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Assembly and phylogenomic analysis of cotton mitochondrial genomes provide insights into the history of cotton evolution

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The Crop Journal 2023年第6期11卷 1782-1792页

作者： Yanlei Feng Yukang Wang Hejun Lu Jun Li Delara Akhter Fang Liu Ting Zhao xingxing shen Xiaobo Li James Whelan Tianzhen Zhang Jianping Hu Ronghui Pan College of Agriculture and Biotechnology&ZJU-Hangzhou Global Scientific and Technological Innovation Center Zhejiang UniversityHangzhou 310058/311215ZhejiangChina Zhejiang Laboratory Hangzhou 311121ZhejiangChina Key Laboratory of Growth Regulation and Translational Research of Zhejiang Province School of Life SciencesWestlake UniversityHangzhou 310024ZhejiangChina Department of Genetics and Plant Breeding Sylhet Agricultural UniversitySylhet 3100Bangladesh State Key Laboratory of Cotton Biology Institute of Cotton ResearchChinese Academy of Agricultural SciencesAnyang 450000HenanChina Institute of Biology Westlake Institute for Advanced StudyHangzhou 310024ZhejiangChina College of Life Science Zhejiang UniversityHangzhou 310058ZhejiangChina Michigan State University Department of Energy Plant Research Laboratory and Plant Biology DepartmentEast LansingMI 48824USA

Cotton is a major crop that provides the most important renewable textile fibers in the *** of the taxonomy and evolution of cotton species have received wide attentions,not only due to cotton’s economic value but also due to the fact that Gossypium is an ideal model system to study the origin,evolution,and cultivation of polyploid *** studies suggested the involvement of mitochondrial genome editing sites and copy number as well as mitochondrial functions in cotton fiber ***,with only a few mitogenomes assembled in the cotton genus Gossypium,our knowledge about their roles in cotton evolution and speciation is still *** close this gap,here we assembled 20 mitogenomes from 15 cotton species spanning all the cotton clades(A–G,K,and AD genomes)and 5 cotton relatives using short and long sequencing *** analyses uncovered a high level of mitochondrial gene sequence conservation,abundant sequence repeats and many insertions of foreign sequences,as well as extensive structural variations in cotton *** sequence repeats and foreign sequences caused significant mitogenome size inflation in Gossypium and its close relative Kokia in general,while there is no significant difference between the lint and fuzz cotton mitogenomes in terms of gene content,RNA editing,and gene expression ***,we further revealed the specific presence and expression of two novel mitochondrial open reading frames(ORFs)in lint-fiber cotton ***,these structural features and novel ORFs help us gain valuable insights into the history of cotton evolution and polyploidization and the origin of species producing long lint fibers from a mitogenomic perspective.

关键词： Cotton evolution Cotton phylogeny Lint fiber cotton Mitochondrial genome Mitochondrial genes

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小农户步入农业绿色发展轨道的路径初探

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中国农业资源与区划 2021年第3期42卷 103-109页

作者：沈兴兴农业农村部管理干部学院现代农业研究中心

[目的]不能让小农户成为农业绿色发展这场革命的"旁观者"和"落伍者",促进小农户绿色发展转型是亟待解决的一个重大时代课题。为研究提出适合我国小农户步入农业绿色发展轨道的可行路径。[方法]文章首先从理论层面论述了小农户绿色发展... 详细信息

[目的]不能让小农户成为农业绿色发展这场革命的"旁观者"和"落伍者",促进小农户绿色发展转型是亟待解决的一个重大时代课题。为研究提出适合我国小农户步入农业绿色发展轨道的可行路径。[方法]文章首先从理论层面论述了小农户绿色发展的天然优势和劣势,其次基于江苏、浙江、黑龙江、湖北等地小农户与各类新型经营主体绿色生产的实地调研,全面评估当前小农户从事绿色生产的意愿、能力、利益诉求,并分别评价了各类利益联结机制对小农户绿色生产的激励作用,明确了小农户当前实现绿色发展的能力瓶颈和外部需求。[结果]从自身能力提升、强化外部支撑两方面,综合提出小农户步入农业绿色发展轨道的具体可行路径。[结论]提出通过自我学习与公共宣传教育、成立小农户自发组织、发起互助保险等提升小农户自我发展能力,通过完善绿色导向的公共政策体系、专业化社会服务体系和优化各类利益联结机制,强化小农户绿色发展的外部服务支撑。

关键词：小农户绿色发展自我能力外部服务路径

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国家级自然保护区治理模式的供给侧结构性改革研究

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湿地科学 2018年第1期16卷 24-29页

作者：沈兴兴农业部管理干部学院现代农业研究中心

在当前供给侧结构性改革的大背景下,从供给的体制机制、供给主体和供给要素的多元化等方面,分析了当前政府供给模式下自然保护区治理的主要问题,认为中国的自然保护区应该借鉴国际上自然保护区治理模式的发展经验,朝着更加公平、负责和... 详细信息

在当前供给侧结构性改革的大背景下,从供给的体制机制、供给主体和供给要素的多元化等方面,分析了当前政府供给模式下自然保护区治理的主要问题,认为中国的自然保护区应该借鉴国际上自然保护区治理模式的发展经验,朝着更加公平、负责和透明的多方联合治理模式改革,提出了4种可能的多方共治类型,建立了多方共治模式选择的层次分析模型,认为中央与省政府联合管理的多方共治模式是目前最适合国家级自然保护区治理的供给模式;最后,以东洞庭湖国家级自然保护区为例,通过对利益相关方的权力与责任的重新界定、成本与收益的重新分配,构建了东洞庭湖国家级自然保护区的多方共治模式。

关键词：自然保护区治理模式多方共治

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Inhibiting ceramide synthase 5 expression in microglia decreases neuroinflammation after spinal cord injury

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Neural Regeneration Research 2025年第10期20卷 2955-2968页

作者： Wei Zhang Yubao Lu Ruoqi shen Yingjie Wu Chenrui Liu xingxing Fang Liangming Zhang Bin Liu Limin Rong Department of Spine Surgery The Third Affiliated HospitalSun Yat-sen UniversityGuangzhouGuangdong ProvinceChina National Medical Products Administration(NMPA)Key Laboratory for Quality Research and Evaluation of Cell Products GuangzhouGuangdong ProvinceChina Guangdong Provincial Center for Quality Control of Minimally Invasive Spine Surgery GuangzhouGuangdong ProvinceChina Guangdong Provincial Center for Engineering and Technology Research of Minimally Invasive Spine Surgery GuangzhouGuangdong ProvinceChina

Microglia,the resident monocyte of the central nervous system,play a crucial role in the response to spinal cord ***,the precise mechanism remains *** investigate the molecular mechanisms by which microglia regulate the neuroinflammatory response to spinal cord injury,we performed single-cell RNA sequencing dataset analysis,focusing on changes in microglial *** found that the MG1 subpopulation emerged in the acute/subacute phase of spinal cord injury and expressed genes related to cell pyroptosis,sphingomyelin metabolism,and neuroinflammation at high ***,we established a mouse model of contusive injury and performed intrathecal injection of siRNA and molecular inhibitors to validate the role of ceramide synthase 5 in the neuroinflammatory responses and pyroptosis after spinal cord ***,we established a PC12-BV2 cell co-culture system and found that ceramide synthase 5 and pyroptosis-associated proteins were highly expressed to induce the apoptosis of neuron *** ceramide synthase 5 expression in a mouse model of spinal cord injury effectively reduced ***,ceramide synthase 5-induced pyroptosis was dependent on activation of the NLRP3 signaling *** ceramide synthase 5 expression in microglia in vivo reduced neuronal apoptosis and promoted recovery of neurological ***2g7 formed a“bridge”between sphingolipid metabolism and ceramide synthase 5-mediated cell death by inhibiting the NLRP3 signaling ***,these findings suggest that inhibiting ceramide synthase 5 expression in microglia after spinal cord injury effectively suppressed microglial pyroptosis mediated by NLRP3,thereby exerting neuroprotective effects.

关键词： ceramide synthase 5 gasdermin D microglia neuroinflammation NLRP3 nuclear factor kappa B Pla2g7 pyroptosis sphingomyelin metabolism spinal cord injury

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普通小农户绿色农产品优价路径初探

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中国农业资源与区划 2021年第8期42卷 6-12页

作者：沈兴兴段晋苑刘帅农业农村部管理干部学院

[目的]绿色农产品无法实现优价,是制约农业绿色发展的一个关键因素。当前在以家庭经营为主的基本国情和农情下,探讨普通小农户绿色农产品的优价路径,助力小农户更好更快地走绿色发展之路尤为重要。[方法]文章首先从理论和制度层面剖析... 详细信息

[目的]绿色农产品无法实现优价,是制约农业绿色发展的一个关键因素。当前在以家庭经营为主的基本国情和农情下,探讨普通小农户绿色农产品的优价路径,助力小农户更好更快地走绿色发展之路尤为重要。[方法]文章首先从理论和制度层面剖析了绿色农产品无法优价的一般原因,其次基于农业绿色发展先行区的绿色生产现状调研,深入剖析当前规模经营主体与普通小农户分别在绿色生产各阶段的优势与劣势;进而分析当前新型经营主体的优价途径对普通小农户的适用性。[结果]当前大部分普通小农户都很难借鉴规模经营主体的优价模式,普通小农户绿色农产品想要实现优价,除了必要的公共服务支撑,还需要各类新型经营主体以及社会各方力量的共同支持。[结论]基于自我发展能力提升和强化外部服务支撑,从降低绿色生产成本、拓宽绿色市场渠道、规范绿色市场环境、强化绿色认证监管、倡导绿色消费理念等几个方面提出具体措施,助力绿色生产的普通小农户走上优质优价之路。

关键词：小农户新型经营主体绿色发展绿色农产品优质优价

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农业绿色生产社会化服务模式探析

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中国农业资源与区划 2020年第1期41卷 15-20页

作者：沈兴兴段晋苑朱守银农业农村部管理干部学院现代农业研究中心

[目的]在当前全面推进农业绿色发展、以绿色发展引领乡村振兴的农业发展新阶段,绿色生产社会化服务是促进小农户与现代农业发展相衔接、全面迈入农业绿色发展轨道的重要途径。为研究提出适合我国当前农业绿色发展需求的绿色生产社会化... 详细信息

[目的]在当前全面推进农业绿色发展、以绿色发展引领乡村振兴的农业发展新阶段,绿色生产社会化服务是促进小农户与现代农业发展相衔接、全面迈入农业绿色发展轨道的重要途径。为研究提出适合我国当前农业绿色发展需求的绿色生产社会化服务模式。[方法]文章首先对农业绿色生产社会化服务内容、种类与潜在供求关系进行了初步界定,并对绿色生产社会化服务与传统生产社会化服务进行了比较分析,明确了绿色生产社会化服务的特殊性;其次基于浙江、黑龙江、湖北等地农业绿色发展社会化服务典型实践,进行实证分析。[结果]提炼分析出4种主要的绿色生产社会化服务模式,并对每种模式的适用条件以及需要重点关注的问题进行了深入探讨。[结论]在此基础上提出当前进一步完善绿色生产社会化服务的政策建议,对于加快服务规模化引领绿色发展,带动小农户走上农业绿色发展轨道具有重要的决策参考价值。

关键词：绿色生产社会化服务服务模式土地流转土地托管

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秸秆资源化再利用理论逻辑、主体行为逻辑与长效机制

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中国农业资源与区划 2022年第10期43卷 120-128页

作者：沈兴兴段晋苑彭超农业农村部管理干部学院

[目的]秸秆资源化再利用是农业农村绿色、高质量发展的重点任务，实践中仍然存在技术、政策、产业化等层面的各种瓶颈，构建秸秆综合利用长效机制是解决问题之根本。[方法]文章基于制度变迁和环境外部性理论视角，系统分析了秸秆资源化... 详细信息

[目的]秸秆资源化再利用是农业农村绿色、高质量发展的重点任务，实践中仍然存在技术、政策、产业化等层面的各种瓶颈，构建秸秆综合利用长效机制是解决问题之根本。[方法]文章基于制度变迁和环境外部性理论视角，系统分析了秸秆资源化再利用的理论逻辑。结合文献与实地调研，深度剖析了实践中秸秆资源化再利用所面临的各种困境，并通过秸秆资源化利用产业链上相关主体的行为逻辑分析。[结果]（1）构建秸秆商业化再利用全产业链是秸秆资源化再利用可持续的前提。（2）在秸秆再利用产业化发展初期，很难依靠完全的市场化实现集体帕累托最优，需要政府给予更多的普惠性扶持。（3）通过秸秆资源化再利用的3个典型案例分析，详细阐述了实践中不同商业模式下市场主体和政府的各自角色作用。[结论]从科学发挥政府有效作用、多措并举提升产品竞争力、营造绿色生产消费社会氛围等方面，提出构建秸秆综合利用长效机制的具体政策建议。

关键词：秸秆资源化再利用理论逻辑行为逻辑全产业链长效机制

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世界自然保护地治理模式发展趋势及启示

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世界林业研究 2015年第5期28卷 44-49页

作者：沈兴兴曾贤刚中国人民大学环境学院北京100872

自然保护地的治理模式对于保护地保护目标的实现具有关键作用,改善治理可以帮助保护区实现生态、社会、经济和文化效益的最大化。文中介绍了国际上自然保护地治理模式的类型、应用现状并总结了未来的发展趋势;在此基础上结合我国自然保... 详细信息

自然保护地的治理模式对于保护地保护目标的实现具有关键作用,改善治理可以帮助保护区实现生态、社会、经济和文化效益的最大化。文中介绍了国际上自然保护地治理模式的类型、应用现状并总结了未来的发展趋势;在此基础上结合我国自然保护区的管理问题及我国当前国情分析,笔者认为当前我国自然保护区的治理模式应适当创新,逐步引入政府委托第三方治理、联合治理模式,现阶段形成以政府直接治理为主、其他治理模式为辅的多种治理模式并存局面。

关键词：自然保护地治理模式自然保护区

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共同富裕背景下乡村生态产品研究进展与发展方向

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世界林业研究 2024年第1期37卷 97-103页

作者：沈兴兴虞慧怡刘帅农业农村部管理干部学院乡村振兴研究中心北京102208 中国环境科学研究院生态文明理论研究中心北京100012

理清当前乡村生态产品的研究现状,总结归纳未来的研究方向,服务政策需求,是贯彻落实以“两山”理念为核心的绿色发展观、推动乡村高质量发展、扎实推进共同富裕的现实要求。结合文献与实地调研,文中综述了学界关于共同富裕与乡村生态产... 详细信息

理清当前乡村生态产品的研究现状,总结归纳未来的研究方向,服务政策需求,是贯彻落实以“两山”理念为核心的绿色发展观、推动乡村高质量发展、扎实推进共同富裕的现实要求。结合文献与实地调研,文中综述了学界关于共同富裕与乡村生态产品的研究进展,发现当前对乡村生态产品的概念界定相对模糊,对乡村生态产品在服务全面推进乡村振兴、扎实推进共同富裕等国家重大战略任务中的功能价值及其作用认识不足,提出未来需重点关注乡村生态产品的内涵与分类界定、乡村生态产品经营全产业链分析、乡村生态产品价值实现途径、乡村生态产品赋能农户增收和壮大集体经济的典型路径等重点研究方向。

关键词：乡村生态产品价值实现农户增收共同富裕乡村振兴

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基于化肥减量化管理的农业清洁生产多方联动机制框架研究

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中国农业资源与区划 2018年第1期39卷 41-47页

作者：沈兴兴刘帅段晋苑彭水洪农业部管理干部学院

[目的]化肥减量增效是实现农业可持续发展的关键举措和优先任务,文章首先基于环境经济学的外部性理论分析与国内外研究现状综述,提出了新形势下基于利益相关方的视角开展化肥减量化管理多方联动机制研究的必要性。[方法]为构建有效的多... 详细信息

[目的]化肥减量增效是实现农业可持续发展的关键举措和优先任务,文章首先基于环境经济学的外部性理论分析与国内外研究现状综述,提出了新形势下基于利益相关方的视角开展化肥减量化管理多方联动机制研究的必要性。[方法]为构建有效的多方联动机制,需要全面了解利益相关方参与化肥减量化管理的现状与主要问题,该文实地调研了普通农户、新型经营主体的耕地保护意识、地力改善意识、清洁生产支付意愿和对政府的主要利益诉求并对其做了对比分析,同时通过关键人物访谈了解基层农技部门、有机肥生产企业在化肥减量过程中面临的主要困难。[结果]构建了化肥减量化管理多方联动机制框架,具体包括肥料生产与使用监管机制、耕地保护责任追究机制、化肥减量化技术推广机制、农业清洁生产补贴机制和绿色农产品消费引导机制等。[结论]结合当前农业供给侧结构性改革的政策背景,强调通过综合运用规范性、激励性和市场性政策工具和手段,建立有效的化肥减量化管理多方联动机制是实现化肥减量增效和农业可持续发展的必然要求。此外,该文补充强调了当前化肥减量应坚持用地、养地相结合,化肥、有机肥配合使用,在保持和改善当前地力水平的前提下,通过提质增效来确保粮食安全、农民增收。

关键词：化肥减量化多方参与利益相关方多方联动机制

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