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OCX-32基因内含子变异对长顺绿壳蛋鸡蛋壳品质的影响

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南方农业学报 2020年第8期51卷 1872-1879页

作者：吴磊谭光辉李杰章覃媛钰张依裕田琴贵州大学动物科学学院/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室/贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室贵阳550025

【目的】探讨OCX-32基因对长顺绿壳蛋鸡蛋壳品质的遗传效应,为长顺绿壳蛋鸡的保种选育及开发利用提供参考依据。【方法】以长顺绿壳蛋鸡为材料,采用PCR产物直接测序法筛选OCX-32基因SNP多态位点,实时荧光定量PCR检测组织表达谱,运用SPSS... 详细信息

【目的】探讨OCX-32基因对长顺绿壳蛋鸡蛋壳品质的遗传效应,为长顺绿壳蛋鸡的保种选育及开发利用提供参考依据。【方法】以长顺绿壳蛋鸡为材料,采用PCR产物直接测序法筛选OCX-32基因SNP多态位点,实时荧光定量PCR检测组织表达谱,运用SPSS 19.0广义线性模型(GLM)分析SNP位点基因型或双倍型与所测定性状指标的相关性。【结果】在长顺绿壳蛋鸡OCX-32基因中检测到3个SNPs位点,分别是位于内含子1上的g.22592323G>T及内含子3上的g.22597350T>C和g.22597555G>A。卡方(χ2)检测结果发现,g.22597350T>C位点的基因型分布显著偏离HardyWeinberg平衡(P心脏>子宫>腹脂>小肠>脾脏>肝脏>腺胃>胸肌>胰腺>肺脏>肌胃。关联分析结果显示,g.22597350T>C位点CC基因型在蛋壳强度和蛋壳重2个品质指标上显著高于CT基因型和TT基因型;双倍型H4H4个体的蛋壳强度显著高于其他7种双倍型个体,蛋壳重显著高于H2H4个体。【结论】OCX-32基因内含子变异能影响长顺绿壳蛋鸡蛋壳品质,检测到的3个SNPs位点可作为鸡蛋壳品质选择的遗传分子标记,其中突变位点g.22597350T>C的CC基因型和双倍型H4H4是影响蛋壳强度和蛋壳重的关键基因型和双倍型,有利改善蛋壳品质。

关键词：长顺绿壳蛋鸡 OCX-32基因 SNP 内含子荧光定量PCR 蛋壳品质

贵州黔南州育龄人群地中海贫血基因检测结果分析

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现代预防医学 2020年第21期47卷 3963-3967页

作者：杨先艳邱永红班文芬熊伟魏萍杨远菊谢丽刘亚贵州省黔南州中医医院产科黔南州妇幼保健院贵州省长顺县妇幼保健院贵州省三都县妇幼保健院贵州省惠水县妇幼保健院贵州省平塘县妇幼保健院

目的分析黔南州育龄人群地中海贫血（简称地贫）基因携带状况,以便为地贫筛查规划提供参考依据。方法对2015-2019年黔南州23 987名育龄人群采用红细胞指标检测（MCV和MCH）和血红蛋白电泳（Hb A2）分析进行地贫筛查,初筛阳性者行基因检... 详细信息

目的分析黔南州育龄人群地中海贫血（简称地贫）基因携带状况,以便为地贫筛查规划提供参考依据。方法对2015-2019年黔南州23 987名育龄人群采用红细胞指标检测（MCV和MCH）和血红蛋白电泳（Hb A2）分析进行地贫筛查,初筛阳性者行基因检测确诊,运用统计学方法分析育龄人群基因检出情况。结果 23 987名育龄人群中,地贫基因阳性1 037例,检出率4.32%（1 037/23 987）。其中男性地贫基因检出率3.80%（376/9 893）,女性为4.69%（661/14 094）。女性检出率高于男性（χ;=11.114,P=0.015）;汉族、布依族、苗族、水族、壮族、侗族、毛南族、土家族、瑶族、仡佬族、彝族、回族、其他民族地贫基因检出率分别为1.66%、5.95%、5.18%、7.24%、5.12%、2.95%、6.88%、2.43%、5.14%、1.34%、1.89%、2.81%、2.56%;黔南州地贫基因检出率排前三位分别是长顺县（4.69%）、惠水县（4.61%）和三都县（4.51%）,基因型主要以--SEA/αα、βCD41-42/βN、βCD17/βN为主,占60.95%。结论黔南州育龄人群地中海贫血基因携带率较高,具有性别、民族和县份分布特点。

关键词：地中海贫血基因诊断育龄人群少数民族

7种饲用紫苏品系在贵州地区适应性比较与营养价值分析

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饲料研究 2022年第23期45卷 123-128页

作者：于二汝李小冬杨航李世歌袁婷婷尚以顺贵州省油料研究所贵州省农业科学院贵州贵阳550006 贵州省草业研究所贵州省农业科学院贵州贵阳550006 贵州鼎芯农牧科技有限公司贵州贵阳550006

试验旨在筛选适宜贵州种植的饲用紫苏品系。选择7份株型高大的紫苏品系,采用2年2点联合试验在贵州省威宁县和长顺县对生物主要农艺性状、营养品质性状以及黄酮和迷迭香酸等功能性物质含量进行测定分析。结果显示:威宁试验点的7个紫苏品... 详细信息

试验旨在筛选适宜贵州种植的饲用紫苏品系。选择7份株型高大的紫苏品系,采用2年2点联合试验在贵州省威宁县和长顺县对生物主要农艺性状、营养品质性状以及黄酮和迷迭香酸等功能性物质含量进行测定分析。结果显示:威宁试验点的7个紫苏品系的出苗期、现序期、初花期和终花期时间分别为12.26~12.34 d、99.89~110.21 d、122.93~135.15 d、146.15~155.04 d;长顺试验点的7个不同品系出苗期、现序期、初花期和终花期时间分别为14.01~14.11 d、97.97~106.71 d、120.01~133.12 d和144.62~152.61 d。威宁试验点干草产量以S2001最高,其次为S2006,分别达到14710.7和14023.9 kg/hm2,显著高于其他品系(P<0.05);长顺试验点干草产量为7075.5~10809.1 kg/hm2,以S2005最高,显著高于其他品系(P<0.05)。营养成分分析发现,S2001(10.01%)与S2003(10.84%)的粗蛋白含量较高,S2005(4.25%)与S2002(4.40%)黄酮含量较高,S2002(1.22%)、S2004(1.37%)与S2005(1.60%)迷迭香酸含量较高,相应品系对应营养组分含量均显著高于其他品系(P<0.05)。关联性分析发现,干草产量与分枝数呈显著正相关,茎叶中迷迭香酸含量与粗脂肪含量呈显著负相关。研究表明,S2005在贵州地区表现最优,是潜在的饲用型紫苏资源。

关键词：饲用紫苏农艺性状适应性营养品质相关性分析

新型冠状病毒PLpro的克隆、表达及其对抗病毒天然免疫反应的调节作用

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中国病原生物学杂志 2021年第10期16卷 1129-1133,1138页

作者：葛晨晨尚超张翠玲芦静李太元李霄金宁一延边大学农学院吉林延吉133002 中国农业科学院长春兽医研究所吉林长春130122

目的探讨新型冠状病毒(SARS-CoV-2)木瓜样蛋白酶(PLpro)对Ⅰ型干扰素免疫应答的调节作用。方法基于新型冠状病毒PLpro利用MEGA7.0构建SARS-CoV-2 PLpro进化树,并进行同源性分析;PCR扩增PLpro基因,并克隆至真核表达载体pcDNA3.1(+)中,构... 详细信息

目的探讨新型冠状病毒(SARS-CoV-2)木瓜样蛋白酶(PLpro)对Ⅰ型干扰素免疫应答的调节作用。方法基于新型冠状病毒PLpro利用MEGA7.0构建SARS-CoV-2 PLpro进化树,并进行同源性分析;PCR扩增PLpro基因,并克隆至真核表达载体pcDNA3.1(+)中,构建真核表达质粒pcDNA3.1-PLpro。转染293细胞,采用Western blot和间接免疫荧光试验验证pcDNA3.1-PLpro的表达。通过qRT-PCR分析PLpro对Poly (I:C)刺激下炎性细胞因子mRNA表达的影响;双荧光素酶报告基因试验检测PLpro对IFN-β通路的影响。结果 SARS-CoV-2 PLpro蛋白序列与SARS PLpro相似性为82.7%,与蝙蝠冠状病毒PLpro相似性为96.8%。PCR扩增出PLpro目的基因片段长度为957 bp,与预期相符合,并在293细胞中表达。PLpro抑制IFN-β荧光素酶活性,同时抑制Poly (I:C)刺激引起的IFN-α、IFN-β、IL-6 mRNA表达升高。结论 SARS-CoV-2的PLpro抑制宿主细胞Ⅰ型干扰素免疫应答,为病毒逃逸宿主天然免疫反应提供有利条件。

关键词：新型冠状病毒木瓜样蛋白酶 Ⅰ型干扰素天然免疫

绿茶粉对长顺绿壳蛋鸡盲肠菌群结构及功能的影响

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黑龙江畜牧兽医 2022年第23期 84-90,136页

作者：木仁雷耀格根图雅周才碧冉田田陈志马媛李静徐文斌黔南民族师范学院生物科学与农学院贵州都匀558000 黔南州特色畜禽分子技术应用重点实验室贵州都匀558000 黔南民族师范学院图书馆贵州都匀558000 浙江大学动物科学学院杭州310058

为了明确绿茶粉对长顺绿壳蛋鸡盲肠菌群结构及功能的影响,试验将27周龄长顺绿壳蛋鸡54只随机分为1个对照组和2个试验组(0.5%组和1.5%组),每组3个重复,每个重复6只。对照组饲喂基础日粮,2个试验组在基础日粮中分别添加0.5%和1.5%的绿茶粉... 详细信息

为了明确绿茶粉对长顺绿壳蛋鸡盲肠菌群结构及功能的影响,试验将27周龄长顺绿壳蛋鸡54只随机分为1个对照组和2个试验组(0.5%组和1.5%组),每组3个重复,每个重复6只。对照组饲喂基础日粮,2个试验组在基础日粮中分别添加0.5%和1.5%的绿茶粉,共饲养6周。最后1天蛋鸡禁食12 h,从各组中随机挑选4只,颈静脉放血致死后取盲肠内容物,并提取总DNA。通过Illumina MiSeq平台进行测序后,分别对菌群α多样性指数和相对丰度进行分析,并对微生物功能进行预测。结果表明:对照组Ace和Chao1指数略高于0.5%和1.5%组,而0.5%和1.5%组Shannon指数略高于对照组,但各组间α多样性指数差异不显著(P>0.05)。在门水平上,拟杆菌门和厚壁菌门为优势菌门,与对照组相比,1.5%组的拟杆菌门和厚壁菌门的相对丰度有所下降,但差异不显著(P>0.05);0.5%和1.5%组的放线菌门的相对丰度均增加,其中0.5%组显著增加(P≤0.05)。在属水平上,拟杆菌属为优势菌属,与对照组相比,0.5%和1.5%组的拟杆菌属相对丰度有所下降,但差异不显著(P>0.05);0.5%组的理研菌科_RC9_肠_组相对丰度显著降低(P≤0.05);0.5%和1.5%组的副拟杆菌属和欧陆森氏菌属相对丰度均增加,其中0.5%组显著增加(P≤0.05)。将细菌的预测宏基因组与COG数据库进行注释发现,基因主要富集在通用功能预测、碳水化合物的运输与代谢、转录等类别;KEGG注释发现,基因主要富集在新陈代谢中的碳水化合物代谢和氨基酸代谢通路中,但各组间的相对丰度均差异不显著(P>0.05)。说明在日粮中添加0.5%~1.5%的绿茶粉,对盲肠菌群α多样性、相对丰度及微生物功能层面的影响程度较小,0.5%组部分菌群相对丰度变化显著。

关键词：绿茶粉长顺绿壳蛋鸡盲肠菌群高通量测序 16S rRNA

社区为基础的自然资源管理(CBNRM)方法的制度化——基于贵州省长顺县凯佐乡的实践

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贵州农业科学 2006年第5期34卷 103-107页

作者：孙秋周丕东袁涓文欧国武韦小平贵州省现代农业发展研究所贵阳550006

CBNRM是一种积极的、社区为主体的参与式方法,旨在可持续地利用自然资源的同时又关注社区生计发展,是实现农村人口、资源与环境可持续发展的策略。CBNRM方法的制度化是将CBNRM的方法/工具、理念以及基本原则在社区或社区组织和政府体系... 详细信息

CBNRM是一种积极的、社区为主体的参与式方法,旨在可持续地利用自然资源的同时又关注社区生计发展,是实现农村人口、资源与环境可持续发展的策略。CBNRM方法的制度化是将CBNRM的方法/工具、理念以及基本原则在社区或社区组织和政府体系内推广,并使之最终成为他们日常工作和行为的规范。研究和实践表明,横向推广和纵向推广相结合,研究、培训和倡导手段并用是CBNRM方法制度化的有效方法和策略。然而目前CBNRM方法的推广应用还面临诸多限制,制定一套与之相适应的相关政策和措施是促进CBNRM方法应用并取得预期效果的根本保障。

关键词：参与式社区自然资源管理制度化

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长顺绿壳蛋鸡肠道菌群结构及基因功能分析

现代畜牧兽医 2022年第7期 7-11页

作者：木仁格根图雅张欢冉田田陈志文狄马媛徐文斌黔南民族师范学院生物科学与农学院贵州黔南558000 浙江大学动物科学学院浙江杭州310058

研究旨在明确长顺绿壳蛋鸡肠道菌群结构及功能。健康、体重无差异的20只27周龄长顺绿壳蛋鸡饲养35 d,随机选择4只,分别提取十二指肠、回肠和盲肠内容物的微生物总DNA,对16S rRNA进行高通量测序。结果显示:盲肠OTUs个数最多,其次为回肠,... 详细信息

研究旨在明确长顺绿壳蛋鸡肠道菌群结构及功能。健康、体重无差异的20只27周龄长顺绿壳蛋鸡饲养35 d,随机选择4只,分别提取十二指肠、回肠和盲肠内容物的微生物总DNA,对16S rRNA进行高通量测序。结果显示:盲肠OTUs个数最多,其次为回肠,最少为十二指肠。盲肠的Ace指数、Chao-1指数和Shannon指数极显著高于十二指肠和回肠(P<0.01)。回肠的Ace指数和Chao-1指数显著高于十二指肠(P<0.05)。在门水平上,厚壁菌门为十二指肠(97.06%)和回肠(96.36%)的优势菌门;拟杆菌门(62.55%)和厚壁菌门(34.05%)为盲肠的优势菌门。在属水平上,乳杆菌属为十二指肠(94.133%)和回肠(95.273%)的优势菌属;拟杆菌属为盲肠(40.548%)的优势菌属。PICRUSt功能预测显示,肠道微生物基因主要富集于KEGG的新陈代谢(44.74%~49.34%)通路,其中盲肠营养物质代谢相关通路中富集基因相对丰度较高,如氨基酸代谢、能量代谢以及辅因子与维生素代谢等。研究表明,随着长顺绿壳蛋鸡肠道延伸,菌群多样性程度明显增加,且盲肠菌群的营养代谢作用更为活跃。

关键词：长顺绿壳蛋鸡肠道菌群十二指肠回肠盲肠

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长顺绿壳蛋鸡FGF23基因遗传变异分析

湖北农业科学 2019年第16期58卷 107-109,117页

作者：吴磊罗华伦张依裕覃媛钰向程举吴学树贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵阳550025 毕节市畜禽品种资源管理站贵州毕节551700

为进一步了解长顺绿壳蛋鸡FGF23基因的遗传效应,试验随机抽取同日出雏、健康无病、同等管理条件下饲喂10周龄的100只长顺绿壳蛋鸡,翅静脉采血,提取DNA,采用混合基因池进行PCR扩增,结合直接测序法对FGF23基因进行单核苷酸多态性(SNP)筛... 详细信息

为进一步了解长顺绿壳蛋鸡FGF23基因的遗传效应,试验随机抽取同日出雏、健康无病、同等管理条件下饲喂10周龄的100只长顺绿壳蛋鸡,翅静脉采血,提取DNA,采用混合基因池进行PCR扩增,结合直接测序法对FGF23基因进行单核苷酸多态性(SNP)筛查。结果表明,在长顺绿壳蛋鸡FGF23基因启动子区共筛查到3个SNP突变位点(g.73424388,T>C;g.73424577,TC),其中,g.73424388和g.73424660两个突变位点呈中度多态,g.73424577呈低度多态,说明长顺绿壳蛋鸡在自然群体中的遗传多样性较为丰富。

关键词：长顺绿壳蛋鸡 FGF23基因单核苷酸多态性抗逆性