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核酸及其衍生物的代谢加工运输相关基因在大鼠肝再生中表达模式的分析

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解剖学报 2008年第3期39卷 329-334页

作者：胡珂徐存拴河南省-科技部共建细胞分化调控重点实验室新乡453007 河南师范大学生命科学学院

目的在基因转录水平了解核苷酸及其衍生物、DNA及RNA代谢、加工、运输相关基因在大鼠肝再生（LR）中的表达变化。方法用搜索网站资料和查阅相关论文等方法获得核苷酸及其衍生物、DNA及RNA代谢、加工、运输相关基因,用大鼠基因组230 2.0... 详细信息

目的在基因转录水平了解核苷酸及其衍生物、DNA及RNA代谢、加工、运输相关基因在大鼠肝再生（LR）中的表达变化。方法用搜索网站资料和查阅相关论文等方法获得核苷酸及其衍生物、DNA及RNA代谢、加工、运输相关基因,用大鼠基因组230 2.0芯片检测它们在大鼠再生肝中的表达情况,用手术组和假手术组比较的方法确定肝再生相关基因。结果初步证实,上述基因中有240个基因与大鼠肝再生相关。肝再生早期[部分肝切除（PH）后0.5～4h]、前期（PH后6～12h）、中期（PH后16～66h）、后期（PH后72～168h）等4个时期起始表达的基因数分别为65、14、150和11,基因的总表达次数为133、87、627和169,它们的表达模式分别为6、5、22和9种,共表达上调768次,下调248次。肝再生前期和中期mRNA降解增强;前期、中期和后期DNA重组、修饰、转录及mRNA加工和运输增强;几乎整个肝再生中核苷酸及其衍生物代谢、DNA复制、包装和分解活动增强。结论肝再生相关基因主要在肝再生早期起始表达,在不同时期发挥作用。

关键词：部分肝切除核酸衍生物肝再生相关基因基因组2302.0芯片大鼠

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非编码DNA序列的功能及其鉴定

遗传 2013年第11期35卷 1253-1264页

作者：秦丹徐存拴河南师范大学生命科学学院新乡453007 河南省-科技部共建细胞分化调控国家重点实验室培育基地新乡453007

非编码DNA序列是指基因组中不编码蛋白质的DNA序列。这些序列可以结合调节因子、转录为功能性RNA、单独或协同地调节生理活动和病理过程。文章围绕基因表达调控作用,总结了近几年非编码DNA序列的研究成果,对其结构、功能和可能的作用机... 详细信息

非编码DNA序列是指基因组中不编码蛋白质的DNA序列。这些序列可以结合调节因子、转录为功能性RNA、单独或协同地调节生理活动和病理过程。文章围绕基因表达调控作用,总结了近几年非编码DNA序列的研究成果,对其结构、功能和可能的作用机制进行了初步阐述,介绍了目前鉴定非编码DNA序列中功能元件的计算方法和实验技术,并对非编码DNA未来的研究进行了展望。

关键词：非编码DNA序列基因表达调控功能元件转录因子结合位点非编码RNA 表观遗传学

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大鼠肝再生氨基酸靶向代谢组学分析

解剖学报 2021年第2期52卷 210-215页

作者：杨晖徐存拴河南师范大学生命科学学院河南新乡453007 河南省-科技部共建细胞分化调控国家重点实验室培育基地河南新乡453007

目的探讨氨基酸代谢对大鼠肝再生(LR)的调控作用。方法大鼠随机分为10组,每组5只,包括9个部分肝切除组(PH)和1个正常对照组。运用质谱选择反应检测扫描/多反应检测扫描(SRM/MRM)对大鼠肝再生中10个时间点的20种氨基酸的含量进行靶向代... 详细信息

目的探讨氨基酸代谢对大鼠肝再生(LR)的调控作用。方法大鼠随机分为10组,每组5只,包括9个部分肝切除组(PH)和1个正常对照组。运用质谱选择反应检测扫描/多反应检测扫描(SRM/MRM)对大鼠肝再生中10个时间点的20种氨基酸的含量进行靶向代谢组学鉴定,并对氨基酸含量变化进行聚类分析。结果丙氨酸在30、36和72 h上调;精氨酸在6和12 h上调;天冬氨酸在6、12和36 h上调;谷氨酸在6、12、30、36、72和120 h上调;组氨酸在12、24、30、36、72和120 h上调;谷氨酰胺在72 h上调;异亮氨酸在24 h下调。通过对氨基酸聚类分析发现,这些氨基酸可以聚为3类。结论肝再生过程中多种氨基酸发生了变化,且贯穿大鼠肝再生的全过程。氨基酸含量的变化,对肝再生中肝细胞增殖有重要作用。

关键词：肝再生氨基酸靶向代谢聚类分析大鼠

细胞核结构与发生相关基因在大鼠肝再生中表达模式的分析

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解剖学报 2008年第3期39卷 310-315页

作者：蔺芳徐存拴河南省-科技部共建细胞分化调控重点实验室新乡453007 河南师范大学生命科学学院

目的了解大鼠肝再生中细胞核结构与发生相关基因的表达动态。方法用查阅网站资料和相关论文等方法获得上述基因,用大鼠基因组230 2.0芯片检测它们在大鼠再生肝中的表达情况,用比较手术和假手术组中基因的有意义表达异同,确定肝再生相关... 详细信息

目的了解大鼠肝再生中细胞核结构与发生相关基因的表达动态。方法用查阅网站资料和相关论文等方法获得上述基因,用大鼠基因组230 2.0芯片检测它们在大鼠再生肝中的表达情况,用比较手术和假手术组中基因的有意义表达异同,确定肝再生相关基因。结果初步证实上述基因中406个基因与肝再生相关。部分肝切除（PH）后,肝再生早期（0.5～4h）、前期（6～12h）、中期（12～66h）、后期（72～168h）等4个阶段起始表达的基因数为200、29、179和5;基因的总表达次数为374、290、1 876和603。共上调1 224次,下调496次。肝再生前期和中期核形成与发生相关基因表达增强;中期核被膜、核基质和核质相关基因表达增强;中期和后期核染色体、核仁和核功能蛋白复合体相关基因表达增强。结论细胞核结构与发生相关基因在大鼠肝再生中表达活跃,并与肝再生密切相关。

关键词：部分肝切除细胞核结构发生肝再生基因组2302.0芯片大鼠

细胞表面受体介导的信号通路相关基因对大鼠肝再生的调控作用分析

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解剖学报 2008年第3期39卷 316-322页

作者：杜斌徐存拴河南省-科技部共建细胞分化调控重点实验室新乡453007 河南师范大学生命科学学院

目的在基因转录水平了解12条细胞表面受体介导的信号通路相关基因对大鼠肝再生的调控作用。方法用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得上述基因,用大鼠基因组230 2.0芯片检测它们在大鼠再生肝中的表达情况,用比较手术和假手术中基因... 详细信息

目的在基因转录水平了解12条细胞表面受体介导的信号通路相关基因对大鼠肝再生的调控作用。方法用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得上述基因,用大鼠基因组230 2.0芯片检测它们在大鼠再生肝中的表达情况,用比较手术和假手术中基因的表达差异性确定肝再生相关基因。结果初步证实上述基因中491个与肝再生相关,其中226个基因之间有742种直接作用关系。细胞因子和趋化因子介导的酶联受体、G蛋白耦联受体、谷氨酸;抗原受体介导的,整合素介导的,脂多糖介导的,Notch、Osmosensory、Smoothened、Toll、Wnt等12条信号通路中与肝再生相关的上调基因数和下调基因数,分别为26和23、164和54、59和51、5和1、22和14、21和10、1和1、4和11、23和11、32和17。肝再生中基因上调表达次数和下调表达次数分别为188和128、464和190、308和207、13和5、88和46、123和50、2和1、20和43、148和30、174和62。结论除Osmosensory和脂多糖介导的信号通路在肝再生中作用较小,Smoothened信号通路作用减弱外,其他9条信号通路在肝再生中作用增强。

关键词：部分肝切除细胞表面受体信号通路肝再生基因组2302.0芯片大鼠

Heat shock induction of a 65 kDa ATP-binding proteinase in rat C6 glioma cells

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Cell Research 1999年第2期9卷 135-144页

作者： xu cun shuan WEI MING ZHANG DIETER TECHEL MARCO MEYER YAN ZHANG LI LUDGER RENSING (Department of Biology, Henan Normal University,Xinxiang 453002)(Institute of Cell Biology, Bremen University, D-28359 Bremen, Germany) Department of Biology Henan Normal University Xinxiang China Institute of Cell Biology Bremen University Bremen Germany

The 45, 55, 65 and 100 kDa ATP-binding proteinases (ATP-BPases) of the heat-shocked (44 ℃ for 30 min, recovery for 12h) rat C6 glioma cells were purified by DEAE-ionexchange and ATP-affinity chromatography. Their molecular masses, isoelectric points (pI), pH-optima and other properties were analyzed by native proteinase *** was shown that the 65 kDa ATP-BPase is specifically induced by heat shock and not detectable in control *** N-terminal 1-9 amino acid sequence was determined by Edman degradation, but no homologies to other proteins in the protein data bases were found. 30 and 31 kDa proteinases can be cleaved from the 45, 55 and 65 kDa proteinases to which they are linked. A possible relationship of the heat-induced 65 kDa ATP-BPase with the ATP-dependent proteinases (ATP-DPases) in prokaryotes and eukaryotes is discussed.

关键词： Rat C6 glioma cells ATP-binding Proteinases heat shock induction native Proteinase gels

转录因子基因在大鼠肝再生中的表达方式和作用分析

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解剖学报 2008年第3期39卷 323-328页

作者：董华明徐存拴河南省-科技部共建细胞分化调控重点实验室新乡453007 河南师范大学生命科学学院

目的探讨转录因子基因在肝再生中的表达变化及作用。方法经查阅网站资料和相关论文获得转录因子基因及其参与的生理活动,用大鼠基因组230 2.0芯片检测转录因子基因在大鼠再生肝中的表达,用手术组和假手术组比较的方法确定肝再生相关基... 详细信息

目的探讨转录因子基因在肝再生中的表达变化及作用。方法经查阅网站资料和相关论文获得转录因子基因及其参与的生理活动,用大鼠基因组230 2.0芯片检测转录因子基因在大鼠再生肝中的表达,用手术组和假手术组比较的方法确定肝再生相关基因。结果初步证实上述基因中有320个基因与肝再生相关,涉及细胞代谢、增殖、分化、凋亡等16种生理活动。它们在肝再生中的表达分为41种方式,表明肝再生中细胞生理生化活动具有阶段性、多样性和复杂性。其中,肝再生早期[部分肝切除（PH）后0.5～4h]和前期（PH后6～12h）糖类合成,脂类代谢和炎症反应相关转录因子基因表达增强,中期和后期细胞增殖、生长、分化和凋亡相关转录因子基因表达增强。结论肝再生的生理生化活动受多种转录因子基因调控。其中,e2f1、fos、copeb等转录因子基因发挥关键作用。

关键词：部分肝切除转录因子肝再生相关基因基因组2302.0芯片大鼠

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肝陷窝细胞的研究进展

解剖学报 2010年第2期41卷 326-327页

作者：和春肖徐存拴河南师范大学生命科学学院河南省-科技部共建细胞分化调控国家重点实验室培育基地河南新乡453007

肝陷窝细胞(PCs)是肝脏的自然杀伤细胞(HNKCs),具有抗肿瘤、抗病毒、调节肝细胞的生长、分化、抑制肝纤维化等作用。本文简要地总结了近几年肝陷窝细胞的研究进展。

关键词：肝脏陷窝细胞自然杀伤细胞

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库普弗细胞的研究进展

解剖学报 2010年第2期41卷 331-332页

作者：张强伟徐存拴河南师范大学生命科学学院河南省-科技部共建细胞分化调控国家重点实验室培育基地河南新乡453007

库普弗细胞(KCs)是肝脏的非实质细胞。具有分泌细胞因子及吞噬、免疫等功能,亦与多种肝脏疾病,如肝损伤、肝纤维化、肝硬化等密切相关。本文简要总结了近几年有关库普弗细胞的生理功能及与肝病关系等方面的研究进展。

关键词：库普弗细胞细胞因子