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Integrated analysis of human influenza A(H1N1)virus infectionrelated genes to construct a suitable diagnostic model

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BIOCELL 2021年第4期45卷 885-899页

作者： WENBIAO CHEN KEFAN BI JINGJING JIANG xujun zhang HONGYAN DIAO State Key Laboratory for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases National Clinical Research Center for Infectious DiseasesCollaborative Innovation Center for Diagnosis and Treatment of Infectious DiseasesThe First Affiliated HospitalCollege of MedicineZhejiang UniversityHangzhou310003China

The genome characteristics and structural functions of coding proteins correlate with the genetic diversity of the H1N1 virus,which aids in the understanding of its underlying pathogenic *** this study,analyses of the characteristic of the H1N1 virus infection-related genes,their biological functions,and infection-related reversal drugs were ***,we used multi-dimensional bioinformatics analysis to identify the key genes and then used these to construct a diagnostic model for the H1N1 virus *** was a total of 169 differently expressed genes in the samples between 21 h before infection and 77 h after *** were used during the protein-protein interaction(PPI)analysis,and we obtained a total of 1725 interacting ***,we performed a weighted gene co-expression network analysis(WGCNA)on these genes,and we identified three modules that showed significant potential for the diagnosis of the H1N1 virus *** modules contained 60 genes,and they were used to construct this diagnostic model,which showed an effective prediction ***,these 60 genes were involved in the biological functions of this infectious virus,like the cellular response to type I interferon and in the negative regulation of the viral life ***,20 genes showed an upregulated expression as the infection *** 36 upregulated genes were used to examine the relationship between genes,human influenza A virus,and infection-related reversal *** study revealed numerous important reversal drug molecules on the H1N1 *** included rimantadine,interferons,and shikimic *** study provided a novel method to analyze the characteristic of different genes and explore their corresponding biological function during the infection caused by the H1N1 *** diagnostic model,which comprises 60 genes,shows that a significant predictive value can be the potential biomarker for the diagnosis of the H1N1 virus infection.

关键词： Human influenza A H1N1 virus Gene Diagnosis model

Proteome-Wide Profiling of the Covalent-Druggable Cysteines with a Structure-Based Deep Graph Learning Network

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Research 2022年第4期2022卷 435-449页

作者： Hongyan Du Dejun Jiang Junbo Gao xujun zhang Lingxiao Jiang Yundian Zeng Zhenxing Wu Chao Shen Lei Xu Dongsheng Cao Tingjun Hou Peichen Pan Innovation Institute for Artificial Intelligence in Medicine of Zhejiang University College of Pharmaceutical SciencesZhejiangUniversityHangzhou310058ZhejiangChina State Key Lab of CADe-CG Zhejiang UniversityHangzhou310058 ZhejiangChina Institute of Bioinformatics and Medical Engineering School of Electrical and Information EngineeringJiangsu University of TechnologyChangzhou213001China Xiangya School of Pharmaceutical Sciences Central South UniversityChangsha410004 HunanChina

Covalent ligands have attracted increasing attention due to their unique advantages,such as long residence time,high selectivity,and strong binding *** also show promise for targets where previous efforts to identify noncovalent small molecule inhibitors have ***,our limited knowledge of covalent binding sites has hindered the discovery of novel ***,developing in silico methods to identify covalent binding sites is highly ***,we propose DeepCoSI,the first structure-based deep graph learning model to identify ligandable covalent sites in the *** integrating the characterization of the binding pocket and the interactions between each cysteine and the surrounding environment,DeepCoSI achieves state-of-the-art predictive *** validation on two external test sets which mimic the real application scenarios shows that DeepCosI has strong ability to distinguish ligandable sites from the ***,we profiled the entire set of protein structures in the RCSB Protein Data Bank(PDB)with DeepCoSI to evaluate the ligandability of each cysteine for covalent ligand design,and made the predicted data publicly available on website.

关键词： valent integrating selectivity

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用小波变换矩阵作小波分析

电力系统自动化 1999年第24期23卷 36-38页

作者：张旭俊江西省电力试验研究所南昌330006

详细地介绍了用Harr变换对暂态信号进行分解和重构的方法。该法易于根据需要，在重构时突出信号的基本概况或某些细节。与其他变换相比，易于掌握，计算量少。由文中计算实例来看，该法值得进一步研究。

关键词：小波分析小波变换矩阵电力系统

基于TFNCD算子的三角模糊数多属性群决策

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系统工程与电子技术 2019年第9期41卷 2065-2071页

作者：江登英张徐军武汉理工大学理学院

针对属性权重和专家权重全部未知的三角模糊数(triangular fuzzy number,TFN)多属性群决策问题,在TFN熵的基础上构造了确信度指标来量化对决策信息的信任程度,构建了TFN确信度(TFN certitude degree,TFNCD)算子,并证明了其置换不变性、... 详细信息

针对属性权重和专家权重全部未知的三角模糊数(triangular fuzzy number,TFN)多属性群决策问题,在TFN熵的基础上构造了确信度指标来量化对决策信息的信任程度,构建了TFN确信度(TFN certitude degree,TFNCD)算子,并证明了其置换不变性、幂等性和有界性等性质,结合支持度确定专家权重,提出了基于TFNCD算子的属性信息集结新方法。最后,通过算例的对比分析验证了TFNCD算子及其集结方法的有效性,该方法充分考虑了TFN类型的数据特征和两种权重完全未知的情况,且属性信息集结更加客观高效,计算相对简便,为TFN多属性决策问题提供了新的信息集结方式和解决思路。

关键词：三角模糊数三角模糊数确信度算子多属性群决策属性权重专家权重

应用遗传毒性测试评价不同饮用水处理工艺出水的安全性

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东南大学学报（自然科学版） 2009年第5期39卷 1023-1027页

作者：张徐军吕锡武东南大学能源与环境学院南京210096 东南大学公共卫生学院南京210009

应用微核试验和彗星试验对长江原水、常规工艺(混凝+沉淀+砂滤池)出水、强化常规工艺(混凝+沉淀+生物强化活性滤池)出水和生物活性炭工艺(混凝+沉淀+砂滤+生物活性炭滤池)出水进行遗传毒性分析.试验结果表明:当水样浓度为0.13～1.00L/皿... 详细信息

应用微核试验和彗星试验对长江原水、常规工艺(混凝+沉淀+砂滤池)出水、强化常规工艺(混凝+沉淀+生物强化活性滤池)出水和生物活性炭工艺(混凝+沉淀+砂滤+生物活性炭滤池)出水进行遗传毒性分析.试验结果表明:当水样浓度为0.13～1.00L/皿时,长江原水、常规工艺出水和强化常规工艺出水可引起人外周血淋巴细胞微核率显著升高,生物活性炭工艺出水则不能达到类似效果;长江原水、常规工艺出水和强化常规工艺出水均可引起不同程度的DNA损伤,并分别存在剂量-反应关系,而生物活性炭工艺出水仅在浓度为0.5L/皿(相当于原水体积)时引起DNA损伤.微核试验和彗星试验可有效应用于不同饮用水处理工艺出水的安全性评价.

关键词：饮用水安全性评价遗传毒性生物强化活性滤池生物活性炭长江原水

用Prony方法进行时频分解及其与经典方法的比较

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电测与仪表 2020年第14期57卷 148-152页

作者：张旭俊张宇国网江西省电力有限公司电力科学研究院南昌330096

文章用Prony方法对采样数据系列进行时频分解,并用自动识别主模态项数的方法对其进行改进,使其容易收敛求解。因Prony分解可用矩形窗分段分割减少点数,由此可得出振荡衰减的正弦函数组合,时频分解比较清晰、简洁。所提出的Prony方法也... 详细信息

文章用Prony方法对采样数据系列进行时频分解,并用自动识别主模态项数的方法对其进行改进,使其容易收敛求解。因Prony分解可用矩形窗分段分割减少点数,由此可得出振荡衰减的正弦函数组合,时频分解比较清晰、简洁。所提出的Prony方法也与其它经典方法进行图例比较,结果表明用Prony方法进行时频分解可弥补经典方法的某些不足。用列主元求解法方程R时,可自动确定主模态项数,利于Prony分解获得最简结果。

关键词： Prony分解 FFT分解小波矩阵分析时频分解

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最严格水资源管理制度相关政策体系研究

水利水电科技进展 2015年第5期35卷 130-135页

作者：陈明忠张续军水利部水资源司北京100053

剖析我国水资源面临的严峻形势,梳理实行最严格水资源管理制度形成过程,明晰了实行最严格水资源管理制度总体要求,跟踪调查了全国落实最严格水资源管理制度的最新进展,结合新时期水利工作方针要求,提出下一步落实最严格水资源管理制度... 详细信息

剖析我国水资源面临的严峻形势,梳理实行最严格水资源管理制度形成过程,明晰了实行最严格水资源管理制度总体要求,跟踪调查了全国落实最严格水资源管理制度的最新进展,结合新时期水利工作方针要求,提出下一步落实最严格水资源管理制度的工作重点:进一步突出监督管理,严格落实水资源管理各项制度;进一步突出节水优先,深入推进节水型社会建设;进一步突出品牌特色,加快推进水生态文明建设;着力破解3个突出障碍(计量监控能力、基层管理能力、依法管水能力),建立3项保障机制(持续推动国家水资源监控能力建设项目,强力推动基层水资源管理能力的提升,加快推动水资源领域立法工作)。

关键词：最严格水资源管理制度水资源管理水生态文明节水型社会水资源立法水利工作方针

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Daubechies小波系数新解法

电测与仪表 2022年第12期59卷 89-95页

作者：张旭俊张宇国网江西省电力有限公司电力科学研究院南昌330096

小波分析是当前信号处理的的热门方向,涉及多个专业领域。经典小波理论深奥难懂,超出了一般高等数学的范畴,文中以Daubechies小波为例,对经典小波理论的推导以通俗方式进行了简化,为了便于读者的理解,给出详细的推导过程,并引用小波矩... 详细信息

小波分析是当前信号处理的的热门方向,涉及多个专业领域。经典小波理论深奥难懂,超出了一般高等数学的范畴,文中以Daubechies小波为例,对经典小波理论的推导以通俗方式进行了简化,为了便于读者的理解,给出详细的推导过程,并引用小波矩阵来表达。对采样序列数据进行小波分解和重构,经过小波重构可准确无损地恢复到原始数据。把小波正交性对应着小波矩阵的正交性,多次的双尺度分解,就可得到多分辩率的结果。文中给出了双尺度小波分解在故障异常、励磁涌流、开关函数波形分析的工程案例,并提出了边缘失真问题的有效解决办法。

关键词：小波小波矩阵 Daubechies小波正交小波矩阵

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“9·11”梦魇仍困扰美国人

当代世界 2006年第10期 20-22页

作者：张绪军

2001年9月11日发生在纽约世贸中心那惊心动魄的一幕，在时隔5年之后的今天仍然是美国人心头挥不去的梦魇。每年的9月，都是美国人痛定思痛之时。回望世贸大厦灰飞烟灭的惊悸会重回每个人的心头。细观美国各机构5年来的民意调查发现，“9... 详细信息

2001年9月11日发生在纽约世贸中心那惊心动魄的一幕，在时隔5年之后的今天仍然是美国人心头挥不去的梦魇。每年的9月，都是美国人痛定思痛之时。回望世贸大厦灰飞烟灭的惊悸会重回每个人的心头。细观美国各机构5年来的民意调查发现，“9·11”对美国人心态影响之深远，从未见丝毫减弱。

关键词：美国人世贸中心民意调查心态影响 “9·11”事件