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Designing a multi-epitope vaccine against Peptostreptococcus anaerobius based on an immunoinformatics approach

Synthetic and Systems Biotechnology 2023年第4期8卷 757-770页

作者： Yudan Mao xianzun xiao Jie Zhang Xiangyu Mou Wenjing Zhao Shenzhen Key Laboratory of Systems Medicine for Inflammatory Diseases School of MedicineShenzhen Campus of Sun Yat-Sen UniversityShenzhenGuangdong518107China

Peptostreptococcus anaerobius is an anaerobic bacterium,which has been found selectively en-riched in the fecal and mucosal microbiota of colorectal cancer(CRC)patients.Emerging evidence suggest P.anaerobius may contribute to the development of CRC in human.In this study,we designed a multi-epitope chimeric vaccine against P.anaerobius PCWBR2,a recently identified adhesin that interacts directly with colon cell lines by bindingα2/β1 integrin frequently overexpressed in human CRC tumors and cell lines.Immunoinformatics tools predicted six cytotoxic T lymphocyte epitopes,five helper T lymphocyte epitopes,and six linear B lymphocyte epitopes.The predicted epitopes were joined with AAY or GPGPG linkers and a previously reported TLR4 agonist was added to the vaccine construct’s N terminal as an adjuvant using EAAAK linkers and the order of epitopes was optimized.Further in silico analysis revealed that the vaccine construct possesses satisfactory antigenicity,allergenicity,solubility,physicochemical properties,adjuvant-TLR4 molecular docking,and immune profile characteristics.Our study provided a promising design for vaccines against P.anaerobius.

关键词： Colorectal cancer Peptostreptococcus anaerobius PCWBR2 Immunoformatics Multi-epitope

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