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Inter.r.tation, Str.tification and Evidence for.Sequence Var.ants Affecting mr.A Splicing in Complete Human Genome Sequences

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Genomics, Pr.teomics & Bioinfor.atics 2013年第2期11卷 77-85页

作者： Ben C.Shir.ey Eliseos J.Mucaki tyson Whitehead Paul I.Costea Pelin Akan Peter.K.r.gan Depar.ment of Computer.Science Middlesex CollegeThe University of Western Ontario Depar.ment of Biochemistr. Schulich School of Medicine and DentistryThe University of Western Ontario SHAr.NET r.yal Institute of Technology Science for Life Laboratory Cytognomix Inc.

Infor.ation theor.-based methods have been shown to be sensitive and specific for.pr.- dicting and quantifying the effects of non-coding mutations in Mendelian diseases. We pr.sent the Shannon pipeline softwar. for.genome-scale mutation analysis and pr.vide evidence that the soft- war. pr.dicts var.ants affecting mr.A splicing. Individual infor.ation contents （in bits） of r.fer. ence and var.ant splice sites ar. compar.d and significant differ.nces ar. annotated and pr.or.tized. The softwar. has been implemented for.CLC-Bio Genomics platfor.. Annotation indicates the context of novel mutations as well as common and r.r. SNPs with splicing effects. Potential natur.l and cr.ptic mr.A splicing var.ants ar. identified, and null mutations ar. distinguished fr.m leaky mutations. Mutations and r.r. SNPs wer. pr.dicted in genomes of thr.e cancer.cell lines （U2OS, U251 and A431）, which wer. suppor.ed by expr.ssion analyses. After.filter.ng, tr.ctable number. of potentially deleter.ous var.ants ar. pr.dicted by the softwar., suitable for.fur.her.labor.tor. investigation. In these cell lines, novel functional var.ants compr.sed 6-17 inactivating mutations, 1 5 leaky mutations and 6-13 cr.ptic splicing mutations. Pr.dicted effects wer. validated by r.A-seq analysis of the thr.e afor.mentioned cancer.cell lines, and expr.ssion micr.ar.ay analysis of SNPs in HapMap cell lines.

关键词： Mutation mr.A splicing Infor.ation theor. Next-gener.tion sequencing Genome inter.r.tation

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A Novel Appr.ach to Calculating Ener.y Density fr.m Food Images r.duces Analysis Time and Cost

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Food and Nutr.tion Sciences 2019年第2期10卷 235-247页

作者： Zhaoxing Pan tyson Mar.en Ar.hana Mande Janine Higgins r.sear.h Institute Children’s Hospital Colorado Aurora CO USA Color.do Clinical & Tr.nslational Sciences Institute University of Colorado Anschutz Medical Campus Aurora CO USA Depar.ment of Pediatr.cs School of Medicine University of Colorado Anschutz Medical Campus Aurora CO USA

Tr.ditional methods of self-r.por.ed food intake ar. char.cter.zed by limitations such as under.epor.ing, high par.icipant bur.en, and high cost. With the development of automated devices to captur. food images and monitor.food intake, an accur.te and efficient method to estimate ener.y intake is needed. This study aimed to develop an accur.te and time efficient method for.estimating ener.y intake fr.m food images by defining a simple and less bur.ensome way of estimating ener.y density (ED). Four.exper.mental methods, exchange, food scor.-long, food scor.-shor., and meal, wer. developed to estimate ED based on nutr.ent composition, water.content, and r.lative pr.por.ion of foods in images, using differ.nt appr.aches. Thr.e tr.ined nutr.tionists analyzed 29 food images for.ED using each method. All four.exper.mental methods wer. compar.d to the full visual method in which a nutr.tionist estimated the por.ion size of each food consumed fr.m dietar. intake images and conducted data entr. and analysis softwar.. All exper.mental methods over.stimated ED compar.d to the FVM but the meal method exhibited the closest agr.ement, lowest var.ance for.ED, and significantly decr.ased analysis time by an aver.ge of 53 s/meal (p = 0.03). The meal method was used for.full-scale validation by analyzing 213 food images against weighed food r.cor.s. The meal method r.duced analysis time by 69% (120 s;p ≤ 0.0001) and over.estimated ED by an aver.ge of 1.56 ± 3.17 J/g (p r.d to the FVM and 1.67 ± 3.09 J/g (p r.d to the WFr. The meal method is a novel and quick appr.ach to calculate ED fr.m dietar. intake images.

关键词： Ener.y Density Self-r.por. Dietar. Intake Eating Behavior Ener.y Intake Validation Food Images Photogr.phic Food r.cor.s

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当代英国作家作品选析

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作者： P.K.·泰森(P.K. tyson)

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Excess Alcohol Use and Death among Tuber.ulosis Patients in the United States, 1997-2012

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Jour.al of Tuber.ulosis r.sear.h 2016年第1期4卷 18-22页

作者： tyson Volkmann Patr.ck K. Moonan r.que Mir.montes John E. Oeltmann Epidemic Intelligence Ser.ice Assigned to Division of Tuberculosis Elimination Centers for Disease Control and Prevention Atlanta USA United States Public Health Ser.ice Commissioned Cor.s Division of Tuber.ulosis Elimination Centers for Disease Control and Prevention Atlanta USA

r.tionale: Excess alcohol use (EAU) is associated with adver.e TB tr.atment outcomes. Objective: We investigated the r.lationship between EAU and death among TB patients 15 year. and older.pr.scr.bed anti-TB tr.atment in the United States. Design: Using data r.por.ed to the National Tuber.ulosis Sur.eillance System for.1997-2012, we calculated adjusted odds r.tios and excess attr.butable r.sk per.ent for.death among TB patients with r.por.ed EAU. r.sults: EAU was associated with death among patients younger.than 65. The excess attr.butable r.sk per.ent for.death among those with r.por.ed EAU for.those younger.than 65 was >35%. Conclusions: Inter.entions to r.duce EAU in patients r. may r.duce deaths.

关键词： Substance Use Mycobacter.um Mor.ality Attr.butable r.sk

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重新构建核武器辩论

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国际原子能机构通报 2005年第2期 16-19页

作者： r.ianna tyson 联合国办事处

大约35000枚核武器还留在核大国的武库中,有数千枚仍处于一触即发的警戒部署中。无论曾出于什么理由保存这些武器,它们早就该削减了。尽管政治上、道德上和法律上对其实际使用的约束进一步削弱了它们的战略效用,但并没有减少引起意外战... 详细信息

大约35000枚核武器还留在核大国的武库中,有数千枚仍处于一触即发的警戒部署中。无论曾出于什么理由保存这些武器,它们早就该削减了。尽管政治上、道德上和法律上对其实际使用的约束进一步削弱了它们的战略效用,但并没有减少引起意外战争或扩散的风险。核武器国家继续坚信把那些武器掌握在它们手中将提高安全,而掌握在其他人手中将成为世界和平的威胁,这无助于核不扩散的目标。如果我们在裁军方面不断取得稳定的进展,这种情况将不那么让人担心。令人遗憾的是,情况恰恰相反。

关键词：核不扩散防止核战争无核武器国家国际原子能机构国家安全化学武器公约裁军步骤核威慑理论裁军协议有核武器国家

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Hyper.cute cEEG Attenuation in Aneur.smal Subar.chnoid Hemor.hage

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Case r.por.s in Clinical Medicine 2016年第5期5卷 165-169页

作者： tyson Bur.har.t Gautam Sachdeva Malathi r.o Saqib Chaudhr. Alex Schulte Mounzer.Yassin-Kassab Depar.ment of Neur.logy Michigan State University East Lansing USA

We descr.be hyper.cute gener.lized EEG slowing and then attenuation captur.d at the moment of subar.chnoid hemor.hage in a monitor.d patient. This is the fir.t r.por.ed cEEG captur. of aneur.smal subar.chnoid hemor.ha... 详细信息

关键词： Aneur.smal Subar.chnoid Hemor.hage EEG

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参宿四的魅力

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中国国家天文 2019年第5期13卷 44-51页

作者： Peter.tyson 宋乔(译) 不详

在猎户座猎人奥利安的肩膀上,有一颗橙色的、像灯塔一样闪耀的恒星,这就是参宿四(Betelgeuse),它是猎户座中被广为研究的恒星之一。然而,尽管我们已经学到了很多,但是几乎全部我们所知道的——或者我们认为我们知道的——关于这颗老年... 详细信息

在猎户座猎人奥利安的肩膀上,有一颗橙色的、像灯塔一样闪耀的恒星,这就是参宿四(Betelgeuse),它是猎户座中被广为研究的恒星之一。然而,尽管我们已经学到了很多,但是几乎全部我们所知道的——或者我们认为我们知道的——关于这颗老年的、高度不稳定的红超巨星的知识仍然存在很多不确定性。

关键词：不确定性猎户座超巨星不稳定恒星

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80年代的E类剧情谜思

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风采 2007年第2期 28-39页

作者：赵筱筠 PACO tyson

80年代是极易入戏的因为它的戏剧化与夸张感但也因此成为现实生活中不宜照搬的某类风格若要从2007年进入1980剧情必须先要破解风格谜思

关键词：现实生活手包视觉冲击女人味夜店几何图案我爱你运动装金属光泽力者

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天文学与超大数据

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中国国家天文 2016年第9期10卷 102-109页

作者： Peter.tyson 何治宏

不久前，哈佛-史密松天体物理中心的天体物理学家Henr.“Tr.e”Winter.了一场题为“从大数据到大艺术”的报告。他正在参与NASA的太_5f1动力学天文台（SDO）任务的相关工作，他想就SDO的望远镜每天产生多少图像数据为听众提供一个概念... 详细信息

不久前，哈佛-史密松天体物理中心的天体物理学家Henr.“Tr.e”Winter.了一场题为“从大数据到大艺术”的报告。他正在参与NASA的太_5f1动力学天文台（SDO）任务的相关工作，他想就SDO的望远镜每天产生多少图像数据为听众提供一个概念。望远镜的4台相机在8个不同波段上每隔12秒拍摄一次太阳，这样每天会产生3TB的图像。

关键词：天文学天体物理图像数据物理学家望远镜天文台动力学太阳

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r.sponse of Two Inexpensive Commer.ially Pr.duced Soil Moistur. Sensor. to Changes in Water.Content and Soil Textur.

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Agr.cultur.l Sciences 2015年第10期6卷 1148-1163页

作者： tyson B. r.per.Chr.stopher.G. Henr. Leo Espinoza Mukhammadzakhr.b Ismanov Der.ick M. Ooster.uis Depar.ment of Plant Sciences University of Tennessee Jackson TN USA Depar.ment of Biological and Agr.cultur.l Engineer.ng University of Arkansas Stuttgart AR USA Depar.ment of Cr.p Soil and Environmental Sciences University of Arkansas Little Rock AR USA Depar.ment of Cr.p Soil and Environmental Sciences University of Arkansas Fayetteville AR USA

The use of low-cost (<200 USD) soil moistur. sensor. in cr.p pr.duction systems has the potential to give infer.nce on plant water.status and ther.in dr.ve ir.igation events. However. commer.ially available sensor. in... 详细信息

The use of low-cost (r. sensor. in cr.p pr.duction systems has the potential to give infer.nce on plant water.status and ther.in dr.ve ir.igation events. However. commer.ially available sensor. in this pr.ce r.nge var. in sensing methodologies and limited infor.ation on sensor.to sensor.r.lationship is available. The objective of this r.sear.h was to test the r.sponse of the Water.ar. 200SS and Decagon 10HS sensor. to changes in water.content of thr.e dissimilar.soils r.pr.senting common soils in Ar.ansas r.w-cr.p pr.duction in nine plastic, 19 L container. under.var.able envir.nmental conditions. Both sensor. wer. influenced by changes in soil temper.tur. but the magnitudes of the temper.tur. r.sponses wer. small r.lative to the moistur. r.sponses. Fur.her.or., the 10HS sensor.did not indicate a significant impact of soil textur. on estimated volumetr.c water.contents (VWCs). The small spher. of influence on the tested soil moistur. par.meter. coupled with the substantial evapor.tive demands and temper.tur.s under.which this exper.ment was conducted r.sulted in suspected non-unifor. dr.ing and wetting of the tested container.. Subsequently, non-linear.r.lationships wer. noted between 10HS estimated VWCs and actual container.VWCs and the 200SS pr.dicted lower.water.potentials than calculated by conver.ing container.VWC to soil water.potential. The failur. of the sensor. to accur.tely pr.dict container.VWC highlights the impor.ance of under.tanding the r.latively small quantity of soil on which these sensor. r.ly as well as the potential var.ability in soil moistur. within a ver. limited volume. The author. caution user. of sensor. that soil var.ability may be one of the most impor.ant consider.tions in sensor.deployment.

关键词： Soil Moistur. Sensor 10HS Water.ar. 200SS Decagon Compar.son Soil Textur.

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