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A review of the pangenome:how it affects our understanding of genomic variation,selection and breeding in domestic animals?

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Journal of Animal Science and Biotechnology 2023年第5期14卷 1815-1833页

作者： Ying Gong Yefang Li xuexue liu Yuehui Ma Lin Jiang Laboratory of Animal Genetics Breeding and ReproductionMinistry of AgricultureInstitute of Animal SciencesChinese Academy of Agricultural Sciences(CAAS)Beijing 100193China National Germplasm Center of Domestic Animal Resources Ministry of TechnologyInstitute of Animal SciencesChinese Academy of Agricultural Sciences(CAAS)Beijing 100193China Centre d’Anthropobiologie et de Génomique de Toulouse UniversitéPaul Sabatier37 allées Jules GuesdeToulouse 31000France

As large-scale genomic studies have progressed,it has been revealed that a single reference genome pattern cannot represent genetic diversity at the species *** domestic animals tend to have complex routes of origin and migration,suggesting a possible omission of some population-specific sequences in the current reference ***,the pangenome is a collection of all DNA sequences of a species that contains sequences shared by all individuals(core genome)and is also able to display sequence information unique to each individual(variable genome).The progress of pangenome research in humans,plants and domestic animals has proved that the missing genetic components and the identification of large structural variants(SVs)can be explored through pangenomic *** individual specific sequences have been shown to be related to biological adaptability,phenotype and important economic *** maturity of technologies and methods such as third-generation sequencing,Tel-omere-to-telomere genomes,graphic genomes,and reference-free assembly will further promote the development of *** the future,pangenome combined with long-read data and multi-omics will help to resolve large SVs and their relationship with the main economic traits of interest in domesticated animals,providing better insights into animal domestication,evolution and *** this review,we mainly discuss how pangenome analysis reveals genetic variations in domestic animals(sheep,cattle,pigs,chickens)and their impacts on phenotypes and how this can contribute to the understanding of species ***,we also go through potential issues and the future perspectives of pangenome research in livestock and poultry.

关键词： Breeding Domestic animals Pangenome Structural variations

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Genomic regions under selection for important traits in domestic horse breeds

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Frontiers of Agricultural Science and Engineering 2017年第3期4卷 289-294页

作者： xuexue liu Yuehui MA Lin JIANG Institute of Animal Science Chinese Academy of Agricultural Sciences CAAS-ILRI Joint Laboratory on Livestock and Forage Genetic Resources Institute of Animal ScienceChinese Academy of Agricultural Sciences

Horses were domesticated 5500 years ago,thousands of years later than other domestic animals;however, in this relatively short period, domestic horses have had a great impact on human history by accelerating civilization, revolutionizing warfare and advancing agricultural production. Modern breeding using markerassisted selection has greatly accelerated breeding progress. Therefore, identification of genetic markers underlying the traits of interest in domestic horses is the basis for the modern breeding system. In this review, we present an overview of genetic mapping studies and genome wide analyses to identify the genomic regions targeted by positive selection for four important aspects of horses, coat color, racing performance, gait and height at withers. The MC1 R locus, for example, has been shown to be the main gene responsible for chestnut color, and the MSTN locus has been shown to control the muscle fiber growth in racing breeds. The missense mutation in DMRT3 is the causal mutation for the alternate gaits in horses. Height at withers, a quantitative trait, was mapped to four major loci(3:105547002, 6:81481064, 9:75550059 and 11:23259732) that can explain 83% of the height variations in domestic horses.

关键词： horse coat color racing performance gait height

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Whole-genome sequencing reveals selection signals among Chinese,Pakistani,and Nepalese goats

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Journal of Genetics and Genomics 2023年第5期50卷 362-365页

作者： Yefang Li Ying Gong Zhengkai Zhang Ling Li xuexue liu Xiaohong He Qianjun Zhao Yabin Pu Yuehui Ma Lin Jiang Institute of Animal Sciences Chinese Academy of Agricultural SciencesBeijing 100193China CAAS-ILRI Joint Laboratory on Livestock and Forage Genetic Resources Institute of Animal ScienceChinese Academy of Agricultural SciencesBeijing 100093China College of Animal Science and Technology Qingdao Agricultural UniversityQingdaoShandong 266109China Centre d’Anthropobiologie et de Genomique de Toulouse Universite Paul SabatierToulouse 31000France

The goat(Capra hircus)is one of the oldest domesticated animal species,with archeological evidence indicating that its earliest domestication from the wild ancestor(bezoar)occurred in the Fertile Crescent 10,000 calibrated calendar years ago(Zeder and Hesse,2000).A variety of well-adapted goat breeds with excellent economic traits have been selected artificially and naturally for human needs in China,Pakistan,and *** example,cashmere goat breeds produce fine cashmere wool and are mainly distributed on the Himalayan Plateau(e.g.,Nepal and Tibet)and in cold northern China(e.g.,Inner Mongolia and Liaoning).The Toggenburg dairy goat is the most productive breed of dairy goat and is distributed in at least 50 countries on all continents(Ferro et al.,2017).Pakistani ewes are reared mostly for meat and wool purposes,but some are used as dairy goats,such as the Bugi Toori goat and Pateri goat(Bilal et al.,2018).Additionally,indigenous goats of the southern Asian regions are well adapted to the local hot *** unique traits and biodiversity serve as genetic resources that can be used for the artificial breeding of ***,several studies have provided patterns of genome-wide characteristics in goat populations to explore the underlying genetic basis of trait formation and environmental adaptability in China(Zhang et al.,2018),Pakistan(Kumar et al.,2018),and Nepal(Sasazaki et al.,2021),***,due to the proximity of these geographic regions,the profiles of genetic differences,gene flow,and common genes related to high trait performance between goat populations from China,Pakistan,and Nepal remain unclear.

关键词： breeding adapted Whole

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三肇凹陷扶杨油层成藏要素空间匹配与油分布关系

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断块油气田 2010年第5期17卷 533-536页

作者：付广刘雪雪大庆石油学院黑龙江大庆163318

三肇凹陷扶杨油层3个主要成藏要素的研究结果表明:烃源岩主要是青一段发育的暗色泥岩,已进入大量生烃期,可以向扶杨油层供给充足的原油;圈闭类型主要是断层圈闭,或断层-岩性;原油运移输导通道为T2源断裂与砂体。通过空间匹配关系研究得... 详细信息

三肇凹陷扶杨油层3个主要成藏要素的研究结果表明:烃源岩主要是青一段发育的暗色泥岩,已进入大量生烃期,可以向扶杨油层供给充足的原油;圈闭类型主要是断层圈闭,或断层-岩性;原油运移输导通道为T2源断裂与砂体。通过空间匹配关系研究得到,三肇凹陷扶杨油层断层圈闭与青一段烃源岩在空间上有2种匹配关系,一种是扶杨油层断层圈闭直接位于青一段源岩下方,由T2断裂垂向连接;另一种是扶杨油层断层圈闭位于青一段源岩的侧下方,除T2断裂垂向连接外,还需要砂体输导通道的侧向连接。三肇凹陷扶杨油层3个成藏要素空间匹配关系对其成藏与分布的控制作用主要表现在以下方面:青一段烃源岩生成油"倒灌"运移区控制着2种源圈配置中油藏形成与分布;源上圈正下方配置中T2断裂发育区内断层圈闭油富集程度高;源上圈侧下方配置中砂体侧向运移输导通道上的断层圈闭有利于油藏形成;断层下盘是2种源圈配置类型中油聚集的主要部位。

关键词：成藏要素空间匹配断层圈闭 T2源断裂青一段烃源岩扶杨油层三肇凹陷

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MOFs负载ACF吸附剂的制备及H_(2)S脱除特性

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精细化工 2024年第8期41卷 1710-1717,1773页

作者：张铎孙艺文虎赵思琛翟小伟刘学学西安科技大学安全科学与工程学院陕西西安710054 西安科技大学西部矿井开采及灾害防治教育部重点实验室陕西西安710054

将活性炭纤维(ACF)负载到金属有机框架材料MOF-199上,在水热条件下制备了MOF-199@ACF吸附剂,利用固定床反应装置评价其脱H_(2)S性能;采用氮气吸/脱附、XRD、EDS、SEM、XPS表征和分析了MOF-199@ACF的物相组成;考察了ACF负载量、吸附温度... 详细信息

将活性炭纤维(ACF)负载到金属有机框架材料MOF-199上,在水热条件下制备了MOF-199@ACF吸附剂,利用固定床反应装置评价其脱H_(2)S性能;采用氮气吸/脱附、XRD、EDS、SEM、XPS表征和分析了MOF-199@ACF的物相组成;考察了ACF负载量、吸附温度、相对湿度对MOF-199@ACF脱除H_(2)S性能的影响,探究了MOF-199@ACF在H_(2)S脱除中可能的反应机理。结果表明,与MOF-199相比,ACF负载量(质量分数)为1%的吸附剂MOF-199@1%ACF的H_(2)S出现时间从180 min延后至405 min,穿透硫容从7.2 mg/g提升至14.5 mg/g;ACF负载量为1%不会干扰MOF-199结晶形成的稳定结构,ACF参与配位使MOF-199@1%ACF表面粗糙化,导致更多的吸附位点暴露,增加了比表面积(从MOF-199的1108.6 m^(2)/g增至1978.3 m^(2)/g);MOF-199@1%ACF是以化学吸附的活化吸附为主,升高温度(30~70℃)有利于加快吸附速率;适量水气(相对湿度10%)有助于性能提升(穿透硫容14.8 mg/g)。

关键词：煤气化 MOF-199 活性炭纤维脱硫剂吸附 H2S 功能材料

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串行数据芯片的编程检测方法

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现代电子技术 2010年第2期33卷 160-163页

作者：刘雪雪无锡机电高等职业技术学校江苏无锡214028

串行数据芯片的调试检测常因设备问题而花费很多时间。这里介绍ADC0832芯片的控制方法、接口电路、控制原理,通过自制印制板调试ADC0832芯片,阐述一般串行数据芯片的编程调试检测过程。通过这一过程,叙述串行数据芯片中地址无法检测问... 详细信息

串行数据芯片的调试检测常因设备问题而花费很多时间。这里介绍ADC0832芯片的控制方法、接口电路、控制原理,通过自制印制板调试ADC0832芯片,阐述一般串行数据芯片的编程调试检测过程。通过这一过程,叙述串行数据芯片中地址无法检测问题的解决方法,特别是在地址为00时检测不到转换数据时,采用新型MSO-2024示波器采样,为编程人员提供了准确的判断依据。

关键词： ADC0832芯片转换数据软件调试硬件调试

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基于多层复杂网络的农产品智慧冷链物流配送路径研究

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微型电脑应用 2022年第9期38卷 77-79,84页

作者：刘雪雪陕西铁路工程职业技术学院工程管理与物流学院陕西渭南714000

针对当前农产品冷链物流配送方法存在配送距离长、成本高的问题,提出基于多层复杂网络的农产品智慧冷链物流配送路径方法。将物流配送网络作为多层复杂网络转换为无向图形式,得出最小化目标函数和约束条件;引入人工蜂群算法,初始化人工... 详细信息

针对当前农产品冷链物流配送方法存在配送距离长、成本高的问题,提出基于多层复杂网络的农产品智慧冷链物流配送路径方法。将物流配送网络作为多层复杂网络转换为无向图形式,得出最小化目标函数和约束条件;引入人工蜂群算法,初始化人工蜂群;采用自然数编码,构造食物源编码;利用交换领域点,生成候选食物源;计算适应度函数,获取最优配送路径。实验结果表明,所提方法的配送距离最短,配送成本控制最低。

关键词：多层复杂网络冷链物流配送人工蜂群算法最大迭代次数

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新加坡南洋理工学院的课程安排与借鉴

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职业教育研究 2009年第11期11卷 157-158页

作者：刘雪雪无锡机电高等职业学校江苏无锡214028

新加坡南洋理工学院的课程安排采用双轨制,将"工厂式"活动带入教学环境之中,工作与学习融合在一起,理论与实践兼顾,能根据市场及科技的发展灵活调整课程,课程项目模块的灵活性、适应性好,组合能力强。我国可借鉴其项目课程安排的方法,... 详细信息

新加坡南洋理工学院的课程安排采用双轨制,将"工厂式"活动带入教学环境之中,工作与学习融合在一起,理论与实践兼顾,能根据市场及科技的发展灵活调整课程,课程项目模块的灵活性、适应性好,组合能力强。我国可借鉴其项目课程安排的方法,采用理论与实践一体化的教学模式,加强与企业的联系,了解企业的需求,为企业提供操作型人才。

关键词：新加坡南洋理工学院课程安排课程构架课程内容

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松北探区扶余油层油气成藏有利区预测

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大庆石油地质与开发 2012年第6期31卷 15-19页

作者：刘雪雪付广李冬春刘颖中国石油辽河油田金马油田开发公司辽宁盘锦124010 东北石油大学地球科学学院黑龙江大庆163318 大庆油田有限责任公司第二采油厂黑龙江大庆163414 大港油田采油五厂天津300280

源岩供烃、油气储集、运移路径以及保存条件是松北探区扶余油层油气成藏的主要控制因素。以此为基础，选取源岩平均厚度、有机碳质量分数、有机质成熟度、氯仿沥青“A”、有机质类型、油源区距探区距离、沉积相类型、储层平均厚度、盖... 详细信息

源岩供烃、油气储集、运移路径以及保存条件是松北探区扶余油层油气成藏的主要控制因素。以此为基础，选取源岩平均厚度、有机碳质量分数、有机质成熟度、氯仿沥青“A”、有机质类型、油源区距探区距离、沉积相类型、储层平均厚度、盖层平均厚度和地层水矿化度10个指标作为松北探区扶余油层油气成藏综合评价参数，构建油气成藏模糊综合评价矩阵，引用层次分析法确定各参数的权重系数。通过计算松北探区13个区块扶余油层油气成藏条件综合评价值，可知松北探区扶余油层哈尔滨东区块油气成藏最有利，其次为宾县和木兰区块。

关键词：有利区预测松北探区扶余油层模糊综合评判层次分析法

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高效液相色谱-质谱联用在农药残留检测中的应用

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现代食品 2024年第20期30卷 217-219页

作者：刘雪雪莱西市检验检测中心山东莱西266600

为研究高效液相色谱-质谱联用(LC-MS)技术在农药残留检测中的应用,本文阐述了单仪器分析方法及串联质谱法,综述了多种串联质谱方法(如三重四极杆质谱、四极杆-飞行时间质谱等)的工作原理与应用,并以食品样品中多种农药残留检测为例,详... 详细信息

为研究高效液相色谱-质谱联用(LC-MS)技术在农药残留检测中的应用,本文阐述了单仪器分析方法及串联质谱法,综述了多种串联质谱方法(如三重四极杆质谱、四极杆-飞行时间质谱等)的工作原理与应用,并以食品样品中多种农药残留检测为例,详细分析了LC-MS技术在农药提取、分离及定量分析中的应用。

关键词：高效液相色谱-质谱联用农药残留食品安全

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