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HITAC-seq enables high-throughput cost-effective sequencing of plasmids and DNA fragments with identity

Journal of Genetics and Genomics 2021年第8期48卷 671-680页

作者： Xiang gao Weipeng Mo Junpeng Shi Ning Song Pei Liang Jian Chen Yiting Shi Weilong Guo xinchen Li Xiaohong Yang Beibei Xin Haiming Zhao Weibin Song Jinsheng Lai State Key Laboratory of Plant Physiology and Biochemistry and National Maize Improvement Center Department of Plant Genetics and BreedingChina Agricultural UniversityBeijing 100193PR China Department of Microbiology and Immunology College of Biological SciencesChina Agricultural UniversityBeijing 100193PFi China State Key Laboratory of Plant Physiology and Biochemistry College of Biological SciencesChina Agricultural UniversityBeijing 100193PR China Key Laboratory of Crop Heterosis and Utilization State Key Laboratory for AgrobiotechnologyBeijing Key Laboratory of Crop Genetic ImprovementChina Agricultural UniversityBeijing 100193PR China Center for Crop Functional Genomics and Molecular Breeding China Agricultural UniversityBeijing 100193PR China

DNA sequencing is vital for many aspects of biological research and diagnostics. Despite the development of second and third generation sequencing technologies, Sanger sequencing has long been the only choice when required to precisely track each sequenced plasmids or DNA fragments. Here, we report a complete set of novel barcoding and assembling system, Highly-parallel Indexed Tagmentation-reads Assembled Consensus sequencing(HITAC-seq), that could massively sequence and track the identities of each individual sequencing sample. With the cost of much less than that of single read of Sanger sequencing,HITAC-seq can generate high-quality contiguous sequences of up to 10 kilobases or longer. The capability of HITAC-seq was confirmed through large-scale sequencing of thousands of plasmid clones and hundreds of amplicon fragments using approximately 100 pg of input DNAs. Due to its long synthetic length, HITACseq was effective in detecting relatively large structural variations, as demonstrated by the identification of a~1.3 kb Copia retrotransposon insertion in the upstream of a likely maize domestication gene. Besides being a practical alternative to traditional Sanger sequencing, HITAC-seq is suitable for many highthroughput sequencing and genotyping applications.

关键词： HITAC-seq Structure variation Sequencing technology Sanger sequencing Comparative genomics

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苯骈三氮唑对铝表面Al_2O_3/氧化铈复合膜耐蚀性的影响（英文）

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稀有金属材料与工程 2018年第12期47卷 3597-3603页

作者：王桂香高岗韩昕辰应丽霞马福秋哈尔滨工程大学黑龙江哈尔滨150001

采用阳极氧化法和化学浸渍法相结合的方式在铝表面制备了Al_2O_3/铈氧化物复合膜。首先在硫酸溶液中对铝进行阳极氧化,然后将阳极氧化后的铝在Ce(NO_3)_3溶液中进行化学转化处理。探究了溶液中苯骈三氮唑(BTA)的浓度对所制备的Al_2O_3/... 详细信息

采用阳极氧化法和化学浸渍法相结合的方式在铝表面制备了Al_2O_3/铈氧化物复合膜。首先在硫酸溶液中对铝进行阳极氧化,然后将阳极氧化后的铝在Ce(NO_3)_3溶液中进行化学转化处理。探究了溶液中苯骈三氮唑(BTA)的浓度对所制备的Al_2O_3/铈氧化物复合膜抗腐蚀性能的影响。采用X射线衍射仪(XRD)、X射线光电子能谱(XPS)、扫描电子显微镜(SEM)、电化学工作站等技术手段对复合膜的性能进行了表征。测试结果表明,当BTA的加入浓度为0.5 g/L时,铈离子沉积效果最佳,所制备复合膜表面的平整性和光滑性得到了良好的改善,此时的复合膜抗腐蚀性能明显提高。

关键词：铝铈转化膜苯骈三氮唑腐蚀性能

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四川盆地广元-梁平古裂陷构造-沉积演化

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石油与天然气地质 2020年第4期41卷 784-799页

作者：高平李双建何治亮沃玉进韩月卿李新晨中国石化石油勘探开发研究院北京100083 中国地质大学(北京)能源学院北京100083 中国石化科技部北京100728 中国石油大学(北京)地球科学学院北京102249

二叠纪-三叠纪转折期,四川盆地北部广元-梁平地区发育一个北西-南东向古裂陷,称之为"开江-梁平古裂陷"。由于对广元-梁平古裂陷的认识直接影响到川北和川东北地区的油气勘探部署,因此有必要对该古裂陷的构造-沉积演化进行深入研究。通... 详细信息

二叠纪-三叠纪转折期,四川盆地北部广元-梁平地区发育一个北西-南东向古裂陷,称之为"开江-梁平古裂陷"。由于对广元-梁平古裂陷的认识直接影响到川北和川东北地区的油气勘探部署,因此有必要对该古裂陷的构造-沉积演化进行深入研究。通过系统收集广元-梁平古裂陷槽内外的露头和钻井资料,并根据地层不整合面特征、沉积充填特征、测井曲线突变特征、沉积物地球化学特征等沉积记录以及地震剖面约束,发现广元-梁平古裂陷槽内仍存在茅口组三段(茅三段)和四段沉积物,槽内茅口组顶部缺乏广泛岩溶,表明茅口组减薄并非岩溶侵蚀造成,而是由相变导致的。广元-梁平古裂陷的雏形最早形成于茅三段和茅四段沉积期,吴家坪期在此基础上继承性发展,长兴期拉张裂陷活动加剧,热液活动加强,构造沉积分异明显,为古裂陷发育的高峰期,直至飞仙关组四段沉积期,古裂陷才完全被填平补齐。广元-梁平古裂陷对环裂陷槽中-上二叠统多层系储层具有明显控制作用,不仅控制着茅口组生屑滩储层的发育,还控制着吴家坪组颗粒滩储层的发育,且吴家坪组储层中存在油气运聚过程,发育残余孔隙,为下一步油气勘探的有利目标。

关键词：沉积记录热液活动长兴组吴家坪组开江-梁平海槽二叠系四川盆地

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Deep Web接口的自动识别技术研究

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计算机工程与应用 2017年第7期53卷 109-114页

作者：杨永红高磊余航徐欣辰中国石化胜利油田分公司勘探开发研究院山东东营257000 上海大学计算机工程与科学学院上海200444

获取Deep Web中信息的主要途径是通过在其提供的查询接口上提交查询来实现的,目前大部分的研究以表单内的标签获得表单内容结构,判断是不是一个Deep Web查询接口。提出了接口块的概念,设计了一种基于页面信息和视觉信息的接口块定位方法... 详细信息

获取Deep Web中信息的主要途径是通过在其提供的查询接口上提交查询来实现的,目前大部分的研究以表单内的标签获得表单内容结构,判断是不是一个Deep Web查询接口。提出了接口块的概念,设计了一种基于页面信息和视觉信息的接口块定位方法,最后将判定接口块是不是Deep Web接口看作是一个模式识别的分类问题,通过抽取适当的表单结构特征,采用C4.5决策树和SVM相结合的分类算法来进行接口块的判定,得到页面中含有的Deep Web查询接口。采用UIUC的TEL-8数据集进行实验,结果表明,该方法的准确率达到了97.30%,具有良好的可行性和实用性。

关键词： DeepWeb接口文档对象化模型树接口块多类分类

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滇西昌宁-孟连古特提斯闭合的岩浆活动响应——来自临沧岩体南段花岗岩的地质地球化学证据

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地质通报 2021年第1期40卷 125-137页

作者：苑新晨杨启军吕勇潘明高爱洋徐放桂林理工大学地球科学学院广西桂林541006 有色金属隐伏矿床勘查及材料开发协同创新中心广西桂林541006 中国地质科学院岩溶地质研究所广西桂林541004

临沧花岗岩岩体(简称临沧岩体)是滇西澜沧江地区南段出露面积最大的复式岩基,也是特提斯构造域的重要组成单元,其岩石类型主要为黑云母二长花岗岩。锆石样品得出的定年结果为225.1±6.1 Ma,表明这些花岗岩类侵位于晚三叠世。临沧花岗岩... 详细信息

临沧花岗岩岩体(简称临沧岩体)是滇西澜沧江地区南段出露面积最大的复式岩基,也是特提斯构造域的重要组成单元,其岩石类型主要为黑云母二长花岗岩。锆石样品得出的定年结果为225.1±6.1 Ma,表明这些花岗岩类侵位于晚三叠世。临沧花岗岩的K2O/Na2O值大于1,铝饱和指数A/CNK=1.05~1.95属高钾钙碱性过铝-强过铝质S型花岗岩。岩石总体上富集轻稀土元素((La/Yb)N=6.06~21.01),亏损重稀土元素,并显示出明显的负Eu异常(δEu=0.20~0.38)。岩石地球化学特征指示,临沧花岗岩应为昌宁-孟连古特提斯封闭过程的产物原岩为中下地壳贫粘土的变质砂岩和变质泥岩,其Pearce构造判别图解中的同碰撞属性是对古特提斯封闭及保山-思茅地块碰撞的响应。

关键词：临沧花岗岩 U-Pb锆石年代学古特提斯洋陆陆碰撞

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“双碳”目标下猪产业链碳减排策略

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畜牧与兽医 2023年第8期55卷 133-137页

作者：高慧周心晨韩新燕李奎浙江省畜牧技术推广与种畜禽监测总站浙江杭州310021 海南浙江大学研究院/浙江大学动物科学学院/农业农村部华东动物营养与饲料重点实验室浙江杭州310058

畜牧业作为温室气体排放大头,在助力实现“碳达峰、碳中和”的“双碳”目标的道路上肩负重任。然而消费需求增长和粮食危机给畜牧业碳减排之路带来了巨大挑战。挑战亦是机遇,畜牧业尤其是猪产业仍大有可为。经过分析和实践,现已有不少... 详细信息

畜牧业作为温室气体排放大头,在助力实现“碳达峰、碳中和”的“双碳”目标的道路上肩负重任。然而消费需求增长和粮食危机给畜牧业碳减排之路带来了巨大挑战。挑战亦是机遇,畜牧业尤其是猪产业仍大有可为。经过分析和实践,现已有不少促进猪产业碳减排的策略。文章归纳了猪产业碳排放来源,从节约饲料、减少废弃物排放两大角度总结分析了猪相关产业链可采取的减排策略,并提供部分实际案例以供参考,对于猪产业绿色、低碳、健康发展具有现实意义。

关键词：碳达峰碳中和碳减排猪产业链废弃物

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基于成对约束的半监督选择性聚类集成

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江苏科技大学学报（自然科学版） 2020年第4期34卷 57-63页

作者：皋军黄欣辰邵星江苏科技大学计算机学院镇江212003 盐城工学院信息工程学院盐城224002

针对现有聚类集成算法基本都是无监督聚类集成算法和传统聚类集成方法,其通常将所有产生的聚类成员都参与集成的问题,设计了一种基于成对约束的半监督选择性聚类集成方法(SSCES).SSCES方法选择基于聚类成员质量和差异度的选择聚类集成... 详细信息

针对现有聚类集成算法基本都是无监督聚类集成算法和传统聚类集成方法,其通常将所有产生的聚类成员都参与集成的问题,设计了一种基于成对约束的半监督选择性聚类集成方法(SSCES).SSCES方法选择基于聚类成员质量和差异度的选择聚类集成为研究对象,借鉴半监督集成的关键思想,将半监督聚类信息带入到选择聚类集成中.通过在多组数据集上实验来验证SSCES算法的有效性.

关键词：聚类集成聚类成员成对约束半监督选择性聚类集成

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不同来流条件下四圆柱尾流场试验研究

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海洋工程 2018年第6期36卷 84-91页

作者：高洋洋蘧鑫晨杨康张宝峰浙江大学海洋学院浙江舟山316000 中国电建集团华东勘测设计研究院有限公司浙江杭州311122

基于粒子图像测速技术(PIV)对小间距比比L/D=1.5工况下方形布置四圆柱在不同来流角角α(α=0°、15°、30°、45°)条件下的尾流流场特性进行了试验研究,分析了不同来流角度条件下四圆柱瞬时和时均尾流流场特征,获得了瞬时和时均速度矢... 详细信息

基于粒子图像测速技术(PIV)对小间距比比L/D=1.5工况下方形布置四圆柱在不同来流角角α(α=0°、15°、30°、45°)条件下的尾流流场特性进行了试验研究,分析了不同来流角度条件下四圆柱瞬时和时均尾流流场特征,获得了瞬时和时均速度矢量、涡量等值线、流线拓扑及雷诺应力分布随来流角度变化的规律。试验结果表明,来流角度对方形布置四圆柱尾流形态有显著影响。四圆柱瞬时尾流形态随来流角度增大可分为延伸体流动流态(α=0°)、尾流剪切层附着流态(α=15°、30°)及尾流剪切层共同脱落流态(α=45°)三种流态。当来流角度增大时,四圆柱下游断面平均流向速度分布由"W"形向"U"形转变,时均雷诺正应力及雷诺剪切应力等值线分布特征也会发生明显改变。

关键词：四圆柱绕流来流角粒子图像测速技术瞬时尾流形态时均流场形态

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超弹性胶筒用填料填充天然硫化橡胶力学性能研究

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润滑与密封 2013年第10期38卷 25-29页

作者：于桂杰高敏魏新晨曲晓峰张剑中国石油大学(华东)储运与建筑工程学院山东青岛266580 胜利油田分公司采油工艺研究院山东东营257000

封隔器超弹性胶筒所用的天然硫化橡胶添加了填充物,单纯利用理论研究无法选择合适的应变能函数模型。通过对填料填充橡胶材料进行单轴拉伸试验,拟合得到Mooney-Rivlin模型和Yeoh模型材料参数,并结合实验数据确定填料填充橡胶材料的应变... 详细信息

封隔器超弹性胶筒所用的天然硫化橡胶添加了填充物,单纯利用理论研究无法选择合适的应变能函数模型。通过对填料填充橡胶材料进行单轴拉伸试验,拟合得到Mooney-Rivlin模型和Yeoh模型材料参数,并结合实验数据确定填料填充橡胶材料的应变能函数模型;采用ANSYS软件分析2种不同弹性模量的橡胶封隔器的坐封效果。结果表明,对于填料填充天然硫化橡胶材料,Yeoh模型拟合效果更好;在相同载荷作用下,弹性模量小的填料填充橡胶材料变形量更大,胶筒最大Von Mises应力较小且最大接触应力较大,更适合用作封隔器的中胶筒。

关键词：橡胶材料应变能函数封隔器拉伸试验

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海南岛植胶区割胶劳动力年龄结构及空间分布特征

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热带地理 2024年第10期44卷 1915-1924页

作者：王贵珍陈帮乾赖虹燕王心澄高远凤吴志祥中国热带农业科学院橡胶研究所//海南儋州热带农业生态系统国家野外科学观测研究站//海南省热带作物栽培生理学重点实验室海口571101 西南林业大学大数据与智能工程学院昆明650224 南京林业大学林学院南京210037

割胶作为当前获取天然橡胶这一重要工业原料的唯一手段,其劳动力供应的稳定性对天然橡胶产业的可持续发展至关重要。目前,割胶劳动力短缺和老龄化现象已引起高度关注,但相关研究缺乏详细空间信息的转换估算,不利于宏观调控。文章基于202... 详细信息

割胶作为当前获取天然橡胶这一重要工业原料的唯一手段,其劳动力供应的稳定性对天然橡胶产业的可持续发展至关重要。目前,割胶劳动力短缺和老龄化现象已引起高度关注,但相关研究缺乏详细空间信息的转换估算,不利于宏观调控。文章基于2020年海南岛天然橡胶林分布图、Dynamic World土地利用分类产品和WorldPop人口分布数据集,分析了海南岛植胶区潜在割胶劳动力的空间分布和年龄结构特征,并进行转换估算和缺乏程度分级,利用空间统计分析揭示割胶劳动力亏缺的空间格局。结果表明:1)海南植胶区潜在割胶劳动力总数为156.74万人,空间分布呈现“北高南低”的态势,且45~59岁年龄占比达34%,老龄化趋势明显。2)劳动力缺乏程度在空间上存在显著差异,其中一级缺乏区域主要集中在中西部与中东部市县的交界区域,呈带状分布;而二、三级缺乏广泛分布于中西部、中部及部分中东部市县交界区,中部尤为严重,呈连片状分布。3)儋州市、白沙县和琼中县一级缺乏面积位居前三,累计面积达到5.05×10~4 hm2;白沙县、琼中县、澄迈县和乐东县在二、三级缺乏面积上同样突出,总面积达到2.33×10~4 hm2。

关键词：橡胶林割胶劳动力年龄结构空间格局劳动力缺口分析海南岛

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