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MosaicBase:A Knowledgebase of Postzygotic Mosaic Variants in Noncancer Disease-related and Healthy Human Individuals

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Genomics, Proteomics & Bioinformatics 2020年第2期18卷 140-149页

作者： Xiaoxu Yang Changhong Yang xianing zheng Luoxing Xiong Yutian Tao Meng Wang Adam Yongxin Ye Qixi Wu Yanmei Dou Junyu Luo Liping Wei August Yue Huang Center for Bioinformatics State Key Laboratory of Protein and Plant Gene ResearchSchool of Life SciencesPeking UniversityBeijing 100871China Department of Bioinformatics Chongqing Medical UniversityChongqing 400016China College of Life Sciences Beijing Normal UniversityBeijing 100875China National Institute of Biological Sciences Beijing 102206China Peking-Tsinghua Center for Life Sciences(CLS) Academy for Advanced Interdisciplinary StudiesPeking UniversityBeijing 100871China Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College Beijing 100730China School of Life Sciences Peking UniversityBeijing 100871China

Mosaic variants resulting from postzygotic mutations are prevalent in the human genome and play important roles in human ***,except for cancer-related variants,there is no collection of postzygotic mosaic variants in noncancer disease-related and healthy ***,we present MosaicBase,a comprehensive database that includes 6698 mosaic variants related to 266 noncancer diseases and 27,991 mosaic variants identified in 422 healthy *** and phenotypic information of each variant was manually extracted and curated from 383 *** supports the query of variants with Online Mendelian Inheritance in Man(OMIM)entries,genomic coordinates,gene symbols,or Entrez *** also provide an integrated genome browser for users to easily access mosaic variants and their related annotations for any genomic *** analyzing the variants collected in MosaicBase,we find that mosaic variants that directly contribute to disease phenotype show features distinct from those of variants in individuals with mild or no phenotypes,in terms of their genomic distribution,mutation signatures,and fraction of mutant *** will not only assist clinicians in genetic counseling and diagnosis but also provide a useful resource to understand the genomic baseline of postzygotic mutations in the general human *** is publicly available at http://***/or http://49.***.21.8:8000.

关键词： Postzygotic Mosaicism Noncancer Mutation MosaicBase

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Responses of River Runoff to Climate Change Based on Nonlinear Mixed Regression Model in Chaohe River Basin of Hebei Province, China

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Chinese Geographical Science 2010年第2期20卷 152-158页

作者： JIANG Yan LIU Changming zheng Hongxing LI Xuyong WU xianing State Key Laboratory of Urban and Regional Ecology Research Center for Eco-Environmental Sciences Chinese Academy of Sciences Beijing 100085 China College of Water Sciences Beijing Normal University Beijing 100875 China Institute of Geographic Sciences and Natural Resources Research Chinese Academy of Sciences Beijing 100101 China Sinohydro Corporation Limited Beijing 100044 China

Taking the nonlinear nature of runoff system into account,and combining auto-regression method and multi-regression method,a Nonlinear Mixed Regression Model (NMR) was established to analyze the impact of temperature and precipitation changes on annual river runoff process. The model was calibrated and verified by using BP neural network with observed meteorological and runoff data from Daiying Hydrological Station in the Chaohe River of Hebei Province in 1956–2000. Compared with auto-regression model,linear multi-regression model and linear mixed regression model,NMR can improve forecasting precision remarkably. Therefore,the simulation of climate change scenarios was carried out by NMR. The results show that the nonlinear mixed regression model can simulate annual river runoff well.

关键词： river runoff runoff forecast nonlinear mixed regression model linear multi-regression model linear mixed regression model BP neural network

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企业数字化转型与资本市场融资效率——基于股权资本成本的证据

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国际商务（对外经济贸易大学学报） 2023年第6期 133-153页

作者：郑晓佳张雪彬蒋先玲对外经济贸易大学国际经济贸易学院北京100029

本文以2007—2019年中国沪深A股上市企业为样本,检验企业数字化转型对股权资本成本的影响及其机制。实证结果表明:企业进行数字化转型显著降低了股权资本成本;在财务压力更大、信息复杂程度更高、公司治理水平更低的企业中,数字化转型... 详细信息

本文以2007—2019年中国沪深A股上市企业为样本,检验企业数字化转型对股权资本成本的影响及其机制。实证结果表明:企业进行数字化转型显著降低了股权资本成本;在财务压力更大、信息复杂程度更高、公司治理水平更低的企业中,数字化转型降低股权资本成本的效应更强。机制分析显示,数字化转型主要通过降低企业盈余波动、吸引外部关注以及提高公司治理质量三条渠道,降低企业的股权资本成本。

关键词：数字化转型股权资本成本信息不对称外部关注公司治理

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合并与未合并糖尿病的胰腺癌患者血管生成素样蛋白2在血清中的表达及其与预后的关系

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临床肝胆病杂志 2021年第6期37卷 1398-1403页

作者：秦雯陈泰文郑海平黄夏宁朱小东广西医科大学附属武鸣医院病理科南宁530199 广西医科大学附属武鸣医院肿瘤科南宁530199 广西医科大学附属肿瘤医院胃及腹部肿瘤病区南宁530021 广西医科大学第一附属医院肿瘤内科南宁530021

目的探讨血管生成素样蛋白2(ANGPTL2)在合并与未合并糖尿病的胰腺癌患者中的表达水平及其作为胰腺癌患者预后指标的价值。方法收集2015年1月—2018年1月于广西医科大学第一附属医院、广西医科大学附属肿瘤医院、广西医科大学附属武鸣医... 详细信息

目的探讨血管生成素样蛋白2(ANGPTL2)在合并与未合并糖尿病的胰腺癌患者中的表达水平及其作为胰腺癌患者预后指标的价值。方法收集2015年1月—2018年1月于广西医科大学第一附属医院、广西医科大学附属肿瘤医院、广西医科大学附属武鸣医院治疗的胰腺癌患者的血清标本125例,其中单纯胰腺癌组64例、合并糖尿病胰腺癌组61例,另选取66例健康体检者作为对照组。采用ELISA法检测各组血清ANGPTL2水平,分析ANGPTL2的表达水平与临床指标、生存预后的关系。符合正态分布的计量资料3组间比较采用单因素方差分析,进一步两两比较采用Bonferroni法;偏态分布者的计量资料3组间比较采用独立样本Kruskal-Wallis H秩和检验,进一步两两比较采用单因素ANOVA法。计数资料组间比较采用χ2检验。相关性分析采用Spearman相关分析。Kaplan-Meier法绘制生存曲线,log-rank检验比较生存率。采用Cox风险模型行单/多因素分析,确定影响胰腺癌预后的独立危险因素。结果合并糖尿病胰腺癌组患者血清ANGPTL2[7.79(7.12~8.17)ng/ml]明显高于单纯胰腺癌组[5.74(5.08~6.40)ng/ml]和健康对照组[3.72(3.25~4.16)ng/ml](P值均<0.001)。血清ANGPTL2水平与CA19-9、CEA均呈正相关(r值分别为0.560、0.731,P值均<0.001)。单因素分析显示,肿瘤大小、远处器官转移、分化程度、CEA、ANGPTL2、HbA1c与胰腺癌患者远期生存密切相关(P值均<0.05);多因素分析显示,肿瘤大小(HR=2.657,P=0.005)、远处器官转移(HR=5.000,P=0.014)、分化程度(HR=2.466,P=0.004)、CEA(HR=1.110,P<0.001)、ANGPTL2(HR=1.901,P=0.001)均为影响胰腺癌患者预后的独立危险因素。在所有胰腺癌患者中,ANGPTL2高表达组的2年生存率明显低于ANGPTL2低表达组(8.51%vs 25.81%,χ2=5.651,P=0.017)。在合并糖尿病的胰腺癌患者中ANGPTL2高表达组的2年生存率也明显低于ANGPTL2低表达组(2.20%vs 32.70%,χ2=24.895,P<0.001)。结论ANGPTL2可能是评价胰腺癌患者,特别是合并糖尿病的胰腺癌患者预后的有效指标。

关键词：胰腺肿瘤糖尿病血管生成素类预后

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复合前列腺特异性抗原的单克隆抗体制备及化学发光法免疫定量检测试剂研究

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中国免疫学杂志 2016年第8期32卷 1171-1174,1178页

作者：詹炉停温桂平赵敏依含刘江武郭小怡林海军黄刘女夏宁邵郑子峥厦门大学分子疫苗学与分子诊断学国家重点实验室国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心公共卫生学院厦门361102 厦门大学生命科学学院厦门361102 厦门万泰凯瑞生物技术有限公司厦门361000

目的：获得特异性检测复合前列腺特异性抗原（c-PSA）的单克隆抗体配对,建立基于化学发光c-PSA免疫定量试剂。方法：利用市购c-PSA抗原免疫6周龄雌性BALB/c小鼠,间接法ELISA差异筛选抗c-PSA、游离前列腺特异性抗原（f-PSA）、总前列腺... 详细信息

目的：获得特异性检测复合前列腺特异性抗原（c-PSA）的单克隆抗体配对,建立基于化学发光c-PSA免疫定量试剂。方法：利用市购c-PSA抗原免疫6周龄雌性BALB/c小鼠,间接法ELISA差异筛选抗c-PSA、游离前列腺特异性抗原（f-PSA）、总前列腺特异型抗原（t-PSA）的抗体,抗体配对后化学发光定量检测血清中c-PSA蛋白。结果：获得抗体配对1A10/7D6-SAE,经c-PSA标准品及临床血清样本初步筛选,该抗体配对适用于基于化学法发光的免疫反应定量检测试剂的开发;血清阳性样本与阴性样本检测结果显示具有统计学意义（P〈0.000 1）;阳性样本定量结果与Siemens公司复合前列腺特异性抗原测定试剂盒（直接化学发光法）的相关系数为0.97;线性范围为0.1~100 ng/ml;检测灵敏度为0.005 ng/ml。结论：成功筛选获得特异性检测c-PSA的抗体配对,并开发c-PSA化学发光免疫定量试剂,其检测能力与国际主流试剂相当。

关键词：复合前列腺特异性抗原单克隆抗体化学发光定量试剂

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仙灵骨葆胶囊联合氨基葡萄糖治疗膝骨关节炎有效性和安全性的Meta分析

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中国药房 2021年第7期32卷 870-875页

作者：郑子恢张田李琼李文英袁华张白鸽马琳金鹏飞北京医院药学部/国家老年医学中心/中国医学科学院老年医学研究院/北京市药物临床风险与个体化应用评价重点实验室(北京医院) 北京100730

目的:系统评价仙灵骨葆胶囊联合氨基葡萄糖治疗膝骨关节炎(KOA)的有效性和安全性,为临床KOA的治疗提供循证参考。方法:计算机检索Cochrane图书馆、PubMed、Embase、中国知网、万方数据库、中国生物医学文献数据库和维普网,检索时限为各... 详细信息

目的:系统评价仙灵骨葆胶囊联合氨基葡萄糖治疗膝骨关节炎(KOA)的有效性和安全性,为临床KOA的治疗提供循证参考。方法:计算机检索Cochrane图书馆、PubMed、Embase、中国知网、万方数据库、中国生物医学文献数据库和维普网,检索时限为各数据库建库起至2020年11月。收集在氨基葡萄糖(对照组)的基础上联用仙灵骨葆胶囊(试验组)治疗KOA的随机对照试验(RCT),对符合纳入标准的临床研究进行资料提取后,采用Cochrane 5.1.0系统评价员手册评价质量,并采用Rev Man 5.4软件进行Meta分析。结果:共纳入11项RCT,包括970例患者。Meta分析结果显示,试验组患者治愈率[OR=2.41,95%CI(1.48,3.93),P<0.001]、显效率[OR=1.95,95%CI(1.49,2.56),P<0.001]、总有效率[OR=4.00,95%CI(2.57,6.24),P<0.001]、疼痛视觉模拟(VAS)评分[MD=-2.34,95%CI(-2.51,-2.17),P<0.001]、膝关节功能评分[MD=31.32,95%CI(27.89,34.75),P<0.001]、日本骨科协会(JOA)腰痛评分[MD=12.22,95%CI(9.68,14.76),P<0.001]和疼痛缓解时间[MD=-1.55,95%CI(-1.84,-1.25),P<0.001]方面均显著优于对照组,不良反应发生率显著低于对照组[OR=0.04,95%CI(0.02,0.12),P<0.001]。结论:仙灵骨葆胶囊联合氨基葡萄糖治疗KOA在治愈率、显效率、总有效率、VAS评分、膝关节功能评分、JOA腰痛评分和疼痛缓解时间方面明显优于单独使用氨基葡萄糖,并可明显降低不良反应发生率。

关键词：仙灵骨葆胶囊氨基葡萄糖膝骨关节炎有效性安全性 Meta分析

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