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2017-2019年度上海市松江区A(H1N1)pdm09流感病毒HA和NA基因特征分析

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疾病监测 2021年第5期36卷 423-430页

作者：吴佳瑾刘玲赵雪盛峰松乔雪飞上海市松江区疾病预防控制中心上海201620 上海市疾病预防控制中心上海200336

目的分析上海市松江区2017-2019监测年度A(H1N1)pdm09流感病毒HA和NA基因特征。方法对松江区分离的毒株随机挑选46株A(H1N1)pdm09流感病毒毒株进行HA和NA基因序列进化分析和氨基酸位点变异分析,采用神经氨酸酶抑制实验开展奥司他韦和扎... 详细信息

目的分析上海市松江区2017-2019监测年度A(H1N1)pdm09流感病毒HA和NA基因特征。方法对松江区分离的毒株随机挑选46株A(H1N1)pdm09流感病毒毒株进行HA和NA基因序列进化分析和氨基酸位点变异分析,采用神经氨酸酶抑制实验开展奥司他韦和扎那米韦敏感性监测。结果A(H1N1)pdm09流感病毒属于6B.1A分支且进化出了6B.1A2、6B.1A5A和6B.1A6进化簇。核苷酸序列分析显示,HA和NA基因与WHO推荐的2019-2020年度的疫苗株A/Brisbane/02/2018的亲缘关系较为接近,同源性分别为98.6%~99.4%和99.1%~99.7%。氨基酸序列分析显示,HA1蛋白共有23个位点发生氨基酸序列变异,43.48%病毒发生位于抗原决定簇Cb、Sa和Sb区的S74R、S164T、T185I共同突变,提示病毒发生抗原漂移。鸡胚适应性分析发现HA蛋白D187V、Q223R和E224K位点的适应性突变。NA蛋白共有25个位点发生变异,存在酶活性中心E119K(2/46)突变。神经氨酸酶抑制实验显示,所测流感病毒对奥司他韦和扎那米韦均敏感。结论A(H1N1)pdm09流感病毒HA和NA基因及其编码的氨基酸持续变异,因此应持续监测流感病毒,为科学防控提供依据。

关键词： A(H1N1)pdm09流感病毒血凝素神经氨酸酶基因特征鸡胚适应性分析

2017—2019年上海市松江区诺如病毒感染性腹泻疫情的病毒基因型特征分析

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中华预防医学杂志 2021年第11期55卷 1316-1320页

作者：乔雪飞刘玲吴健灏李萌俞佳莉李欣吕锡宏吴佳瑾上海市松江区疾病预防控制中心 201620

目的了解2017—2019年上海市松江区诺如病毒感染性腹泻疫情病毒基因型特征。方法收集上海市松江区2017—2019年69起由诺如病毒引起的感染性腹泻疫情的流行病学资料及相关样本,用针对诺如病毒ORF1和ORF2连接区进行基因测序的方法进行诺... 详细信息

目的了解2017—2019年上海市松江区诺如病毒感染性腹泻疫情病毒基因型特征。方法收集上海市松江区2017—2019年69起由诺如病毒引起的感染性腹泻疫情的流行病学资料及相关样本,用针对诺如病毒ORF1和ORF2连接区进行基因测序的方法进行诺如病毒基因测序及型别鉴定。结果2017—2019年,上海市松江区共报告诺如病毒感染腹泻疫情69起,共检测1767份样本:619份病例样本(诺如病毒阳性率19.9%),343份从业人员样本(诺如病毒阳性率1.1%),505份环境样本(诺如病毒阳性率0.5%)和300份食品样本(未检出)。测序获得141株基因序列,基因型别分析显示2017年和2018年主要引起感染性腹泻的基因型别为GII.P16-GII.2(50.98%,26/51),而2019年引起感染性腹泻的基因型别中GII.P16-GII.2(13.73%,7/51)和***-GII.4(9.80%,5/51)较多。结论引起上海市松江区2017—2019年诺如病毒感染的69起腹泻疫情病毒主要的基因型别为GII.P16-GII.2,呈明显的春、秋冬季高峰,且幼儿园及学校的事件较多。

关键词：腹泻基因型横断面研究诺如病毒

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甜菜碱参与西瓜抗枯萎病的初步探究

热带作物学报 2018年第2期39卷 355-360页

作者：徐子健孙梦利江雪飞乔飞海南大学热带农林学院海南省热带生物资源可持续利用重点实验室(省部共建国家重点实验室培育基地)海南海口570228 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点开放实验室海南儋州571737

为探究甜菜碱在参与西瓜抗枯萎病方面的作用,本研究以西瓜悬浮细胞为试验材料,利用镰刀菌酸诱导,测定细胞活性氧(ROS)的变化情况以及甜菜碱合成相关基因的表达变化等。结果表明:镰刀菌酸对西瓜细胞的生长有明显的抑制作用,通过外源添加... 详细信息

为探究甜菜碱在参与西瓜抗枯萎病方面的作用,本研究以西瓜悬浮细胞为试验材料,利用镰刀菌酸诱导,测定细胞活性氧(ROS)的变化情况以及甜菜碱合成相关基因的表达变化等。结果表明:镰刀菌酸对西瓜细胞的生长有明显的抑制作用,通过外源添加甜菜碱可以缓解低浓度(≤100μmol/L)下镰刀菌酸的胁迫;通过镰刀菌酸诱导西瓜细胞,可以使细胞内ROS迅速升高,并在30 min达到最大值,而同时添加甜菜碱处理可以明显降低细胞ROS含量;此外,镰刀菌酸诱导可以使甜菜碱合成基因Cl BADH和Cl CMO基因表达量呈现先上升后缓慢下降的趋势,且0.5 h相对表达量达到最高,这证明镰刀菌酸对西瓜甜菜碱合成基因Cl BADH和Cl COM的表达有不同程度诱导作用。上述研究结果初步表明甜菜碱在参与西瓜抗枯萎病方面具有一定作用,为加强对西瓜枯萎病抗病机制的探索和发掘抗性相关基因提供了理论支持。

关键词：西瓜甜菜碱镰刀菌酸活性氧表达分析

2016-2020年上海市松江区腹泻患者副溶血弧菌耐药性与分子分型研究

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疾病监测 2022年第2期37卷 245-250页

作者：俞佳莉乔雪飞盛峰松钱懿青吴健灏吴佳瑾李欣上海市松江区疾病预防控制中心上海201620

目的了解上海市松江区腹泻患者副溶血弧菌的毒力基因、耐药性和分子分型等,为预防食源性疾病提供科学依据。方法参照WS 271-2007进行副溶血弧菌的检测和分离,并应用微量肉汤法进行药物敏感性试验,采用PCR方法检测毒力基因,并对菌株进... 详细信息

目的了解上海市松江区腹泻患者副溶血弧菌的毒力基因、耐药性和分子分型等,为预防食源性疾病提供科学依据。方法参照WS 271-2007进行副溶血弧菌的检测和分离,并应用微量肉汤法进行药物敏感性试验,采用PCR方法检测毒力基因,并对菌株进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型。结果 2016—2020年采集腹泻患者肛拭子标本2 053份,共检出副溶血弧菌155株,阳性率为7.55%,其中夏秋季阳性率较高(11.80%),与冬春季(0.13%)的差异有统计学意义(χ^(2)=92.725,P0.05)。155株副溶血弧菌均携带毒力基因tlh,其中87.74%携带tdh,2.58%携带trh,8.39%不携带tdh和trh,三者差异有统计学意义(χ^(2)=317.890,P<0.01)。副溶血弧菌对多种抗生素敏感,对头孢唑林的耐药率最高(56.25%),其次为氨苄西林和环丙沙星,且存在多重耐药。PFGE分子分型显示,155株副溶血弧菌分为7个簇,共80种型别,部分菌株100%同源,为优势菌株。结论上海市松江区腹泻患者副溶血弧菌检出率较高,大部分携带毒力基因tdh,且对头孢唑林耐药严重,5年内优势菌株存在聚集性,须引起重视。

关键词：副溶血弧菌药物敏感性毒力基因脉冲场凝胶电泳

白纹伊蚊体内沃尔巴克氏体感染及基因分型调查

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上海预防医学 2024年第1期36卷 30-35页

作者：吕锡宏张驰乔雪飞王飞陶骏捷庞博文刘洪霞上海市松江区疾病预防控制中心上海201620 上海市虹口区疾病预防控制中心上海200082 上海市疾病预防控制中心上海200336

【目的】了解白纹伊蚊体内沃尔巴克氏体(Wolbachia)的感染及基因分型情况。【方法】2020—2021年采集居民区和野外区的白纹伊蚊成蚊和幼虫标本,采用聚合酶链反应(PCR)扩增沃尔巴克氏体表面蛋白(wsp)基因并进行wAlb A和wAlb B分型扩增,... 详细信息

【目的】了解白纹伊蚊体内沃尔巴克氏体(Wolbachia)的感染及基因分型情况。【方法】2020—2021年采集居民区和野外区的白纹伊蚊成蚊和幼虫标本,采用聚合酶链反应(PCR)扩增沃尔巴克氏体表面蛋白(wsp)基因并进行wAlb A和wAlb B分型扩增,测序并进行系统进化分析;不同地区生境、雌雄成蚊及成蚊幼虫之间的检出率差异采用χ^(2)检验。【结果】白纹伊蚊成蚊和幼虫的沃尔巴克氏体检出率分别为43.5%(77/177)和70.4%(190/270),差异有统计学意义(χ^(2)=32.086,P<0.001),均以共同检出wAlb A和wAlb B为主;白纹伊蚊雌蚊和雄蚊的沃尔巴克氏体检出率分别为50.7%(76/150)和3.7%(1/27),差异有统计学意义(χ^(2)=20.533,P<0.001);松江野外区、居民区及虹口居民区的白纹伊蚊成蚊沃尔巴克氏体检出率分别为91.7%(55/60)、18.8%(22/117)和41.7%(30/72),差异有统计学意义(χ^(2)=54.322,P<0.001)。基因分型和系统进化分析显示,白纹伊蚊成蚊和幼虫感染沃尔巴克氏体主要为A群wAlb A型和B群wAlb B型;另外存在个别序列单独形成进化枝,且与其他序列的遗传距离较大。【结论】松江区白纹伊蚊体内沃尔巴克氏体的感染情况较普遍,基因型主要有wAlb A型和wAlb B型,可能还存在其他亚型,值得进一步探究。

关键词：白纹伊蚊沃尔巴克氏体 wsp基因进化分析

2019年上海市松江区手足口病A组肠道病毒病原特征分析

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中华实验和临床病毒学杂志 2022年第2期36卷 189-194页

作者：刘玲吴佳瑾乔雪飞王嘉瑜孙中兴韩宁盛峰松上海市松江区疾病预防控制中心微生物检验科上海201620 上海市疾病预防控制中心病原生物检定所上海200336

目的了解上海市松江区2019年手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病原中A组肠道病毒(enterovirus,EV)VP1基因特征。方法使用实时荧光逆转录-聚合酶链式反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)检测HFMD疑似病例的标本,EV阳性标本接种人横纹肌肉瘤细胞(rhabdomyosarcoma cells,RD)培养病毒。分离到的A组EV毒株经VP1区基因测序后使用MEGA X软件进行系统进化分析及核苷酸、氨基酸同源性分析。结果2019年共检测207份HFMD标本,其中188份检出EV,柯萨奇病毒(coxsackievirus,CV)-A6、CV-A16、CV-A10、CV-A4阳性分别为47.34%(89/188)、41.49%(78/188)、3.72%(7/188)、2.66%(5/188),其他EV阳性为4.79%(9/188),未检出EV-A71。HFMD夏季流行高峰(5~7月)多检出B1基因亚型的CV-A16,B1a和B1b进化分支共同流行,秋冬季的次高峰(9~12月)检出D3a进化分支的CV-A6较多。CV-A10和CV-A4散在发病,均为C2基因亚型。与原型株相比,CV-A6、CV-A16、CV-A10、CV-A4 VP1基因核苷酸(氨基酸)序列同源性分别为79.22%~81.78%(95.97%~97.19%)、62.70%~65.54%(90.10%~91.30%)、81.76%~82.65%(91.63%~92.03%)、81.09%~81.79%(97.27%~97.67%)。结论HFMD病原体流行的多样性及复杂性增加了HFMD防控难度。EV监测项目的拓展及分子流行病学的研究有助于防控HFMD。

关键词：手足口病肠道病毒基因型系统进化分析同源性

2017—2020年上海市松江区乙型流感病毒病原学特征分析

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中华实验和临床病毒学杂志 2022年第6期36卷 671-677页

作者：刘玲吴佳瑾徐馨雨姚霞菁姜永根盛峰松乔雪飞上海市松江区疾病预防控制中心上海201620

目的分析上海市松江区2017—2020年乙型流感病毒流行情况及其血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因特征。方法使用实时荧光逆转录-聚合酶链式反应检测流感病毒疑似病例的标本,乙型流感病毒阳性标本接种犬肾细胞... 详细信息

目的分析上海市松江区2017—2020年乙型流感病毒流行情况及其血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因特征。方法使用实时荧光逆转录-聚合酶链式反应检测流感病毒疑似病例的标本,乙型流感病毒阳性标本接种犬肾细胞和鸡胚培养病毒。对乙型流感毒株HA和NA基因测序,序列进行基因进化及氨基酸变异分析,采用神经氨酸酶抑制实验研究毒株对奥司他韦和扎那米韦的敏感性。结果2017—2020年度松江区乙型流感病毒阳性率为14.24%(506/3554),主要流行季为冬春季,呈现B/Victoria和B/Yamagata亚型交替流行的特点。松江B/Victoria流行株主要位于1A(△3)B进化分支,少数位于1A及1A(△2)分支,与疫苗株B/Brisbane/60/2008相比,流行株HA和NA核苷酸同源性分别在97.62%~98.19%、98.11%~98.78%,1A(△3)B分支HA蛋白抗原决定簇区突变主要发生在120环和160环。B/Yamagata流行株均位于3进化分支,与疫苗株B/Phuket/3073/2013相比,HA(NA)核苷酸同源性98.71%~99.04%(98.69%~99.27%),未发现抗原决定簇区氨基酸改变。神经氨酸酶抑制实验显示,所测的乙型流感病毒对奥司他韦和扎那米韦均敏感。结论2017—2020年乙型流感病毒流行株与疫苗株抗原性匹配度不佳,需持续做好乙型流感病毒监测及病原学特征分析,为流感疫苗筛选及药物研发提供科学依据。

关键词：乙型流感病毒血凝素神经氨酸酶基因特性神经氨酸酶抑制剂

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全流程自动化病毒核酸检测系统构建与优化

实验技术与管理 2022年第9期39卷 269-273页

作者：盛峰松乔雪飞姜永根吴佳瑾孙中兴熊彩虹刘家朋上海市松江区疾病预防控制中心上海201620 上海汇像信息技术有限公司上海200241

为提高实验室病毒核酸检测能力,减少检测人员暴露风险,该研究利用机械臂取代人工操作,整合病毒样本前处理、核酸提取纯化、PCR体系构建、PCR扩增检测4个子系统,并通过优化开盖功能、吸液防堵塞功能及液面追踪功能,实现全流程自动化病毒... 详细信息

为提高实验室病毒核酸检测能力,减少检测人员暴露风险,该研究利用机械臂取代人工操作,整合病毒样本前处理、核酸提取纯化、PCR体系构建、PCR扩增检测4个子系统,并通过优化开盖功能、吸液防堵塞功能及液面追踪功能,实现全流程自动化病毒核酸检测系统稳定运行。优化后,开盖成功率提高至99.13%(P<0.001),吸液成功率提高至99.31%(P<0.001),构建PCR扩增体系成功率提高至98.89%(P=0.005)。通过优化时序管理,实现24小时千人份病毒样本全流程自动化核酸检测,满足高通量精准病毒核酸检测需求。

关键词：病毒核酸检测自动化全流程高通量

Mixed-Alkali Effect on Thermal Property and Elastic Behavior in Borosilicate Glasses

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Journal of Wuhan University of Technology(Materials Science) 2023年第5期38卷 1017-1024页

作者： XIE Xianmao ZHOU Hemin KE xuefei WANG Xiaowei WANG Yadan ZHANG Jiayan qiao Ang TAO Haizheng State Key Laboratory of Silicate Materials for Architectures Wuhan University of TechnologyWuhan 430070China AVIC Jonhon Optronic Technology Co.Ltd. Luoyang 471003China Wuhan University of Technology Advanced Engineering Technology Research Institute of Zhongshan City Zhongshan 528437China

We investigated the mixed alkali effect on the thermal properties and elastic response to temperature in the borosilicate glasses system with the composition of 70.65Si O_(2)·21.09B_(2)O_(3)·1.88Al_(2)O_(3)·(6.38-x)Li_(2)O·x Na_(2)O glasses,where x=0.00,1.595,3.19,4.785,and *** for the expected positive and negative deviations from linearity for the coefficients of thermal expansion,room temperature E and G,we observed a new mixed alkali efiect on the response of elastic moduli to *** transform infrared spectra were obtained to elucidate the possible structural origin of the mixed alkali *** work provides a valuable insight into the structural and mechanical properties of mixed-alkali borosilicate glasses.

关键词： mixed-alkali effect borosilicate glass elastic response to temperature structural origin