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Rapid changes of microsatellite flanking sequence in the allopolyploidization of new synthesized hexaploid wheat

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Science China(Life Sciences) 2004年第6期47卷 553-561页

作者： ZHANG Lianquan LIU Dengcai YAN Zehong lan xiujin ZHENG Youliang ZHOU Yonghong Triticeae Research Institute Sichuan Agricultural UniversityDujiangyan 611830China

It was suggested that the rapid changes of DNA sequence and gene expression oc- curred at the early stages of allopolyploid formation. In this study, we revealed the microsatellite (SSR) differences between newly formed allopolyploids and their donor parents by using 21 primer sets specific for D genome of wheat. It was indicated that rapid changes had occurred in the “shock” process of the allopolyploid formation between tetraploid wheat and Aegilops tauschii. The changes of SSR flanking sequence resulted in appearance of novel bands or disappearance of parental bands. The disappearance of the parental bands showed much higher frequencies in comparison with that of appearance of novel bands. Disappearance of the parental bands was not random. The frequency of disappearance in tetraploid wheat was much higher than in Ae. tauschii, i. e. the disappearance frequency in AABB genome was much higher than in D genome. Changes of SSR flanking sequence occurred at the early stage of F1 hybrid or just after chro- mosome doubling. From the above results, it can be inferred that SSR flanking sequence region was very active and was amenable to change in the process of polyploidization. This suggested that SSR flanking sequence probably had special biological function at the early stage of ploy- ploidization. The rapid and directional changes at the early stage of polyploidization might con- tribute to the rapid evolution of the newly formed allopolyploid and allow the divergent genomes to act in harmony.

关键词： synthesized hexaploid wheat genome evolution microsatellite allopolyploidization SSR.

A major vernalization-independent QTL for tiller angle on chromosome arm 2BL in bread wheat

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The Crop Journal 2022年第1期10卷 185-193页

作者： Jiajun Liu Jieguang Zhou Huaping Tang Yang Tu Yang Mu Lulu Gou Qiantao Jiang Yaxi Liu Guoyue Chen Jirui Wang Pengfei Qi Wei Li Yunfeng Jiang Zehong Yan Houyang Kang Yuming Wei xiujin lan Youliang Zheng Jian Ma State Key Laboratory of Crop Gene Exploration and Utilization in Southwest China Triticeae Research InstituteSichuan Agricultural UniversityChengdu 611130SichuanChina College of Agronomy Sichuan Agricultural UniversityChengdu 611130SichuanChina

Tiller angle(TA)strongly influences plant architecture and grain yield in ***,the genetic basis of TA in wheat is largely *** identified three TA-related quantitative trait loci(QTL).One of them was ***-2 B-769,a major QTL localized on chromosome arm 2 ***-2 B-769 was detected in seven environments,explaining 18.1%–51.1%of phenotypic *** developed a linked Kompetitive Allele-Specific Polymerase chain reaction(KASP)marker,KASP-AX-108792274,to further validate this locus in three additional populations in multiple ***-2 B-769 increased TA by up to 24.9%in these *** were significant and positive correlations between TA and flag leaf angle(FlanG).However,TA was not correlated with plant height or anthesis date,suggesting that expression of ***-2 B-769 is independent of *** CS2 B01 G583800,a gene known to be involved in leaf angle regulation,was identified as the most likely candidate gene for ***-2 *** results enrich our understanding of the mechanisms regulating wheat TA at maturity and may support precise mapping and cloning of gene(s)underlying ***-2 B-769.

关键词： Tiller angle QTL detection and validation Candidate genes Expression patterns

对具有一个共同亲本的杂种F1育性差异的初步研究

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四川农业大学学报 2020年第1期38卷 1-7页

作者：陶军兰秀锦四川农业大学小麦研究所成都611130 绵阳市农业科学研究院四川绵阳621023

【目的】对具有一个共同亲本的杂种F1所表现出的育性差异进行了研究。【方法】观察了F1的育性、减数分裂配对情况;采用SLAF-Seq-BSA(specific-locus amplified fragment sequencing and bulked segregant analysis)技术,对与育性有关系... 详细信息

【目的】对具有一个共同亲本的杂种F1所表现出的育性差异进行了研究。【方法】观察了F1的育性、减数分裂配对情况;采用SLAF-Seq-BSA(specific-locus amplified fragment sequencing and bulked segregant analysis)技术,对与育性有关系的基因进行关联分析;对不育F1及其两个亲本的花药的转录组进行了分析。【结果】在不同播期下,正反交杂种F1表现出稳定的不育特性,其自交结实率低于0.5%(国内法)。雄性不育的014-459/川麦55和可育的014-459/绵08-9杂种F1减数分裂时染色体行为相似。SLAF分析将不育相关基因在染色体上的关联区域限定在2D染色体上的3个区域,转录组分析将亲本和F1之间表达有差异的基因确定出来,结合SLAF分析和转录组分析,找到了F1不育的育性相关基因。【结论】减数分裂染色体行为异常不是014-459和普通小麦的杂种F1表现不育的原因。F1不育是一种新的不育类型,初步确定与F1表现出不育的关联基因是2D01G027900,GO注释号是0009753,其主要功能是对茉莉酸起响应。

关键词：小麦 F1不育 SLAF-Seq 转录组

普通小麦TaGNOM1的分子鉴定和表达分析

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四川农业大学学报 2020年第4期38卷 373-383页

作者：李婷涂洋李聪刘航兰秀锦马建四川农业大学小麦研究所成都611130

【目的】初步了解GNOM1基因在小麦中的可能的功能。【方法】对小麦同源基因TaGNOM1进行了结构、启动子调控区、组织特异性表达以及非生物胁迫表达等进行了分析,同时利用实时荧光定量PCR技术(RT-qPCR)在"中国春"中对该基因的表达模式进... 详细信息

【目的】初步了解GNOM1基因在小麦中的可能的功能。【方法】对小麦同源基因TaGNOM1进行了结构、启动子调控区、组织特异性表达以及非生物胁迫表达等进行了分析,同时利用实时荧光定量PCR技术(RT-qPCR)在"中国春"中对该基因的表达模式进行了验证。【结果】TaGNOM1位于小麦第4同源染色体群(4A、4B和4D),其基因结构一致,包含1个内含子和2个外显子。在所研究的物种中除大麦外,均包含有保守的功能域(Sec7)。组织特异性表达分析表明,与其他组织相比GNOM1基因在小麦的穗、茎和根部,水稻的花药、穗及根部,以及大麦的花序轴表达更为丰富。公共数据库和RT-qPCR分析结果表明小麦TaGNOM1在高盐处理下,表达量受到正向调控;而在低温、ABA、干旱和高温处理下,受到负向调控。这些结果表明该基因可能参与小麦非生物逆境胁迫的调控。【结论】拓宽了对TaGNOM1基因的认识,对进一步研究其在小麦中的生物学功能提供了参考信息。

关键词：普通小麦 TaGNOM1 基因结构蛋白结构转录因子表达模式非生物胁迫

LVS/DR、NGINX混合负载均衡集群技术应用研究

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湖北民族学院学报（自然科学版） 2017年第1期35卷 23-26页

作者：陈荣赏蓝秀锦厦门理工学院计算机与信息工程学院福建厦门361024 欧仕达听力(厦门)科技有限公司福建厦门361000

为解决单一集群技术满足不了企业Web服务器集群应用需求,提出构建LVS/DR+NGINX集群混合应用模式.通过分析LVS、NGINX、HAPROXY、TOMCAT集群技术的优缺点,假设LVS/DR+NGINX集群混合模式解决单点故障、节点网络带宽瓶颈、并发性处理性能... 详细信息

为解决单一集群技术满足不了企业Web服务器集群应用需求,提出构建LVS/DR+NGINX集群混合应用模式.通过分析LVS、NGINX、HAPROXY、TOMCAT集群技术的优缺点,假设LVS/DR+NGINX集群混合模式解决单点故障、节点网络带宽瓶颈、并发性处理性能提高问题,通过对方案模式构建、测试,测试结果证明该模式实现Web服务器集群应用的高性能和高可靠性需求.

关键词：集群技术 LVS/DR+NGINX WEB服务器集群高性能高可靠

主要植物类病斑突变体研究进展及其对小麦相关研究的启示

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四川农业大学学报 2022年第5期40卷 633-644页

作者：马建李聪田荣唐华苹兰秀锦姚琦馥四川农业大学小麦研究所成都611130 铜仁学院农林工程与规划学院/贵州省梵净山地区生物多样性保护与利用重点实验室贵州铜仁554300

【目的】了解植物类病斑基因的研究进展和调控模式,为叶部性状遗传改良和抗病基因挖掘奠定基础。【方法】通过搜集查阅国内外与类病斑基因相关文献研究动态,对植物类病斑突变体的起源和命名、分类、遗传机制和抗病性进行了总结归纳。【... 详细信息

【目的】了解植物类病斑基因的研究进展和调控模式,为叶部性状遗传改良和抗病基因挖掘奠定基础。【方法】通过搜集查阅国内外与类病斑基因相关文献研究动态,对植物类病斑突变体的起源和命名、分类、遗传机制和抗病性进行了总结归纳。【结果】类病斑的产生会影响植株的生长发育。类病斑的产生类似于过敏反应,导致细胞程序性死亡但是增强植株的抗病能力。基于主要植物拟南芥、水稻、玉米和大麦研究进展,大量研究证明类病斑基因在生物胁迫方面发挥着重要作用。【结论】以拟南芥和水稻为代表的模式作物中已经报道了许多类病斑基因,包括小麦在内的其他作物中类病斑基因的研究较为缓慢。上述主要植物的类病斑研究进展以及测序技术、分子生物学和转基因技术的发展,将极大促进小麦中类病斑基因的克隆和调控机制的解析。类病斑基因的研究具有重要的研究价值和应用前景。

关键词：植物类病斑突变体抗病性细胞程序性死亡

基于55K SNP芯片的普通小麦穗长非条件和条件QTL分析

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中国农业科学 2022年第8期55卷 1492-1502页

作者：唐华苹陈黄鑫李聪苟璐璐谭翠牟杨唐力为兰秀锦魏育明马建四川农业大学小麦研究所四川农业大学动物营养研究所攀枝花市农林科学研究院

【目的】进一步挖掘小麦穗长具有利用价值的数量遗传位点（QTL），同时深入探究穗长与其他重要农艺性状之间的遗传关系，为精细定位和分子辅助选择育种奠定基础。【方法】以20828为母本、SY95-71为父本，构建126份F7代重组自交系群体。... 详细信息

【目的】进一步挖掘小麦穗长具有利用价值的数量遗传位点（QTL），同时深入探究穗长与其他重要农艺性状之间的遗传关系，为精细定位和分子辅助选择育种奠定基础。【方法】以20828为母本、SY95-71为父本，构建126份F7代重组自交系群体。将亲本及其重组自交系分别于2016—2017年和2017—2018年生长季种植在中国四川省成都市温江区试验基地、中国四川省崇州市试验基地、中国四川省雅安市试验基地以及孟加拉国库尔纳市试验田，调查7个不同环境下的穗长表型。利用基于小麦55K SNP芯片构建的遗传连锁图谱进行非条件QTL的定位，并分析其效应。分别以株高、穗茎长、每穗小穗数和千粒重为条件，对定位到的主效QTL进行条件QTL分析，分析穗长与它们的遗传关系。【结果】通过非条件QTL定位到13个穗长QTL，分别位于1A、1D、2B、2D、4B、6D和7A染色体，LOD值为2.79—6.19，贡献率为5.35%—12.77%。其中，定位到3个稳定遗传的主效QTL:QSl-sau-2SY-2B、QSl-sau-2SY-2D.5和QSl-sau-2SY-4B，贡献率分别为6.54%—11.72%、10.16%—12.57%和5.35%—10.92%。这三个主效QTL在多环境分析中也可以检测到。进一步聚合分析表明，聚合QSl-sau-2SY-2B、QSl-sau-2SY-2D.5和QSl-sau-2SY-4B增效位点的株系穗长表型显著长于聚合任意2个主效QTL或仅含单个主效QTL增效位点的株系。同时，发现QSl-sau-2SY-2B对于株高、穗茎长、每穗小穗数和千粒重均没有显著影响，QSl-sau-2SY-2D.5对于千粒重有显著影响，达到3.98%，而对于株高、穗茎长和每穗小穗数没有显著影响，QSl-sau-2SY-4B对于株高和穗茎长有极显著影响，分别达到-12.28%和-22.26%，而对于每穗小穗数和千粒重没有显著影响。条件QTL分析结果表明，在QTL水平上，QSl-sau-2SY-2B与株高和穗茎长无关，但受到每穗小穗数和千粒重的影响，QSl-sau-2SY-2D.5与穗茎长、每穗小穗数和千粒重无关，但受到株高的影响，QSl-sau-2SY-4B与穗茎长和千粒重无关，但受到株高和每穗小穗数的影响。【结论】定位到3个控制穗长且稳定遗传的主效QTL——QSl-sau-2SY-2B、QSl-sau-2SY-2D.5和QSl-sau-2SY-4B。其中，QSl-sau-2SY-2B可能为新的QTL，独立于株高和穗茎长遗传。

关键词：普通小麦 55K SNP芯片穗长非条件QTL 条件QTL

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小麦颖壳绒毛性状的驯化

四川农业大学学报 2019年第6期37卷 743-754,770页

作者：罗伟刘家君丁浦洋邹亚亚李婷谢全马建兰秀锦四川农业大学小麦研究所成都611130 南京农业大学农学院南京210095

【目的】分析普通小麦驯化过程中颖壳绒毛的演变趋势,并总结颖壳绒毛可能具有的功能。【方法】对二倍体(栽培一粒小麦、乌拉尔图小麦和节节麦),四倍体(包括野生二粒小麦、栽培二粒小麦、圆锥小麦、硬粒小麦、东方小麦和波斯小麦),六倍体... 详细信息

【目的】分析普通小麦驯化过程中颖壳绒毛的演变趋势,并总结颖壳绒毛可能具有的功能。【方法】对二倍体(栽培一粒小麦、乌拉尔图小麦和节节麦),四倍体(包括野生二粒小麦、栽培二粒小麦、圆锥小麦、硬粒小麦、东方小麦和波斯小麦),六倍体(包括云南小麦、印度圆粒小麦、新疆稻麦、西藏半野生小麦、斯卑尔脱小麦、茹科夫斯基小麦、密穗小麦以及国内外育成品种或品系等)共2 537份材料的颖壳性状进行观察和鉴定。同时结合研究过程中的发现和文献报道,对该性状的功能进行总结。【结果】在827份二倍体和四倍体小麦中,颖壳绒毛出现的频率为2.18%;而在1 710份国内外六倍体小麦中,有7.37%的材料具有颖壳绒毛。其中,888份中国的地方小麦中,有10.25%属于颖壳绒毛材料,远高于中国育成品种的比例。此外,颖壳绒毛可能具有抗生物和非生物胁迫的功能。【结论】在普通小麦驯化过程中,颖壳绒毛可能遭到了淘汰,因此呈现下降趋势。

关键词：小麦近缘种属小麦颖壳绒毛驯化

小麦抗穗发芽的鉴定及其灌浆过程中胚、种皮和颖壳三因素与籽粒发芽率的关系

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四川农业大学学报 1996年第4期14卷 533-536,570页

作者：兰秀锦王志容四川农业大学小麦研究所都江堰市611830

通过对7个小麦品种开花后不同天数的整穗发芽率、脱粒种子发芽率和切胚发芽率的测定，结果表明：不同品种间稳发芽抗性的差异主要是生理性抑制程度的不同，并且在开花20天之前，这种生理性抑制主要存在于颖壳内。由此认为可以在早期通... 详细信息

通过对7个小麦品种开花后不同天数的整穗发芽率、脱粒种子发芽率和切胚发芽率的测定，结果表明：不同品种间稳发芽抗性的差异主要是生理性抑制程度的不同，并且在开花20天之前，这种生理性抑制主要存在于颖壳内。由此认为可以在早期通过植物体的其他生理生化测定来判断不同品种的穗发芽抗性。同时筛选出一份抗穗发芽的白位改良品种。

关键词：小麦生理性抑制穗发芽抗性