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Low expression of fatty acid oxidation related gene ACADM indicates poor prognosis of renal clear cell carcinoma and is related to tumor immune infltration

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Oncology Research 2024年第3期32卷 545-561页

作者： JIECHUAN QIU TIANMIN YANG yanning sun KAI sun YINGKUN XU QINGHUA XIA Department of Urology Shandong Provincial Hospital A fliated to Shandong First Medical UniversityJinan250021China Depatment of Urology Shandong Provincial HospitalCheeloo College of MedicineShandong UniversityJinan250021China Depatment of Breast and Thyroid Surgery The First Afiliated Hospital of Chongqing Medical UniversityChongqing400042China

This research aims to identify the key fatty acid beta-oxidation(FAO)genes that are altered in kidney renal clear cell carcinoma(KIRC)and to analyze the role of these genes in KIRC The Gene Expression Omnibus(GEO)and FAO datasets were used to identify these key genes.Wilcoxon rank sum test was used to assess the levels of acyl-CoA dehydrogenase medium chain(ACADM)between KIRC and non cancer samples.The logistic regression and Wilcoxon rank sum test were used to explore the association between ACADM and clinical features.The diagnostic performance of ACADM for KIRC was asessed using a diagnostic receiver operating ch aracteristic(ROC)curve.The co-expressed genes of ACADM were identifed in LinkedOmics database,and their function and pathway enrichment were analyzed.The correlation between ACADM expression level and immune infitration was analyzed by Gene Set Variation Analysis(GSVA)method Additionally,the proliferation,migration,and invasion abilities of KIRC cells were assessed after overexpressing ACADM.Following differential analysis and intersection,we identifed six hub genes,induding ACADM.We found that the expression level of ACADM was decreased in KIRC tissues and had a better diagnostic efect(AUC=0.916).Survival analysis suggested that patients with decreased ACADM expression had a worse prognosis.According to correlation analysis,a variety of dinical features were associated with the expression level of ACADML By analyzing the infiltration level of immune cells,we found that ACADM may be related to the enrichment of immune cells.Finally,ACADM overexpression inhibited proliferation,migration,and invasion of KIRC cells.In conclusion,our findings suggest that reduced ACADM expression in KIRC patients is indicative of poor prognosis.These results imply that ACADM may be a diagnostic and prognostic marker for individuals with KIRC,offering a reference for dinicians in diagnosis and treatment.

关键词： Kidney renal clear cell carcinoma Acyl CoA dehydrogenase medium chain Immune infiltration Fatty acid oxidation Prognosis

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Increased long-distance and homo-trans interactions related to H3K27me3 in Arabidopsis hybrids

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Journal of Integrative Plant Biology 2024年第2期66卷 208-227页

作者： Zhaoxu Gao yanning Su Le Chang Guanzhong Jiao Yang Ou Mei Yang Chao Xu Pengtao Liu Zejia Wang Zewen Qi Wenwen Liu Linhua sun Guangming He Xing Wang Deng Hang He School of Advanced Agriculture Sciences and School of Life Sciences State Key Laboratory of Protein and Plant Gene ResearchPeking UniversityBeijing 100871China College of Grassland Science Beijing Forestry UniversityBeijing 100083China Peking University Institute of Advanced Agricultural Sciences Shandong Laboratory of Advanced Agricultural Sciences in WeifangWeifang 261325China

In plants,the genome structure of hybrids changes compared with their parents,but the effects of these changes in hybrids remain elusive.Comparing reciprocal crosses between Col×C24 and C24×Col in Arabidopsis using high-throughput chromosome conformation capture assay(Hi-C)analysis,we found that hybrid three-dimensional(3D)chromatin organization had more long-distance interactions relative to parents,and this was mainly located in promoter regions and enriched in genes with heterosis-related pathways.The interactions between euchromatin and heterochromatin were increased,and the compartment strength decreased in hybrids.In compartment domain(CD)boundaries,the distal interactions were more in hybrids than their parents.In the hybrids of CURLY LEAF(clf)mutants clfCol×clfC24and clfC24×clfCol,the heterosis phenotype was damaged,and the long-distance interactions in hybrids were fewer than in their parents with lower H3K27me3.ChIP-seq data revealed higher levels of H3K27me3 in the region adjacent to the CD boundary and the same interactional homo-trans sites in the wild-type(WT)hybrids,which may have led to more long-distance interactions.In addition,the differentially expressed genes(DEGs)located in the boundaries of CDs and loop regions changed obviously in WT,and the functional enrichment for DEGs was different between WT and clf in the longdistance interactions and loop regions.Our findings may therefore propose a new epigenetic explanation of heterosis in the Arabidopsis hybrids and provide new insights into crop breeding and yield increase.

关键词： 3D chromatin organization H3K27me3 homo-trans hybrids long-distanceinteractions

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Mantle contributions to granitoids associated with Sn mineralization:Geochemical and isotopic evidence from the giant Dachang deposit,South China

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Geoscience Frontiers 2024年第1期15卷 187-208页

作者： Tingyi Wang Qihai Shu Xiaoping Xia Chao Li yanning Wang Jiahao Chen Xiang sun M.Santosh Qingfei Wang State Key Laboratory of Geological Processes and Mineral Resources China University of GeosciencesBeijing 100083China Frontiers Science Center for Deep-time Digital Earth China University of Geosciences(Beijing)Beijing 100083China State Key Laboratory of Isotope Geochemistry Guangzhou Institute of GeochemistryChinese Academy of SciencesGuangzhou 510640China National Research Center for Geoanalysis Chinese Academy of Geological SciencesBeijing 100037China Department of Earth Science University of AdelaideAdelaideSouth Australia 5005Australia State Key Laboratory of Nuclear Resources and Environment East China University of TechnologyNanchang 330013China

Major Sn deposits are commonly linked to crust-derived and highly evolved granites,with magma generation aided by mantle heating.However,whether and how the mantle components contribute to Sn polymetallic mineralization remains unclear.In this study,in combination with a compilation of equivalent data in the region,we provide new constraints on this issue based on detailed investigations on the petrogenesis and metallogenic significance of granitoids including the causative batholith and later granodiorite porphyry dike in the giant Dachang Sn deposit from South China.The former has zircon U-Pb ages of 93-91 Ma and belongs to highly evolved S-type biotite granite,which experienced fractionation of massive feldspar.The latter shows zircon U-Pb ages of 90 Ma and displays I-type granite features.The batholith was mainly derived from the dehydration melting of biotite in the metasedimentary sources,as revealed by the relatively low whole-rock Pb contents(850℃),whole-rock Mg#(52 to 58),apatiteεNd(t)(-9.2 to-6.5)and zirconεHf(t)(-7.6 to 2.5)values but lower zirconδ18O values(6.33 to 8.30‰)of the later granodiorite porphyry dike than those of the batholith also suggest that mantle material was involved in the generation of the dikes,which is evident by the variational features of zircon and apatite trace elements.In addition,at the zircon Hf0.05,the higher zirconΔFMQ values(mostly from-1.8 to 2.0)and H2O contents(100-1100 ppm)of the Dachang granitoids than the pure crust-derived S-type gr

关键词： Highly evolved S-type biotite granite I-type granodiorite porphyry dike Crust-mantle mixing Mantle contributions Dachang Sn mineralization

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拜登任内美欧同盟协调的演进及其对华影响

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国际关系研究 2024年第1期 41-59,M0004,M0005页

作者：孙成昊邹琰宁清华大学战略与安全研究中心《世界知识》杂志社

拜登任内的美欧同盟关系得到一定程度修复,双方在政策协调上取得部分成果,呈现一系列新特征。一方面,拜登政府采取应对乌克兰危机和实施大国竞争的“双线并举”政策,希望将欧洲纳入制衡中俄的战略轨道。另一方面,乌克兰危机升级后,欧洲... 详细信息

拜登任内的美欧同盟关系得到一定程度修复,双方在政策协调上取得部分成果,呈现一系列新特征。一方面,拜登政府采取应对乌克兰危机和实施大国竞争的“双线并举”政策,希望将欧洲纳入制衡中俄的战略轨道。另一方面,乌克兰危机升级后,欧洲在各领域遭受严重冲击,对美国依赖加深,美国也将部分精力和资源转向欧洲,欧洲对美国的政策影响力亦有所上升。美欧协调的状态和效果受到同盟管理方式、实力对比变化以及同盟内部因素的塑造。美欧试图将地区危机渲染为与中俄的阵营式对抗,美欧同盟协调也将对中国产生深刻影响,导致中国在经贸、安全和意识形态等领域面临更大挑战。同时,美欧对俄和对华问题的战略考量不同,其涉华政策协调依然有其局限性。面对美欧同盟协调演进的新动向,中国应保持警惕并积极运筹中美欧关系,构建和塑造对自身发展有利的外部环境。

关键词：拜登政府美欧同盟政策协调中美欧关系

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城区数字高程模型修正方法:顾及空间异质性的可解释随机森林模型

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地球信息科学学报 2024年第4期26卷 978-988页

作者：刘妍孙延宁陈传法刘盼盼刘雅婷山东科技大学测绘与空间信息学院青岛266590 山东省水利科学研究院济南250101

目前,以遥感测量手段获取的全球数字高程模型(Global Digital Elevation Model,GDEM)在城区含有各种地物而不能反映真实的地球表面形态。因此,为提高城区GDEM产品质量,本文提出了一种顾及空间异质性和SHAP(Shapley Additive Explanatio... 详细信息

目前,以遥感测量手段获取的全球数字高程模型(Global Digital Elevation Model,GDEM)在城区含有各种地物而不能反映真实的地球表面形态。因此,为提高城区GDEM产品质量,本文提出了一种顾及空间异质性和SHAP(Shapley Additive Explanations)特征筛选的GDEM修正方法。该方法首先利用高斯混合聚类(Gaussian Mixture Model,GMM)和泰森多边形将研究区域划分为同质子区,解决GDEM修正误差和特征因子空间关系的异质性问题;然后基于SHAP可解释框架筛选每个子区的最优特征变量并借助随机森林(RF)构建对应的修正模型用于城区GDEM修正。为验证本文方法的实用性和高效性,以纽约30 m分辨率的COPDEM(COPDEM30)为研究对象,将本文方法与其他3种方法(包括顾及空间异质性的局域随机森林(SH-RF)、顾及SHAP特征筛选的全局随机森林(FS-RF)和传统随机森林(RF))的预估结果以及一种去除建筑物和植被偏差的GDEM(FABDEM)进行对比。实验结果表明,本文方法预测效果最优,SH-RF、FS-RF次之,RF效果最差。此外,与FABDEM相比,本文方法的平均绝对误差(MAE)降低了42.3%,中误差(RMSE)降低了63.2%。对本文方法的迁移实验表明,相比原始COPDEM30,修正后GDEM的MAE和RMSE分别降低了50.5%和50.4%。

关键词：全球数字高程模型修正空间异质性 SHAP可解释模型特征筛选城区精度评价

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利妥昔单抗治疗过程中复发视神经脊髓炎谱系疾病患者外周血淋巴细胞亚群特征分析

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中华神经医学杂志 2024年第4期23卷 372-378页

作者：黄燕宁武雷孙慧高赛黄德晖张熙南开大学医学院天津300071 中国人民解放军总医院神经内科北京100853

目的通过分析利妥昔单抗(RTX)治疗期间复发视神经脊髓炎谱系疾病(NMOSD)患者外周血淋巴细胞亚群特征,明确不同淋巴细胞亚群对NMOSD复发的影响。方法收集中国人民解放军总医院神经内科自2018年8月至2023年8月收治的76例外周血水通道蛋白4... 详细信息

目的通过分析利妥昔单抗(RTX)治疗期间复发视神经脊髓炎谱系疾病(NMOSD)患者外周血淋巴细胞亚群特征,明确不同淋巴细胞亚群对NMOSD复发的影响。方法收集中国人民解放军总医院神经内科自2018年8月至2023年8月收治的76例外周血水通道蛋白4-IgG阳性NMOSD患者使用RTX治疗期间的175次淋巴细胞亚群监测数据,根据数据采集时患者是否处于复发状态将数据分为复发组(n=26)和非复发组(n=149)。通过两样本t检验或Mann-Whitney U检验比较2组数据对应的RTX使用时间间隔及淋巴细胞亚群差异,并通过点二列相关分析初步探讨各淋巴细胞亚群及RTX使用时间间隔与NMOSD患者复发之间的相关性。结果复发组RTX使用时间间隔较未复发组明显延长[10.00(6.73,14.37)月vs.7.27(6.30,9.10)月],CD3-CD56^(+)自然杀伤淋巴细胞百分比较未复发组明显偏低[10.72%(7.06%,15.34%)vs.13.85%(9.42%,20.13%)],而CD19^(+)B淋巴细胞百分比较未复发组明显升高[7.41%(1.18%,15.70%)vs.3.55%(0.38%,8.74%)],差异均有统计学意义(P<0.05)。RTX使用时间间隔、CD3-D19^(+)B淋巴细胞与NMOSD是否复发之间存在正相关关系(r=0.363,P<0.001;r=0.218,P=0.004),CD3-CD56^(+)自然杀伤淋巴细胞与NMOSD是否复发之间存在负相关关系(r=-0.193,P=0.011)。结论RTX使用时间间隔延长增加NMOSD复发风险;CD3-CD56^(+)自然杀伤淋巴细胞、CD19^(+)B淋巴细胞可能参与NMOSD患者的疾病状态调控。

关键词：视神经脊髓炎谱系疾病利妥昔单抗复发淋巴细胞

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多源遥感日降水数据融合方法:顾及空间自相关的随机森林模型

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地球信息科学学报 2024年第6期26卷 1517-1530页

作者：何青鑫陈传法王宇辉孙延宁刘雅婷胡保健山东科技大学测绘与空间信息学院青岛266590 几核(浙江)科技有限公司湖州313000 山东省水利科学研究院济南250101

高质量的降水数据是气象服务与水文应用的基础资料保障,多时空尺度的卫星降水数据作为重要的降水数据源,现已被广泛应用到水文气象领域。然而,卫星降水产品存在空间分辨率粗糙、准确性差等问题,难以满足精细化水文和气象的应用需求。本... 详细信息

高质量的降水数据是气象服务与水文应用的基础资料保障,多时空尺度的卫星降水数据作为重要的降水数据源,现已被广泛应用到水文气象领域。然而,卫星降水产品存在空间分辨率粗糙、准确性差等问题,难以满足精细化水文和气象的应用需求。本文以随机森林(Random Forest,RF)为基础模型,提出一种顾及空间自相关性的多源遥感日降水数据融合方法(Spatial Random Forest Multi-source Fusion,SRF-MF)。该方法首先基于降水与环境因子之间存在较强的相关性,在月尺度上利用空间随机森林对多种卫星降水产品分别进行降尺度,然后根据日比率将月降水分解为日降水,最后借助随机森林将降尺度数据和站点数据融合,最终生成高质量的日降水数据。利用2015—2019年四川省5种卫星降水产品(CHIRPS、CMORPH、PERSIANN、GAMaP和IMERG)和实测雨量计数据,通过SRF-MF方法生成了逐日降水数据集,并将该数据集与原始卫星降水产品和5种机器学习方法比较,包括随机森林合并方法(RF-MEP)、单机器学习方法(RF、ANN)和双机器学习方法(RF-RF、RF-ANN)。实验结果表明,在不同时间尺度上(日、月、季、年)SRF-MF方法产生的降水数据集精度均明显优于其他几种方法,而且针对不同强度降水事件的捕捉精度更高,其降水分布图的空间细节信息更加丰富,准确性更高。本文研究结果将为提高卫星降水数据质量,以及扩大应用领域提供研究思路。

关键词：降水多源数据空间自相关融合日尺度机器学习降尺度精细化

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一种超参数自适应航天器交会变轨策略优化方法

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宇航学报 2024年第1期45卷 52-62页

作者：孙雷翔郭延宁邓武东吕跃勇马广富哈尔滨工业大学(深圳)空间科学与应用技术研究院深圳518055 哈尔滨工业大学航天学院哈尔滨150001 上海卫星工程研究所上海201109

利用强化学习技术,本文提出了一种超参数自适应的燃料最优地球同步轨道(GEO)航天器交会变轨策略优化方法。首先,建立了GEO航天器交会Lambert变轨模型。以变轨时刻为决策变量、燃料消耗为适应度函数,使用改进式综合学习粒子群算法(ICLPSO... 详细信息

利用强化学习技术,本文提出了一种超参数自适应的燃料最优地球同步轨道(GEO)航天器交会变轨策略优化方法。首先,建立了GEO航天器交会Lambert变轨模型。以变轨时刻为决策变量、燃料消耗为适应度函数,使用改进式综合学习粒子群算法(ICLPSO)作为变轨策略优化的基础方法。其次,考虑到求解的最优性和快速性,重新设计了以粒子群算法(PSO)优化结果为参考基线的奖励函数。使用一族典型GEO航天器交会工况训练深度确定性策略梯度神经网络(DDPG)。将DDPG与ICLPSO组合为强化学习粒子群算法(RLPSO),从而实现算法超参数根据实时迭代收敛情况的自适应动态调整。最后,仿真结果表明与PSO、综合学习粒子群算法(CLPSO)相比,RLPSO在较少迭代后即可给出适应度较高的规划结果,减轻了迭代过程中的计算资源消耗。

关键词：地球同步轨道 Lambert变轨强化学习粒子群算法深度确定性策略梯度

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4种常见木质素有机溶剂法分级的研究进展

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中国造纸学报 2024年第2期39卷 1-8页

作者：程鹏超孙衍宁李尧李继庚王兴孙广卫张馨月大连工业大学轻工与化学工程学院辽宁生物质化学与材料重点实验室辽宁大连116034 华南理工大学制浆造纸工程国家重点实验室广东广州510640

随着对木质素基生物质材料开发和研究的逐渐深入,进一步提高木质素基生物质材料的性能,需对木质素原料进行结构分级。有机溶剂法分级是一种可以获得具有特定理化性质木质素的简单可行的分级方法。本文总结了近年来采用有机溶剂法,对硫... 详细信息

随着对木质素基生物质材料开发和研究的逐渐深入,进一步提高木质素基生物质材料的性能,需对木质素原料进行结构分级。有机溶剂法分级是一种可以获得具有特定理化性质木质素的简单可行的分级方法。本文总结了近年来采用有机溶剂法,对硫酸盐木质素、有机溶剂木质素、碱木质素和酶解木质素4种常见木质素进行分级,且分级效果较好的研究成果,利用分子质量及分子质量分布,以及醇羟基、酚羟基、甲氧基等官能团含量作为分级评价指标,比较了不同分级策略所使用的单一或多种有机溶剂的分级特点和优缺点,并对木质素分级研究作简要总结和展望。

关键词：木质素分级方法有机溶剂分子质量分布

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以酚醛树脂为前驱体合成氮掺杂中空碳球及其类酶活性研究

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化工新型材料 2024年第6期52卷 132-138页

作者：汪玉鑫郑燕宁杨崎峰孙建华孙丽霞张美新廖丹葵广西大学化学化工学院广西石化资源加工及过程强化技术重点实验室南宁530004 广西博世科环保科技股份有限公司南宁530007

以间苯二酚甲醛树脂为前驱体,三聚氰胺为氮源,球形碳酸钙为模板剂,氢氧化钾为扩孔剂,通过硬模板法合成了氮掺杂中空碳球(NHCSs),通过扫描电子显微镜、场发射透射电子显微镜、X射线光电子能谱仪对NHCSs的微观形貌、表面元素组成及化学价... 详细信息

以间苯二酚甲醛树脂为前驱体,三聚氰胺为氮源,球形碳酸钙为模板剂,氢氧化钾为扩孔剂,通过硬模板法合成了氮掺杂中空碳球(NHCSs),通过扫描电子显微镜、场发射透射电子显微镜、X射线光电子能谱仪对NHCSs的微观形貌、表面元素组成及化学价态进行了表征,探究了NHCSs过氧化物模拟酶活性及反应体系中产生的活性氧中间体。结果表明:在弱酸性和H_(2)O_(2)存在的条件下,NHCSs可以快速地催化氧化3,3′,5,5′-四甲基联苯胺(TMB)生成蓝色产物;经过氢氧化钾扩孔处理后的NHCS-1对TMB和H_(2)O_(2)具有良好的亲和力;超氧自由基·O_(2)^(-)和羟基自由基·OH是主要的活性物种。采用简单快速的比色法检测H_(2)O_(2),线性范围为8~1000μmol/L,检测限为4.97μmol/L。

关键词：氮掺杂中空碳球过氧化物模拟酶比色法

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