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猪丹毒丝菌SYBR GreenⅠ荧光定量PCR检测方法的建立

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中国兽医科学 2024年第3期54卷 337-343页

作者：陈超高春阳刘刚姜志康柳宇张雪莲袁生韩先杰青岛农业大学动物医学院山东青岛266109 华中农业大学动物科学技术学院、动物医学院湖北武汉430070 佛山科学技术学院生命科学与工程学院广东佛山528225

为建立一种快速、敏感的猪丹毒丝菌检测方法, 本试验将猪丹毒丝菌的 grol 基因与载体TA/ Blunt- Zero 相结合构建重组质粒,以该重组质粒 DNA 为模板,筛选最佳反应条件,建立 SYBR Green Ⅰ荧光定量 PCR 检测方法,并对该方法进行灵敏度... 详细信息

为建立一种快速、敏感的猪丹毒丝菌检测方法, 本试验将猪丹毒丝菌的 grol 基因与载体TA/ Blunt- Zero 相结合构建重组质粒,以该重组质粒 DNA 为模板,筛选最佳反应条件,建立 SYBR Green Ⅰ荧光定量 PCR 检测方法,并对该方法进行灵敏度、特异性和重复性测定。结果表明,本研究建立的检测方法对在 2×10^(2)~2×10^(9)copies/ μL 浓度范围内的质粒标准品有良好的线性关系, 线性相关系数 R^(2)=0.999 5,标准曲线为 y=-3.231x+41.834,未见非特异性扩增。该方法对质粒标准品最低检测浓度为 20 copies/ μL,敏感度比普通 PCR 提高了 1 000 倍。用该方法检测猪支气管败血波氏杆菌(Bb)、猪链球菌 3 型(Ss3)、猪链球菌 2型(Ss2)、大肠杆菌(E.coli)、沙门菌(Salmonella)和多杀性巴氏杆菌(Pm)时,检测结果均为阴性,表明该方法具有良好的特异性。重复试验结果显示,组内和组间的变异系数均小于 2%,表明该方法具有良好的重复性。运用本试验建立的方法对 20 株疑似猪丹毒丝菌临床样品进行检测,阳性检出率为 60%,高于普通 PCR 检出率(50%)。综上,本试验建立的检测方法灵敏度高、特异性强、重复性好,适合临床上快速诊断丹毒丝菌。

关键词：猪丹毒丝菌 grol基因 SYBR GreenⅠ荧光定量PCR 检测方法

Structures of the portal vertex reveal essential protein-protein interactions for Herpesvirus assembly and maturation

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Protein & Cell 2020年第5期11卷 366-373页

作者： Nan Wang Wenyuan Chen Ling Zhu Dongjie Zhu Rui Feng Jialing Wang Bin Zhu Xinzheng Zhang Xiaoqing Chen xianjie liu Runbin Yan Dongyao Ni Grace Guoying Zhou Hongrong liu Zihe Rao Xiangxi Wang CAS Key Laboratory of Infection and Immunity National Laboratory of MacromoleculesInstitute of BiophysicsChinese Academy of SciencesBeijing 100101China Key Laboratory for Matter Microstructure and Function of Hunan Province Key Laboratory of Low-dimensional Quantum Structures and Quantum ControlSchool of Physics and ElectronicsHunan Normal UniversityChangsha 410081China Laboratory of Structural Biology Tsinghua UniversityBeijing 100084China State Key Laboratory of Medicinal Chemical Biology Nankai UniversityTianjin 300353China ImmVira Co. LtdSilver Star Hi-tech Industrial ParkLonghua DistrictShenzhen 518116China

Dear Editor,Herpesviridae is a large family of double-stranded DNA(dsDNA)viruses that cause a variety of human diseases ranging from cold sores and chicken pox to congenital defects,blindness and cancer(Chayavichitsilp et al.,2009;Wang et al.,2018).In the past 70 years,substantial advances in our knowledge of the molecular biology of herpesviruses have led to insights into disease pathogenesis and management.However,the mechanism for capsid assembly that requires the ordered packing of about 4,000 protein subunits into the hexons,pentons and triplexes remains elusive.It is still a puzzle how initially identical subunits adopt both hexameric and pentameric conformations in the capsid and select the correct locations needed to form closed shells of the proper size.Biochemical and genetic studies have shown that the portal is involved in initiation of capsid assembly(Newcomb et al.,2005)and functions akin to a DNA-sensor coupling genome-packaging achieved by a genome-packaging machinery-“terminase complex”(Chen et al.,2020;Yunxiang Yang,2020)with icosahedral capsid maturation(Lokareddy et al.,2017).Structural investigations of the herpesvirus portal have proven challenging due to the small size of this dodecamer,which accounts for less than 1%of the total mass of the capsid protein layer and the technical difficulties involved in resolving non-icosahedral components of such large icosahedral viruses(diameter is∼1,250Å).Efforts of many investigators over two decades have made to reconstruct the cryo-electron microscopy(cryo-EM)structure of herpesvirus portal vertex and more recently near-atomic structures of two herpesvirus(herpes simplex virus type 1(HSV-1)and Kaposi’s sarcoma-associated herpesvirus(KSHV))portal vertices were reported(McElwee et al.,2018;Gong et al.,2019;liu et al.,2019).

关键词： vertex shells packing

Influence of backfilling rate on the stability of the"backfilling bodyimmediate roof"cooperative bearing structure

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International Journal of Mining Science and Technology 2022年第6期32卷 1197-1206页

作者： xianjie Du Guorui Feng Min Zhang Zehua Wang Wenhao liu College of Mining Engineering Taiyuan University of TechnologyTaiyuan 030024China Shanxi-Zheda Institute of Advanced Materials and Chemical Engineering Taiyuan 030024China Key Laboratory of Shanxi Province for Mine Rock Strata Control and Disaster Prevention Taiyuan 030024China State Key Laboratory for GeoMechanics and Deep Underground Engineering China University of Mining and TechnologyXuzhou 221116China Zhengzhou Coal Industry(Group)Co LtdZhengzhou 450007China College of Civil Engineering Taiyuan University of TechnologyTaiyuan 030024China

To reduce the cost of backfilling coal mining and utilize the underground space of coal mines,a new backfilling mining method with low backfilling rate called constructional backfilling coal mining(CBCM)is proposed.The "backfilling body-immediate roof" cooperative bearing structure of CBCM is analyzed by establishing the model of the medium thick plate on an elastic foundation.The influence of the backfilling rate on the stability of overlying strata is analyzed by the numerical simulation experiment.The control effect of CBCM is verified by a physic similar simulation test.The economic benefit of CBCM is analyzed.The conclusions are:the deformation characteristics of the immediate roof and critical backfilling spacing in CBCM can be analyzed based on the Hu Haichang’s theory.Exerting the bearing capacity of the immediate roof is beneficial to the stability of the overlying strata.The CBCM has a good control effect on the overburden in Xinyang Mine when the backfilling rate is lower than 25%.The backfilling cost of per ton coal is 37.39 yuan/t when the backfilling rate is 13.7%,with a decrease rate of 56.63%than the full-filling.The research results can provide theoretical support for the application of CBCM in coal mining.

关键词： Constructional backfilling coal mining Immediate roof Cooperative bearing structure Medium thick plate on elastic foundation Backfilling rate Overlying strata

疏放条件下新生界底部含水层数值模拟及排泄量评价

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煤矿安全 2024年第4期55卷 197-203页

作者：刘晓娟许光泉傅先杰单崇雷安徽理工大学地球与环境学院安徽淮南232001 中煤新集能源股份有限公司安徽淮南232001

我国东部隐伏矿区煤层开采会引起新生界底部含水层(简称“底含”)地下水间接补给基岩面下砂岩含水层,这不仅会导致地面沉降,同时也增加了矿井排水量,排泄量的确定为矿井水害防治和沉降量的预测提供了一定的依据。以淮南煤田板集矿为例,... 详细信息

我国东部隐伏矿区煤层开采会引起新生界底部含水层(简称“底含”)地下水间接补给基岩面下砂岩含水层,这不仅会导致地面沉降,同时也增加了矿井排水量,排泄量的确定为矿井水害防治和沉降量的预测提供了一定的依据。以淮南煤田板集矿为例,通过对9煤顶板砂岩含水层疏放导致与上覆“底含”补给关系的分析,构建了“底含”数值模型,获得了其水文地质参数,采用水均衡原理计算并评价其排泄量。结果表明:研究区“底含”可划分为5个水文地质单元区块,渗透系数为0.433~0.824 m/d,弹性释水率为1.8×10^(-6)~3.6×10^(-6)m^(-1);在砂岩水疏放条件下,不同阶段“底含”排泄量约占疏放水总量的1/4,其来源主要为侧向补给和静储量消耗;因此,通过基岩风化带的注浆,封堵“底含”与煤层顶板之间的水力通道,是治理“底含”水补给砂岩水的有效措施。

关键词：底部含水层数值模拟水均衡法排泄量板集煤矿

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铀矿井降氡优势通风方式研究

辐射防护 2024年第1期44卷 80-84页

作者：李先杰张哲胡鹏华陈刚任建军刘啸晨核工业北京化工冶金研究院北京101149 核工业湖南矿冶局长沙410007

本文以矿井通风网络入风段和用风段氡析出规律为出发点,由铀矿通风降氡基本方程导出不同通风方式下铀矿降氡需风量的计算公式,并由入风段有效供风能力导出优势通风方式评价指标,给出铀矿通风降氡方式的判别方法。

关键词：铀矿通风方式降氡判别

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数据可视化课程思政教学探索与实践

昆明冶金高等专科学校学报 2024年第1期40卷 49-55页

作者：方芳王瑞刘发稳谢显杰昆明冶金高等专科学校计算机信息学院云南昆明650033

针对高等职业教育中大数据技术专业类的人才培养实际难题,以人才培养方案为指导、学情分析为出发点,基于数据可视化的课程内容及课程目标,提出项目导向式的课程思政教学模式。从课程思政目标、专业内容与课程思政、课程特点等方面挖掘... 详细信息

针对高等职业教育中大数据技术专业类的人才培养实际难题,以人才培养方案为指导、学情分析为出发点,基于数据可视化的课程内容及课程目标,提出项目导向式的课程思政教学模式。从课程思政目标、专业内容与课程思政、课程特点等方面挖掘思政元素,进而阐述课程思政的总体设计,同时也说明了使用的4种教学方法如何促进课程思政培养目标的达成。最后以其中一个章节为例介绍了教学实践过程,并总结了课程思政教学效果。实践证明,在专业课程中融入思政元素具有“易理解”“会动手”“有互动”“勤思考”的育人效果。

关键词：数据可视化课程思政项目式教学

绿地暴露和颗粒物暴露与缺血性脑卒中患者死亡关联的队列研究

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中华疾病控制杂志 2024年第5期28卷 547-553页

作者：刘成榕刘超张莹莹赵珂张珮瑶张丙银鹿子龙郭晓雷薛付忠贾贤杰蚌埠医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室蚌埠233030 山东省疾病预防控制中心慢性非传染性疾病防制所济南250014 山东大学齐鲁医学院公共卫生学院生物统计学系济南250012 国家健康医疗大数据研究院济南250003

目的基于卫星遥感数据评估的绿地暴露和颗粒物暴露与缺血性脑卒中(ischemic stroke, IS)死亡的关联。方法在山东5个县(区)收集2013―2019年患IS的个案病例,构建IS患者队列。根据每个患者的居住地址匹配归一化植被指数(normalized diff... 详细信息

目的基于卫星遥感数据评估的绿地暴露和颗粒物暴露与缺血性脑卒中(ischemic stroke, IS)死亡的关联。方法在山东5个县(区)收集2013―2019年患IS的个案病例,构建IS患者队列。根据每个患者的居住地址匹配归一化植被指数(normalized differential vegetation index, NDVI)夏季暴露值和PM2.5、PM10的年均暴露浓度。采用Cox比例风险回归模型探讨长期绿地暴露与PM2.5和PM10的联合暴露及其交互作用与IS患者死亡的关联,并且按性别、年龄和居住地进行分层分析。采用限制性立方样条函数分别评估绿地暴露、PM2.5和PM10与IS患者死亡风险的暴露-反应关系。结果共纳入59 084人,因IS死亡4 726人(8.00%)。分析结果显示:在评估NDVI与PM2.5和PM10的联合暴露时发现NDVI与IS患者死亡风险呈负相关。交互作用结果表明:NDVI每增加0.1个单位,IS患者的死亡风险为0.74(95%CI:0.67~0.82),PM2.5每增加10μg/m3的IS患者的死亡风险为0.94(0.88~1.00),交互项为1.04 (1.02~1.07)。年龄、性别和居住地是影响NDVI与PM2.5和PM10的联合暴露及其交互作用与IS患者死亡关联的效应修饰因子。NDVI与IS患者死亡风险的暴露-反应关系曲线呈非线性趋势,PM2.5和PM10与IS患者死亡风险的暴露-反应关系曲线呈“U”型和“J”型。结论绿地暴露可能降低IS患者的死亡风险,同时进行良好的绿地规划以及降低PM2.5和PM10的暴露浓度可能进一步降低该病的死亡风险。

关键词：缺血性脑卒中绿地暴露细微颗粒物吸入颗粒物回顾性队列研究

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社区绿地与高血压患病风险关联研究

中国预防医学杂志 2024年第1期25卷 58-63页

作者：刘超朋文佳褚一凡赵珂吴学森贾贤杰蚌埠医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室安徽蚌埠233030 复旦大学公共卫生学院流行病教研室

目的评估社区绿地与成年人高血压及高血压前期患病风险的关联。方法采用多阶段分层随机抽样,在安徽省蚌埠市某区抽取成年人,通过问卷调查和健康体检获取社会人口学特征和血压水平。计算参与者家庭所在250 m缓冲区的归一化植被指数(nor... 详细信息

目的评估社区绿地与成年人高血压及高血压前期患病风险的关联。方法采用多阶段分层随机抽样,在安徽省蚌埠市某区抽取成年人,通过问卷调查和健康体检获取社会人口学特征和血压水平。计算参与者家庭所在250 m缓冲区的归一化植被指数(normalized difference vegetation index,NDVI)、优化土壤调节植被指数(optimized soil adjusted vegetation index,OSAVI)。应用广义线性混合效应模型探讨社区绿地与居民高血压前期、高血压患病风险的关联,以及关联的差异性。采用中介分析评估体质量指数(body mass index,BMI)、PM2.5的中介作用。结果最终纳入成年人2 940人,处于高血压前期955例,患病率总体达32.48%,高血压1 414例,患病率总体达48.10%。按照植被暴露水平四分位数分组,调整协变量后,与家庭处于NDVI250、OSAVI250Q1(最低)组居民相比,处于Q4(最高)组居民高血压前期和高血压患病风险更低;以正常血压组作为对照组发现,社区绿地对高血压患病的影响高于其对高血压前期患病的影响。中介分析显示,BMI介导了NDVI250与高血压前期和高血压患病风险负向关联的13.36%(95%CI:4.00%~41.00%)和16.92%(95%CI:3.90%~40.00%),未观察到PM2.5在社区绿地和高血压前期以及高血压之间的关系的中介作用。结论家庭处于较高的植被水平周围可能与较低的高血压及高血压前期患病风险相关,BMI可能是中介因素之一。

关键词：高血压前期高血压社区绿地

1950-2015年中国布鲁菌病空间流行病学分析

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蚌埠医学院学报 2024年第3期49卷 362-365页

作者：丁言稳刘婷蔡奔贾贤杰蚌埠医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室安徽蚌埠233030

目的:分析布鲁氏菌病(布病)流行趋势,包括地区和空间分布特征,为布病的早期防治提供依据。方法:采用Excel 2010构建1950-2015年布病数据库,绘制60年间布病发病率、死亡率和月平均发病例数趋势图作趋势分析。通过Arcgis 10.2软件空间统... 详细信息

目的:分析布鲁氏菌病(布病)流行趋势,包括地区和空间分布特征,为布病的早期防治提供依据。方法:采用Excel 2010构建1950-2015年布病数据库,绘制60年间布病发病率、死亡率和月平均发病例数趋势图作趋势分析。通过Arcgis 10.2软件空间统计工具,对2000-2015年布病发病率作空间自相关分析。结果:1950-2009年60年间,中国共报告布病发病927987例,死亡547例,年平均发病率为0.2012(1/100000),年平均死亡率为0.0003(1/100000);布病发病率较高的为内蒙古、黑龙江、山西、新疆等省、自治区;2008-2013年中国布病发病情况的全局空间分布关系为离散模式(Moran′s I0.05);高高空间关联模式存在于山西、新疆和宁夏,高低空间关联模式多存在于内蒙古和山西。结论:中国布病发病呈现全局空间负相关关系,高低空间关联模式多存在于内蒙古,高高空间关联模式多存在于山西、新疆和宁夏,应加大对这几个省和自治区布病的监控和防治。

关键词：布鲁菌病中国时间分布空间自相关分析