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Exploring the genetic characteristics of 93-11 and Nipponbare recombination inbred lines based on the Golden Gate SNP assay

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Science China(Life Sciences) 2016年第7期59卷 700-707页

作者： Renbo Yu Wei Yan Manzhong Liang Xiaojun Dai Haodong chen Yunong Sun Xingwang Deng xiangding chen Hang He Liangbi chen College of Life Sciences Hunan Normal University State Key Laboratory of Protein and Plant Gene Research Peking-Tsinghua Center for Life Sciences School of Advanced Agriculture Sciences and School of Life Sciences Peking University College of Life Sciences Capital Normal University

Understanding genetic characteristics in rice populations will facilitate exploring evolutionary mechanisms and gene cloning. Numerous molecular markers have been utilized in linkage map construction and quantitative trait locus （QTL） mappings. However, segregation-distorted markers were rarely considered, which prevented understanding genetic characteristics in many populations. In this study, we designed a 384-marker GoldenGate SNP array to genotype 283 recombination inbred lines （RILs） derived from 93-11 and Nipponbare Oryza sativa crosses. Using 294 markers that were highly polymorpbic between parents, a linkage map with a total genetic distance of 1,583.2 cM was constructed, including 231 segregation-distorted mark- ers. This linkage map was consistent with maps generated by other methods in previous studies. In total, 85 significant quanti- tative trait loci （QTLs） with phenotypic variation explained （PVE） values〉5% were identified. Among them, 34 QTLs were overlapped with reported genes/QTLs relevant to corresponding traits, and 17 QTLs were overlapped with reported sterili- ty-related genes/QTLs. Our study provides evidence that segregation-distorted markers can be used in linkage map construc- tion and QTL mapping. Moreover, genetic information resulting from this study will help us to understand recombination events and segregation distortion. Furthermore, this study will facilitate gene cloning and understanding mechanism of in- ter-subspecies hybrid sterility and correlations with important agronomic traits in rice.

关键词： GoldenGate SNP assay linkage map segregation-distorted markers QTLs

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荧光转基因斑马鱼Tg(ttn.2:EGFP)的构建

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生物工程学报 2023年第4期39卷 1804-1814页

作者：陈佳乐曹秋香曹慧陈湘定邓云湖南师范大学生命科学学院湖南长沙410081

为了建立一种用于研究肌肉和心脏发育及其相关疾病的绿色荧光蛋白(enhanced green fluorescent protein,EGFP)转基因斑马鱼品系,本研究使用斑马鱼ttn.2基因编码区上游启动子序列和绿色荧光蛋白基因编码序列构建了重组表达载体,并将该载... 详细信息

为了建立一种用于研究肌肉和心脏发育及其相关疾病的绿色荧光蛋白(enhanced green fluorescent protein,EGFP)转基因斑马鱼品系,本研究使用斑马鱼ttn.2基因编码区上游启动子序列和绿色荧光蛋白基因编码序列构建了重组表达载体,并将该载体和Tol2转座酶的加帽mRNA显微共注射入斑马鱼1-细胞期胚胎,通过荧光检测、遗传杂交筛选和分子鉴定等方法,成功建立了能稳定遗传的Tg(ttn.2:EGFP)转基因斑马鱼品系。荧光表达分析及原位杂交分析结果表明,绿色荧光信号在斑马鱼肌肉和心脏组织中特异表达模式与ttn.2基因的mRNA表达一致。通过反向PCR鉴定转基因表达载体在F1代斑马鱼品系中的随机整合位点,结果表明:No.33转基因品系的EGFP基因整合在斑马鱼的4号和11号染色体上,No.34转基因品系则整合在1号染色体上。该荧光转基因斑马鱼品系Tg(ttn.2:EGFP)的成功构建为肌肉和心脏发育以及相关疾病研究提供了一个新的理想实验模型。此外,绿色荧光强烈表达的斑马鱼品系还可以作为一种新的观赏鱼。

关键词： ttn.2 Tol2转座子转基因斑马鱼

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水风光互补系统装机容量配置解析优化及敏感性分析

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水利学报 2023年第8期54卷 978-986页

作者：陈祥鼎刘攀吴迪马黎龚兰强黄康迪武汉大学水资源与水电工程科学国家重点实验室湖北武汉 430072 中国电建贵阳勘测设计研究院有限公司贵州贵阳 550081 武汉大学水资源与水电工程科学国家重点实验室湖北武汉 430072 中国长江三峡集团有限公司科学技术研究院北京 100038

水风光装机容量优化配置对于提高能源利用效率具有重要意义,但传统的以系统净效益最大为目标的数值模拟方法难以刻画明晰互补系统净效益、装机容量、电价、成本等经济技术参数之间的定量关系.为此,本文提出装机容量配置的解析优化方法.... 详细信息

水风光装机容量优化配置对于提高能源利用效率具有重要意义,但传统的以系统净效益最大为目标的数值模拟方法难以刻画明晰互补系统净效益、装机容量、电价、成本等经济技术参数之间的定量关系.为此,本文提出装机容量配置的解析优化方法.首先构建风光弃电率函数,以精准模拟长时段风光弃电量;然后基于成本-效益模型解析最优装机函数,并采用数值模拟方法检验;最后,对最优装机函数泰勒展开,以评估容量配置中最优装机和互补系统净效益对各经济技术参数的敏感性.以雅砻江流域二滩水风光互补工程为实例,研究结果表明:提出的解析优化方法经检验可精确配置装机容量;最优装机和净效益最敏感的参数均为上网电价,最不敏感参数均为运行维护成本,系统净效益对上网电价敏感性为运行维护成本的4.44 倍.研究可为流域水风光互补电站规划设计提供技术支持.

关键词：水风光多能互补解析优化最优装机函数经济技术参数敏感性分析

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A genome wide association study between copy number variation (CNV) and human height in Chinese population

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Journal of Genetics and Genomics 2010年第12期37卷 779-785页

作者： Xi Li Lijun Tan Xiaogang Liu Shufeng Lei Tielin Yang xiangding chen Fang Zhang Yue Fang Yan Guo Liang Zhang Han Yan Feng Pan Zhixin Zhang Yumei Peng Qi Zhou Lina He Xuezhen Zhu Jing cheng Lishu Zhang Yaozhong Liu Qing Tian Hongwen Deng Laboratory of Molecular and Statistical Genetics College of Life Sciences Hunan Normal University Changsha 410081 China The Key Laboratory of Biomedical Information Engineering of Ministry of Education and Institute of Molecular Genetics School of Life Science and Technology Xi'an Jiaotong University Xi'an 710049 China National Engineering Research Center for Beijing Biochip Technology Beijing 102206 China Department of Basic Medical Science and Orthopedic Surgery School of Medicine University of Missouri - Kansas City Kansas City MO 64108 USA College of Life Sciences and Bioengineering Beijing Jiaotong University Beijing 100044 China

Copy number variation （CNV） is a type of genetic variation which may have important roles in phenotypic variability and disease susceptibility. To hunt for genetic variants underlying human height variation, we performed a genome wide CNV association study for human height in 618 Chinese unrelated subjects using Affymetrix 500K array set. After adjusting for age and sex, we found that four CNVs at 6p21.3, 8p23.3-23.2, 9p23 and 16p12.1 were associated with human height （with borderline significant p value： 0.013, 0.011, 0.024, 0.049; respectively）. However, after multiple tests correction, none of them was associated with human height. We observed that the gain of copy number （more than 2 copies） at 8p23.3-23.2 was associated with lower height （normal copy number vs. gain of copy number： 161.2 cm vs. 153.7 cm, p = 0.011）, which accounted for 0.9% of height variation. Loss of copy number （less than 2 copies） at 6p21.3 was associated with 0.8% lower height （loss of copy number vs. normal copy number： 154.5 cm vs. 161.1 cm, p = 0.013）. Since no important genes influencing height located in CNVs at loci of 8p23.3-23.2 and 6p21.3, the two CNVs may cause the structural rear- rangements of neighbored important candidate genes, thus regulates the variation of height. Our results expand our knowledge of the genetic factors underlying height variation and the biological regulation of human height.

关键词： CNV human height GWAS Affymetrix 500K array

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无水氟化氢的制备工艺

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有机氟工业 2022年第1期 48-50页

作者：李金安丁洁陈湘鼎郴州中化氟源新材料有限公司湖南郴州424200

无水氟化氢(AHF)是氟化工行业最为基础的化工原料,无水氟化氢的制备技术在工业上已经成熟应用。目前工业上主要的制备技术是萤石法和氟硅酸法,其中萤石法采用的是回转窑式制备无水氟化氢,氟硅酸法采用浓硫酸使氟硅酸分解成氟化氢和四氟... 详细信息

无水氟化氢(AHF)是氟化工行业最为基础的化工原料,无水氟化氢的制备技术在工业上已经成熟应用。目前工业上主要的制备技术是萤石法和氟硅酸法,其中萤石法采用的是回转窑式制备无水氟化氢,氟硅酸法采用浓硫酸使氟硅酸分解成氟化氢和四氟化硅气体制备无水氟化氢。萤石法存在传热、传质低等缺点,氟硅酸法存在大量稀硫酸需处理等制约因素,而气固相法流化床工艺采用水蒸气、三氧化硫气体和萤石粉在流化床内发生反应制备无水氟化氢,因流化床具有较高的传质、传热效率的特点,流化态下的气固相反应极大地提高了传质和传热效率。

关键词：流化床氟化氢三氧化硫

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夏枯草提取物调控乳腺癌细胞增殖及凋亡机制研究

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中华实验外科杂志 2021年第10期38卷 1922-1925页

作者：王锐白皓天杨婧陈静孔祥定黑龙江中医药大学药剂学教研室哈尔滨150040 黑龙江中医药大学病理教研室哈尔滨150040 黑龙江中医药大学附属第一医院外二科哈尔滨150040

目的探讨夏枯草提取物对乳腺癌细胞增殖和凋亡的影响及可能机制。方法采用0.04、0.08、0.16、0.32 mg/ml浓度夏枯草提取物处理乳腺癌MCF-7细胞筛选后续实验浓度。根据处理方法将MCF-7细胞分成不同组别。细胞计数试剂盒8(CCK-8)检测细胞... 详细信息

目的探讨夏枯草提取物对乳腺癌细胞增殖和凋亡的影响及可能机制。方法采用0.04、0.08、0.16、0.32 mg/ml浓度夏枯草提取物处理乳腺癌MCF-7细胞筛选后续实验浓度。根据处理方法将MCF-7细胞分成不同组别。细胞计数试剂盒8(CCK-8)检测细胞增殖抑制率;蛋白质印迹法检测裂解的半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3(cleaved-Caspase-3)、细胞周期蛋白D1(Cyclin D1)、血管内皮生长因子(VEGF)、磷酸化磷脂酰肌醇3激酶(p-PI3K)和磷酸化蛋白激酶B(p-Akt)蛋白表达;流式细胞仪检测细胞凋亡;实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测miR-195表达水平。两组间比较行t检验,多组间比较采用单因素方差分析,组间两两比较采用SNK检验。结果 0.04、0.08、0.16和0.32 mg/ml浓度夏枯草提取物处理后细胞MCF-7增殖率显著低于NC组,差异有统计学意义[(92.11±9.21)%、(78.69±7.87)%、(51.37±5.14)%、(46.05±4.61)%,F=89.060,P<0.05]。夏枯草提取物处理的MCF-7细胞中cleaved-Caspase-3表达水平(1.05±0.11比0.42±0.04)、细胞凋亡率[(25.22±2.53)%比(8.12±0.80)%]和miR-195表达(3.67±0.37比1.00±0.12)均高于NC组,差异有统计学意义(t=16.147、19.333、20.593,P<0.05)。miR-195组miR-195表达(3.46±0.35比1.00±0.11)、cleaved-Caspase-3表达(0.96±0.10比0.43±0.04)和凋亡率[(22.36±2.24)%比(8.02±0.80)%]高于miR-NC组,Cyclin D1表达(0.35±0.04比0.92±0.09)和细胞增殖率[(45.27±3.53)%比(89.12±7.10)%]低于miR-NC组(P<0.05),差异有统计学意义(t=20.116、17.362、14.763、11.991、18.086,P<0.05)。夏枯草提取物组VEGF(0.40±0.04比0.92±0.09)、p-PI3K(0.32±0.04比0.76±0.08)和p-Akt表达水平(0.34±0.03比0.70±0.06)低于NC组,差异有统计学意义(t=31.208、42.144,P<0.05)。结论夏枯草提取物通过上调miR-195抑制VEGF/PI3K/Akt信号通路抑制乳腺癌细胞增殖,促进细胞凋亡。

关键词：夏枯草提取物乳腺癌增殖凋亡

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哈尔滨市11 465例体检人群甲状腺结节多普勒超声检查结果与分析

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中华地方病学杂志 2019年第10期38卷 840-843页

作者：何岩涛孔祥定陈静王康王宽宇黑龙江中医药大学研究生院哈尔滨150040 黑龙江中医药大学附属第一医院外科哈尔滨150040

目的了解哈尔滨市甲状腺结节的检出情况及与性别、年龄之间的关系和甲状腺结节的临床特点。方法采用横断面研究方法,以2017年11月至2018年10月在黑龙江中医药大学附属第一医院外科体检人员为观察对象,进行甲状腺彩色多普勒超声检查,比... 详细信息

目的了解哈尔滨市甲状腺结节的检出情况及与性别、年龄之间的关系和甲状腺结节的临床特点。方法采用横断面研究方法,以2017年11月至2018年10月在黑龙江中医药大学附属第一医院外科体检人员为观察对象,进行甲状腺彩色多普勒超声检查,比较不同性别、年龄段甲状腺结节检出率,分析甲状腺结节部位、大小特点。结果在11465例体检者中,检出甲状腺结节6209例,总检出率为54.16%,其中男性检出1069人,检出率为44.08%(1069/2425);女性检出5140人,检出率为56.86%(5140/9040),不同性别比较,差异有统计学意义(χ2=125.71,P2.0cm)711人(11.45%)。结论哈尔滨市甲状腺结节的检出率较高,女性明显大于男性,年龄≥70岁者高于其他年龄段;发生结节部位多出现在双侧叶,以小结节为主。

关键词：甲状腺结节流行病学研究超声检查

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采用树木年轮资料重建山东沂山地区200多年来的湿润指数

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地理研究 1998年第2期17卷 150-156页

作者：沈长泗陈金敏张志华吴祥定张佩云王桂岩山东省气象科学研究所国家气候中心中国科学院地理研究所山东省林业科学研究所

在中国，尤其在中国西北部地区，树轮年表是古气候信息的一个重要来源。由于某种原因，中国东部地区少有树轮研究工作。该文通过运引ＡＲＳＴＡＮ程序，建立并研究了山东境内沂山地区的树轮主年表（１７５０～１９９２）。树轮和气候要... 详细信息

在中国，尤其在中国西北部地区，树轮年表是古气候信息的一个重要来源。由于某种原因，中国东部地区少有树轮研究工作。该文通过运引ＡＲＳＴＡＮ程序，建立并研究了山东境内沂山地区的树轮主年表（１７５０～１９９２）。树轮和气候要素的响应面分析得出沂山地区的树轮生长和温度降水呈非线性相关，因此使用传统方法重建单个气候因子是不合理的。通过响应函数和回归分析，５月至８月份的湿润指数（Ｐ／Ｔ）被确定为重建对象，该湿润指数值代表了温度和降水对树轮生长的共同影响，且相关性很高，远超过信度检验。利用线性回归方法，获得重建湿润指数的预报方程，用树木年轮年表重建了自１７５０年以来的沂山地区逐年５月～８月湿润指数的变化。分析了沂山地区湿润指数重建的可靠性。

关键词：沂山树轮湿润指数气候重建古气候

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甲状腺术后声音嘶哑中医治疗研究进展

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中医临床研究 2023年第12期15卷 145-148页

作者：陈新杰王宽宇孔祥定陈静黑龙江中医药大学黑龙江哈尔滨150040

甲状腺术后声音嘶哑是甲状腺外科疾病中常见的并发症,多是因为术中物理性因素或术后局部病理因素直接或间接损伤喉返神经所造成,给患者生理和心理带来双重负担。术后声音嘶哑虽属于中医“喉喑”的范畴,但在病因病机上又有其特殊之处,术... 详细信息

甲状腺术后声音嘶哑是甲状腺外科疾病中常见的并发症,多是因为术中物理性因素或术后局部病理因素直接或间接损伤喉返神经所造成,给患者生理和心理带来双重负担。术后声音嘶哑虽属于中医“喉喑”的范畴,但在病因病机上又有其特殊之处,术后初期以甲状腺区域术野暴露时间过长,手术损伤造成痰阻喉窍,化热伤津等实证为主,后期则出现气阴亏虚,声道失于濡养,虚实夹杂,同时因经脉损伤导致气血瘀阻于喉间导致声门开阖不利,气息运行不畅,出现声音嘶哑。而西医以常规的营养神经和激素抗感染治疗,方法单一且疗效不理想,易出现不良反应,患者接受度低,而中医以中医辨证治疗、局部针灸、中药超声雾化疗法、内外合治、中西结合为主。内治根据不同症状,临床上证型以气阴两虚证、痰瘀阻窍证居多,用药以开音、收涩药为主,结合滋补肺胃气阴可取良效,外治以局部针灸、超声雾化吸入为主,雾化吸入采用滋阴清热利咽之药,而以维生素、甲钴胺等营养神经药以及糖皮质激素联合中药汤剂、中药雾化吸入中西医结合治疗,双管齐下,取效更优。文章通过综述近年来中医对术后声音嘶哑的治疗进展,阐述优势与不足,展望未来,以期为进一步提高临床治疗质量提供参考。

关键词：甲状腺术后声音嘶哑中医治疗法

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案例教学联合探索教学法在甲状腺外科疾病临床带教中的效果评价

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中国医药科学 2023年第7期13卷 92-95页

作者：王钢孔祥定陈静王宽宇黑龙江中医药大学第一临床医学院黑龙江哈尔滨150040 黑龙江中医药大学附属第一医院外二科黑龙江哈尔滨150040

目的探讨应用案例教学(CBL)联合探索教学(RBL)法在甲状腺外科疾病临床带教中对学生学习成绩、知识掌握程度、学习能力、兴趣等方面的影响。方法抽取103名黑龙江中医药大学2019级中西医临床医学五年制本科生,均在黑龙江中医药大学附属第... 详细信息

目的探讨应用案例教学(CBL)联合探索教学(RBL)法在甲状腺外科疾病临床带教中对学生学习成绩、知识掌握程度、学习能力、兴趣等方面的影响。方法抽取103名黑龙江中医药大学2019级中西医临床医学五年制本科生,均在黑龙江中医药大学附属第一医院外二科参加临床实习。按随机数表法分为CBL联合RBL教学组(试验组,n=52)和传统教学组(对照组,n=51),出科前对学生进行理论考核和实践考核,并进行问卷调查。结果试验组学生的理论考核成绩和实践考核成绩均高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。问卷结果显示,试验组在激发学生的学习兴趣,提高学生自学能力和对知识的系统性掌握程度,增强学生的临床思维能力、实践操作能力、团队协作能力以及科研创新能力等方面优于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论CBL联合RBL教学法可以提高甲状腺外科疾病临床带教的教学质量,提升学生学习、科研能力,改善甲状腺外科教学效果。

关键词：甲状腺外科疾病案例教学法探索教学法教学方法

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