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A comparative analysis of small RNAs between two Upland cotton backcross inbred lines with different fiber length: Expression and distribution

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The Crop Journal 2019年第2期7卷 198-208页

作者： Guoyuan Liu Man Wu Wenfeng Pei Xihua Li Nuohan Wang Jianjiang Ma xinshan zang Shuxun Yu Jinfa Zhang Jiwen Yu State Key Laboratory of Cotton Biology Cotton Institute of the Chinese Academy of Agricultural Sciences Key Laboratory of Cotton Genetic Improvement Ministry of Agriculture Department of Plant and Environmental Sciences New Mexico State University

The cotton fiber is the most important raw material for the textile industry and an ideal model system for studying cell elongation. However, the genetic variation of fiber elongation in relation to miRNA is poorly understood. A high-throughput comparative RNA-seq of two lines differing in fiber length(FL) from a backcross inbred line(BIL)population of G. hirsutum × G. barbadense revealed differentially expressed(DE) miRNAs and their targets in rapidly elongating fibers. A real-time quantitative PCR analysis was further performed to validate the results. A total of 463(including 47 DE) miRNAs were identified,and seven DE miRNAs were co-localized with seven FL quantitative trait loci(QTL)identified in the G. hirsutum × G. barbadense population. Of 82(including 21 DE) targets identified, nine(including one DE) were also co-localized with the seven FL QTL. The relationship between the allopolyploid and its diploid ancestral species with respect to miRNAs and their targets was also characterized. These results will facilitate the understanding of the molecular genetic mechanism of fiber elongation with regards to miRNAs in cotton.

关键词： Allopolyploid Gossypium Fiber elongation miRNA QTL hotspots

超声波处理对中棉113种子萌发和幼苗生长发育的影响

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中国棉花 2024年第5期51卷 20-24页

作者：王军张先亮贺昆仑王康文黄俊森 Nasre Ahmed 高宇裴小雨任翔王星星臧新山马雄风高俊山安徽农业大学生命科学学院合肥230036 中国农业科学院棉花研究所/棉花生物育种与综合利用全国重点实验室/农业农村部棉花生物学与遗传育种重点实验室河南安阳455000 中国农业科学院西部农业研究中心新疆昌吉831100 郑州大学农学院郑州450000

超声波处理可以促进种子萌发、提高陈旧种子发芽率,调控作物产量和品质。本研究旨在通过分析超声波处理对棉花种子萌发和幼苗生物量的影响,明确超声波处理对棉花种子萌发和幼苗生长发育的调控效应。以中棉113为试验材料,用频率40 kHz、... 详细信息

超声波处理可以促进种子萌发、提高陈旧种子发芽率,调控作物产量和品质。本研究旨在通过分析超声波处理对棉花种子萌发和幼苗生物量的影响,明确超声波处理对棉花种子萌发和幼苗生长发育的调控效应。以中棉113为试验材料,用频率40 kHz、功率200 W的超声波清洗器对中棉113的种子进行不同时间(20 min、30 min、40 min)处理,通过统计发芽率、发芽势、发芽指数和胚根长度,明确超声波处理调控种子萌发的适宜时间;通过调查和测定超声波处理后种子的出苗情况和两叶一心期材料的鲜物质质量和干物质质量,评估超声波处理对幼苗生长发育的影响。研究表明,超声波处理的种子发芽势和发芽指数显著高于对照组,随处理时间延长呈先上升后下降的趋势,其中超声波处理30 min的最高,且该处理种子胚根长度显著增长,出苗状况最佳。超声波处理后,种子出苗加快,两叶一心期幼苗鲜物质质量和干物质质量均显著提高。研究明确了适宜条件的超声波处理对中棉113种子萌发和幼苗生长发育具有促进作用,其中30 min为频率40 kHz、功率200 W的超声波的适宜处理时间。这些结果可为超声波技术在棉花生产实践中的应用提供科学依据。

关键词：超声波中棉113 种子萌发幼苗生长发育发芽率发芽势

A targeted QTL analysis for fiber length using a genetic population between two introgressed backcrossed inbred lines in upland cotton(Gossypium hirsutum)

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The Crop Journal 2019年第3期7卷 273-282页

作者： Guoyuan Liua Wenfeng Pei Dan Li Jianjiang Ma Yupeng Cui Nuohan Wang Jikun Song Man Wu Libei Li xinshan zang Shuxun Yu Jinfa Zhang Jiwen Yu State Key Laboratory of Cotton Biology Cotton Institute of the Chinese Academy of Agricultural SciencesKey Laboratory of Cotton Genetic ImprovementMinistry of AgricultureAnyang 455000HenanChina Xinjiang Research Base State Key Laboratory of Cotton BiologyXinjiang Agricultural UniversityUrumqi 830001XinjiangChina Department of Plant and Environmental Sciences New Mexico State UniversityLas CrucesNM 88003USA

Cotton fiber is the most important natural raw material for the textile industry, and fiber length(FL) is one of the most important traits in *** trait locus(QTL)mapping based on high-density genetic maps is an efficient approach to identify genetic regions for *** our study, two backcrossed inbred lines(BILs) were chosen as parents to construct a high-density genetic map in F2 which was used to fine map FL QTL in F2:3 *** genetic map had a total size of 3462.8 cM, containing 9182 singlenucleotide polymorphisms(SNPs) based on *** FL related stable QTL were identified on two chromosomes(qFL-A08–1 on A08 and qFL-D03–1 on D03),and qFL-A08–1 was confirmed by a *** previously obtained RNA-seq data for the two BILs and qRT-PCR analysis, two candidate genes annotated as cytochrome b5(CB5, Gh_A08 G1729) and microtubule end-binding 1 C(EB1C, Gh_D03 G0232) that may regulate FL during the fiber elongation stage were *** addition, nine recombination hotspots in this population were *** results of this study will provide an important foundation for further studies on the molecular and genetic regulation of fiber elongation.

关键词： Gossypium Single-nucleotide polymorphism Fiber length Quantitative trait locus

Genome-wide association study of micronaire using a natural population of representative upland cotton(Gossypium hirsutum L.)

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Journal of Cotton Research 2021年第2期4卷 114-125页

作者： SONG Jikun PEI Wenfeng MA Jianjiang YANG Shuxian JIA Bing BIAN Yingying XIN Yue WU Luyao zang xinshan QU Yanying ZHANG Jinfa WU Man YU Jiwen State Key Laboratory of Cotton Biology Ministry of Agriculture and Rural Affairs/Institute of Cotton ResearchChinese Academy of Agricultural SciencesAnyang455000HenanChina Engineering Research Centre of Cotton Ministry of Education/College of AgricultureXinjiang Agricultural UniversityUrumqi830052XinjiangChina Department of Plant and Environmental Sciences New Mexico State UniversityLas Cruces880033NMUSA

Background: Micronaire is a comprehensive index reflecting the fineness and maturity of cotton *** is one of the important internal quality indicators of the cotton fiber and is closely related to the value of the cotton *** the genetic basis of micronaire is required for the genetic improvement of the ***,the genetic architecture of micronaire at the genomic level is *** present genome-wide association study(GWAS)aimed to identify the genetic mechanism of the micronaire trait in 83 representa:tive upland cotton lines grown in multiple *** GWAS of micronaire used 83 upland cotton accessions assayed by a Cotton 63 K Illumina Infinium single nucleotide polymorphism(SNP)array.A total of 11 quantitative trait loci(QTLs)for micronaire were detected on 10 *** 11 QTLs included 27 identified genes with specific expression patterns.A novel QTL,qFM-A12–1,included 12 significant SNPs,and GhFLA9 was identified as a candidate gene based on haplotype block analysis and on strong and direct linkage disequilibrium between the significantly related SNPs and ***9 was expressed at a high level during secondary wall thickening at 20∼25 days *** expression level of GhFLA9 was significantly higher in the low micronaire line(Msco-12)than that in the high micronaire line(Chuangyou-9).Conclusions: This study provides a genetic reference for genetic improvement of cotton fiber micronaire and a foundation for verification of the functions of GhFLA9.

关键词： Upland cotton(Gossypium hirsutum L.) Fiber micronaire GWAS Candidate genes GhFLA9

纳米Al_(2)O_(3)改良滨海水泥土的动力特性及微观机理试验研究

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浙江大学学报（工学版） 2024年第7期58卷 1457-1466页

作者：庄心善杨本驰陶高梁湖北工业大学土木建筑与环境学院湖北武汉430068

在循环荷载及腐蚀环境下进行动三轴、扫描电镜、核磁共振等试验,分析纳米Al_(2)O_(3)改良滨海水泥土的动应力–应变、动弹性模量、阻尼比及微观孔隙变化.试验结果表明:动应变随动应力增大而增加,动弹性模量随动应力增大而减小;加载频率... 详细信息

在循环荷载及腐蚀环境下进行动三轴、扫描电镜、核磁共振等试验,分析纳米Al_(2)O_(3)改良滨海水泥土的动应力–应变、动弹性模量、阻尼比及微观孔隙变化.试验结果表明:动应变随动应力增大而增加,动弹性模量随动应力增大而减小;加载频率增大使动应变减小,使动弹性模量增加;海盐的质量分数增大使动应变增大,使动弹性模量减小.纳米Al_(2)O_(3)改良水泥土的阻尼比-动应变曲线随着加载频率的增加逐渐下移,该曲线在不同加载频率下均出现交汇点,交汇点随着海盐的质量分数增大向右移动.相比素水泥土,纳米Al2O3改良水泥土的孔隙弛豫时间分布曲线主峰峰值及峰面积显著缩小,土孔隙中有C-S-H、C-A-H凝胶物质胶结填充,形成空间网状结构,胶结效果显著.纳米Al_(2)O_(3)改良水泥土在海盐质量分数小的情况下孔隙明显减少,且孔隙率比素水泥土的更低.

关键词：纳米Al_(2)O_(3) 水泥土循环荷载腐蚀环境微观结构

非课堂经历对大学生能力发展的影响研究——基于313所高校学生的证据

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中国高教研究 2024年第5期 38-45页

作者：苟斐斐周信杉西北师范大学教育科学学院甘肃兰州730070 广西民族大学教育科学学院广西南宁530006

非课堂活动对能力发展的影响是院校持续改进和学生抉择活动参与的基石。通过对139971份调查数据和17份文本资料分析发现:非课堂经历对综合能力、认知能力、非认知能力均产生显著正向预测作用,预测力为0.235、0.157、0.313;各种非课堂经... 详细信息

非课堂活动对能力发展的影响是院校持续改进和学生抉择活动参与的基石。通过对139971份调查数据和17份文本资料分析发现:非课堂经历对综合能力、认知能力、非认知能力均产生显著正向预测作用,预测力为0.235、0.157、0.313;各种非课堂经历对大学生能力发展的预测力依次排序为学术活动经历、社会实践活动经历、体育活动经历、社团活动经历,其中体育活动效能突显,社团活动效能不佳;非课堂经历主要以“显性”的方式影响认知能力发展,以“隐性”的方式影响非认知能力发展。院校应鼓励和支持学生参与非课堂活动,规范与引导社团组织良性发展;学生应有取舍地参与非课堂活动,完善能力结构;学界应关注农村籍大学生非课堂经历,为实现高等教育过程公平奠定基础。

关键词：大学生非课堂经历能力发展过程公平

基于Biomek i7自动化工作站筛选高效固碳脱羧酶突变体的方法

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微生物学通报 2024年第3期51卷 792-800页

作者：蒋昕珊范雁刘霖薛松大连理工大学生物工程学院辽宁大连116023 仲恺农业工程学院轻工食品学院广东广州510225

【背景】2,3-二羟基苯甲酸脱羧酶(2,3-dihydroxybenzoic acid decarboxylase,2,3-DHBD)能够催化CO_(2)与酚类化合物羧化生成芳香羧酸,为固定CO_(2)合成增值化学品提供一种新的策略。由于目前转化效率低,限制了其应用。【目的】提高酶的... 详细信息

【背景】2,3-二羟基苯甲酸脱羧酶(2,3-dihydroxybenzoic acid decarboxylase,2,3-DHBD)能够催化CO_(2)与酚类化合物羧化生成芳香羧酸,为固定CO_(2)合成增值化学品提供一种新的策略。由于目前转化效率低,限制了其应用。【目的】提高酶的催化效率,建立基于Biomek i7自动化工作站的高通量筛选方法以期实现高效筛选高羧化活性的苯甲酸脱羧酶的突变体,并建立一个从突变体构建到其酶活筛选的标准方法。【方法】基于Biomek i7自动化工作站对来源于米曲霉(Aspergillus oryzae)的2,3-DHBD(2,3-DHBD_Ao)进行突变体定点半饱和突变、克隆挑选、培养及酶活检测,实现508个克隆的两轮筛选,并利用HPLC评估高通量筛选方法的准确性。【结果】确定了高通量筛选粗酶催化的脱羧及羧化反应体系和Biomek i7自动化工作站筛选流程,对508个克隆进行两轮筛选,得到13个正向突变,HPLC检测最终确定3个正向突变体,构建的文库阳性突变率为0.6%,获得羧化活性最高的突变体是野生型2,3-DHBD_Ao的120%。【结论】利用Biomek i7自动化工作站建立了高通量筛选高羧化活性脱羧酶的方法,首次将自动化高通量设备与突变体筛选结合,提供了筛选时评价指标的确定思路,经过175 h即可完成508个克隆的两轮筛选工作,相较于人工筛选,该方法缩短了筛选周期,具有快速、准确和高效的特点。

关键词：高通量筛选 2,3-二羟基苯甲酸脱羧酶酶的进化羧化

磁共振T1 mapping及ECV技术在扩张型心肌病中的应用进展

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磁共振成像 2024年第5期15卷 204-208页

作者：赵凯迪曹新山滨州医学院附属医院放射科滨州256600

扩张型心肌病(dilated cardiomyopathy,DCM)是由心室腔扩张或者扩大而导致心肌收缩功能受损,这种病症属于一种常见的、有明显家族史的心血管系统疾病。心肌磁共振钆对比剂延迟强化(late gadolinium enhancement,LGE)可被广泛用作无创心... 详细信息

扩张型心肌病(dilated cardiomyopathy,DCM)是由心室腔扩张或者扩大而导致心肌收缩功能受损,这种病症属于一种常见的、有明显家族史的心血管系统疾病。心肌磁共振钆对比剂延迟强化(late gadolinium enhancement,LGE)可被广泛用作无创心肌纤维化诊断的有效手段,但其对弥漫性心肌纤维化诊断的精确程度有所欠缺,因此在临床应用中存在一定的局限性。近年来,T1 mapping技术的临床应用为医学影像学带来了巨大的变革,特别是对于弥漫性心肌纤维化的诊断、识别、预后判断等,它可以以极高的精确度检测出T1值以及细胞外容积(extracellular volume,ECV),对DCM进行全方位评估。本文就T1 mapping及ECV在DCM患者的早期诊断、相关疾病鉴别、风险分层及预后评估和治疗疗效评估中的最新应用进展予以总结,旨在提高DCM的早期检出率,对患者的病情进展进行更加准确的判断,从而为患者制订出最佳的治疗策略,改善患者的预后,并有望为将来的研究提供参考。

关键词：扩张型心肌病心肌弥漫纤维化 T1 mapping 细胞外体积分数磁共振成像早期诊断

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棉花窄卷苞叶基因fg的精细定位

棉花学报 2023年第3期35卷 173-180页

作者：王康文王雪平王军梁雨裴小雨任翔王星星张先亮彭云玲臧新山马雄风甘肃农业大学农学院/甘肃省干旱生境作物学重点实验室/甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室兰州730070 中国农业科学院棉花研究所/棉花生物育种与综合利用全国重点实验室/农业农村部棉花生物学与遗传育种重点实验室河南安阳455000 中国农业科学院西部农业研究中心新疆昌吉831100 郑州大学农学院郑州450000

【目的】窄卷苞叶可以减少棉花苞叶碎屑的附着,有助于降低机采棉含杂率。对棉花窄卷苞叶基因fg进行精细定位,为该基因的图位克隆和育种利用提供参考。【方法】以陆地棉T582为母本,分别与父本陆地棉TM-1、海岛棉3-79杂交构建2个F2分离群... 详细信息

【目的】窄卷苞叶可以减少棉花苞叶碎屑的附着,有助于降低机采棉含杂率。对棉花窄卷苞叶基因fg进行精细定位,为该基因的图位克隆和育种利用提供参考。【方法】以陆地棉T582为母本,分别与父本陆地棉TM-1、海岛棉3-79杂交构建2个F2分离群体;其中群体1(T582×TM-1)包含370个单株,群体2(T582×3-79)包含2667个单株。根据TM-1和3-79参考基因组数据,利用开发的插入缺失(insertion-deletion,Indel)标记对fg进行精细定位。利用棉花功能基因组学和多组学数据,对定位区间内的基因进行功能注释及表达模式分析。【结果】遗传分析结果表明,棉花窄卷苞叶由隐性单基因控制。在前人对fg基因初定位的基础上,进一步将窄卷苞叶基因fg定位在A03染色体分子标记M3与M4之间,区间大小为188 kb。预测定位区间内有14个注释的功能基因。其中,Gh_A03G021700、Gh_A03G021900、Gh_A03G022600和Gh_A03G022700基因在花萼、副萼中的表达量较高。【结论】棉花窄卷苞叶fg基因被精细定位在A03染色体188 kb区间内,并初步分析了定位区间内的14个候选基因,为该基因的图位克隆奠定了基础。

关键词：棉花窄卷苞叶 fg 分子标记精细定位 F2群体

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