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AAV2-PDE6B restores retinal structure and function in the retinal degeneration 10 mouse model of retinitis pigmentosa by promoting phototransduction and inhibiting apoptosis

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Neural Regeneration Research 2025年第8期20卷 2408-2419页

作者： Ruiqi Qiu Mingzhu Yang xiuxiu jin jingyang Liu Weiping Wang Xiaoli Zhang jinfeng Han Bo Lei Henan Eye Hospital Henan Provincial People’s HospitalPeople’s Hospital of Zhengzhou UniversityZhengzhouHenan ProvinceChina Eye Institute Henan Academy of Innovations in Medical ScienceZhengzhouHenan ProvinceChina Branch of National Clinical Research Center for Ocular Disease Henan Provincial People’s HospitalZhengzhouHenan ProvinceChina Academy of Medical Science Zhengzhou UniversityZhengzhouHenan ProvinceChina

Retinitis pigmentosa is a group of inherited diseases that lead to retinal degeneration and photoreceptor cell ***,there is no effective treatment for retinitis pigmentosa caused by PDE6B ***-associated virus(AAV)-mediated gene therapy is a promising strategy for treating retinitis *** aim of this study was to explore the molecular mechanisms by which AAV2-PDE6B rescues retinal *** do this,we injected retinal degeneration 10(rd10)mice subretinally with AAV2-PDE6B and assessed the therapeutic effects on retinal function and structure using dark-and light-adapted electroretinogram,optical coherence tomography,and ***-independent acquisition-mass spectrometry-based proteomic analysis was conducted to investigate protein expression levels and pathway enrichment,and the results from this analysis were verified by real-time polymerase chain reaction and western ***2-PDE6B injection significantly upregulated PDE6βexpression,preserved electroretinogram responses,and preserved outer nuclear layer thickness in rd10 *** expressed proteins between wild-type and rd10 mice were closely related to visual perception,and treating rd10 mice with AAV2-PDE6B restored differentially expressed protein expression to levels similar to those seen in wild-type *** Encyclopedia of Genes and Genome analysis showed that the differentially expressed proteins whose expression was most significantly altered by AAV2-PDE6B injection were enriched in phototransduction ***,the phototransductionrelated proteins Pde6α,Rom1,Rho,Aldh1a1,and Rbp1 exhibited opposite expression patterns in rd10 mice with or without AAV2-PDE6B ***,Bax/Bcl-2,p-ERK/ERK,and p-c-Fos/c-Fos expression levels decreased in rd10 mice following AAV2-PDE6B *** data suggest that AAV2-PDE6B-mediated gene therapy promotes phototransduction and inhibits apoptosis by inhibiting the ERK signaling pathway and upr

关键词： apoptosis AAV2-PDE6B ERK1/2 gene therapy phototransduction proteomics rd10 retinitis pigmentosa

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Identification of Age-associated Proteins and Functional Alterations in Human Retinal Pigment Epithelium

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Genomics, Proteomics & Bioinformatics 2022年第4期20卷 633-647页

作者： xiuxiu jin jingyang Liu Weiping Wang Jiangfeng Li Guangming Liu Ruiqi Qiu Mingzhu Yang Meng Liu Lin Yang Xiaofeng Du Bo Lei Henan Eye Institute Henan Eye HospitalPeople’s Hospital of Zhengzhou UniversityHenan Provincial People’s HospitalZhengzhou 450003China Branch of National Clinical Research Center for Ocular Disease Henan Provincial People’s HospitalZhengzhou 450003China School of Medicine Henan Provincial People’s HospitalHenan UniversityZhengzhou 450003China Academy of Medical Sciences Zhengzhou UniversityZhengzhou 450001China School of Basic Medical Sciences Zhengzhou UniversityZhengzhou 450001China

Retinal pigment epithelium(RPE)has essential functions,such as nourishing and supporting the neural retina,and is of vital importance in the pathogenesis of age-related retinal ***,the exact molecular changes of RPE during aging remain poorly ***,we isolated human primary RPE(h RPE)cells from 18 eye donors distributed over a wide age range(10–67 years old).A quantitative proteomic analysis was performed to analyze changes in their intracellular and secreted ***-group related subtypes and age-associated proteins were revealed and potential age-associated mechanisms were validated in ARPE-19 and h RPE *** results of proteomic data analysis and verifications suggest that RNF123-and RNF149-related protein ubiquitination plays an important role in protecting h RPE cells from oxidative damage during *** older h RPE cells,apoptotic signaling-related pathways were up-regulated,and endoplasmic reticulum organization was down-regulated both in the intracellular and secreted *** work paints a detailed molecular picture of h RPE cells during the aging process and provides new insights into the molecular characteristics of RPE during aging and under other related clinical retinal conditions.

关键词： Human retinal pigment epithelium Proteomics Aging Retina Apoptosis

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IMVis: Visual analytics for influence maximization algorithm evaluation in hypergraphs

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Visual Informatics 2024年第2期8卷 13-26页

作者： jin Xu Chaojian Zhang Ming Xie xiuxiu Zhan Luwang Yan Yubo Tao Zhigeng Pan Hangzhou Normal University HangzhouChina Zhejiang University HangzhouChina Nanjing University of Information Science and Technology NanjingChina

Influence maximization(IM)algorithms play a significant role in hypergraph analysis tasks,such as epidemic control analysis,viral marketing,and social influence analysis,and various IM algorithms have been *** main challenge lies in IM algorithm evaluation,due to the complexity and diversity of the spreading processes of different IM algorithms in different *** evaluation methods mainly leverage statistical metrics,such as influence spread,to quantify overall performance,but do not fully unravel spreading characteristics and *** this paper,we propose an exploratory visual analytics system,IMVis,to assist users in exploring and evaluating IM algorithms at the overview,pattern,and node levels.A spreading pattern mining method is first proposed to characterize spreading processes and extract important spreading patterns to facilitate efficient analysis and comparison of IM *** visualization glyphs are designed to comprehensively reveal both temporal and structural features of IM algorithms’spreading processes in hypergraphs at multiple *** effectiveness and usefulness of IMVis are demonstrated through two case studies and expert interviews.

关键词： Influence maximization evaluation Comparative visual analysis Visual analytics

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Microbiome and metabolome dysbiosis analysis in impaired glucose tolerance for the prediction of progression to diabetes mellitus

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Journal of Genetics and Genomics 2024年第1期51卷 75-86页

作者： Boxun Zhang Xuan Zhang Zhen Luo Jixiang Ren Xiaotong Yu Haiyan Zhao Yitian Wang Wenhui Zhang Weiwei Tian xiuxiu Wei Qiyou Ding Haoyu Yang Zishan jin Xiaolin Tong Jun Wang Linhua Zhao Institute of Metabolic Diseases Guang'anmen HospitalChina Academy of Chinese Medical SciencesBeijing 100053China Faculty of Biological Science and Technology Baotou Teacher's CollegeBaotouInner Mongolia 014030China CAS Key Laboratory of Pathogenic Microbiology and Immunology Institute of MicrobiologyChinese Academy of SciencesBeijing 100101China Infinitus(China)Company Ltd GuangzhouGuangdong 510405China Affiliated Hospital of Changchun University of Chinese Medicine ChangchunJilin 130021China Department of Endocrinology Guang'anmen HospitalChina Academy of Chinese Medical SciencesBeijing 100053China Xinjiekou Community Health Service Center in Xicheng District Beijing 100035China Department of Spleen and Stomach Shenzhen Traditional Chinese Medicine HospitalShenzhenGuangdong 518033China University of Chinese Academy of Sciences Beijing 100049China Beijing University of Chinese Medicine Beijing 100105China Northeast Asia Institute of Traditional Chinese Medicine Changchun University of Chinese MedicineChangchunJilin 130117China

Gut microbiota and circulating metabolite dysbiosis predate important pathological changes in glucose metabolic disorders;however,comprehensive studies on impaired glucose tolerance(IGT),a diabetes mellitus(DM)precursor,are ***,we perform metagenomic sequencing and metabolomics on 47 pairs of individuals with IGT and newly diagnosed DM and 46 controls with normal glucose tolerance(NGT);patients with IGT are followed up after 4 years for progression to *** of baseline data reveals significant differences in gut microbiota and serum metabolites among the IGT,DM,and NGT *** addition,13 types of gut microbiota and 17 types of circulating metabolites showed significant differences at baseline before IGT progressed to DM,including higher levels of Eggerthella unclassified,Coprobacillus unclassified,Clostridium ramosum,L-valine,L-norleucine,and L-isoleucine,and lower levels of Eubacterium eligens,Bacteroides faecis,Lachnospiraceae bacterium 3_1_46FAA,Alistipes senegalensis,Megaspaera elsdenii,Clostridium perfringens,α-linolenic acid,10E,12Z-octadecadienoic acid,and dodecanoic acid.A random forest model based on differential intestinal microbiota and circulating metabolites can predict the progression from IGT to DM(AUC=0.87).These results suggest that microbiome and metabolome dysbiosis occur in individuals with IGT and have important predictive values and potential for intervention in preventing IGT from progressing to DM.

关键词： Impaired glucose tolerance Diabetes mellitus Gut microbiota Metabolomics

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新型冠状病毒关键受体ACE2在眼部的分布及其临床意义

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中华实验眼科杂志 2020年第5期38卷 463-467页

作者：张璐佳靳秀秀(综述) 雷博(审校) 新乡医学院 453003 河南省人民医院郑州大学人民医院河南省眼科研究所河南省立眼科医院河南省眼科疾病临床医学研究中心郑州450003

目前,新型冠状病毒(2019-nCoV)引起的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情呈大流行状态。2019-nCoV主要引起人类呼吸道感染并引起肺部组织结构和功能损害,已发现部分患者合并病毒性结膜炎,或以双眼病毒性结膜炎为首发症状,因此了解2019-nCo... 详细信息

目前,新型冠状病毒(2019-nCoV)引起的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情呈大流行状态。2019-nCoV主要引起人类呼吸道感染并引起肺部组织结构和功能损害,已发现部分患者合并病毒性结膜炎,或以双眼病毒性结膜炎为首发症状,因此了解2019-nCoV的生物学行为及眼是否会被其感染非常重要。2019-nCoV主要通过与细胞表面的血管紧张素转化酶2(ACE2)结合侵入人类组织细胞,研究发现ACE2不仅表达于人肺脏、肾脏、心血管等器官,而且在人的结膜、角膜、房水及视网膜中也有表达。了解眼内ACE2的分布,有助于更加全面地认识COVID-19的感染机制和发病原因并且更好地了解眼科其他相关疾病的病理机制。ACE2是2019-nCoV侵染宿主的受体蛋白,同时也是肾素-血管紧张素系统(RAS)中的一个关键酶,眼部相对独立的RAS在维持眼的生理功能中发挥重要的调控作用,并且与许多眼科常见病有关。本文对ACE2在眼组织中的分布及其临床意义进行综述。

关键词：血管紧张素转化酶2 眼新型冠状病毒感染肾素-血管紧张素系统

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基于季节趋势模型法预测中国尿素产量

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大氮肥 2022年第3期45卷 212-216页

作者：金秀秀烟台安云思商务咨询有限公司山东烟台264004 山东大学山东济南250100

运用月平均季节指数趋势法和移动平均季节指数趋势法两种季节性分析方法对2017—2020年尿素月产量进行分析,建立趋势预测模型,用2021年尿素产量对趋势预测模型检验。两种方法均对尿素月产量的预测有实际意义,其中移动平均季节指数趋势... 详细信息

运用月平均季节指数趋势法和移动平均季节指数趋势法两种季节性分析方法对2017—2020年尿素月产量进行分析,建立趋势预测模型,用2021年尿素产量对趋势预测模型检验。两种方法均对尿素月产量的预测有实际意义,其中移动平均季节指数趋势法预测的精度更高一些,该预测模型可为尿素市场决策和政府化肥行业指导提供有效的建议。

关键词：尿素产量季节指数法预测

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基于时间序列的中国尿素产量预测

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山东化工 2022年第4期51卷 97-99,102页

作者：金秀秀山东大学管理学院山东济南250000

中国尿素产量约占全球总产能的30%,产量和需求量均居于首位,并且尿素作为粮食的粮食,在粮食安全扮演重要的角色,尿素产量变化具有重要的研究意义。应用时间序列分析2017~2020年尿素月产量,建立预测模型,并用2021年1~9月实际尿素产量对... 详细信息

中国尿素产量约占全球总产能的30%,产量和需求量均居于首位,并且尿素作为粮食的粮食,在粮食安全扮演重要的角色,尿素产量变化具有重要的研究意义。应用时间序列分析2017~2020年尿素月产量,建立预测模型,并用2021年1~9月实际尿素产量对趋势预测模型检验。时间序列拟合的简单季节模型预测的精度较高,该预测模型为尿素市场决策,政府指导化肥行业提供有效的建议。

关键词：尿素产量时间序列,简单季节模型预测

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机场不停航施工运行安全评估

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综合运输 2021年第10期43卷 90-96页

作者：李龙海金秀秀中国民航大学交通科学与工程学院天津300300 河南省交通规划设计研究院河南450000

随着我国民用机场的飞速发展,机场规模的不断扩大,改扩建工程对于机场势在必行,不停航施工与机场运行之间的矛盾日渐突出,机场不停航施工可能会给机场带来运行秩序上的干扰、机场不安全事件发生等。为了降低不停航施工带来的机场运行安... 详细信息

随着我国民用机场的飞速发展,机场规模的不断扩大,改扩建工程对于机场势在必行,不停航施工与机场运行之间的矛盾日渐突出,机场不停航施工可能会给机场带来运行秩序上的干扰、机场不安全事件发生等。为了降低不停航施工带来的机场运行安全方面的潜在风险,利用集对分析法能够更好的体现风险分析的不确定性、准确性与系统性等优点,对机场不停航施工运行安全进行评估,得到危险源实施缓解措施前后安全态势值的变化。结果表明:集对分析法既能对机场不停航施工运行安全做出科学有效的评估,又能溯其根源有针对性的提出缓解措施,对提高机场不停航施工运行安全有效,并具有广泛的适用性,为更科学地运行安全风险评估提供了借鉴。

关键词：不停航施工民航机场运行安全集对分析法风险评估

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MALDI-TOF质谱仪在血培养中的应用

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中国当代医药 2023年第8期30卷 167-172页

作者：金秀秀张亚彬中国人民解放军联勤保障部队第九〇〇医院检验科福建福州350025 福建建发德尔医疗有限公司福建福州350000

目的评估MALDI-TOF质谱仪在血培养中的应用,探究MALDI-TOF质谱仪对血培养阳性报告时间(TTP)的影响,尽可能缩短TTP,及早终止临床错误用药,提供正确治疗方案。方法收集2021年12月至2022年4月中国人民解放军联勤保障部队第九〇〇医院的104... 详细信息

目的评估MALDI-TOF质谱仪在血培养中的应用,探究MALDI-TOF质谱仪对血培养阳性报告时间(TTP)的影响,尽可能缩短TTP,及早终止临床错误用药,提供正确治疗方案。方法收集2021年12月至2022年4月中国人民解放军联勤保障部队第九〇〇医院的104份标本,统计TTP以及标本周转时间(TAT),同时进行MALDI-TOF质谱仪和WalkAway96plus仪细菌鉴定结果比对。另对2022年3月和5月共53份阳性血培养瓶原液,利用十二烷基硫酸钠(SDS)和皂素进行标本前处理,直接比对两者的优势,选最优试剂。结果与WalkAway96plus仪鉴定相比,MALDI-TOF质谱仪鉴定的共104株菌株(57株革兰氏阴性菌和47株革兰氏阳性菌)的属种水平完全相符,每个样本的置信度均大于99.9%,无错误鉴定,总得阳性符合率是100%(104/104)。WalkAway96plus仪正确的属鉴定率为84.6%(88/104),正确的种鉴定率为68.3%(71/104)。MALDI-TOF质谱仪对菌株的属、种鉴定水平均优于WalkAway96plus仪,差异有统计学意义(P<0.05)。结论用SDS进行标本前处理,结合MALDI-TOF质谱仪,使得TTP大大缩短及血培养鉴定流程更加优化,为临床提供更好服务。

关键词： MALDI-TOF质谱仪应用评估血培养阳性报告时间标本前处理

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一起由肠炎沙门菌引起食物中毒事件的病原学检验分析

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医学动物防制 2023年第5期39卷 510-510,F0003,F0004页

作者：靳秀秀熊海平许海燕王彧超张鑫黄爱龙南通市疾病预防控制中心检验科江苏226000

目的通过脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)技术分析一起食物中毒事件病原菌的相关性,从遗传学确定该起事件发生的原因。方法参照《感染性腹泻诊断标准》(WS 271—2007),对采集的肛拭子和可疑食物等样品进行病原... 详细信息

目的通过脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)技术分析一起食物中毒事件病原菌的相关性,从遗传学确定该起事件发生的原因。方法参照《感染性腹泻诊断标准》(WS 271—2007),对采集的肛拭子和可疑食物等样品进行病原菌培养、分离和鉴定。利用脉冲场凝胶电泳对分离菌株进行分子分型,采用Bio Numerics 5.1软件开展相关性分析。药敏试验的方法为微量肉汤稀释法。结果本起食物中毒事件共分离到4株肠炎沙门菌,分别分离自患者肛拭子(2株)、厨师肛拭子(1株)与可疑食物(1株)。4株分离菌对7种抗生素存在不同程度的耐药性;PFGE溯源性分析结果显示,4株分离菌呈现高度同源。结论本起食物中毒事件由食用被肠炎沙门菌污染的食物所致。分离株的多重耐药性应引起相关部门的重视。PFGE分子分型从全基因组的层面分析菌株的遗传学关系,是病原菌溯源研究的重要手段。

关键词：肠炎沙门菌食物性疾病脉冲场凝胶电泳耐药性病原学分析

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