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Investigating the Genetic Bases of Growth Regulation by E2F3 in Dwarf Surf Clams Mulinia lateralis

Journal of Ocean University of China 2024年第5期23卷 1347-1358页

作者： yao ruixing WANG Chen KONG Lingling WANG Yujue BAO Zhenmin HU Xiaoli MOE Key Laboratory of Marine Genetics and Breeding College of Marine Life Sciences Ocean University of China Laboratory for Marine Fisheries Science and Food Production Processes Qingdao Marine Science and TechnologyCenter Key Laboratory of Tropical Aquatic Germplasm of Hainan Province Sanya Oceanographic Institution Ocean University of China

Bivalve aquaculture plays a crucial role in the aquaculture industry due to the economic value of many bivalve species. Understanding the underlying genetic basis of bivalve growth regulation is essential for enhancing germplasm innovation and ensuring sustainable development of the industry. Though numerous candidate genes have been identified, their functional validation remains challenging. Fortunately, the dwarf surf clam(Mulinia lateralis) serves as a promising model organism for investigating genetic mechanisms underlying growth regulation in bivalves. The GWAS study in the Yesso scallop(Patinopecten yessoensis) has pinpointed the E2F3 gene as a key regulator of growth-related traits. However, the specific role of E2F3 in bivalve growth remains unclear. This study aimed to further confirm the regulatory function of the E2F3 gene in the dwarf surf clam through RNA interference experiments. Our results revealed several genes are associated with individual growth and development, including CTS7, HSP70B2, and PGLYRP3, as well as genes involved in lipid metabolism such as FABP2 and FASN. Functional enrichment analysis indicated that E2F3 primarily modulates critical processes like amino acid and lipid metabolism. These findings suggest that E2F3 likely regulates growth in the dwarf surf clam by influencing amino acid and lipid metabolism. Overall, this study advances our understanding on the function of E2F3 gene in growth regulation in bivalves, providing valuable insights for future research in this field.

关键词： bivalve dwarf surf clam Mulinia lateralis E2F3 growth regulation RNA interference experiment transcriptomic analysis

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Dynamic Topology Multi Force Particle Swarm Optimization Algorithm and Its Application

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Chinese Journal of Mechanical Engineering 2016年第1期29卷 124-135页

作者： CHEN Dongning ZHANG ruixing yao Chengyu ZHAO Zheyu Hebei Provincial Key Laboratory of Heavy Machinery Fluid Power Transmission and Control Yanshan University Qinhuangdao 066004 China Key Laboratory of Advanced Forging & Stamping Technology and Science (Yanshan University) Ministry of Education of China Qinhuangdao 066004 China Hebei Provincial Key Laboratory of Industrial Computer Control Engineering Yanshan University Qinhuangdao 066004 China

Particle swarm optimization （PSO） algorithm is an effective bio-inspired algorithm but it has shortage of premature convergence. Researchers have made some improvements especially in force rules and population topologies. However, the current algorithms only consider a single kind of force rules and lack consideration of comprehensive improvement in both multi force rules and population topologies. In this paper, a dynamic topology multi force particle swarm optimization （DTMFPSO） algorithm is proposed in order to get better search performance. First of all, the principle of the presented multi force particle swarm optimization （MFPSO） algorithm is that different force rules are used in different search stages, which can balance the ability of global and local search. Secondly, a fitness-driven edge-changing （FE） topology based on the probability selection mechanism of roulette method is designed to cut and add edges between the particles, and the DTMFPSO algorithm is proposed by combining the FE topology with the MFPSO algorithm through concurrent evolution of both algorithm and structure in order to further improve the search accuracy. Thirdly, Benchmark functions are employed to evaluate the performance of the DTMFPSO algorithm, and test results show that the proposed algorithm is better than the well-known PSO algorithms, such as gPSO, MPSO, and EPSO algorithms. Finally, the proposed algorithm is applied to optimize the process parameters for ultrasonic vibration cutting on SiC wafer, and the surface quality of the SiC wafer is improved by 12.8% compared with the PSO algorithm in Ref. [25]. This research proposes a DTMFPSO algorithm with multi force rules and dynamic population topologies evolved simultaneously, and it has better search performance.

关键词： force rule MFPSO algorithm FE topology DTMFPSO algorithm parameter optimization

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浅谈会计委派制的理论及推行措施

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价值工程 2010年第3期29卷 13-13页

作者：要瑞星山西路桥第二工程有限公司临汾041000

从四方面讨论了财务会计委派制的理论依据,在分析当前会计委派制的利弊基础上探讨推行会计委派制的具体措施。

关键词：会计委派制理论依据利弊推行措施

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混合粒子交互微粒群算法

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机械工程学报 2015年第6期51卷 198-207页

作者：姚成玉王斌陈东宁张瑞星燕山大学河北省工业计算机控制工程重点实验室秦皇岛066004 燕山大学河北省重型机械流体动力传输与控制重点实验室秦皇岛066004 先进锻压成形技术与科学教育部重点实验室(燕山大学) 秦皇岛066004

针对现有微粒群算法仅考虑单一一种引斥力规则使得其搜索能力存在的不足,考虑在不同搜索阶段采用不同的引斥力规则,提出搜索后期引力增强型混合引斥力微粒群算法(LAPSO算法)。利用拟态物理学中的引斥力规则使粒子保持多样性,提高算法的... 详细信息

针对现有微粒群算法仅考虑单一一种引斥力规则使得其搜索能力存在的不足,考虑在不同搜索阶段采用不同的引斥力规则,提出搜索后期引力增强型混合引斥力微粒群算法(LAPSO算法)。利用拟态物理学中的引斥力规则使粒子保持多样性,提高算法的全局搜索能力;当进入到具有全局最优解的区域时,增强引力作用、减少斥力作用,利用比自身适应度好的粒子和全局最优解粒子的引力作用,提高算法的局部搜索能力。为进一步提高LAPSO算法的优化性能,将其与混合全连接型-环形拓扑结合,提出混合粒子交互微粒群算法(HIPSO算法)。通过6个Benchmark函数进行测试,结果表明,与现有的扩展-微粒群、微-微粒群、中值导向-微粒群等算法相比,所提的LAPSO算法、HIPSO算法具有较好的种群多样性,具有更好的寻优精度、收敛率和最优解搜索能力。结合文献[7]中的柔性流水车间调度离散优化实例和文献[20]中的超声振动加工工艺参数连续优化实例,验证了HIPSO算法的最优解搜索能力。

关键词：微粒群算法引斥力 LAPSO算法混合粒子交互 HIPSO算法

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基于脚步声的身份识别

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计算机应用与软件 2014年第1期31卷 162-164页

作者：张瑞兴王晅余瑶陕西师范大学物理学与信息技术学院陕西西安710062

现有的基于脚步声的身份识别研究方法均采用语音声学参数作为特征,例如梅尔倒谱系数、频谱包络相似度等,这类方法的缺点是对于同一人在不同鞋类和不同地板上的脚步声识别有很大的约束性和限制性,对不同的发声机制较为敏感。提出一种新... 详细信息

现有的基于脚步声的身份识别研究方法均采用语音声学参数作为特征,例如梅尔倒谱系数、频谱包络相似度等,这类方法的缺点是对于同一人在不同鞋类和不同地板上的脚步声识别有很大的约束性和限制性,对不同的发声机制较为敏感。提出一种新的步声特征提取方法,用步声持续时间与步声间隔时间作为识别特征,最后使用k-nn算法做识别测试。实验结果表明,该方法对于脚步声的身份识别是有效的,对于不同发声机制下的脚步声有良好的适用性。

关键词：脚步声身份识别发声机制步声间隔时间步声持续时间k近算法

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搜索后期斥力增强型混合引斥力微粒群算法及可靠性优化应用

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中国机械工程 2014年第21期25卷 2930-2936页

作者：陈东宁姚成玉王斌张瑞星燕山大学河北省重型机械流体动力传输与控制重点实验室秦皇岛066004 燕山大学先进锻压成形技术与科学教育部重点实验室秦皇岛066004 燕山大学河北省工业计算机控制工程重点实验室秦皇岛066004

将利用贝叶斯网络构造的系统故障概率函数作为可靠性指标,考虑费用、质量、体积构造了资源约束函数。针对微粒群算法引斥力规则的不足,提出了搜索后期斥力增强型混合引斥力微粒群算法(LRPSO算法):在搜索前期,使微粒在其他微粒的引斥力... 详细信息

将利用贝叶斯网络构造的系统故障概率函数作为可靠性指标,考虑费用、质量、体积构造了资源约束函数。针对微粒群算法引斥力规则的不足,提出了搜索后期斥力增强型混合引斥力微粒群算法(LRPSO算法):在搜索前期,使微粒在其他微粒的引斥力作用下进行最优搜索,以保持种群多样性;在搜索后期,减小引力、增强斥力,利用斥力项避免微粒陷入较差位置,以提高局部搜索能力。算法测试和可靠性优化实例验证了LRPSO算法的有效性。

关键词：可靠性优化贝叶斯网络引斥力 LRPSO算法

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健康青年人24h胃内pH和胆汁反流同步监测

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胃肠病学 2005年第2期10卷 88-92页

作者：姚树坤张艳丽张瑞星河北医科大学第四医院消化内科 050011

背景:生理性十二指肠胃反流(DGR)在正常人中普遍存在,其意义尚不明确。Bilitec2000便携式胆红素监测仪因能定量检测胆红素水平而成为公认的监测胃内胆汁反流最可靠而可行的方法,但目前尚缺乏统一的正常参考值范围。目的:探讨健康青年人... 详细信息

背景:生理性十二指肠胃反流(DGR)在正常人中普遍存在,其意义尚不明确。Bilitec2000便携式胆红素监测仪因能定量检测胆红素水平而成为公认的监测胃内胆汁反流最可靠而可行的方法,但目前尚缺乏统一的正常参考值范围。目的:探讨健康青年人生理性DGR的发生特点,并为其24h胃内胆汁反流监测提供正常参考值范围。方法:应用Bilitec2000便携式胆红素监测仪和pH监测仪同步监测48名健康青年志愿者的24h胃内pH和胆汁反流情况。计算3个胆红素吸收(BA)界值下的胆汁反流时间百分比,分析各时段胆汁反流参数的特点,同时行pH值与BA值的相关性分析。结果:健康青年人的胆汁反流程度个体差异较大,BA界值为0.14、0.20和0.25时,其胆汁反流总时间百分比的第95百分位数分别为64.1%、49.2%和33.3%。胆汁反流以短时间反流(<5min)最为常见,时间长于45min的反流事件主要发生于卧位时;立位时的短时间反流频率高于卧位,卧位时的最长反流时间长于立位。夜间胆汁反流事件(BA≥0.25)和胃自发性碱化(pH≥4)多不同步发生。结论:建议应用Bilitec2000便携式胆红素监测仪监测DGR时以0.25作为BA界值,健康青年人群生理性DGR胆汁反流总时间百分比的参考值范围上界为33.3%。生理性DGR的短时间胆汁反流主要发生于立位,反流事件主要发生于卧位。

关键词：健康青年人同步监测胃内pH 24h 正常参考值范围胆红素监测仪胃内胆汁反流十二指肠胃反流胆红素水平青年志愿者 pH监测仪相关性分析自发性碱化生理性 DGR 便携式百分比定量检测发生特点个体差异百分位数

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肝癥口服液含药血清对SMMC-7721肝癌细胞TGFβ1/Smads信号转导通路的影响

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中国组织化学与细胞化学杂志 2006年第4期15卷 441-446页

作者：孔丽姚树坤殷飞张瑞星河北医科大学第三医院肝病科河北医科大学第四医院消化科石家庄050051

目的观察肝癥口服液含药血清对SMMC-7721肝癌细胞TGFβ1/Smads信号转导通路的影响。方法以肝癌患者和健康志愿者服药前后血清培养人SMMC-7721肝癌细胞,应用RT-PCR和WesternBlotting方法观察含药血清对肝癌细胞SmadsmRNA及其蛋白表达的... 详细信息

目的观察肝癥口服液含药血清对SMMC-7721肝癌细胞TGFβ1/Smads信号转导通路的影响。方法以肝癌患者和健康志愿者服药前后血清培养人SMMC-7721肝癌细胞,应用RT-PCR和WesternBlotting方法观察含药血清对肝癌细胞SmadsmRNA及其蛋白表达的影响。结果肝癌患者肝癥口服液含药血清可增强Smad4mRNA及其蛋白表达,而抑制Smad7的过强表达,具有显著性差异;健康志愿者肝癥口服液含药血清可明显抑制肝癌细胞Smad7mRNA表达。结论解除TGFβ1/Smads信号转导通路过度受抑状态,可能是肝癥口服液抗癌的机制之一。

关键词：肝癥口服液肝癌细胞SMMC-7721 TGFβ1/Smads信号转导通路

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求解液压阀块加工车间调度的多作用力微粒群算法

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中国机械工程 2015年第3期26卷 369-378页

作者：陈东宁张瑞星姚成玉茜彦辉燕山大学河北省重型机械流体动力传输与控制重点实验室秦皇岛066004 先进锻压成形技术与科学教育部重点实验室(燕山大学) 秦皇岛066004 燕山大学河北省工业计算机控制工程重点实验室秦皇岛066004

为有效地解决液压阀块加工车间调度问题,考虑工序间和机器间的约束关系,以最大完成时间最小为目标,给出了液压阀块加工车间调度优化模型。为平衡算法的全局和局部搜索能力,提出了多作用力微粒群(MFPSO)算法,采用多作用力阶段性搜索策略... 详细信息

为有效地解决液压阀块加工车间调度问题,考虑工序间和机器间的约束关系,以最大完成时间最小为目标,给出了液压阀块加工车间调度优化模型。为平衡算法的全局和局部搜索能力,提出了多作用力微粒群(MFPSO)算法,采用多作用力阶段性搜索策略,将搜索过程划分为前期、中期、后期3个阶段,并对应构造单一斥力、平衡引斥力、单一引力3种作用力规则,在不同搜索阶段采用不同的作用力规则,提高了算法的搜索机制和寻优性能。将MFPSO算法用于求解液压阀块加工车间调度问题,利用矩阵变量来处理约束条件,给出了一种基于矩阵的微粒编码、解码方法。通过液压阀块加工车间调度优化实例,将MFPSO算法与微粒群算法、中值导向微粒群算法、扩展微粒群算法、蚁群算法进行了对比,结果表明,提出的MFPSO算法结果最优,从而验证了该算法的有效性。

关键词：液压阀块加工车间调度微粒群算法作用力规则 MFPSO算法

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中药脂肝宁预防酒精性脂肪肝的实验研究

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中国组织化学与细胞化学杂志 2006年第3期15卷 328-332页

作者：周俊英姚树坤张瑞星河北医科大学第三医院感染科石家庄050051 河北医科大学第四医院消化科石家庄050014

目的探讨中药脂肝宁预防酒精性脂肪肝的作用机理。方法应用酒精灌胃方法建立大鼠酒精性脂肪肝模型,造模同时给予中药脂肝宁(ZGN)药物干预,以硫普罗宁(TPN)为对照,检测血清肝功能和肝匀浆甘油三酯(TG)、氧自由基(ORF)、抗超氧阴离子(ASOA... 详细信息

目的探讨中药脂肝宁预防酒精性脂肪肝的作用机理。方法应用酒精灌胃方法建立大鼠酒精性脂肪肝模型,造模同时给予中药脂肝宁(ZGN)药物干预,以硫普罗宁(TPN)为对照,检测血清肝功能和肝匀浆甘油三酯(TG)、氧自由基(ORF)、抗超氧阴离子(ASOA)、超氧化物歧化酶(SOD)及丙二醛(MDA)含量,并对大鼠肝脏行病理学检查。结果酒精灌胃12周后大鼠形成酒精性脂肪肝,中药脂肝宁高浓度组血清门冬氨酸氨基转移酶(AST)和肝匀浆TG、ORF及MDA含量显著降低,而ASOA和SOD含量升高(P<0.05),肝脏脂肪变明显改善。结论中药脂肝宁通过抑制氧化应激、稳定肝细胞膜、抑制脂质过氧化来改善酒精所致肝细胞脂肪变性。

关键词：脂肝宁酒精性脂肪肝实验研究

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