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Metabolomic and proteomic responses of Phaeodactylum tricornutum to hypoxia

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Journal of Oceanology and Limnology 2022年第5期40卷 1963-1973页

作者： Peipei ZHAO Qinghua WU xuekui xia Shiyi GUO Sizhong SHEN Yujue WANG Aiyou HUANG Key Biosensor Laboratory of Shandong Province Biology InstituteQilu University of Technology(Shandong Academy of Sciences)Jinan 250103China State Key Laboratory of Marine Resource Utilization in the South China Sea Hainan UniversityHaikou 570228China Laboratory of Development and Utilization of Marine Microbial Resource Hainan UniversityHaikou 570228China Key Laboratory of Tropical Hydrobiology and Biotechnology of Hainan Province Haikou 570228China College of Marine Sciences Hainan UniversityHaikou 570228China Department of Chemistry University of WashingtonSeattle WA 98195USA

Diatoms are important contributors to global net primary productivity,and play a crucial role in the biogeochemical cycles of carbon,phosphorus,nitrogen,iron,and *** in some regions in the ocean,there’s a trend that carbon content is high while oxygen concentration is low,and the underlying mechanisms of diatoms’response to low oxygen environments are worth *** tricornutum is a model diatom whose genome has been sequenced;it provides a universal molecular toolbox and a stable transgenic expression ***,the study of the responses of *** to low oxygen has not only fundamental research significance but also important ecologic al *** this study,growth rates were determined and proteomic analysis and metabolomic analysis were performed to examine *** responses under different oxygen concentrations(2%oxygen concentration for hypoxic condition and 21%oxygen concentration for the normal condition(sterilized air)).Results show that the hypoxic environment inhibited the growth of *** the hypoxic conditions,*** could reset its metabolism pathways,including enhancement in lipid utilization,replenishment of tricarboxylic acid(TCA)cycle through the glyoxylic acid cycle,and down-regulation of photorespiration to reduce energy ***,the stress resistance mechanism was activated to facilitate the adaptation to low oxygen *** study helps to reveal the different metabolic changes to hypoxia of diatom from that of higher plants,which might be ascribed to their different habitats and needs further exploration in the future.

关键词： Phaeodactylum tricornutum hypoxia metabolomics proteomics

Integrating PCR-free amplification and synergistic sensing for ultrasensitive and rapid CRISPR/Cas12a-based SARS-CoV-2 antigen detection

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Synthetic and Systems Biotechnology 2021年第4期6卷 283-291页

作者： xiangxiang Zhao Zhengduo Wang Bowen Yang Zilong Li Yaojun Tong Yuhai Bi Zhenghong Li xuekui xia xiangyin Chen Lixin Zhang Weishan Wang Gao-Yi Tan State Key Laboratory of Bioreactor Engineering and School of BiotechnologyEast China University of Science and Technology(ECUST)Shanghai200237China State Key Laboratory of Microbial Resources Institute of MicrobiologyChinese Academy of SciencesBeijing100101China State Key Laboratory of Microbial Metabolism and School of Life Sciences&BiotechnologyShanghai Jiao Tong UniversityShanghai200240China CAS Key Laboratory of Pathogenic Microbiology and Immunology Institute of MicrobiologyCenter for Influenza Research and Early-warning(CASCIRE)CAS-TWAS Center of Excellence for Emerging Infectious Diseases(CEEID)Chinese Academy of SciencesBeijing100101China Key Biosensor Laboratory of Shandong Province Biology InstituteQilu University of Technology(Shandong Academy of Sciences)Jinan250013China

Antigen detection provides particularly valuable information for medical diagnoses;however,the current detection methods are less sensitive and accurate than nucleic acid *** combination of CRISPR/Cas12a and aptamers provides a new detection paradigm,but sensitive sensing and stable amplification in antigen detection remain ***,we present a PCR-free multiple trigger dsDNA tandem-based signal amplification strategy and a de novo designed dual aptamer synergistic sensing *** of these two strategies endowed the CRISPR/Cas12a and aptamer-based method with ultra-sensitive,fast,and stable antigen *** a demonstration of this method,the limit of detection was at the single virus level(0.17 fM,approximately two copies/μL)in SARS-CoV-2 antigen nucleocapsid protein analysis of saliva or serum *** entire procedure required only 20 *** our system’s simplicity and modular setup,we believe that it could be adapted reasonably easily for general applications in CRISPR/Cas12a-aptamer-based detection.

关键词： CRISPR/Cas12a Aptamer Antigen detection SARS-CoV-2 PCR-Free amplification Synergistic sensing

南海红树林内生真菌ZZF13次级代谢产物的研究

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中山大学学报（自然科学版） 2009年第4期48卷 133-136页

作者：夏雪奎李庆邵长伦刘昌衡佘志刚林永成山东省科学院应用微生物重点实验室//中日友好生物技术研究中心山东济南250014 中山大学化学与化学工程学院广东广州510275

红树林内生真菌ZZF13,为湛江红树林秋茄内生真菌,种属尚未鉴定。从该菌的培养液中分离得到5个化合物,通过波谱解析以及文献对照,分别鉴定为skyrin(1),lichenxanthone(2),griseoxanthone C(3),1,3,6-三羟基-8-甲基-Xanthone(4),5,7-二羟... 详细信息

红树林内生真菌ZZF13,为湛江红树林秋茄内生真菌,种属尚未鉴定。从该菌的培养液中分离得到5个化合物,通过波谱解析以及文献对照,分别鉴定为skyrin(1),lichenxanthone(2),griseoxanthone C(3),1,3,6-三羟基-8-甲基-Xanthone(4),5,7-二羟基-2-甲基色原酮(5),初步的药理活性显示,化合物1和5对Bacillus subtilisATCC 6633的M IC分别为100和100μg/mL。

关键词：红树林内生真菌次级代谢产物生物活性

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复方蜂胶提取物提高小鼠的免疫力

现代食品科技 2021年第11期37卷 144-150页

作者：赵佩佩殷欣夏雪奎张玉刘昌衡史亚萍齐鲁工业大学(山东省科学院)生物研究所山东省科学院生物研究所山东济南250103 济南臻研汇康生物科技有限公司山东济南250100

本研究探讨了复方蜂胶提取物对免疫低下模型小鼠免疫功能的影响。利用氢化可的松(HY)构建小鼠免疫低下模型,设置阴性对照组、模型组、蜂胶提取物组(0.125 g/kg)、3个复方剂量组(0.125、0.50、1.25 g/kg),对小鼠连续灌胃30 d,检测各种免... 详细信息

本研究探讨了复方蜂胶提取物对免疫低下模型小鼠免疫功能的影响。利用氢化可的松(HY)构建小鼠免疫低下模型,设置阴性对照组、模型组、蜂胶提取物组(0.125 g/kg)、3个复方剂量组(0.125、0.50、1.25 g/kg),对小鼠连续灌胃30 d,检测各种免疫功能等指标,探究复方蜂胶提取物对小鼠免疫功能的影响。实验发现单一蜂胶提取物组和各剂量的复方蜂胶提取物均可以抵制HY对小鼠脾脏、胸腺的损伤,将脏器指数分别从2.80恢复到3.89、3.81、3.92和4.11(p<0.01);各实验组均可显著改善HY导致的小鼠外周血白细胞(PBWC)和淋巴细胞(PBL)水平降低(p<0.05),其中高剂量组可将PBWC和PBL水平从3.62×10^(9)/L和2.83×10^(9)/L升高到5.35×10^(9)/L和4.96×10^(9)/L(p<0.01);中、高剂量组可提高免疫低下小鼠的碳廓清吞噬指数,将其从4.16提高到5.29和5.16(p<0.01),低剂量组和单一蜂胶提取物组效果不明显;中剂量组可提高免疫低下小鼠腹腔巨噬细胞吞噬荧光微球的吞噬百分率,将其从18.70%提高到28.60%(p<0.01);中、高剂量组可显著提高抗体生成细胞数(p<0.05);从而表明复方蜂胶提取物具有增强免疫低下小鼠免疫力的功效。

关键词：复方蜂胶提取物免疫功能免疫低下小鼠枸杞黄芪黄精

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秀丽隐杆线虫模型在抗衰老研究中的应用

生物资源 2023年第1期45卷 9-15页

作者：孟艺伟赵燕秋孟庆洲吴清华曲昆玉赵佩佩王盟盟赵祥祥代焕琴殷欣夏雪奎齐鲁工业大学(山东省科学院)生物研究所山东济南250103 中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室北京100101

随着人口老龄化问题的凸显,衰老相关的研究越来越被重视。秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)是抗衰老研究领域中非常重要的生物模型,具有生命周期短、易于培养和观察等优点,但与其他哺乳动物模型相比仍有一些局限性,如DNA甲基化的... 详细信息

随着人口老龄化问题的凸显,衰老相关的研究越来越被重视。秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)是抗衰老研究领域中非常重要的生物模型,具有生命周期短、易于培养和观察等优点,但与其他哺乳动物模型相比仍有一些局限性,如DNA甲基化的缺乏等。本文主要综述了秀丽隐杆线虫模型在抗衰老研究和药物筛选中的应用,包括抗衰老药物对线虫寿命和抗性的测定与评估、药物筛选以及健康衰老研究中的应用,并概括了该模型的优势和局限性,为秀丽隐杆线虫模型在抗衰老研究中的应用提供理论依据。

关键词：秀丽隐杆线虫抗衰老基因应用

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液态发酵茶饮料菌株分离鉴定及发酵特征研究

农产品加工（下） 2010年第8期 30-35页

作者：王小军张绵松袁文鹏夏雪奎孟秀梅刘昌衡山东省科学院生物研究所山东济南250014 山东省应用微生物重点实验室山东济南250014 山东省科学院中日友好生物中心山东济南250014

以适合液态发酵茶饮料的菌株筛选为目的,研究了分离自茶叶中4株优势菌初步鉴定及其发酵特征。结果表明,分离自茶叶的4株优势菌(乳酸乳球菌、卡斯特德巴利酵母、灰绿曲霉、青霉菌)均能在茶汁中良好生长,茶汁经过不同菌株发酵后呈现不同... 详细信息

以适合液态发酵茶饮料的菌株筛选为目的,研究了分离自茶叶中4株优势菌初步鉴定及其发酵特征。结果表明,分离自茶叶的4株优势菌(乳酸乳球菌、卡斯特德巴利酵母、灰绿曲霉、青霉菌)均能在茶汁中良好生长,茶汁经过不同菌株发酵后呈现不同的发酵特征,主要表现有汤汁明亮,酚氨比降低,芳香类物质增加,醇厚和陈香等品质,并且溶入许多微生物代谢活性物质,形成营养丰富,保健价值好,风味独特的发酵茶饮料。

关键词：茶饮料菌种鉴定发酵

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小檗碱通过挟持药物外排泵Mdr1p逆转白色念珠菌的多药耐药

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Science Bulletin 2021年第18期66卷 1895-1905,M0004页

作者：童垚俊张敬宇孙诺王湘铭危期张钰黄韧普颖颖代焕琴任彪裴刚宋福行朱国良王馨叶夏雪奎陈相因蒋岚王申林欧阳立明谢宁张部昌姜远英刘雪婷 Richard Calderone 白凡张立新 Gil Alterovitzk State Key Laboratory of Bioreactor Engineering and School of Biotechnology East China University of Science and TechnologyShanghai 200237China Chinese Academy of Sciences Key Laboratory of Pathogenic Microbiology and Immunology Institute of MicrobiologyChinese Academy of SciencesBeijing 100190China Biomedical Pioneering Innovation Center(BIOPIC) School of Life SciencesPeking UniversityBeijing 100871China Georgetown University Medical Center Department of Microbiology&Immunology.Washington DC 20057USA Institute of Health Sciences School of Life SciencesAnhui UniversityHefei 230601China Guangdong Provincial Key Laboratory of Laboratory Animals Guangdong Laboratory Animals Monitoring InstituteGuangzhou 510663China Department of Pharmacology Second Military Medical UniversityShanghai 200433China State Key Laboratory of Mycology Institute of MicrobiologyChinese Academy of SciencesBeijing 100101China The Novo Nordisk Foundation Center for Biosustainability Technical University of Denmark2800 Kgs.LyngbyDenmark Key Biosensor Laboratory of Shandong Province Biology InstituteQilu University of Technology(Shandong Academy of Sciences)Jinan 250013China Brigham and Women's Hospital Boston MA 02115USA National Artificial Intelligence Institute US.Department of Veterans AffairsWashington DC 20420USA

药物外排泵的过量表达是病原微生物产生多药耐药(MDR)的重要原因之一.逆转药物外排泵的功能有望对抗多药耐药问题.在能危及人类生命的真菌病原菌白色念珠菌中,主要易化子超家族(MFS)类型转运蛋白Mdr1p能非特异性地向细胞外转运很多结构... 详细信息

药物外排泵的过量表达是病原微生物产生多药耐药(MDR)的重要原因之一.逆转药物外排泵的功能有望对抗多药耐药问题.在能危及人类生命的真菌病原菌白色念珠菌中,主要易化子超家族(MFS)类型转运蛋白Mdr1p能非特异性地向细胞外转运很多结构上不相关的抗真菌化合物,从而导致了白色念珠菌的多药耐药.本研究报道了一个有悖过往认知的案例:一个天然产物小檗碱不仅不会被白色念珠菌Mdr1p外排,而且还能特异性地挟持过表达的Mdr1p把自己运输进细胞.进一步研究发现,进入白色念珠菌细胞后的小檗碱能够在线粒体中积累,通过破坏线粒体膜电势和线粒体复合物I引起线粒体功能紊乱,从而杀死Mdr1p过表达的多药耐药白色念珠菌.在用Mdr1p过表达的白色念珠菌小鼠感染模型中,小檗碱治疗组小鼠的平均存活时间(MST)得到了显著延长.本研究提示找寻药物外排泵的逆转剂可能为如何克服多药耐药问题提供了一个新的思路.

关键词： Candida albicans Berberine Multidrug-resistance Drug excretion transporter Mitochondria

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蔬菜鱼糜制品的研制

农产品加工（下） 2009年第8期 39-41页

作者：孟秀梅张绵松袁文鹏夏雪奎王小军刘昌衡山东省科学院生物研究所山东济南250014 山东省科学院中日友好生物技术研究中心山东济南250014

以鱼糜为主要原料,研究添加蔬菜汁、淀粉、蛋清对产品特性的影响。实验结果表明,鱼糜加入量70%,胡萝卜汁3%,番茄汁1%,马铃薯淀粉5%,蛋清5%,所得鱼糜制品色泽呈红褐色,切面密实,弹性和韧性好,具有鱼肉的鲜香和胡萝卜、番茄蔬菜特有的气味... 详细信息

以鱼糜为主要原料,研究添加蔬菜汁、淀粉、蛋清对产品特性的影响。实验结果表明,鱼糜加入量70%,胡萝卜汁3%,番茄汁1%,马铃薯淀粉5%,蛋清5%,所得鱼糜制品色泽呈红褐色,切面密实,弹性和韧性好,具有鱼肉的鲜香和胡萝卜、番茄蔬菜特有的气味,营养价值高,口感细腻。

关键词：蔬菜鱼糜胡萝卜番茄

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B细胞型幼淋巴细胞白血病1例并文献复习

现代肿瘤医学 2019年第8期27卷 1400-1402页

作者：夏思古学奎广州中医药大学第一临床医学院广东广州510405

目的:提高对B细胞型幼淋巴细胞白血病(B-PLL)的诊治认识。方法:回顾分析了我院1例B-PLL患者的临床表现、骨髓细胞形态学、免疫分型、不良基因检测等临床资料以及治疗过程,并结合文献进行学习讨论。结果:B-PLL患者初诊时白细胞总数较高,... 详细信息

目的:提高对B细胞型幼淋巴细胞白血病(B-PLL)的诊治认识。方法:回顾分析了我院1例B-PLL患者的临床表现、骨髓细胞形态学、免疫分型、不良基因检测等临床资料以及治疗过程,并结合文献进行学习讨论。结果:B-PLL患者初诊时白细胞总数较高,脾肿大;骨髓形态学呈体积中等的幼稚淋巴细胞,核圆、核仁清晰、核染色质浓密、核浆比例低的特点;成熟B细胞免疫表型,免疫球蛋白轻链限制性表达,排除其他淋巴增殖性疾病,诊断为B细胞型幼淋巴细胞白血病。该患者TP53缺失,给予R-CHOP方案治疗,治疗反应差。结论:形态学检查和免疫表型是诊断B-PLL的重要手段,同时需整合临床表现、细胞遗传学等结果综合判断,TP53基因缺失或突变会导致这类患者传统化疗的预后不良。

关键词： B细胞型幼淋巴细胞白血病 B细胞淋巴瘤免疫组化分型