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RNA-based NGS检测EML4-ALK融合V1亚型肺腺癌1例

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中国肺癌杂志 2024年第6期27卷 480-484页

作者：徐悦穆宁刘梅吴盛楠马春华天津市人民医院肿瘤诊疗中心天津300121

肺癌是全球发病率和死亡率最高的恶性肿瘤。对于肺腺癌而言,识别特定的基因突变并给予相应靶向药物可大大提高患者的生存时间。其中,间变性淋巴瘤激酶(anaplastic lymphoma kinase,ALK)融合发生在3%-7%的非小细胞肺癌(non-small cell lu... 详细信息

肺癌是全球发病率和死亡率最高的恶性肿瘤。对于肺腺癌而言,识别特定的基因突变并给予相应靶向药物可大大提高患者的生存时间。其中,间变性淋巴瘤激酶(anaplastic lymphoma kinase,ALK)融合发生在3%-7%的非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中。在临床中,多种检测方法可应用于判断ALK融合状态,但存在检测结果假阴性可能。本文回顾性分析1例肺腺癌患者的诊治经过,经多种检测方式判断ALK融合状态,其中,免疫组化(immunohistochemistry,IHC)(Ventana D5f3)、基于RNA的下一代测序(RNA-based next-generation sequencing,RNA-based NGS)检测证实棘皮类微管关联蛋白样4(echinoderm microtubule associated protein like 4,EML4)-ALK融合阳性,而基于DNA的NGS(DNA-based NGS)检测为阴性。本文比较分析判断ALK融合的检测方法,以明确在不同临床案例中选择何种检测方式最准确、最简便,以便于指导后续治疗。

关键词：肺肿瘤间变性淋巴瘤激酶基因融合下一代测序免疫组化靶向治疗

河北阳原马鞍山遗址1997-1998年发掘基本材料与初步认识

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人类学学报 2024年第1期43卷 67-80页

作者：冯玥梅惠杰谢飞孙秀丽王幼平北京大学中国考古学研究中心北京100871 北京大学考古文博学院北京100871 河北师范大学石家庄050024 河北省文物考古研究院石家庄050033 中国文化遗产研究院北京100029

马鞍山遗址位于泥河湾盆地桑干河北岸二级阶地,是虎头梁遗址群的重要组成部分。1997-1998年发掘获得多层古人类活动面,石制品和动物化石数以万计,编号标本3549件,遗迹包括十余处火塘和一个可能为储藏坑的遗迹。^(14)C测年的贝叶斯模型显... 详细信息

马鞍山遗址位于泥河湾盆地桑干河北岸二级阶地,是虎头梁遗址群的重要组成部分。1997-1998年发掘获得多层古人类活动面,石制品和动物化石数以万计,编号标本3549件,遗迹包括十余处火塘和一个可能为储藏坑的遗迹。^(14)C测年的贝叶斯模型显示,遗址校正后的年代大致距今1.7-1.5万年。石制品以火山角砾岩为主要原料,以楔形细石核技法为主要特征,石器类型多样;动物化石数量较少,主要为羊、马、牛等大中型偶蹄动物,还有少量鸵鸟蛋皮串珠和1件骨锥。这些发现为认识泥河湾盆地与东北亚地区在更新世末期的人群交流与文化互动提供了重要线索,也是探讨华北北部地区旧石器-新石器过渡阶段历史过程的关键材料。

关键词：马鞍山遗址细石核虎头梁遗址东北亚旧石器-新石器过渡

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Learning a graph-based classifier for fault localization

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Science China(Information Sciences) 2020年第6期63卷 195-216页

作者： Hao ZHONG Hong mei Department of Computer Science and Engineering Shanghai Jiao Tong University

Because software emerged, locating software faults has been intensively researched, culminating in various approaches and tools that have been applied in real development. Despite the success of these developments, improved tools are still demanded by programmers. Meanwhile, some programmers are reluctant to use any tools when locating faults in their development. The state-of-the-art situation can be naturally improved by learning how programmers locate faults. The rapid development of open-source software has accumulated many bug fixes. A bug fix is a specific type of comments containing a set of buggy files and their corresponding fixed files, which reveal how programmers repair bugs. feasibly, an automatic model can learn fault locations from bug fixes, but prior attempts to achieve this vision have been prevented by various technical challenges. for example, most bug fixes are not compilable after checking out, which hinders analyzing bug fixes by most advanced static/dynamic tools. This paper proposes an approach called Clafa that trains a graph-based fault classifier from bug fixes. Clafa is built on a recent partial-code tool called Grapa, which enables the analysis of partial programs by the complete code tool called WALA. Once Grapa has built a program dependency graph from a bug fix, Clafa compares the graph from the buggy code with the graph from the fixed code, locates the buggy nodes, and extracts the various graph features of the buggy and clean nodes. Based on the extraction result, Clafa trains a classifier that combines Adaboost and decision tree learning. The trained Clafa can predict whether a node of a program dependency graph is buggy or *** evaluate Clafa on thousands of buggy files collected from four open-source projects: Aries, Mahout,Derby, and Cassandra. The f-scores of Clafa achieves are approximately 80% on all projects.

关键词： fault classifier partial code analysis bug fix analysis

基于物理白盒子与翻转课堂的系统辨识实验教学改革实践

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实验室研究与探索 2024年第10期43卷 169-174,227页

作者：陆金金梅名豪田园大连海事大学船舶电气工程学院辽宁大连116026

为降低系统辨识入门难度,激发学生的学习兴趣,开发了一套实验教学装置,设计了一个内部结构为一阶和二阶电路而参数未知的待测对象“白盒子”,采用STM32f103单片机实现波形测量,结合上位机实现虚拟示波器与标尺功能。设计基于阶跃响应法... 详细信息

为降低系统辨识入门难度,激发学生的学习兴趣,开发了一套实验教学装置,设计了一个内部结构为一阶和二阶电路而参数未知的待测对象“白盒子”,采用STM32f103单片机实现波形测量,结合上位机实现虚拟示波器与标尺功能。设计基于阶跃响应法的实验内容,逐步递进辨识系统参数。结合翻转课堂教学模式,提高学生参与度。教学实施结果表明,基于物理白盒子的辨识实验有助于学生深入理解系统辨识概念并掌握基本方法,从形象思维转向抽象思维,提高实践能力。

关键词：实验教学系统辨识翻转课堂虚拟示波器

不同缩尺下悬索桥隧道锚原位模型承载特性试验研究

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铁道科学与工程学报 2024年第6期21卷 2384-2395页

作者：茆大炜杜少华左成荣梅松华中国电建集团中南勘测设计研究院有限公司湖南长沙410014 水能资源利用关键技术湖南省重点实验室湖南长沙410014 河南科技大学土木建筑学院河南洛阳471023

为探究隧道锚模型“缩尺效应”引起的试验结果差异性,以丽江金沙江大桥悬索桥实桥隧道锚为研究对象,按照相似理论开展不同缩尺原位模型试验,以期获得不同几何相似比对模型受载后变形变位特性、流变特性、潜在破坏模式及超载性能等方面... 详细信息

为探究隧道锚模型“缩尺效应”引起的试验结果差异性,以丽江金沙江大桥悬索桥实桥隧道锚为研究对象,按照相似理论开展不同缩尺原位模型试验,以期获得不同几何相似比对模型受载后变形变位特性、流变特性、潜在破坏模式及超载性能等方面的响应规律。针对变形和应变等效应量,采用多点式位移计、应变计及压力盒综合测试了锚塞体及周围岩体在不同应力水平下的变形规律与破坏特征;针对长期变形、承载特性,借助气液式加载系统加载到0.824 MPa和2.472 MPa,获得2种荷载下锚塞体及周围岩体的蠕变全过程。结果表明:在各级荷载加载下,模型锚塞体流变阶段变形较大,周边围岩节理裂隙在不同荷载水平作用下被逐渐压密,其中1∶12缩尺条件下的围岩裂隙压密主要发生在第1级荷载过程,1∶20缩尺条件下主要发生在第3级荷载作用下。相比于1∶12缩尺模型,1∶20锚塞体模型变形量较为明显,但两者整体变形特征基本一致,反映围岩破碎程度不利于隧道锚变形稳定。1∶12缩尺模型的后锚面及围岩表面变形分布呈马鞍形,而1∶20缩尺下模型对应的变形分布则呈现双峰形,且2种缩尺下锚塞体板上和围岩的变形残余率均较高。研究结果为分析悬索桥隧道锚因缩尺效应造成的承载特性差异性提供参考。

关键词：悬索桥隧道锚原位模型试验缩尺效应承载特性

液相法合成MOf-808催化糠醛转移加氢研究

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化学研究与应用 2024年第1期36卷 34-41页

作者：王彤夏晓光左艳梅扬州工业职业技术学院化学工程学院江苏扬州225127

采用简单易行的常压液相合成法,通过调节氧氯化锆和均苯三甲酸的比例,制备得到MOf-808-x,利用X-射线衍射(XRD)、傅里叶红外光谱(fT-IR)、场发射透射电子显微镜(TEM)等对其结构、形貌进行一系列表征。以糠醛加氢为探针反应,考察了MOf-80... 详细信息

采用简单易行的常压液相合成法,通过调节氧氯化锆和均苯三甲酸的比例,制备得到MOf-808-x,利用X-射线衍射(XRD)、傅里叶红外光谱(fT-IR)、场发射透射电子显微镜(TEM)等对其结构、形貌进行一系列表征。以糠醛加氢为探针反应,考察了MOf-808-x在异丙醇为氢供体体系中催化糠醛转移加氢制糠醇反应性能,并优化了反应条件。结果表明:合成催化剂适宜的原料配比可以提高反应活性。以MOf-808-1为催化剂时,在100℃反应2 h,糠醛转化率为100%,糠醇选择性>99%。

关键词：液相法金属有机框架糠醇转移加氢

Anion Exchange Membranes Based on Chloromethylation of fluorinated Poly（arylene ether）s

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Chemical Research in Chinese Universities 2015年第6期31卷 1056-1061页

作者： mei Wenhai Laboratory of Polymer Composites Engineering Changchun Institute of Applied Chemistry Chinese Academy of Sciences Changchun 130022 P. R. China State Key Laboratory of Polymer Physics and Chemistry Chinese Academy of Sciences Changehun 130022 P. R. China University of Chinese Academy of Sciences Beijing 100049 P. R. China

This report details the properties of fluorine-containing anion exchange membranes（AEMs） synthesized by chloromethylation and quaternization of fluorinated poly（arylene ether）s（fPAEs） based on decafluorobiphenyl and bisphenol A. Meanwhile, we compared their properties with those of their non-fluorinated counterparts, Udel-based AEMs. The reactivity of the chloromethylation of fluorinated poly（arylene ether）s was lowered by the strong elec- tron-withdrawing group, per-fluorinated biphenyl residue. Therefore higher temperature, more chloromethylation reagent, and longer reaction time were needed in the chloromethylation of fPAEs. Because of the hydrophobicity of fluorine, the swelling of fPAEs was depressed. In the fPAE-based AEMs, the water uptake of fPAE-1 membrane（f-1） was just 30%. There is a strong correlation between water uptake and conductivity for both Udel- and fPAE-based AEMs. Among all the membranes, the water uptake and the conductivity of fPAE-3 membrane（f-3） could reach up to 100% and 13.47 mS/cm respectively at 30 ℃. The mechanical properties of fPAE-based AEMs at room tempera- ture were worse than those of Udel-based ones because of the weak intermolecular interaction caused by the low po- larizability of fluorine. However, their high temperature mechanical properties are better, which can be explained in terms of low swelling.

关键词： Anion exchange membrane fluorinated poly(arylene ether) Chloromethylation

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联合全息平面与物平面的全息图质量评价

激光杂志 2024年第7期45卷 124-129页

作者：鲁轶凡蒋志迪郁梅宁波大学信息科学与工程学院宁波315211 宁波大学科学技术学院宁波315300

数字全息图可为用户提供更详细的3D信息;但其编码失真及特殊的性质为其质量评价带来了挑战。提出了一种联合全息平面与物平面的全参考全息图质量评价方法。首先,在全息平面上利用信息保真度准则度量了压缩全息图的退化程度。其次,在物... 详细信息

数字全息图可为用户提供更详细的3D信息;但其编码失真及特殊的性质为其质量评价带来了挑战。提出了一种联合全息平面与物平面的全参考全息图质量评价方法。首先,在全息平面上利用信息保真度准则度量了压缩全息图的退化程度。其次,在物平面上对重建的多视口参考全息图和压缩全息图提取显著性加权的梯度相似度,再利用Grünwald-Letnikov分数阶导数度量全局特征变化;结合二者计算重建的多视口参考全息图和压缩全息图的相似度。最后,将全息平面的计算结果和物平面的相似度作为联合特征,利用随机森林对以上特征进行训练,建立质量评价模型。实验结果表明,所提出方法的PLCC约为0.9179,SROCC约为0.9075,优于相关代表性全息图质量评价方法,与人眼主观感受契合度更高。

关键词：全息图全息平面物平面全参考全息图质量评价

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虚拟现实中视觉诱发晕动症时空多特征评价

光学精密工程 2024年第4期32卷 595-608页

作者：董奇峰郁梅蒋志迪鲁子昂蒋刚毅宁波大学信息科学与工程学院浙江宁波315211 宁波大学科学技术学院信息工程学院浙江宁波315212

沉浸式的虚拟现实体验中视觉诱发晕动症(Visually Induced Motion Sickness,VIMS)是影响虚拟现实系统发展与应用的一个重要问题。现有的基于视觉内容的评价方案大多考虑的要素不够全面,对运动信息的提取较为简单,且少有考虑时域上的突... 详细信息

沉浸式的虚拟现实体验中视觉诱发晕动症(Visually Induced Motion Sickness,VIMS)是影响虚拟现实系统发展与应用的一个重要问题。现有的基于视觉内容的评价方案大多考虑的要素不够全面,对运动信息的提取较为简单,且少有考虑时域上的突变对晕动症的影响。针对上述问题,提出了虚拟现实中视觉诱发晕动症时空多特征评价模型;基于立体全景视频中空域、时域信息来设计视觉诱发晕动症评价模型,采用更符合人眼感知的加权运动特征,并考虑了立体全景视频时域的突变信息设计了特征提取方式。所提出模型分为预处理模块、特征提取模块及时域聚合与回归模块。预处理模块用于视口提取和光流图、视差图、显著图的估计。特征提取模块包含前背景加权运动特征提取、基于变换域的视差特征提取、空间特征提取及时域突变特征提取。时域聚合后通过支持向量回归得到VIMS评价分数。实验结果表明,该模型在立体全景视频数据库SPVCD上的预测结果与平均主观意见分的皮尔逊线性相关系数为0.821、斯皮尔曼相关系数为0.790、均方根误差为0.489。该模型取得了优良的预测性能,验证了所提出特征提取模块的有效性。

关键词：虚拟现实立体全景视频晕动症运动感知突变特征