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Disclosing incoherent sparse and low-rank patterns inside homologous GPCR tasks for better modelling of ligand bioactivities

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Frontiers of Computer Science 2022年第4期16卷 91-102页

作者： Jiansheng Wu Chuangchuang Lan Xuelin Ye Jiale Deng Wanqing Huang xueni yang Yanxiang Zhu Haifeng Hu School of Geographic and Biologic Information Nanjing University of Posts and TelecommunicationsNanjing210023China Smart Health Big Data Analysis and Location Services Engineering Lab of Jiangsu Province Nanjing University of Posts and TelecommunicationsNanjing210023China Department of Statistics University of WarwickCoventryCV47ALUK Modern Economics&Management College Jiangxi University of Finance and EconomicsNanchang330013China School of Telecommunication and Information Engineering Nanjing University of Posts and TelecommunicationsNanjing210023China Verimake Research Nanjing Qujike Info-tech Co.Ltd.Nanjing210088China

There are many new and potential drug targets in G protein-coupled receptors(GPCRs)without sufficient ligand associations,and accurately predicting and interpreting ligand bioactivities is vital for screening and optimizing hit compounds targeting these GPCRs.To efficiently address the lack of labeled training samples,we proposed a multi-task regression learning with incoherent sparse and low-rank patterns(MTR-ISLR)to model ligand bioactivities and identify their key substructures associated with these GPCRs targets.That is,MTR-ISLR intends to enhance the performance and interpretability of models under a small size of available training data by introducing homologous GPCR tasks.Meanwhile,the low-rank constraint term encourages to catch the underlying relationship among homologous GPCR tasks for greater model generalization,and the entry-wise sparse regularization term ensures to recognize essential discriminative substructures from each task for explanative modeling.We examined MTR-ISLR on a set of 31 important human GPCRs datasets from 9 subfamilies,each with less than 400 ligand associations.The results show that MTR-ISLR reaches better performance when compared with traditional single-task learning,deep multi-task learning and multi-task learning with joint feature learning-based models on most cases,where MTR-ISLR obtains an average improvement of 7%in correlation coefficient(r2)and 12%in root mean square error(RMSE)against the runner-up predictors.The MTR-ISLR web server appends freely all source codes and data for academic usages.^(1))

关键词： G protein-coupled receptors(GPCRs) ligand bioactivities multi-task learning incoherent sparse and lowrank patterns

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阴道紧缩术治疗中重度阴道松弛症的效果及对阴道微生态的影响

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中国性科学 2024年第5期33卷 86-89页

作者：苏远华杨晓梅杨雪妮徐晶贵州航天医院妇科贵州遵义563000 遵义医科大学第一附属医院妇产科贵州遵义563000 务川县人民医院妇科贵州遵义564300

目的探讨阴道紧缩术治疗中重度阴道松弛症患者的临床效果及对阴道微生态的影响。方法选取2020年1月至2022年12月于贵州航天医院、遵义医科大学第一附属医院及务川县人民医院就诊的150例中重度阴道松弛症患者作为研究对象。按照就诊顺序... 详细信息

目的探讨阴道紧缩术治疗中重度阴道松弛症患者的临床效果及对阴道微生态的影响。方法选取2020年1月至2022年12月于贵州航天医院、遵义医科大学第一附属医院及务川县人民医院就诊的150例中重度阴道松弛症患者作为研究对象。按照就诊顺序将患者随机分为观察组(n=74,行阴道紧缩术治疗)、对照组(n=76,行盆底康复物理治疗),比较两组疗效及阴道微生态状况。结果治疗前两组阴道松弛度评分及性生活满意度评分比较,差异无统计学意义(P>0.05);治疗后观察组上述评分高于对照组,差异具有统计学意义(P0.05);治疗后观察组上述指标低于对照组,差异具有统计学意义(P0.05);治疗后观察组上述指标均高于对照组,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论阴道紧缩术能较好地改善患者因阴道松弛并发的微生态失调,能纠正患者因阴道松弛而容易反复感染阴道炎症的体质,对阴道松弛症的治疗效果确切。

关键词：阴道紧缩术阴道松弛症临床效果阴道微生态

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简体中文版社会影响量表的修订及信效度检验

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护理研究 2024年第8期38卷 1336-1342页

作者：李艳清钱燕严晓玲朱颖倩陈星杨雪妮蔡晶杜林静徐秀群南通大学附属医院江苏226001 南通大学医学院

目的:对中文版社会影响量表(Social Impact Scale,SIS)进行修订,并检验其信效度。方法:遵循Beaton文化调适指南,应用专家咨询进行文化调适,形成简体中文版SIS。通过便利抽样法,选择417例癌症病人进行问卷调查,评价量表的信效度。结果:... 详细信息

目的:对中文版社会影响量表(Social Impact Scale,SIS)进行修订,并检验其信效度。方法:遵循Beaton文化调适指南,应用专家咨询进行文化调适,形成简体中文版SIS。通过便利抽样法,选择417例癌症病人进行问卷调查,评价量表的信效度。结果:简体中文版SIS包括4个维度,共22个条目。量表的条目内容效度指数为0.875~1.000,平均内容效度指数为0.978;探索性因子分析提取4个公因子,累计方差贡献率为64.040%;验证性因子分析显示模型结构拟合良好。总量表的Cronbach's α系数为0.925,4个维度的Cronbach's α系数为0.748~0.810,分半信度为0.890,重测信度为0.901。结论:简体中文版SIS信效度良好,可以用于我国癌症病人病耻感的评估。

关键词：癌症病耻感量表信度效度

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认知障碍患者主要照顾者自我效能研究进展

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老年医学研究 2024年第2期5卷 51-55页

作者：朱颖倩徐秀群于海荣李艳清杨雪妮陈星南通大学医学院护理学院江苏南通226006 南通大学附属医院护理部江苏南通226006

照顾者自我效能的高低决定其能否很好地适应照顾角色,并提高照顾质量。本文对认知障碍主要照顾者自我效能的概念、测量工具、研究现状、影响因素、护理干预五个方面进行综述,以期为开展照顾者自我效能相关干预性研究提供参考依据。

关键词：认知障碍照顾者自我效能照顾负担

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Dynamic immune recovery process after liver transplantation revealed by single-cell multi-omics analysis

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The Innovation 2024年第3期5卷 55-68页

作者： Rui Wang Xiao Peng Yixin Yuan Baojie Shi Yuan Liu Hengxiao Ni Wenzhi Guo Qiwei yang Pingguo Liu Jie Wang Zhaojie Su Shengnan Yu Dehua Liu Jinyan Zhang Junjie Xia xueni Liu Hao Li Zhengfeng yang Zhihai Peng Organ Transplantation Clinical Medical Center of Xiamen University Department of General SurgeryXiang’an Hospital of Xiamen UniversitySchool of MedicineXiamen UniversityXiamen 361102China Organ Transplantation Institute of Xiamen University Xiamen Human Organ Transplantation Quality Control CenterXiamen Key Laboratory of Regeneration MedicineFujian Provincial Key Laboratory of Organ and Tissue RegenerationSchool of MedicineXiamen UniversityXiamen 361102China Department of General Surgery Shanghai General HospitalShanghai Jiao Tong University School of MedicineShanghai 200080China State Key Laboratory of Cellular Stress Biology School of Life SciencesFaculty of Medicine and Life SciencesXiamen UniversityXiamen 361102China Department of Hepatobiliary and Pancreatic Surgery The First Affiliated Hospital of Zhengzhou UniversityZhengzhou 450000China Department of Hepatobiliary&Pancreatic Surgery The National Key Clinical SpecialtyZhongshan Hospital of Xiamen UniversitySchool of MedicineXiamen UniversityXiamen 361102China Precision Research Center for Refractory Diseases Institute for Clinical ResearchShanghai General HospitalShanghai Jiao Tong University School of MedicineShanghai 201620China

Elucidating the temporal process of immune remodeling under immunosuppressive treatment after liver transplantation(LT)is critical for precise clinical management strategies.Here,we performed a single-cell multi-omics analysis of peripheral blood mononuclear cells(PBMCs)collected from LT patients(with and without acute cellular rejection[ACR])at 13 time points.Validation was performed in two independent cohorts with additional LT patients and healthy controls.Our study revealed a four-phase recovery process after LT and delineated changes in immune cell composition,expression programs,and interactions along this process.The intensity of the immune response differs between the ACR and non-ACR patients.Notably,the newly identified inflamed NK cells,CD14+RNASE2+monocytes,and FOS-expressing monocytes emerged as predictive indicators of ACR.This study illuminates the longitudinal evolution of the immune cell landscape under tacrolimus-based immunosuppressive treatment during LT recovery,providing a four-phase framework that aids the clinical management of LT patients.

关键词： process analysis precise

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霉菌检测中封闭式培养方法的建立和应用

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食品科学 2019年第16期40卷 308-313页

作者：韩涛杨雪妮张芳福建省产品质量检验研究院福建福州350002 福建中医药大学药学院福建福州350108

通过微氧胁迫下黑曲霉的生长动态研究,构建霉菌的封闭式培养方法,并用于食品中霉菌的检测,对比分析霉菌封闭式培养方法的可行性和实用性。结果表明,建立的封闭式培养方法与传统敞开式培养方法的计数结果无显著差异。因此,对于食品中霉... 详细信息

通过微氧胁迫下黑曲霉的生长动态研究,构建霉菌的封闭式培养方法,并用于食品中霉菌的检测,对比分析霉菌封闭式培养方法的可行性和实用性。结果表明,建立的封闭式培养方法与传统敞开式培养方法的计数结果无显著差异。因此,对于食品中霉菌计数,可以采用以空气与培养基的体积比不小于3为参数的封闭式培养方法,代替传统的敞开式培养方法,以解决霉菌孢子扩散和污染的难题。

关键词：霉菌封闭式培养食品计数检测

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热液体系溶解度实验和热力学计算方法在成矿过程模拟中的应用

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矿床地质 2024年第1期43卷 71-85页

作者：杨颖王佳新张雪旎袁顺达中国地质大学(北京)地球科学与资源学院北京100083 中国地质科学院矿产资源研究所自然资源部成矿作用与资源评价重点实验室北京100037

热液流体对金属元素的迁移、富集及沉淀成矿起着关键作用,定量刻画金属元素在热液成矿过程中的运移是矿床学研究的重点和难点。以热力学理论为基础,通过开展溶解度实验,揭示金属元素在热液流体中的地球化学行为,是研究金属元素迁移、富... 详细信息

热液流体对金属元素的迁移、富集及沉淀成矿起着关键作用,定量刻画金属元素在热液成矿过程中的运移是矿床学研究的重点和难点。以热力学理论为基础,通过开展溶解度实验,揭示金属元素在热液流体中的地球化学行为,是研究金属元素迁移、富集沉淀机制行之有效的重要手段。其中,基于钛合金反应釜开展不同物理化学条件下金属元素在热液流体中的溶解度实验,结合相关的热力学模拟,能够精确测定金属元素在热液流体中的溶解度、络合物配位数、气液两相中的分配系数及相关热力学参数,为定量模拟热液成矿过程提供重要的实验依据。文章归纳了近年来针对热液体系的实验矿床学方法,分析了各类实验方法与分析手段的优点与不足。重点介绍钛合金反应釜溶解度实验和热力学模拟计算方法,并结合该方法模拟钪矿床成矿的水岩反应过程,说明该方法在成矿过程模拟中的应用,最后阐述了其存在的问题,并对该领域未来的研究趋势提出了展望,以期推动该方法在战略性关键金属超常富集机制研究中的应用。

关键词：溶解度热液流体热力学成矿过程模拟实验矿床学

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基于地质建造的岷江上游干旱河谷区下段土壤特征和植被时空变化

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现代地质 2024年第3期38卷 660-673页

作者：周雪妮巴仁基肖成志曹亚廷计扬中国地质调查局军民融合地质调查中心四川成都610036 自然资源要素耦合过程与效应重点实验室北京100055 成都理工大学环境与土木工程学院四川成都610059 中国地质大学(武汉)地球物理与空间信息学院湖北武汉430074

为探讨岷江上游干旱河谷区地质建造对土壤性质的控制以及对植被分布的制约,支撑生态保护修复分区治理工作,本文以岷江上游干旱河谷区下段为研究区,采用地质建造调查、元素分析测试和遥感解译方法,结合土地利用数据,从地质建造类型、土... 详细信息

为探讨岷江上游干旱河谷区地质建造对土壤性质的控制以及对植被分布的制约,支撑生态保护修复分区治理工作,本文以岷江上游干旱河谷区下段为研究区,采用地质建造调查、元素分析测试和遥感解译方法,结合土地利用数据,从地质建造类型、土壤特征、土地利用和植被覆盖度方面分析地质建造单元对土壤和植被的影响。结果表明:第四纪松散堆积建造区土壤层厚、养分丰富,由于人类活动改造作用较强,区内植物种类以经济作物为主;三叠纪复理石建造区土壤层较厚,养分丰富,基岩构造裂隙较发育,富水性较好,适宜灌木和少量乔木生长,该区植被覆盖度高;泥盆纪泥页岩-碳酸盐岩建造土壤层较厚、土壤钙等养分含量高,分布大量喜钙侧柏;志留纪泥砂质-碳酸盐建造区区发育非贯穿性裂隙,受构造作用影响浅表层的岩石风化破碎程度高,水土极易流失,以低矮灌木和草地为主;元古宙中酸性岩浆岩建造区土壤层薄,裂隙发育,土壤中磷等养分含量较高,土壤层含水率最低,以灌丛植物生长为主;中元古代火山岩-熔岩建造区发育闭合状裂隙,含水性差,仅适合灌草丛生长,植被覆盖度偏低。

关键词：地质建造土壤特征植被覆盖度时空演变干旱河谷

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晚清学者对“日本文学”的发现——以傅云龙《游历日本图经》为中心

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长江学术 2024年第2期 117-128页

作者：郭雪妮陕西师范大学文学院陕西西安710119

晚清士人对“文学”启蒙的重视,一般被认为是在甲午战争之后,且多以康有为、梁启超等赴日名人为先驱。然而,作为晚清首批赴日游历使的傅云龙对“日本文学”的发现,却很少被提及。傅云龙在《游历日本图经》中专设“日本文学”一门,上卷... 详细信息

晚清士人对“文学”启蒙的重视,一般被认为是在甲午战争之后,且多以康有为、梁启超等赴日名人为先驱。然而,作为晚清首批赴日游历使的傅云龙对“日本文学”的发现,却很少被提及。傅云龙在《游历日本图经》中专设“日本文学”一门,上卷以江户儒学为中心,兼论诗学、书学、医学、兵学,下卷专论明治时期日本的学校教育。傅云龙的文学观虽然未脱士大夫风的广义“文学论”,但他通过对明治二十年日本的踏查,既感知到了西学与汉学地位之升降,亦捕捉到了西洋教育对文学“启蒙”“开化”之重视。傅云龙对“日本文学”的发现,在晚清的日本研究著作中具有重要的先驱意义。

关键词：傅云龙《游历日本图经》日本文学明治文坛

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KDK40型开堵口一体机改进

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冶金设备 2023年第5期 114-116页

作者：杨雪妮麻荣李永刚中钢集团西安重机有限公司陕西西安710201

KDK40型开堵口一体机是矿热炉炉前专门堵口和开口的设备,其运行效果直接影响矿热炉的生产效率和生产安全。本文主要通过对KDK40型开堵口一体机进行整体分析,提出优化方案,进一步增强设备的整体稳定性和可靠性,使其占用空间更小、适应范... 详细信息

KDK40型开堵口一体机是矿热炉炉前专门堵口和开口的设备,其运行效果直接影响矿热炉的生产效率和生产安全。本文主要通过对KDK40型开堵口一体机进行整体分析,提出优化方案,进一步增强设备的整体稳定性和可靠性,使其占用空间更小、适应范围更广,操作简便、易于维护,从而大大降低设备故障率。

关键词：矿热炉 KDK40型开堵口一体机受力优化结构优化

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