球面镜交叉磨削中波纹度产生机理的研究

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金刚石与磨料磨具工程 2020年第3期40卷 91-97页

作者：席建普刘同士李亚东李彬赵则祥中原工学院机电学院郑州450007

基于大口径非球面镜交叉磨削加工方式,分析主轴偏心振动幅值和磨削工艺参数对其表面波纹度的影响,建立磨削表面波纹度形成机理三维模型。通过仿真试验分析磨削表面三维波纹度与加工工艺参数的关系,提出特定主轴最佳磨削工艺参数匹配方... 详细信息

基于大口径非球面镜交叉磨削加工方式,分析主轴偏心振动幅值和磨削工艺参数对其表面波纹度的影响,建立磨削表面波纹度形成机理三维模型。通过仿真试验分析磨削表面三维波纹度与加工工艺参数的关系,提出特定主轴最佳磨削工艺参数匹配方案。磨削试验结果表明:建立的三维表面波纹度模型与磨削工艺参数关系合理,最优的磨削工艺参数匹配方案为砂轮转速1600~1800 r/min,X轴进给速度1~3 mm/r,工件旋转速度20 r/min。

关键词：大口径非球面表面波纹度交叉磨削振动

内嵌式快刀伺服机构的静态特性分析与实验验证

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机床与液压 2020年第10期48卷 34-39页

作者：席建普李亚东刘同士杨清中原工学院机电学院河南郑州450000

基于音圈电机驱动研制一种内嵌式快刀伺服装置,该装置结构紧凑,导向精度高,并运用Workbench进行了有限元仿真。静态分析得到气浮装置的应力应变分布情况,获得零部件最大变形量和最大应力值;模态分析得到气浮装置各阶固有频率和振型,并... 详细信息

基于音圈电机驱动研制一种内嵌式快刀伺服装置,该装置结构紧凑,导向精度高,并运用Workbench进行了有限元仿真。静态分析得到气浮装置的应力应变分布情况,获得零部件最大变形量和最大应力值;模态分析得到气浮装置各阶固有频率和振型,并通过模态实验进行对比,验证有限元模型的合理性。分析结果表明:增加刚性支撑可提高快刀伺服装置固有频率,能有效避免"共振"现象发生。该设计方案能够实现大行程高刚度切削加工要求。

关键词：快刀伺服装置有限元模态分析振动抑制

Terahertz emission from layered GaTe crystal due to surface lattice reorganization and in-plane noncubic mobility anisotropy

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Photonics Research 2019年第5期7卷 518-525页

作者： Jiangpeng Dong Kevin-P. Gradwohl yadong Xu Tao Wang Binbin Zhang Bao xiao Christian Teichert Wanqi Jie State Key Laboratory of Solidification Processing Ministry of Industry and Information Technology (MIIT) Key Laboratory of Radiation Detection Materials and Devices School of Materials and Engineering Northwestern Polytechnical University Xi'an 710072 China Institute of Physics Montanuniversitaet Leoben Leoben 8700 Austria

In this work, a model based on the optical rectification effect and the photocurrent surge effect is proposed to describe the terahertz emission mechanism of the layered GaTe crystal. As a centrosymmetric crystal, the optical rectification effect arises from the breaking of the inversion symmetry due to lattice reorganization of the crystal’s surface layer. In addition, the photocurrent surge originating from the unidirectional charge carrier diffusion-due to the noncubic mobility anisotropy within the layers-produces terahertz radiation. This is confirmed by both terahertz emission spectroscopy and electric property characterization. The current surge perpendicular to the layers also makes an important contribution to the terahertz radiation, which is consistent with its incident angle dependence. Based on our results, we infer that the contribution of optical rectification changes from 90%under normal incidence to 23% under a 40° incidence angle. The results not only demonstrate the terahertz radiation properties of layered GaTe bulk crystals, but also promise the potential application of terahertz emission spectroscopy for characterizing the surface properties of layered materials.

关键词： GaTe crystal surface lattice reorganization in-plane noncubic mobility

NAR神经网络的应用与检验——以城市居民生活需水定额为例

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灌溉排水学报 2017年第11期36卷 122-128页

作者：李析男王宁梅亚东赵先进贵州省水利水电勘测设计研究院贵阳550002 贵州省喀斯特地区水资源开发利用工程技术研究中心贵阳550002 武汉大学水资源与水电工程科学国家重点实验室武汉430072

NAR神经网络具有反馈和记忆功能,其在时间序列的建模仿真方面具有显著优点。以城市居民生活需水定额为例,采用NAR神经网络建立了贵州省城市居民生活需水定额的时间序列模型,通过试验法、留一法交叉检验讨论了模型相关输入参数的计算与选... 详细信息

NAR神经网络具有反馈和记忆功能,其在时间序列的建模仿真方面具有显著优点。以城市居民生活需水定额为例,采用NAR神经网络建立了贵州省城市居民生活需水定额的时间序列模型,通过试验法、留一法交叉检验讨论了模型相关输入参数的计算与选取,通过相关系数、Nash效率系数、LBQ检验、ROC曲线方法检验了模型的性能和预测结果的精度,进而对贵州省城市居民生活需水定额变化趋势进行了预测。结果表明,(1)NAR模型性能良好并具有较高的预测精度,NAR神经网络的相关系数r、Nash效率系数分别达到0.97、0.87,LBQ检验得出预测结果误差不存在自相关性,采用预测结果绘制ROC曲线,其AUC值达到0.938(处于水平1,有较高准确性);(2)需水定额合理性评价中,预测2020年、2030年需水定额分别为137.72 L/(人·d)、132.94 L/(人·d),满足《室外给水设计规范》(GB50013—2006)的要求,具有较好的适用性。

关键词： NAR神经网络模型留一法交叉验证 Ljung-Box Q检验 ROC曲线定额预测

基于Kano改进模型的清河坊旅游休闲街区夜间旅游满意度研究

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Journal of Resources and Ecology 2024年第1期15卷 55-65页

作者：朱玺刘敏孙亚东张瑞芯勾海霞北京联合大学应用文理学院北京100191 北京联合大学旅游学院北京100101

夜间旅游为旅游休闲街区延长活动时间,而旅游休闲街区为夜间旅游提供活动场所。将Kano模型引入满意度研究领域,并根据其优缺点做出改进,构建旅游休闲街区夜间旅游满意度的评估指标体系,结合调查问卷进行属性判定,通过主副属性、离散程... 详细信息

夜间旅游为旅游休闲街区延长活动时间,而旅游休闲街区为夜间旅游提供活动场所。将Kano模型引入满意度研究领域,并根据其优缺点做出改进,构建旅游休闲街区夜间旅游满意度的评估指标体系,结合调查问卷进行属性判定,通过主副属性、离散程度以及敏感性比较分析,确定各因子优化的优先顺序并提出优化建议。结果表明:(1)杭州清河坊夜间旅游群体以年轻人为主,总体满意度较高;(2)识别出1个魅力因子、7个期望因子、10个无差别因子和3个逆向因子;(3)改进优先顺序应为服务层>设施层>体验层>项目层;(4)背景音乐、文化内涵、节事类项目等方面更受访客青睐;(5)交通、服务态度和参与感等方面急需优化。

关键词：旅游休闲街区夜间旅游满意度研究清河坊 Kano模型

煤层顶板承压含水层涌水模式与疏放水钻孔优化设计

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煤田地质与勘探 2021年第5期49卷 139-146页

作者：虎维岳姬亚东黄欢中煤科工集团西安研究院有限公司陕西西安710077 陕西省煤矿水害防治技术重点实验室陕西西安710077

针对煤层顶板承压含水层涌水模式不清的问题,从煤层回采过程中顶板含水层涌水的时空变化特征入手,提出顶板含水层涌水量由静态储存量和动态补给量构成,认为静态储存量主要受来压步距、顶板垮落和导水裂隙(合称冒裂)影响区含水层厚度、... 详细信息

针对煤层顶板承压含水层涌水模式不清的问题,从煤层回采过程中顶板含水层涌水的时空变化特征入手,提出顶板含水层涌水量由静态储存量和动态补给量构成,认为静态储存量主要受来压步距、顶板垮落和导水裂隙(合称冒裂)影响区含水层厚度、含水层给水度控制,动态补给量主要受冒裂影响区外围含水层厚度、渗透性流场中水力梯度和过水断面面积控制;根据导水裂隙波及含水层情况,将顶板含水层涌水模式划分为井底进水的触及井涌水、井壁及井底进水的非完整井涌水和井壁进水的完整井涌水3种模式,并基于地下水渗流理论给出不同涌水模式下动态补给水量计算公式;针对以往疏放水钻孔数量多及疏放水量大的问题,以实现工作面顶板含水层静态储存量疏放后动态补给量可控为目的,提出冒裂区高度控制钻孔深度、单孔水位影响半径控制钻孔布置间距、钻孔疏放水量稳定时间控制超前疏放时间的疏放水钻孔优化设计理念,对疏放水及疏放钻孔布置进行优化,形成系统的顶板含水层水疏放体系。研究结果丰富了煤层顶板含水层涌水量计算和控制方法,对顶板水害防控具有实际的指导意义。

关键词：顶板含水层静态储存量动态补给量涌水模式疏放水钻孔优化